شرح
دانه‌های انتخاب DNA Hieff NGS بر اساس اصل SPRI (تحرک معکوس فاز جامد) تهیه شده‌اند و برای خالص‌سازی DNA و انتخاب اندازه در طول آماده‌سازی کتابخانه‌های توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) قابل استفاده است. Hieff NGS™ DNA Selection Beads با انواع کیت های آماده سازی کتابخانه DNA و RNA سازگار است و جایگزین خوبی برای مهره های آمپر.
اجزاء
| اجزای شماره | نام | 12601ES08 | 12601ES56 | 12601ES75 |
| 12601 | دانه های انتخاب DNA Hieff NGS™ | 5 میلی لیتر | 60 میلی لیتر | 450 میلی لیتر |
مشخصات
| خط تولید | مهره های پاکسازی و انتخاب DNA |
| مواد اولیه | DNA |
| سازگاری | DNA |
| فناوری جداسازی | مهره مغناطیسی |
| نوع محصول نهایی | DNA |
| برای استفاده با (برنامه) | DNA celan up، انتخاب اندازه DNA |
حمل و نقل و ذخیره سازی
مهره ها همراه با بسته های یخ ارسال می شوند و می توان آنها را در دمای 2 تا 8 درجه سانتی گراد به مدت یک سال نگهداری کرد.
دستورالعمل ها
- 1. آماده سازی
قبل از استفاده، دانه های انتخابی را حداقل به مدت 30 دقیقه در دمای اتاق متعادل کنید.
- 2. انتخاب اندازه DNA
جریان عملیات انتخاب اندازه در شکل 1 نشان داده شده است و پروتکل به شرح زیر است.
شکل 1. نمودار جریان انتخاب اندازه DNA
2.1 دانه ها را با گرداب یا پیپت کردن هر بار قبل از استفاده به طور کامل مخلوط کنید.
2.2 دور اول مهره های انتخابی را به نمونه اضافه کنید (به جدول 1 مراجعه کنید). حداقل 10 بار با ورتکس کردن یا پیپت کردن به بالا و پایین مخلوط کنید.
2.3 در دمای اتاق به مدت 5 دقیقه جوجه کشی کنید.
2.4 لوله را برای مدت کوتاهی به پایین بچرخانید و آن را روی پایه مغناطیسی قرار دهید. هنگامی که محلول شفاف شد (حدود 5 دقیقه)، مایع رویی را به یک لوله PCR جدید منتقل کنید.
2.5 دور دوم دانه های انتخابی را مطابق جدول 1 از مرحله 2.4 به نمونه اضافه کنید. حداقل 10 بار با گرداب یا پیپت کردن به بالا و پایین مخلوط کنید.
2.6 در دمای اتاق به مدت 5 دقیقه جوجه کشی کنید.
2.7 لوله را برای مدت کوتاهی به پایین بچرخانید و آن را روی پایه مغناطیسی قرار دهید. وقتی محلول شفاف شد (حدود 5 دقیقه)، مایع رویی را آسپیره کرده و دور بریزید.
2.8 لوله را در پایه مغناطیسی نگه دارید و 200 میکرولیتر اتانول 80 درصد تازه آماده شده را بدون ایجاد مزاحمت در دانه ها به آن اضافه کنید و به مدت 30 ثانیه در دمای اتاق انکوبه کنید. اتانول را آسپیره کرده و دور بریزید.
2.9 مرحله 2.8 را یک بار برای مجموع دو شستشو تکرار کنید.
2.10 اتانول باقیمانده را با نوک پیپت 10 میکرولیتری حذف کنید. لوله را در پایه مغناطیسی نگه دارید، مهره های انتخاب را با درب باز با هوا خشک کنید تا زمانی که ترک ها ظاهر شوند (حدود 5 دقیقه).
توجه: دانه‌های انتخابی را خشک کنید. این ممکن است منجر به بازیابیDNAهدف کمتر شود.
2.11 لوله را از پایه مغناطیسی خارج کنید. مقدار مناسبی از ddH2O (≥20 µL) را اضافه کنید و با گرداب یا پیپت کردن حداقل 10 بار به طور کامل مخلوط کنید.
