Keterangan
NGS yang kuat™ MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) dirancang untuk menghilangkan rRNA dan 45S ITS/ETS dari total RNA manusia, tikus, dan mencit berdasarkan alur kerja berbasis RNase H dan untuk mempertahankan mRNA dan RNA non-coding lainnya. Kit ini cocok untuk sampel RNA utuh dan yang terdegradasi sebagian (misalnya, RNA FFPE). Karena sampel FFPE yang terdegradasi biasanya mengandung proporsi ITS/ETS yang lebih tinggi daripada sampel jaringan segar, kit ini menambahkan probe di wilayah 45S ITS/ETS Manusia, dan penghilangan ITS dapat secara signifikan meningkatkan proporsi data yang valid dalam data mentah.
Fitur
- Spesifisitas yang kuat: secara khusus menghilangkan rRNA dan ITS/ETS dari sampel manusia, terutama untuk sampel FFPE
- Kompatibilitas tinggi jumlah awal templat: berlaku untuk sampel 100 ng~1μg
- Efek penghapusan tinggi: untuk rRNA, ITS dan ETS dalam sampel manusia\tikus dan tikus, efek penghapusan lebih dari 95%
- Kualitas stabil: kinerja batch yang ketat dan kontrol kualitas stabilitas
Aplikasi
- Penelitian Ekspresi Gen
- Analisis penyambungan alternatif
- Deteksi dan penemuan RNA non-coding
- identifikasi situs poliadenilasi selektif
- Deteksi gen fusi
Spesifikasi
| Teknologi Penipisan | RNAse H (asam amino) |
| Jenis Sampel | Total RNA manusia, tikus dan mencit |
| Jenis Produk Akhir | mRNA dan RNA non-coding lainnya |
| Jumlah Reaksi | Persiapan 24/96 |
| Jumlah Bahan Awal | 100 ng~1 μg total RNA |
| Target | Hapus rRNA dan 45S ITS/ETS dari total RNA manusia |
Komponen
| Komponen No. | Nama | 12257ES24 (24T) | 12257ES96 (96T) |
| 12257-A | Penyangga Hibridisasi | 72 mikroliter | 288 mikroliter |
| 12257-B | Campuran Probe (rRNA & ITS/ETS) | 48 mikroliter | 192 mikroliter |
| 12257-C | Penyangga RNase H | 72 mikroliter | 288 mikroliter |
| 12257-D | RNAse H (asam amino) | 48 mikroliter | 192 mikroliter |
| 12257-E | Penyangga DNase I | 660 mikroliter | 2×1320 mikroliter |
| 12257-F | DNAse saya | 60 mikroliter | 240 mikroliter |
Pengiriman dan Penyimpanan
Semua komponen dikirim dengan es kering dan dapat disimpan pada suhu -15℃ ~ -25℃ selama satu tahun.
Angka
- Spesifisitas penghapusan rRNA
Untuk sampel konvensional, rRNA dan ITS/EST dapat dihilangkan hingga lebih dari 98%, sedangkan untuk sampel FFPE dengan integritas sekitar 50%, rRNA dan ITS/EST dapat dihilangkan hingga lebih dari 95%. Pada saat yang sama, FFPE dengan integritas yang buruk juga dapat dihilangkan secara efektif.
Tabel 1. Efek spesifisitas penghapusan rRNA
| RNA kualitas | Pemindahan skema | Masukan | RNA duta (%) | ITS/ETS (%) | Pemetaan (%) |
| 293T Asam amino esensial; RIN=10 | menghapus RNA-nya | 1 mikrogram | 0.19 | 4.6 | 98.28 |
| menghapus RNA-nya Dan ITS dan ETS | 1 mikrogram | 0,15 | 0,04 | 98.79 | |
| FFPE Asam amino esensial; DV200 =90% | menghapus RNA-nya | 500 ng | 0.23 | 4.75 | 95.35 |
| menghapus RNA-nya Dan ITS dan ETS | 500 ng | 0.21 | 0,02 | 95.42 | |
| FFPE Asam amino esensial; DV200 =50% | menghapus RNA-nya | 500 ng | 1.4 | 16.28 | 95.57 |
| menghapus RNA-nya Dan ITS dan ETS | 500 ng | 0.56 | 0.11 | 95.51 | |
| FFPE Asam amino esensial; DV200 =20% | menghapus RNA-nya | 1 mikrogram | 0.35 | 67.61 | 58.4 |
| menghapus RNA-nya Dan ITS dan ETS | 1 mikrogram | 0,79 | 0.84 | 60.35 |
Catatan: Sampel RNA manusia yang berbeda digunakan untuk menghilangkan rRNA atau rRNA dan ITS/ETS, dan untuk membuat pustaka dengan kit Persiapan pustaka RNA setelah ITS/ETS. Proporsi rRNA dan ITS/ETS dalam data offline dianalisis dengan pengurutan.
- Kinerja data sekuensing
Tabel 2.Kinerja data sekuensing
| Mencicipi | DV200 | Peralatan | Membersihkan Q20 (%) | Membersihkan Q30 (%) | Membersihkan Bahasa Inggris (%) | RNA-nya (%) | ITS dan ETS (%) | unik(%) |
| 1 | 24% | | 96.75 | 92.68 | 57.05 | 4.58 | 2.42 | 96.90 |
| 2 | 40% | 96.56 | 92.42 | 55.31 | 1.93 | 0.63 | 96.45 | |
| 3 | 53% | 97.4 | 93.52 | 45.19 | 0.23 | 0,01 | 98.08 | |
| 4 | 76% | 97.67 | 93.78 | 51.28 | 0.44 | 0,01 | 93.63 |
[1] Tian S, Zhang B, He Y, dkk. CRISPR-iPAS: metode baru berbasis dCAS13 untuk interferensi poliadenilasi alternatif. Nucleic Acids Res. 2022;50(5):e26. doi:10.1093/nar/gkac108(IF:16.971)
Pembayaran & Keamanan
Informasi pembayaran Anda diproses dengan aman. Kami tidak menyimpan detail kartu kredit atau memiliki akses ke informasi kartu kredit Anda.
Pertanyaan
Anda mungkin juga menyukai
FAQ
Produk ini hanya untuk keperluan penelitian dan tidak ditujukan untuk penggunaan terapeutik atau diagnostik pada manusia atau hewan. Produk dan konten dilindungi oleh paten, merek dagang, dan hak cipta milik
Aplikasi tertentu mungkin memerlukan hak kekayaan intelektual pihak ketiga tambahan.