คำอธิบาย
ไฮฟ์ เอ็นจีเอส™ ชุด MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) ได้รับการออกแบบมาเพื่อกำจัด rRNA และ 45S ITS/ETS จาก RNA ทั้งหมดของมนุษย์ หนู และหนูตะเภา โดยอาศัยเวิร์กโฟลว์ตาม RNase H และเพื่อเก็บรักษา mRNA และ RNA ที่ไม่เข้ารหัสอื่นๆ ชุดนี้เหมาะสำหรับตัวอย่าง RNA ทั้งที่สมบูรณ์และที่ย่อยสลายบางส่วน (เช่น FFPE RNA) เนื่องจากตัวอย่าง FFPE ที่ย่อยสลายมักมี ITS/ETS ในสัดส่วนที่สูงกว่าตัวอย่างเนื้อเยื่อสด ชุดอุปกรณ์นี้จึงเพิ่มโพรบในบริเวณ 45S ITS/ETS ของมนุษย์ และการกำจัด ITS สามารถเพิ่มสัดส่วนของข้อมูลที่ถูกต้องในข้อมูลดิบได้อย่างมาก
คุณสมบัติ
- ความจำเพาะเจาะจงสูง: กำจัด rRNA และ ITS/ETS ออกจากตัวอย่างของมนุษย์โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับตัวอย่าง FFPE
- ความเข้ากันได้สูงของปริมาณเริ่มต้นเทมเพลต: ใช้ได้กับตัวอย่าง 100 ng~1μg
- ผลการกำจัดสูง: สำหรับ rRNA, ITS และ ETS ในตัวอย่างมนุษย์ หนู และหนูทดลอง ผลการกำจัดสูงกว่า 95%
- คุณภาพเสถียร: ประสิทธิภาพการทำงานแบบแบตช์ที่เข้มงวดและการควบคุมคุณภาพที่เสถียร
แอปพลิเคชั่น
- การวิจัยการแสดงออกของยีน
- การวิเคราะห์การตัดต่อทางเลือก
- การตรวจจับและการค้นพบ RNA ที่ไม่เข้ารหัส
- การระบุตำแหน่งโพลีอะดีไนเลชันแบบเลือก
- การตรวจจับยีนฟิวชัน
ข้อมูลจำเพาะ
| เทคโนโลยีการลดลง | อาร์เอ็นเอส เอช |
| ประเภทตัวอย่าง | ปริมาณ RNA ทั้งหมดของมนุษย์ หนู และหนูตะเภา |
| ประเภทผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย | mRNA และ RNA ที่ไม่เข้ารหัสอื่น ๆ |
| จำนวนปฏิกิริยา | เตรียมพร้อม 24/96 |
| ปริมาณวัสดุเริ่มต้น | 100 นาโนกรัม ~ 1 ไมโครกรัม RNA ทั้งหมด |
| เป้า | กำจัด rRNA และ 45S ITS/ETS ออกจาก RNA ทั้งหมดของมนุษย์ |
ส่วนประกอบ
| ส่วนประกอบ หมายเลข | ชื่อ | 12257ES24 (24ต) | 12257ES96 (96ต) |
| 12257-ก | บัฟเฟอร์ไฮบริดิเซชัน | 72 ไมโครลิตร | 288 ไมโครลิตร |
| 12257-ข | โพรบมิกซ์ (rRNA และ ITS/ETS) | 48 ไมโครลิตร | 192 ไมโครลิตร |
| 12257-ซี | บัฟเฟอร์ RNase H | 72 ไมโครลิตร | 288 ไมโครลิตร |
| 12257-ง | อาร์เอ็นเอส เอช | 48 ไมโครลิตร | 192 ไมโครลิตร |
| 12257-อี | บัฟเฟอร์ DNase I | 660 ไมโครลิตร | 2×1320 ไมโครลิตร |
| 12257-ฟ. | ดีเอ็นเอส ไอ | 60 ไมโครลิตร | 240 ไมโครลิตร |
การขนส่งและการเก็บรักษา
ส่วนประกอบทั้งหมดจะถูกจัดส่งพร้อมกับน้ำแข็งแห้งและสามารถจัดเก็บที่อุณหภูมิ -15℃ ~ -25℃ ได้นานหนึ่งปี
ตัวเลข
- ความจำเพาะในการกำจัด rRNA
สำหรับตัวอย่างทั่วไป สามารถกำจัด rRNA และ ITS/EST ได้มากกว่า 98% ในขณะที่ตัวอย่าง FFPE ที่มีความสมบูรณ์ประมาณ 50% สามารถกำจัด rRNA และ ITS/EST ได้มากกว่า 95% ในขณะเดียวกัน FFPE ที่มีความสมบูรณ์ต่ำก็สามารถกำจัดได้อย่างมีประสิทธิภาพเช่นกัน
ตารางที่ 1 ผลความจำเพาะของการกำจัด rRNA