2.12 در دمای اتاق به مدت 5 دقیقه جوجه کشی کنید.
لوله را برای مدت کوتاهی به پایین بچرخانید و آن را روی پایه مغناطیسی قرار دهید. هنگامی که محلول شفاف شد (حدود 5 دقیقه)، 20 میکرولیتر از مایع رویی را به یک لوله جدید منتقل کنید.
- 3.شرایط توصیه شده برای انتخاب اندازه DNA
DNA تیموس گوساله توسط فراصوت قطعه قطعه شد تا قطعه 100-100 جفت باز تهیه شود و دو دور انتخاب اندازه مطابق جدول 1 انجام شد. نتایج با استفاده از Bioanalyzer Agilent 2100 تجزیه و تحلیل شد (شکل 2).
جدول 1. شرایط توصیه شده برای انتخاب اندازه DNA
| طول قطعه DNA | 250-350 جفت باز | 320-420 جفت باز | 450-550 جفت باز | 550-700 جفت باز | 700-900 جفت باز | 800-1000 جفت باز |
| نسبت مهره ها: DNA برای دور اول | 0.80× | 0.70× | 0.60× | 0.55× | 0.50× | 0.45× |
| نسبت مهره ها: DNA برای 2 گرد | 0.20× | 0.20× | 0.20× | 0.15× | 0.15× | 0.15× |
نکته: "×" در جدول حجم DNA نمونه را نشان می دهد. به عنوان مثال، اگر طول درج کتابخانه 250 جفت باز باشد و حجم DNA نمونه 100 میکرولیتر باشد، حجم دانه‌های مغناطیسی مورد استفاده در اولین دور مرتب‌سازی 0.80×100 μL=80 میکرولیتر است. حجم دانه های مغناطیسی مورد استفاده در دور دوم مرتب سازی 0.20×100 میکرولیتر=20 میکرولیتر است.
شکل 2. الکتروفروگرام تراشه DNA با حساسیت بالا Agilent 2100
یادداشت ها:
1. برای ایمنی و سلامتی خود، لطفاً از کت های آزمایشگاهی و دستکش های یکبار مصرف برای عملیات استفاده کنید.
نقل شده از "ادغام اختصاصی توالی توسط خانواده 1 کاپوزاز از Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021؛ 49 (17): 9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"
به نقل از "عفونت اخیر توسط Wolbachia، جوامع میکروبی را در جمعیت های وحشی Laodelphax striatellus تغییر می دهد. Microbiome. 2020; 8(1):104. منتشر شده در 2 ژوئیه 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"
[1] وانگ ایکس، یوان کیو، ژانگ دبلیو، و همکاران. ادغام اختصاصی توالی توسط خانواده 1 کاپوزاز از Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021؛ 49 (17): 9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)
[2] Duan XZ، Sun JT، Wang LT، و همکاران. عفونت اخیر توسط Wolbachia جوامع میکروبی را در جمعیت‌های لائودلفاکس striatellus وحشی تغییر می‌دهد. میکروبیوم. 2020؛ 8 (1): 104. منتشر شده در 2 ژوئیه 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)
[3] آهنگ ب، المترافی ای، سانگ اف، و همکاران.مدیریت رسوبات تیمار شده با فنتون با بیوچار و کمپوست کود گوسفند: اثرات بر ویژگی های تکاملی جامعه باکتریایی J Environ Manage. 2022؛ 316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)
[4] Huang C، Mei Q، Lou L، و همکاران. کولیت اولسراتیو در پاسخ به پیوند میکروبیوتای مدفوع از طریق مدولاسیون میکروبیوتای روده و تعادل سلولی Th17/Treg. سلول ها 2022؛ 11 (11): 1851. منتشر شده در 5 ژوئن 2022. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)
[5] Ghosh S، Yang X، Wang L، Zhang C، Zhao L. تغذیه فاز فعال پربیوتیک میکروبیوتای روده را تغییر می دهد، باعث کاهش مستقل از وزن استئاتوز کبدی و کلسترول سرم در موش های تغذیه شده با رژیم غذایی پرچرب می شود. Comput Struct Biotechnol J. 2020؛ 19:448-458. منتشر شده در 24 دسامبر 2020. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)
