อะกาโรสเป็นคอลลอยด์กาแลกแทนเชิงเส้นที่บริสุทธิ์ซึ่งมีคุณสมบัติชอบน้ำ สกัดจากสาหร่ายทะเลที่ประกอบด้วยอะการ์หรือวุ้น โครงสร้างของอะกาโรสเป็นพอลิเมอร์เชิงเส้นที่ประกอบด้วย β-D-กาแลกโตไพรานอซิล (1-4) ที่เชื่อมกับกาก 3,6-แอนไฮโดร-α-L-กาแลกโตไพรานอซิล อะกาโรสเป็นรีเอเจนต์เจลที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์กรดนิวคลีอิกตามปกติโดยใช้อิเล็กโทรโฟรีซิสเจลหรือวิธีการบล็อต (เช่น อะกาโรสเหนือหรืออะกาโรสใต้) และยังเหมาะสำหรับการใช้งานโปรตีน เช่น การทดลองการแพร่กระจายภูมิคุ้มกันแบบรัศมี (RID)
การวิเคราะห์ด้วยอิเล็กโทรโฟรีซิสแบบเจลอะกาโรสเป็นวิธีการวิเคราะห์ด้วยอิเล็กโทรโฟรีซิสที่ใช้อะกาโรสเป็นตัวกลางรองรับ รวมถึงการเตรียมเจล การโหลดตัวอย่าง และอิเล็กโทรโฟรีซิส ความแตกต่างหลักระหว่างหลักการวิเคราะห์กับอิเล็กโทรโฟรีซิสแบบวัสดุรองรับอื่นๆ คือ อิเล็กโทรโฟรีซิสแบบเจลมีหน้าที่ 2 อย่าง คือ "ตะแกรงโมเลกุล" และ "อิเล็กโทรโฟรีซิส" เมื่อวางเจลในสนามไฟฟ้า กรดนิวคลีอิกที่มีประจุจะเคลื่อนที่ผ่านรูพรุนของเจลไปยังขั้วบวก หลังจากการวิเคราะห์ด้วยอิเล็กโทรโฟรีซิสภายใต้เงื่อนไขต่างๆ เป็นระยะเวลาที่เหมาะสม เศษกรดนิวคลีอิกที่มีขนาดและโครงสร้างต่างกันจะอยู่ในตำแหน่งต่างๆ ในเจล จึงสามารถแยกตัวออกจากกันได้
รูปที่ 1 ขั้นตอนการปฏิบัติการทดลองอิเล็กโทรโฟรีซิสกรดนิวคลีอิก

รูปที่ 2 แผนภาพทิศทางการเคลื่อนที่ของอิเล็กโทรโฟเรซิส
เลือกอะกาโรสให้เหมาะสมอย่างไร?
ตัดสินโดยพิจารณาจากพารามิเตอร์พื้นฐานของอะกาโรส:
- ปริมาณซัลเฟต — ตัวบ่งชี้ความบริสุทธิ์
- ความแข็งแรงของเจล — แรงภายนอกที่จำเป็นเพื่อทำให้เจลแตก
- จุดเจล — อุณหภูมิที่สารละลายอะกาโรสที่ละลายน้ำได้จะกลายเป็นเจลเมื่อเย็นตัวลง
- อิเล็กโตรเอนโดสโมซิส (EEO) — การเคลื่อนไหวทางไฟฟ้าจลนศาสตร์ประเภทหนึ่งที่ของเหลวจะแทรกซึมเข้าไปในเจล กลุ่มแอนไออนิกภายในเจลอะกาโรสจะดูดซับลงบนเมทริกซ์และไม่เคลื่อนที่ แต่ไอออนบวกที่แตกตัวจะเคลื่อนที่ไปทางขั้วลบ จึงทำให้เกิดอิเล็กโตรออสโมซิส เนื่องจากการเคลื่อนตัวทางอิเล็กโตรโฟเรซิสของตัวอย่างมักจะเคลื่อนที่ไปทางขั้วบวก การพาความร้อนภายในที่เกิดจาก EEO อาจรบกวนประสิทธิภาพการแยกตัว โดยอิงตามพารามิเตอร์พื้นฐานของอะกาโรส เจลอะกาโรสคุณภาพสูงควรมีรูพรุนใส มีโอกาสแตกน้อยกว่า และมีลักษณะ เช่น ความบริสุทธิ์สูง (มีปริมาณซัลเฟตต่ำ) ความแข็งแรงของเจลสูง จุดเจลค่อนข้างสูง (แข็งตัวเร็วที่อุณหภูมิห้อง) และ EEO ต่ำ
ตัดสินโดยพิจารณาจากช่วงการแยกของอะกาโรส:
