Nükleik asit, tüm moleküler biyoloji araştırmalarının temelini oluşturur. Dahası, çıkarılan nükleik asidin kalitesi de alt akış deneylerinin başarısını veya başarısızlığını belirleyen temel faktörlerden biridir. Nükleik asit çıkarma reaktifleri geliştirilirken, geleneksel kimyasal bileşenlere ek olarak, bazı küçük molekül nükleik asitler veya enzimler çıkarma verimliliğini büyük ölçüde artırabilir veya hedef olmayan maddelerin müdahalesini ortadan kaldırabilir ve nükleik asit çıkarmada önemli bileşenler haline gelebilir.
Nükleik asit çökeltmesi için yardımcı maddeler hakkında
Taşıyıcı RNA
- Kavram ve işlevi Taşıyıcı RNA
Taşıyıcı RNA, Çince'de nükleik asit çöktürme yardımcısı olarak da bilinir. Nükleik asit çıkarma işleminde, çıkarma için kullanılan santrifüj tüpleri çoğunlukla polipropilenden yapılır. Tüp duvarında statik elektrik vardır ve bu nükleik asitleri emer. Çıkarma ve saflaştırma işleminde Taşıyıcı RNA kullanmak, nükleik asitlerin elektrostatik etkiyi ortadan kaldırmasına, nükleik asitlerin saflaştırma kolonuna iyi bir şekilde adsorbe edilebilmesini sağlamaya, elüsyon verimliliğini artırmaya ve böylece numunedeki nükleik asitlerin mümkün olduğunca geri kazanılmasına yardımcı olabilir.
- Taşıyıcı RNA'nın yaygın türleri
Nükleik asit çöktürmesinde yardımcı madde olarak kullanılan Taşıyıcı RNA'nın; PoliA potasyum tuzu, toplam E. coli RNA'sı, toplam maya RNA'sı, tRNA vb. gibi birden fazla türü bulunmaktadır.
- Kullanımda Yaygın Sorunlar Taşıyıcı RNA
Taşıyıcı RNA, bir süre oda sıcaklığında bekletildikten sonra hala kullanılabilir mi? Taşıyıcı RNA'nın bozunması kullanımını etkiler mi? Taşıyıcı RNA, alt akış deneylerini etkiler mi?
Taşıyıcı RNA, bir RNA koruyucusunda çözülür. Sıvı Taşıyıcı RNA, kısa bir süre (7 gün içinde) 37°C veya oda sıcaklığına yerleştirildiğinde çok az etkiye sahiptir. Esasen Taşıyıcı RNA, 500 nt ila 1000 nt aralığında bir parçadır. Hafif bozulma normal kullanımı etkilemez. Floresan kantitatif PCR gibi alt akış uygulamaları için Taşıyıcı RNA'nın Ct değeri üzerinde hiçbir etkisi yoktur. NGS gibi alt akış uygulamaları için gerçek ihtiyaçlara göre eklenebilir.
- Ürün Tanıtımı Taşıyıcı RNA
Yeasen'in Taşıyıcı RNA'sı mayadan türetilen RNA'dır. Hiçbir kalıntı DNase veya RNase enzimi yoktur ve kalıntı protein ve DNA içeriği son derece düşüktür. Viral nükleik asit ekstraksiyonu ve eser DNA ekstraksiyonu gibi deneylerde kullanılabilir. Çıkarılan nükleik asitler RT-PCR ve RT-qPCR gibi sonraki deneylerde kullanılabilir. Ürün, uygun doğrudan kullanım, uzun mesafeli taşıma ve depolama için sıvı ve liyofilize toz formülasyonlarında mevcuttur.
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
Taşıyıcı RNA, 6 μg/μL | 19701'ler | 1 mL / 5 mL / 100 mL | -25 ile -15 °C arasında muhafaza edilmelidir. Raf ömrü 2 yıldır. |
Taşıyıcı RNA Tozu, 216 μg/tüp | 19703ES | 1 tüp / 100 tüp / 1000 tüp | Oda sıcaklığında muhafaza edilmelidir. Raf ömrü 2 yıldır. |
19704ES | 1 tüp / 100 tüp / 1000 tüp | Oda sıcaklığında muhafaza edilmelidir. Raf ömrü 2 yıldır. |
Doğrusal akrilamid çözeltisi
- Doğrusal akrilamid çözeltisinin kavramı ve işlevi
Lineer akrilamid, İngilizce adıyla Linear Acrylamide (Linear Polyacrylamide, kısaltılmış olarak LPA), nükleik asit saflaştırma işlemi sırasında nükleik asitlerin çökelmesine yardımcı olan bir yardımcı çöktürücüdür.
