Afrika Domuz Vebası Virüsü - Toplam Ana Karışım/Doğrudan Amplifikasyon qPCR Çözümü
Afrika domuz ateşi (ASF), evcil domuzları veya yaban domuzlarını enfekte eden Afrika domuz ateşi virüsü (ASFV) tarafından meydana getirilen akut, şiddetli ve oldukça bulaşıcı bir bulaşıcı hastalıktır. Morbiditesi ve mortalitesi %100'e ulaşabilir, küresel domuz endüstrisini ciddi şekilde tehlikeye atabilir ve hesaplanamaz ekonomik kayıplara neden olabilir. Dünya Hayvan Sağlığı Örgütü (OIE) bunu raporlanması gereken bir hayvan hastalığı olarak listeler.
Şu anda Afrika domuz ateşi için bir aşı veya etkili bir tedavi bulunmamaktadır. Hastalığın yayılmasını önlemek için Afrika domuz ateşinin laboratuvar tanı yöntemleriyle hızlı ve doğru bir şekilde teşhis edilmesi hayati önem taşımaktadır. OIE, ASF'nin rutin tanısı için ana araç olarak qPCR'yi önermektedir.
Yeasen, IVD hammaddeleri Ar-Ge'sinde zengin deneyime sahip bir üreticidir. Afrika domuz ateşi karşısında yeasen olumlu yanıt verir ve müşterileriyle işbirliği yaparak ekstraksiyondan Afrika domuz ateşi virüsünün tespitine kadar üç tam süreç çözümü geliştirir. Peki üç çözüm nedir? Ve bu çözümlerin uygulamaları nelerdir? Okumaya devam edin...
Şekil 1. Yeasen Afrika Domuz Vebası tespit çözümleri
Çözüm I: TaqMan Multiplex qPCR Master Mix (UDG plus)(sorgu)
Yeasen'in TaqMan Multiplex qPCR Master Mix'i (UDG plus) (Cat#13171), enzim karışımı, Mg2+, dNTP'ler ve tampon içeren ASFV tespiti için optimize edilmiş master mix'tir. Master mix, amplifikasyon adımında kullanılır ve primerler ve problar eklenerek önceden karıştırılmış çözelti olarak yapılandırılır. Master mix, spesifik olmayan PCR amplifikasyonunu etkili bir şekilde engelleyebilen ve amplifikasyon verimliliğini 4-pleks'e çıkarabilen faktörlerle tasarlanmıştır.
Ürün Özellikleri
👍UDG kirlilik önleme sistemi, aerosol kontaminasyonu riskini etkili bir şekilde önler
👍Önceden karıştırılmış PCR solüsyonunun (ana karışım + primerler + problar) oda sıcaklığında uzun vadeli kararlılığı, tespit zorluğunu büyük ölçüde basitleştirir
👍Yüksek amplifikasyon verimliliği ve iyi tekrarlanabilirlik
👍Çoklu platform ve çoklu sistem için uygundur
Vaka Gösterimi
👉Önceden karıştırılmış PCR solüsyonunun uzun vadeli kararlılığı
Cat#13171, ASF plazmid sisteminin amplifikasyonunda 7 gün boyunca 37°C'ye yerleştirilebilen ve 15 kez tekrarlanan dondurma ve çözme işlemi uygulanabilen önceden karıştırılmış PCR solüsyonunu yapılandırmak için kullanıldı. Sonuçlar, PCR solüsyonunun Ct değerinin ve duyarlılığının 7 gün boyunca 37℃'ye yerleştirildikten sonra önemli ölçüde değişmediğini ve Ct değerinin 15 kez tekrarlanan dondurma ve çözme işleminden sonra önemli ölçüde değişmediğini gösterdi.
Şekil 2. Cat#13171 TaqMan Multiplex qPCR Ana Karışımı (UDG artı)Soruşturma) ASF plazmid sisteminin amplifikasyonunda uzun vadeli stabiliteye sahip önceden karıştırılmış PCR solüsyonunda kullanılır. 2A-Ct değeri 37℃'de 0 gün ve 7 gün 2B-Duyarlılık 37℃'de 0 gün ve 7 gün 2C-Dondurma-çözme işleminden sonra 15 kez stabilite
👉Kararlı ve Tekrarlanabilir Reaktifler
ASFV plazmid sistemi amplifikasyon deneyini 20 kez tekrarlamak için Cat#13171'in dört farklı partisi seçildi. Ct değerlerinde anlamlı bir fark yoktu ve CV %1'den azdı.
Şekil 3.Yeasen Cat#13171'in tekrarlanabilirlik testi
👉Çoklu platform çoklu sistem uygulanabilir
Yeasen Cat#13171, sırasıyla Bio-Rad CFX96, ABI Q5 ve Slan platformlarında Afrika domuz ateşi ASFV/ACT ikili plazmidlerini çoğaltmak için kullanıldı. Yeasen Cat#13171'in çeşitli tipteki cihazlar için uygun olduğu ve verilerin güvenilir ve kararlı olduğu görülebilir.
Şekil 4. Bio-Rad CFX96 Gerçek Zamanlı PCR Sistemi
Şekil 5. ABI Q5 Gerçek Zamanlı PCR Sistemi
Şekil 6. Slan Gerçek Zamanlı PCR Sistemi
Çözüm II:Evrensel TaqMan multipleks qPCR ana karışımı
Yeasen'in Evrensel TaqMan multipleks qPCR ana karışımı (Cat#11211), antikor modifiyeli Hot-Start Taq DNA polimeraz ve eşleştirilmiş multipleks tamponu kullanılarak düşük konsantrasyonlu şablonların verimli amplifikasyonu için derinlemesine optimize edilmiştir. Bu ürün, tek tüpte 4-plex PCR reaksiyonlarına kadar destekler ve genotipleme ve multipleks qPCR analizi için idealdir.