เจลอะกาโรสมีช่วงการแยกที่กว้างและมักใช้สำหรับการกู้คืนเจลดีเอ็นเอ การแยกดีเอ็นเอ และเพื่อยืนยันว่าดีเอ็นเอถูกรวมเข้าด้วยกันหรือไม่ และพลาสมิดและสิ่งที่คล้ายกันถูกตัดเปิดหรือไม่ ขนาดที่แตกต่างกันของชิ้นส่วนเป้าหมายสอดคล้องกับความเข้มข้นของอะกาโรสที่แตกต่างกัน ตามหลักการที่ว่าความเข้มข้นสูงเหมาะสำหรับการแยกชิ้นส่วนขนาดเล็ก คุณสามารถดูตารางต่อไปนี้เพื่อค้นหาความเข้มข้นของเจลที่เหมาะสมที่สุดสำหรับความต้องการของคุณ
ความเข้มข้นของอะกาโรส --- | ≥3 | 2-3 | 1-2 | 0.7-1 | ≤0.7 |
ขนาดของชิ้นส่วน DNA (bp) | ≤200 | 200-700 | 700-1500 | 1500-5000 | ≥5000 |

ชื่อสินค้า | หมายเลขสินค้า | ข้อมูลจำเพาะผลิตภัณฑ์ | สถานการณ์การใช้งาน |
10208ES60/76 | 100กรัม / 500กรัม | การวิเคราะห์กรดนิวคลีอิกแบบปกติ |
ข้อดีของผลิตภัณฑ์
ค่าอิเล็กโทรเอนโดสโมซิสต่ำ (EEO ≤ 0.13) ส่งผลให้แยกแบนด์ได้ดีเยี่ยม มีความแตกต่างชัดเจน และมีการโยกย้ายที่รวดเร็วยิ่งขึ้น
รูพรุนของเจลมีลักษณะใสและตรง โดยมีความแข็งแรงของเจลสูง และมีแนวโน้มที่จะแตกน้อยลง
วิธีการใช้อะกาโรสคุณภาพสูง
โดยทั่วไปความเข้มข้นของเจลอะกาโรสจะอยู่ระหว่าง 0.7% ถึง 2% ยิ่งความเข้มข้นสูง ขนาดของรูพรุนของโมเลกุลเจลก็จะเล็กลง อัตราการอพยพของดีเอ็นเอจะช้าลง และความละเอียดก็จะสูงขึ้น ในทางกลับกัน ยิ่งความเข้มข้นต่ำ อัตราการอพยพของดีเอ็นเอจะเร็วขึ้น และความละเอียดก็จะต่ำลง เลือกความเข้มข้นของเจลที่เหมาะสมและบัฟเฟอร์อิเล็กโทรโฟรีซิสที่เข้ากันได้ตามวัตถุประสงค์การทดลองที่แตกต่างกัน
ความเข้มข้นของอะกาโรส | ช่วงการแยกที่มีประสิทธิภาพ (bp) | บัฟเฟอร์ที่แนะนำ |
0.5% | 2,000-50,000 | 1×ทีเออี |
0.8% | 800-10,000 | 1×ทีเออี |
1.0% | 400-8,000 | 1×ทีเออี |
1.2% | 300-7,000 | 1×ทีเออี |
1.5% | 200-3,000 | 1×TAE/0.5×TBE |
2.0% | 100-2,000 | 1×TAE/0.5×TBE |
3.0% | 25-1,000 | 0.5×ทีบีอี |
วรรณกรรมตีพิมพ์ (บางส่วน)
- Li Z, Wang M, Fang H และคณะ การดูดซับพลาสมิดที่ต้านทานยาปฏิชีวนะจากอินเทอร์เฟซของแข็งและของเหลวที่เกิดจากนาโนพลาสติกทำให้มลพิษทางยีนในระบบนิเวศทางน้ำรุนแรงขึ้น Environ Pollut. 2023. doi:10.1016/j.envpol.2022.120456ถ้า=10.366(10208ES)
- Wang M, Zhang S, Zheng G และคณะ การกลายพันธุ์ของ Card14 ที่ทำให้ฟังก์ชันการทำงานเพิ่มขึ้น ทำให้เกิดการอักเสบของผิวหนังแบบสะเก็ดเงินโดยธรรมชาติผ่านการตอบสนองของเซลล์เคอราติโนไซต์ที่เพิ่มขึ้นต่อ IL-17A ภูมิคุ้มกัน 2018;49(1):66-79.e5 doi:10.1016/j.immuni.2018.05.012ถ้า=19.734
- Zhang Y, Ding H, Wang X และคณะ MK2 ส่งเสริมการย่อยสลาย Tfcp2l1 ผ่าน β-TrCP ubiquitin ligase เพื่อควบคุมการต่ออายุเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อนของหนู Cell Rep. 2021;37(5):109949. doi:10.1016/j.celrep.2021.109949ถ้า=9.423