- Doğrusal akrilamid çözeltisinin özellikleri
Nötr bir taşıyıcıdır ve biyolojik olmayan bir kökene sahiptir. Bu nedenle potansiyel nükleik asit veya nükleaz kontaminasyonu içermez.
A260/A280 okumalarına müdahale etmeyecek ve polimeraz ve restriksiyon endonükleaz aktivitelerini inhibe etmeyecektir.
PCR ve enzimatik sindirim gibi diğer sonraki moleküler biyoloji uygulamalarıyla uyumludur.
Pikogram düzeyinde veya üzeri DNA ve RNA'nın (Oligo dahil) çökelmesine yardımcı olabilir. Kurtarılabilir parça uzunluğu 20 nükleotidin üzerindedir ve hem tek sarmallı hem de çift sarmallı nükleik asitler uygulanabilir.
- Ürün Tanıtımı
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
Doğrusal Akrilamid Çözeltisi (5 mg/mL) | 10408ES | 1 ml | 4'te saklandı °C. Raf ömrü 3 Yıllar. |
Nükleik asit ekstraksiyon yardımcı enzimi
RNaz A
- RNase A'nın kavramı ve işlevi
Ribonükleaz A (RNase A), bir endoribonükleaz olarak, tek zincirli RNA üzerindeki sitozin (C) veya urasil (U) kalıntılarını özel olarak parçalar. Ribonükleaz A'nın (RNase A) en yaygın uygulaması, plazmit DNA veya genomik DNA hazırlanması sırasında RNA'yı çıkarmaktır. Ek olarak, bu ürün RNase koruma testleri ve RNA dizi analizi gibi moleküler biyoloji deneylerinde de kullanılabilir.
- RNase A'nın özellikleri
RNase A, Sığır pankreasından türetilmiştir. Endo ve ekzonükleaz deoksiribonükleaz kontaminasyonu yoktur. Ön ısıtma yapılmadan doğrudan kullanılabilir ve yüksek sıcaklık ortamlarına dayanıklıdır.
- Ürün Tanıtımı
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
RNaz A (100 mg/mL) | 10406ES | 1 ml | -20°C'de saklanmalıdır. Raf ömrü 2 yıldır. |
RNaz A (10 mg/mL) | 10405ES | 1mL | Oda sıcaklığında muhafaza edilmelidir.Raf ömrü 1 Yıllar. |
10407ES | 100mg/1g | Oda sıcaklığında muhafaza edilmelidir. Raf ömrü 2 yıldır. |
Deoksiribonükleaz I (DNaz I)
Çeşitli hücrelerde ve dokularda bulunan bir endonükleaz olan Deoksiribonükleaz I (DNaz I), pirimidinlere bitişik fosfodiester bağını hedef alır ve keser ve 5' ucunda bir fosfat grubu ve 3' ucunda bir hidroksil grubu bulunan polinükleotidler üretir. Ortalama minimum sindirim ürünü bir tetra-nükleotid polimeridir. DNaz, tek sarmallı DNA, çift sarmallı DNA ve hatta kromatin (kesim hızı histonlardan etkilenir) gibi çeşitli DNA formlarını katalize edebilir. Moleküler biyoloji deneylerinde, genellikle proteinlerden DNA'yı çıkarmak veya DNA'ya etiketli bazlar eklemek için DNA'ya çentikler yerleştirmek için kullanılır.
2.DNase I'in Özellikleri
DNase I'in optimum çalışma aralığı pH 7-8'dir ve aktivitesi Ca'ya bağlıdır2+ ve Co gibi iki değerlikli metal iyonları tarafından aktive edilebilir2+, Minneapolis2+, Çinko2+, vb. 5 mM Ca2+ enzimin hidrolize olmasını önleyebilir. Mg varlığında2+, bu enzim DNA'nın herhangi bir ipliğindeki herhangi bir yeri rastgele tanıyabilir ve kesebilir; Mn varlığında ise2+, DNA'nın her iki ipliğini aynı anda tanıyabilir ve neredeyse aynı yerden kesebilir.