Ürün Özellikleri
👍Kan kirliliklerine karşı güçlü tolerans, Yeasen nükleik asit ekstraksiyon reaktifi Cat#13720 Nükleik Asit Salınım Reaktifi V2 ile kullanılabilir, doğrudan qPCR için idealdir
👍Reaksiyon başına 3 kopyaya kadar ultra yüksek hassasiyet, tespit doğruluğunu büyük ölçüde artırır
👍Önceden karıştırılmış PCR solüsyonunun (ana karışım + primerler + problar) oda sıcaklığında uzun vadeli kararlılığı, tespit zorluğunu büyük ölçüde basitleştirir
Vaka Gösterimi
👉Kandaki kirliliklere karşı güçlü tolerans
Diğer markaların benzer ürünleriyle karşılaştırıldığında, Yeasen Cat#11211 kan örneklerinde inhibitörlere karşı daha yüksek bir toleransa sahiptir. Sonuçlar, Yeasen Cat#11211'in EDTA ve sodyum sitrata karşı yüksek bir toleransa sahip olduğunu ve %0,5 tam kana dayanabildiğini göstermiştir.
Şekil 7. Cat#11211 Evrensel TaqMan multipleks qPCR ana karışımı ve çeşitli markaların ana karışımları, sırasıyla 3 mM EDTA (3A), 6 mM sodyum sitrat (3B), %0,5 kan (3C) ile desteklenmiş ASF qPCR solüsyonları için kullanılır.
👉Reaksiyon başına 3 kopyaya kadar ultra yüksek hassasiyet
ASFV plazmidinin 20 tekrarla amplifikasyonu farklı markalardan gelen ürünlere dayanarak gerçekleştirildi. Deney sonuçları Yeasen ürünlerinin tespit oranının daha yüksek olduğunu göstermektedir.
Şekil 8. Farklı markalara ait benzer ürünler arasındaki tespit oranlarının karşılaştırılması (son sistemde 3 kopya)
👉Uzun vadeli stabilite, oda sıcaklığında 7 gün boyunca stabildir
ASFV/ACT ikili plazmid sisteminin PCR çözeltisi 4℃, 25℃ ve 37℃'de 7 gün sonra stabil performansını koruyabilir. Ct değerinin ve floresan değerinin önemli ölçüde değişmediği görülebilir.
Şekil 9. PCR solüsyonunun stabilitesi
Çözüm III: İzotermal Amplifikasyon
Yeasen'in ürünleri, ASF tespitinin daha hızlı ve daha verimli bir şekilde gerçekleştirilmesine yardımcı olan izotermal amplifikasyon teknolojisini destekliyor. Katalog No: 14402 Hieff™ Bst Plus DNA Polimeraz (40 U/μL) Termofilik Geobacillus sp DNA Polimeraz I'den türetilmiştir, 5'-3' ekzonükleaz aktivitesinden yoksundur. Bu ürün daha güçlü 5'-3' DNA polimeraz aktivitesine, iplik yer değiştirme aktivitesine ve dUTP toleransına sahiptir, bu da LAMP, CPA vb. gibi kirlilik karşıtı izotermal amplifikasyon reaksiyonları için daha uygundur.
Ürün Özellikleri
👍Yüksek amplifikasyon verimliliği
👍Yüksek Verimli Amplifikasyon
👍dUTP toleransı, Cat#10303 Urasil DNA Glikosilaz (UDG/UNG) ile birlikte kullanılabilirSoruşturma), ısıya duyarlı, aerosol kontaminasyon riskini önlemek için 1 U/μL
Vaka Gösterimi
👉İthal markalı N* ürünlerine üstün alternatif
Amplifikasyon işlemi sırasıyla Yeasen ve N* Company'den Bst DNA polimerazı kullanılarak gerçekleştirildi. Farklı markalar arasında Ct değeri ve floresan yoğunluğunda anlamlı bir fark yoktu.
Şekil 10. Farklı markaların amplifikasyon eğrileri
Ürün siparişi
Yeasen, yukarıdaki üç solüsyonda ASFV'nin tespiti için çeşitli ürünler sağlar. Açıklanan ürünler ve ilgili ürünler aşağıdaki tabloda listelenmiştir. Lütfen ihtiyaçlarınıza göre uygun tespit yöntemini ve optimum ürünleri seçin.
Kategori | Ürün Açıklaması | Ürün Adı | Stok Kodu |
Çıkarma | Manyetik boncuk çıkarma | Nükleik Asit Salınım Reaktifi V2 (Soruşturma) | 13720ES |
qPCR Karışımı | Premix kararlı | Hieff Unicon™ TaqMan Multiplex qPCR Ana Karışımı (UDG artı)Soruşturma) | 13171ES |
Yüksek hassasiyet | 11211ES | ||
Enzim ve Antikor | Tak | Hieff UNICON™ HotStart Direct Taq DNA PolimerazıSoruşturma) | 10717ES |
Taq antikoru | 31303ES | ||
En iyi | 14402ES | ||
Hieff™ Bst Plus DNA Polimeraz (2000 U/μL)Soruşturma) | 14403ES | ||
Udg | Urasil DNA Glikosilazı (UDG), ısıya duyarlıSoruşturma) | 10303ES |
Okuma ile ilgili olarak:
Yeasen Biology'nin Afrika Domuz Vebası Virüsü Tespiti İçin Genel Çözümü