- Zhu Z, Zhang L, Sheng R, Chen J. ระบบนาโนส่งมอบ siRNA คอเลสเตอรอลลิปิดประจุบวกแบบไมโครฟลูอิดิก: การปิดยีนในหลอดทดลองที่มีประสิทธิภาพสูง และพฤติกรรมภายในเซลล์ Int J Mol Sci. 2022;23(7):3999. เผยแพร่เมื่อวันที่ 3 เมษายน 2022 doi:10.3390/ijms23073999ถ้า=19.924
- Zhao C, Yang D, Ye Y และคณะ การยับยั้ง Pim-2 kinase โดย LT-171-861 ส่งเสริมความเสียหายต่อ DNA และแสดงผลการตายที่เพิ่มขึ้นด้วยสารยับยั้ง PARP ในมะเร็งไมอีโลม่าหลายแห่ง Biochem Pharmacol 2021;190:114648 doi:10.1016/j.bcp.2021.114648ถ้า=5.858
- Yu J, Yang W, Xing S และคณะ ทองคำผสม/MnO2@BSA nanoอนุภาคสำหรับการกำหนดกรดแอสคอร์บิกด้วยฟลูออโรเมตริกและเรโซแนนซ์แม่เหล็ก Mikrochim Acta. 2019;186(2):89 เผยแพร่เมื่อวันที่ 10 มกราคม 2019 doi:10.1007/s00604-018-3205-8ถ้า=5.479
- เจิ้ง เอ็กซ์, ซู ดับเบิลยู, ซุน อาร์, หยิน เอช, ตง ซี, เจิ้ง เอช. การทำงานร่วมกันระหว่างเอทาเซเลนซึ่งเป็นสารยับยั้งเอนไซม์ไทโอรีดอกซินรีดักเตสและโซเดียมซีเลไนต์ในการยับยั้งการแพร่กระจายและเหนี่ยวนำการตายของเซลล์มะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์เล็กในมนุษย์ Chem Biol Interact. 2017;275:74-85. doi:10.1016/j.cbi.2017.07.020.ถ้า=5.194
- Zhou J, Xiong R, Zhou J และคณะ การมีส่วนร่วมของปัจจัยควบคุม m6A IGF2BP1 ในการเปลี่ยนแปลงของเซลล์เยื่อบุหลอดลม Beas-2B ของมนุษย์ที่ก่อให้เกิดมะเร็งซึ่งเกิดจากสารก่อมะเร็ง NNK ในยาสูบ Toxicol Appl Pharmacol 2022;436:115849 doi:10.1016/j.taap.2021.115849ถ้า=5.219
- Zhou Y, Liu J, Cai S, Liu D, Jiang R, Wang Y. ผลการป้องกันของจินเซนโนไซด์ Rg1 ต่อเซลล์เม็ดเลือด Sca-1⁺ ที่กำลังแก่ชรา Mol Med Rep. 2015;12(3):3621-3628. doi:10.3892/mmr.2015.3884.ถ้า=5.952
คู่มือการเลือกผลิตภัณฑ์ที่เกี่ยวข้อง
การวางตำแหน่งผลิตภัณฑ์ | ชื่อสินค้า | หมายเลขสินค้า | ข้อมูลจำเพาะผลิตภัณฑ์ | สถานการณ์การใช้งาน |
คราบกรดนิวคลีอิก | 10202ES76 | 500 ไมโครลิตร | ละลายน้ำได้ โดยมีลักษณะสเปกตรัมเดียวกับ EB ตรวจพบภายใต้การกระตุ้นด้วยแสง UV 300 นาโนเมตร | |
เครื่องหมายดีเอ็นเอ | 10501ES60/80 | 100 ตัน/10×100 ตัน | 100-2000 บ. | |
เครื่องหมายดีเอ็นเอ GoldBand DL5000 | 10504ES60/80 | 100 ตัน/10×100 ตัน | 100-5000 บ. | |
10507ES60/80 | 100 ตัน/10×100 ตัน | 100-1,500 คู่ | ||
10510ES60/80 | 100 ตัน/10×100 ตัน | 250-12,000 คู่ |