Tanım
Yüksek NGS™ MaxUp İnsan rRNA Tükenme Kiti (rRNA ve ITS/ETS), RNase H tabanlı iş akışına dayalı olarak insan, fare ve sıçan toplam RNA'sından rRNA ve 45S ITS/ETS'yi çıkarmak ve mRNA ve diğer kodlamayan RNA'yı tutmak için tasarlanmıştır. Bu kit hem sağlam hem de kısmen parçalanmış RNA örnekleri (örneğin, FFPE RNA) için uygundur. Parçalanmış FFPE örnekleri genellikle taze doku örneklerinden daha yüksek oranda ITS/ETS içerdiğinden, bu kit İnsan 45S ITS/ETS bölgesine problar ekler ve ITS'nin çıkarılması ham verilerdeki geçerli veri oranını önemli ölçüde artırabilir.
Özellikler
- Güçlü özgüllük: özellikle FFPE örnekleri için insan örneklerinden rRNA ve ITS/ETS'yi özel olarak çıkarın
- Şablon başlangıç miktarının yüksek uyumluluğu: 100 ng~1μg numuneye uygulanabilir
- Yüksek uzaklaştırma etkisi: İnsan\fare ve sıçan örneklerinde rRNA, ITS ve ETS için uzaklaştırma etkisi %95'ten fazladır
- İstikrarlı kalite: sıkı parti performansı ve istikrar kalite kontrolü
Uygulamalar
- Gen İfadesi Araştırması
- Alternatif ekleme analizi
- Kodlamayan RNA'nın tespiti ve keşfi
- Seçici poliadenilasyon bölgelerinin belirlenmesi
- Füzyon gen tespiti
Özellikler
| Tükenme Teknolojisi | RNaz H |
| Örnek Türü | İnsan, fare ve sıçanın toplam RNA'sı |
| Son Ürün Türü | mRNA ve diğer kodlamayan RNA'lar |
| Tepki Sayısı | 24/96 Hazırlıkları |
| Başlangıç Malzemesi Miktarı | 100 ng~1 μg toplam RNA |
| Hedef | İnsan toplam RNA'sından rRNA ve 45S ITS/ETS'yi çıkarın |
Bileşenler
| Bileşenler No. | İsim | 12257ES24 (24T) | 12257ES96 (96T) |
| 12257-A | Hibridizasyon tamponu | 72 μL | 288 μL |
| 12257-B | Prob Karışımı (rRNA ve ITS/ETS) | 48 μL | 192 μL |
| 12257-C | RNase H Tamponu | 72 μL | 288 μL |
| 12257-D | RNaz H | 48 μL | 192 μL |
| 12257-D | DNase I Tamponu | 660 μL | 2×1320 μL |
| 12257-F | DNaz I | 60 μL | 240 μL |
Nakliye ve Depolama
Tüm komponentler kuru buzla birlikte gönderilir ve -15℃ ~ -25℃'de bir yıl boyunca saklanabilir.
Rakamlar
- rRNA çıkarma özgüllüğü
Geleneksel örnekler için rRNA ve ITS/EST %98'den fazla oranda uzaklaştırılabilirken, yaklaşık %50 bütünlüğe sahip FFPE örnekleri için rRNA ve ITS/EST %95'ten fazla oranda uzaklaştırılabilir. Aynı zamanda, zayıf bütünlüğe sahip FFPE de etkili bir şekilde uzaklaştırılabilir.
Tablo 1. rRNA Kaldırma özgüllüğü etkisi
| RNA kalite | Kaldırma şema | Giriş | rRNA (%) | ITS/ETS (%) | Haritalama (%) |
| 293T RNA; RIN=10 | kaldırmak rRNA | 1μg | 0,19 | 4.6 | 98.28 |
| kaldırmak rRNA Ve ITS/ETS | 1μg | 0,15 | 0,04 | 98,79 | |
| FFPE RNA; DV200 =%90 | kaldırmak rRNA | 500ng | 0,23 | 4.75 | 95.35 |
| kaldırmak rRNA Ve ITS/ETS | 500ng | 0,21 | 0,02 | 95.42 | |
| FFPE RNA; DV200 =%50 | kaldırmak rRNA | 500ng | 1.4 | 16.28 | 95.57 |
| kaldırmak rRNA Ve ITS/ETS | 500ng | 0,56 | 0,11 | 95.51 | |
| FFPE RNA; DV200 =%20 | kaldırmak rRNA | 1μg | 0,35 | 67.61 | 58.4 |
| kaldırmak rRNA Ve ITS/ETS | 1μg | 0,79 | 0,84 | 60.35 |
Not: rRNA veya rRNA ve ITS/ETS'yi çıkarmak ve ITS/ETS'den sonra RNA kütüphanesi Hazırlık kiti ile kütüphaneler oluşturmak için farklı insan RNA örnekleri kullanıldı. Çevrimdışı verilerdeki rRNA ve ITS/ETS oranları dizileme yoluyla analiz edildi.
- Sıralama veri performansı
Tablo 2.Sıralama veri performansı
| Örnek | DV200 | Kit | Temiz Q20 (%) | Temiz S30 (%) | Temiz GC (%) | rRNA (%) | ITS/ETS (%) | eşsiz(%) |
| 1 | %24 | EVET Kedi#12257 | 96,75 | 92.68 | 57.05 | 4.58 | 2.42 | 96.90 |
| 2 | %40 | 96.56 | 92.42 | 55.31 | 1.93 | 0,63 | 96.45 | |
| 3 | %53 | 97.4 | 93.52 | 45.19 | 0,23 | 0,01 | 98.08 | |
| 4 | %76 | 97.67 | 93,78 | 51.28 | 0,44 | 0,01 | 93.63 |
[1] Tian S, Zhang B, He Y, ve diğerleri. CRISPR-iPAS: alternatif poliadenilasyon girişimi için yeni bir dCAS13 tabanlı yöntem. Nükleik Asitler Res. 2022;50(5):e26. doi:10.1093/nar/gkac108(IF:16.971)
Ödeme ve Güvenlik
Ödeme bilgileriniz güvenli bir şekilde işlenir. Kredi kartı ayrıntılarını saklamıyoruz veya kredi kartı bilgilerinize erişimimiz yok.
Sorgu
Ayrıca sevebilirsiniz
SSS
Ürün yalnızca araştırma amaçlıdır ve insanlarda veya hayvanlarda terapötik veya teşhis amaçlı kullanım için tasarlanmamıştır. Ürünler ve içerikler, Yeasen Biotechnology'nin sahip olduğu patentler, ticari markalar ve telif haklarıyla korunmaktadır. Ticari marka sembolleri, tüm bölgelerde tescilli olmayıp, menşe ülkesini gösterir.
Bazı uygulamalar üçüncü tarafların ek fikri mülkiyet haklarına ihtiyaç duyabilir.
Yeasen, araştırmalarımızın güvenlik ve etik standartları sağlarken kritik soruları ele alması gerektiğine inanarak etik bilime kendini adamıştır.