| อาร์เอ็นเอ คุณภาพ | การถอดถอน แผนการ | ป้อนข้อมูล | rRNA (%) | ไอทีเอส/อีทีเอส (%) | การทำแผนที่ (%) |
| 293ที อาร์เอ็นเอ; ริน=10 | ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ | 1 ไมโครกรัม | 0.19 | 4.6 | 98.28 |
| ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ และ ไอทีเอส/อีทีเอส | 1 ไมโครกรัม | 0.15 | 0.04 | 98.79 | |
| เอฟเอฟพีอี อาร์เอ็นเอ; ดีวี200 =90% | ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ | 500 นาโนกรัม | 0.23 | 4.75 | 95.35 |
| ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ และ ไอทีเอส/อีทีเอส | 500 นาโนกรัม | 0.21 | 0.02 | 95.42 | |
| เอฟเอฟพีอี อาร์เอ็นเอ; ดีวี200 =50% | ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ | 500 นาโนกรัม | 1.4 | 16.28 | 95.57 |
| ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ และ ไอทีเอส/อีทีเอส | 500 นาโนกรัม | 0.56 | 0.11 | 95.51 | |
| เอฟเอฟพีอี อาร์เอ็นเอ; ดีวี200 =20% | ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ | 1 ไมโครกรัม | 0.35 | 67.61 | 58.4 |
| ลบ อาร์อาร์เอ็นเอ และ ไอทีเอส/อีทีเอส | 1 ไมโครกรัม | 0.79 | 0.84 | 60.35 |
หมายเหตุ: ตัวอย่าง RNA ของมนุษย์ที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้เพื่อกำจัด rRNA หรือ rRNA และ ITS/ETS และเพื่อสร้างไลบรารีด้วยชุดเตรียมไลบรารี RNA หลังจาก ITS/ETS สัดส่วนของ rRNA และ ITS/ETS ในข้อมูลออฟไลน์ได้รับการวิเคราะห์ด้วยการจัดลำดับ
- ประสิทธิภาพของข้อมูลการเรียงลำดับ
ตารางที่ 2.ประสิทธิภาพของข้อมูลการเรียงลำดับ
| ตัวอย่าง | ดีวี200 | ชุด | ทำความสะอาด คำถามที่ 20 - | ทำความสะอาด คำถามที่ 30 - | ทำความสะอาด จีซี - | อาร์อาร์เอ็นเอ - | ไอทีเอส/อีทีเอส - | มีเอกลักษณ์(%) |
| 1 | 24% | | 96.75 | 92.68 | 57.05 | 4.58 | 2.42 | 96.90 |
| 2 | 40% | 96.56 | 92.42 | 55.31 | 1.93 | 0.63 | 96.45 | |
| 3 | 53% | 97.4 | 93.52 | 45.19 | 0.23 | 0.01 | 98.08 | |
| 4 | 76% | 97.67 | 93.78 | 51.28 | 0.44 | 0.01 | 93.63 |
[1] Tian S, Zhang B, He Y และคณะ CRISPR-iPAS: วิธีการใหม่ที่ใช้ dCAS13 สำหรับการรบกวนโพลีอะดีไนเลชันทางเลือก Nucleic Acids Res. 2022;50(5):e26. doi:10.1093/nar/gkac108(IF:16.971)
การชำระเงินและความปลอดภัย
ข้อมูลการชำระเงินของคุณได้รับการดำเนินการอย่างปลอดภัย เราไม่เก็บรายละเอียดบัตรเครดิตและไม่สามารถเข้าถึงข้อมูลบัตรเครดิตของคุณได้
การสอบถาม
คุณอาจชอบ
คำถามที่พบบ่อย
ผลิตภัณฑ์นี้มีวัตถุประสงค์เพื่อการวิจัยเท่านั้น และไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้ในการรักษาหรือวินิจฉัยโรคในมนุษย์หรือสัตว์ ผลิตภัณฑ์และเนื้อหาได้รับการคุ้มครองโดยสิทธิบัตร เครื่องหมายการค้า และลิขสิทธิ์ที่เป็นของ
แอปพลิเคชั่นบางตัวอาจต้องใช้สิทธิ์ในทรัพย์สินทางปัญญาของบุคคลที่สามเพิ่มเติม