شرح
هیف NGS™ MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) برای حذف rRNA و 45S ITS/ETS از RNA کل انسان، موش و موش بر اساس گردش کار مبتنی بر RNase H و حفظ mRNA و سایر RNA های غیر کدکننده طراحی شده است. این کیت برای نمونه های RNA دست نخورده و تا حدی تخریب شده (به عنوان مثال FFPE RNA) مناسب است. از آنجایی که نمونه های تخریب شده FFPE معمولاً دارای نسبت بیشتری از ITS/ETS نسبت به نمونه های بافت تازه هستند، این کیت پروب هایی را در ناحیه Human 45S ITS/ETS اضافه می کند و حذف ITS می تواند به طور قابل توجهی نسبت داده های معتبر را در داده های خام افزایش دهد.
ویژگی ها
- ویژگی قوی: به طور خاص rRNA و ITS/ETS را از نمونه های انسانی، به ویژه برای نمونه های FFPE حذف کنید.
- سازگاری بالا با مقدار اولیه الگو: قابل استفاده برای نمونه 100ng~1μg
- اثر حذف بالا: برای rRNA، ITS و ETS در نمونه های انسان / موش و موش، اثر حذف بیش از 95٪ است.
- کیفیت پایدار: عملکرد دسته ای دقیق و کنترل کیفیت پایداری
برنامه های کاربردی
- تحقیق بیان ژن
- آنالیز اسپلایسینگ جایگزین
- تشخیص و کشف RNA غیر کد کننده
- شناسایی محل های پلی آدنیلاسیون انتخابی
- تشخیص ژن فیوژن
مشخصات
| تکنولوژی تخلیه | RNase H |
| نوع نمونه | RNA کل انسان، موش و موش |
| نوع محصول نهایی | mRNA و سایر RNA های غیر کد کننده |
| تعداد واکنش ها | آمادگی 24/96 |
| مقدار مواد اولیه | 100 نانوگرم تا 1 میکروگرم RNA کل |
| هدف | rRNA را حذف کنید و 45S ITS/ETS از RNA کل انسان تشکیل شود |
اجزاء
| اجزای شماره | نام | 12257ES24 (24T) | 12257ES96 (96T) |
| 12257-الف | بافر هیبریداسیون | 72 میکرولیتر | 288 میکرولیتر |
| 12257-B | مخلوط پروب (rRNA و ITS/ETS) | 48 میکرولیتر | 192 میکرولیتر |
| 12257-C | بافر RNase H | 72 میکرولیتر | 288 میکرولیتر |
| 12257-د | RNase H | 48 میکرولیتر | 192 میکرولیتر |
| 12257-E | بافر DNase I | 660 میکرولیتر | 2×1320 میکرولیتر |
| 12257-F | DNase I | 60 میکرولیتر | 240 میکرولیتر |
حمل و نقل و ذخیره سازی
تمام اجزاء با یخ خشک ارسال می شوند و می توان آنها را در دمای -15 ~ -25 درجه سانتیگراد به مدت یک سال نگهداری کرد.
ارقام
- ویژگی حذف rRNA
برای نمونه های معمولی، rRNA و ITS/EST را می توان بیش از 98 درصد حذف کرد، در حالی که برای نمونه های FFPE با یکپارچگی حدود 50 درصد، rRNA و ITS/EST را می توان بیش از 95 درصد حذف کرد. در همان زمان، FFPE با یکپارچگی ضعیف نیز می تواند به طور موثر حذف شود.
جدول 1. اثر اختصاصی حذف rRNA
| RNA کیفیت | حذف طرح | ورودی | rRNA (%) | ITS/ETS (%) | نقشه برداری (%) |
| 293T RNA RIN=10 | حذف کنید rRNA | 1 میکروگرم | 0.19 | 4.6 | 98.28 |
| حذف کنید rRNA و ITS/ETS | 1 میکروگرم | 0.15 | 0.04 | 98.79 | |
| FFPE RNA DV200 =90% | حذف کنید rRNA | 500 نانوگرم | 0.23 | 4.75 | 95.35 |
| حذف کنید rRNA و ITS/ETS | 500 نانوگرم | 0.21 | 0.02 | 95.42 | |
| FFPE RNA DV200 =50% | حذف کنید rRNA | 500 نانوگرم | 1.4 | 16.28 | 95.57 |
| حذف کنید rRNA و ITS/ETS | 500 نانوگرم | 0.56 | 0.11 | 95.51 | |
| FFPE RNA DV200 =20% | حذف کنید rRNA | 1 میکروگرم | 0.35 | 67.61 | 58.4 |
| حذف کنید rRNA و ITS/ETS | 1 میکروگرم | 0.79 | 0.84 | 60.35 |
توجه: نمونه‌های مختلف RNA انسانی برای حذف rRNA یا rRNA و ITS/ETS و ساخت کتابخانه‌هایی با کیت آماده سازی کتابخانه RNA بعد از ITS/ETS استفاده شد. نسبت rRNA و ITS/ETS در داده های آفلاین با توالی یابی تجزیه و تحلیل شد.
- توالی عملکرد داده ها
جدول 2.توالی عملکرد داده ها
| نمونه | DV200 | کیت | تمیز Q20 (%) | تمیز Q30 (%) | تمیز GC (%) | rRNA (%) | ITS/ETS (%) | منحصر به فرد (%) |
| 1 | 24% | YEASEN گربه شماره 12257 | 96.75 | 92.68 | 57.05 | 4.58 | 2.42 | 96.90 |
| 2 | 40% | 96.56 | 92.42 | 55.31 | 1.93 | 0.63 | 96.45 | |
| 3 | 53% | 97.4 | 93.52 | 45.19 | 0.23 | 0.01 | 98.08 | |
| 4 | 76% | 97.67 | 93.78 | 51.28 | 0.44 | 0.01 | 93.63 |
[1] Tian S، Zhang B، He Y، و همکاران. CRISPR-iPAS: یک روش جدید مبتنی بر dCAS13 برای تداخل پلی آدنیلاسیون جایگزین. Nucleic Acids Res. 2022؛ 50 (5): e26. doi:10.1093/nar/gkac108(IF:16.971)
پرداخت و امنیت
اطلاعات پرداخت شما با اطمینان پردازش می شود. ما جزئیات کارت اعتباری را ذخیره نمی کنیم و به اطلاعات کارت اعتباری شما دسترسی نداریم.
تحقیق
شما همچنین ممکن است دوست داشته باشید
پرسش
این محصول فقط برای اهداف تحقیقاتی است و برای استفاده درمانی یا تشخیصی در انسان یا حیوانات در نظر گرفته نشده است. محصولات و محتوا توسط پتنت ها، علائم تجاری، و حق چاپ متعلق به Yeasen Biotechnology محافظت می شوند. نمادهای علامت تجاری نشان دهنده کشور مبدا هستند، نه لزوما ثبت در همه مناطق.
برخی از برنامه‌های کاربردی ممکن است به حقوق مالکیت معنوی شخص ثالث دیگری نیاز داشته باشند.
Yeasen به علم اخلاق اختصاص داده شده است و معتقد است که تحقیقات ما باید به سؤالات مهم و در عین حال اطمینان از ایمنی و استانداردهای اخلاقی بپردازد.