3.Ürün Tanıtımı
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
Sığır pankreasından Deoksiribonükleaz I (DNase I) | 10607ES | 15 KU/10×15KU | -20°C'de saklanmalıdır. Raf ömrü 2 yıldır. |
Sığır pankreasından Deoksiribonükleaz I (DNase I) | 10608ES | 25 mg/100 mg/1 gr | -20°C'de saklanmalıdır. Raf ömrü 2 yıldır. |
Proteinaz K
1.Protease K'nin kavramı ve işlevi
Proteinase K (Proteinase K), geniş bir kesme aktivitesi aralığına sahip bir serin proteazdır. Göreceli moleküler ağırlığı yaklaşık 29,3 kDa'dır ve alifatik amino asitlerin ve aromatik amino asitlerin karboksil-terminal peptit bağlarını kesebilir. Proteinase K, geniş bir uygulama alanına sahiptir ve kromozomal DNA'yı darbeli alan jel elektroforezi, Western blotting ve DNA ve RNA preparatlarındaki nükleazları çıkarma gibi deneylerde kullanılabilir. SDS (1%) gibi denatüre edici ajanlar aktivitesini artırabilir.
2.Protease K'nin Özellikleri
Genetik olarak rekombinant bir maya suşundan türetilmiştir.
RNase ve DNase içermez.
Üre ve SDS'de aktif ve stabildir.
Geniş pH aralığında (pH 4.0 - 12.0) etkilidir ve optimum pH aralığı pH 7.5 - 9.0'dır.
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
10401ES | 100mg/1g/5g/100g | 4°C'de saklanır. Raf ömrü 3'tür Yıllar. | |
Proteinase K Çözeltisi (20 mg/mL) | 10412ES | 1mL/10mL/25mL/500mL | 4°C'de saklanır. Raf ömrü 2'dir Yıllar. |
Proteinaz K Çözeltisi (20 mg/mL) | 10410ES | 1mL/10mL/25mL/500mL | 4°C'de saklanır. Raf ömrü 2'dir Yıllar. |
RNA sabitleyici
Hayvan ve bitki dokuları için RNA stabilizatör solüsyonu
1. Hayvan ve bitki dokuları için RNA sabitleyici solüsyonunun işlevi
RNazlar çevrede yaygın olarak bulunur ve taze toplanmış hayvan ve bitki dokuları, kan, vücut sıvıları vb. örneklerindeki RNA'yı parçalama olasılıkları çok yüksektir. Hayvan ve bitki dokuları için RNAsafe doku sabitleyici (RNAsafe Tissue Stabilizer), toplanan örneklerdeki RNA'yı sabitlemek ve korumak için özel olarak geliştirilmiştir. Toksik olmayan bir çözelti olarak, dokulara hızla nüfuz edebilir ve endojen RNazları etkisiz hale getirebilir.
2. Hayvan ve bitki dokuları için RNA sabitleyici solüsyonunun özellikleri
Kullanımı son derece kolaydır: Taze dokuları uygun büyüklükte (≤0,5 cm) doku bloklarına kesin ve bunları hacminin 5 ila 10 katı olan RNAsafe'e daldırın.
Uzun stabilizasyon süresi: RNAsafe ile infiltre edilen dokular/hücreler 37°C’de 1 gün, oda sıcaklığında 1 hafta, 4°C’de 4 hafta ve uzun süreli saklama için -20°C/-80°C’de saklanabilir.
Geniş aşağı akış uyumluluğu: HieffTM Toplam RNA Ekstraksiyon Reaktifi (katalog numarası: 10606ES60) gibi hemen hemen tüm RNA izolasyon yöntemleriyle ve santrifüjlü kolon ekstraksiyon yöntemi ve manyetik boncuk saflaştırma yöntemi dahil hemen hemen tüm ticari RNA ekstraksiyon kitleriyle uyumludur.
Malzemelerin geniş uygulama alanı: Çeşitli hayvansal ve bitkisel dokuların (beyin, kalp, karaciğer, pankreas, böbrek, dalak, testis, kas, bitkilerin gövde ve yaprakları vb.) korunmasında, ayrıca maya, doku kültürü hücreleri vb. için kullanılabilir.
3.Ürün Tanıtımı
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
RNAsafe Doku Sabitleyici RNAsafe | 10604ES60 | 100 ml | Oda sıcaklığında saklanır. Raf ömrü 5'tir Yıllar. |
İlgili ürünler
Ürün Adı | Ürün Sayı | Şartname | Depolama Koşulları ve Raf Ömrü |
Lizozim | 10402ES | 5/50 G | -20°C'de saklanır. Raf ömrü 3'tür Yıllar. |
Litikaz (10 U/μL) | 10403ES | 1500/3000/10000 ABD | Şurada saklandı: -20°C. |
Salyangoz | 10404ES | 5/10 G | 2-8°C'de saklanır. Raf ömrü 2 Yıllar. |
RNAsafe-ICE | 10605ES | 100 ml | Oda sıcaklığında saklanır. Raf ömrü 2 Yıllar. |