Aerosolverontreiniging in de operationele omgeving als meest voorkomende oorzaak van vals-positieve resultaten in PCR-resultaten: de baanbrekende ontdekking van uracil-DNA-glycosylase (UDG) door de Amerikaanse wetenschapper Lindahl in E. coli en Bacillus subtilis, en de oprichting van een systeem ter voorkoming van PCR-verontreiniging door het gebruik van UDG-enzym met dUTP.

De commercieel verkrijgbare UDG-enzymen bestaan ​​voornamelijk uit twee typen: de reguliere UDG-enzymen afkomstig van Escherichia coli en Bacillus subtilis, en de thermolabiele UDG-enzymen afkomstig van psychrofiele mariene bacteriën. De reguliere UDG-enzymen vertonen een grotere hittebestendigheid en behouden een kleine hoeveelheid uracil-DNA-glycosylase-activiteit, zelfs na behandeling bij 95 °C gedurende 10 minuten, wat kan leiden tot de afbraak van doelamplificatieproducten die dU bevatten. Bovendien is er, vanwege het gebruik van gemanipuleerde bacteriestammen (zoals E. coli) voor de recombinante expressie van moleculaire enzymen, een bepaalde hoeveelheid resterend gastheergenoom-DNA in deze enzymen. In combinatie met de invloeden van de productieomgeving en menselijke bronnen zijn moleculaire enzymproducten zeer gevoelig voor DNA-verontreiniging. Tijdens de detectie van pathogenen kan verontreinigend DNA ofwel doelwitnucleïnezuren met een lage overvloed maskeren of ernaast worden gedetecteerd, wat de interpretatie van de resultaten beïnvloedt.

Yeasen UCF.ME Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), hittelabiel

Beschrijving

De UCF.ME Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), hittelabiel, 1 U/μL (Cat#14466ES) afgeleid van psychrofiele mariene bacteriën, is het een ultra-laag resterend hitte-labiel UDG-enzym dat bekend staat als UCF.ME. Het gebruik van dit product kan voorkomen dat de restactiviteit van conventionele UDG-enzymen na inactivering dU-bevattende amplificatieproducten afbreekt bij kamertemperatuur. Het voorkomt ook dat achtergrondbacteriën die aanwezig zijn in moleculaire enzymen vals-positieve resultaten veroorzaken in PCR-resultaten. Daarom is de introductie van UCF.ME® ultra-laag resterend thermolabiel UDG-enzym cruciaal voor het nauwkeurig identificeren van infectieuze pathogenen en het helpen bij de klinische diagnose van infecties en infectieziekten.

Productvoordelen

  • Ultra-lage rest van UCF.ME—E. coli genomische DNA-residu <0,1 kopieën/E;
  • Laag nucleaseresidu: geen resterend exonuclease, nicking-enzym of RNase;
  • Sterk verteringsvermogen: 0,05 U/T kan 105 kopieën/T dU-DNA-producten verteren;
  • Goede thermolabiliteit: volledige inactivering onder alle omstandigheden van 50°C gedurende 10 minuten, 55°C gedurende 5 minuten of 95°C gedurende 5 minuten;
  • Compatibel met RT-qPCR-reactiesystemen: geen invloed op het detectiesysteem, zelfs niet bij hoge invoerniveaus (2U/20μL-reactiesysteem).

(1) Eiwitzuiverheid ≥95%

Figuur 1. Resultaten van detectie van eiwitzuiverheid (SDS-PAGE)

(2) Lage restnucleasen: geen restexonucleasen, nicking-enzymen of RNasen

Figuur 2. Resultaten van de nucleaseresidutest

(3) E. coli genomische DNA-residu < 0,1 kopieën/E, de residuniveaus waren aanzienlijk lager dan bij het conventionele reagens

Figuur 3. Resultaten van E.coli genomische DNA-residutest

(4) Hoge verteringscapaciteit: 0,05 U/T is voldoende om 10^5 kopieën/T dU-DNA-producten te verteren.

Figuur 4. Een totaal van 0,05 U UDG-enzym kan 10^5 kopieën/T dU-DNA-producten volledig verteren.

(5) Het spijsverteringsvermogen is sterk: 0,05 U/T is voldoende om 10^5 kopieën/T van dU-DNA-producten te verteren.

    Figuur 5. Na een hitte-inactivatiebehandeling van 50℃,10min;55℃,5min; 55℃,10min;95℃,5min verloor 14466ES zijn spijsverteringsvermogen.

    (6) Compatibel met het RT-qPCR-reactiesysteem, zonder invloed op het detectiesysteem, zelfs bij hoge invoerniveaus (2U/T).

    Figuur 6. RT-qPCR-mix werd bereid met behulp van twee priming-probes van de ORF1ab- en N-genen en 14466ES. Toen 14466ES in het reactiesysteem werd geïnjecteerd in een hoeveelheid van 2U/20μL, was er geen remming van RT-qPCR reactie.

    Productaanbeveling — Ultra-Low Residual PCR Enzyme Raw Materials-serie

    Productpositionering

    Productnaam

    Kat

    Besmettingsvoorkomende hitte-labiele UDG

    UCF.ME Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), hittelabiel, 1 U/μL

    14466ES

    Hete start Taq DNA-polymerase

    Hieff UCF.ME Hotstart-gevoelige Taq DNA-polymerase (5 U/μL)

    14314ES

    Omgekeerde transcriptase

    Hifair UCF.ME V Reverse Transcriptase (200 U/μL)

    14608ES

    Muizen RNase-remmer

    UCF.ME Muizen RNase-remmer (40 U/μL)

    14672ES

    Inquiry