[6] گائو ایکس، یو بی، یو جی، و همکاران. پروفایل رشدی هضم کربوهیدرات های غذایی در خوکچه ها. میکروبیول جلو. 2022؛ 13:896660. منتشر شده در 29 آوریل 2022. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)
[7] Li P، Zhang Y، Yan F، Zhou X. ویژگی های یک باکتریوفاژ، vB_Kox_ZX8، جدا شده از کلبسیلا اکسی توکا بالینی و اثر درمانی آن بر باکتریمی موش. میکروبیول جلو. 2021؛ 12:763136. منتشر شده در 3 دسامبر 2021. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)
[8] Lin Z، Luo P، Huang D، Wu Y، Li F، Liu H. استراتژی مبتنی بر چند omics برای تجزیه و تحلیل سمیت آکریل آمید در مدل Saccharomyces cerevisiae. Chem Biol Interact. 2021; 349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)
[9] Sun X، Lv W، Wang Y، و همکاران. ژن Mrgprb2 در واکنش های آنافیلاکتوئیدی ناشی از تزریق Houttuynia cordata نقش دارد. جی اتنوفارماکول. 2022؛ 289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)
[10] Ma H، Lai B، Zan C، Di X، Zhu X، Wang K. GLO1 از طریق القای PER نوع بتالاکتامازهای با طیف گسترده، به مقاومت دارویی اشریشیاکلی کمک می کند. مقاوم در برابر دارو را آلوده کنید. 2022؛ 15:1573-1586. منتشر شده در 5 آوریل 2022. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)
[11] Zhong Y، Zhao W، Tang Z، و همکاران. تجزیه و تحلیل مقایسه ای رونویسی مراحل مختلف رشد تخمدان در خرچنگ باتلاق قرمز Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021؛ 22 (1): 199. منتشر شده در 21 مارس 2021. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)
[12] لیان سی، یانگ اچ، لان جی، و همکاران. تجزیه و تحلیل مقایسه ای ژنوم کلروپلاست، روابط فیلوژنتیک و تنوع درون گونه ای در گیاه دارویی Isodon rubescens را نشان می دهد. PLoS One. 2022؛ 17 (4): e0266546. منتشر شده در 6 آوریل 2022. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)
[13] دیائو جی، هوانگ جی، ژنگ ایکس و همکاران. پروستاگلاندین E2 نقش دوگانه ای را در تنظیم مهاجرت سلول های دندریتیک ایفا می کند. Int J Mol Med. 2021؛ 47 (1): 207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)
[14] Bing XL، Zhao DS، Peng CW، Huang HJ، Hong XY. شباهت‌ها و تغییرات فضایی جوامع باکتریایی و قارچی در جمعیت‌های گیاه‌خوار برنج مزرعه (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020؛ 27 (5): 947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)
[15] Li X، Zhou S، Zhang J، Zhou Z، Xiong Q. تغییرات جهتی در جامعه باکتریایی روده در لارو مگس سرباز سیاه (Hermetia illucens). حیوانات (بازل). 2021؛ 11 (12): 3475. منتشر شده در 6 دسامبر 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)
[16] Yang J، Peng Y، Kong W. شناسایی و توالی ژنوم کامل ویروس مرموز توت 1. Arch Virol. 2022؛ 167 (2): 687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)
[17] Chang Y، Xia X، Sui L، و همکاران. کلونیزاسیون اندوفیتی قارچ های حشره پاتوژن با تغییر جامعه باکتریایی اندوفیت، مقاومت به بیماری گیاه را افزایش می دهد. J Basic Microbiol. 2021؛ 61 (12): 1098-1112. doi: 10.1002/jobm.202100494(IF:2.281)
[18] Ding CY، Ma YM، Li B، و همکاران. شناسایی و تحلیل عملکردی ژن‌های بیان شده متفاوت در Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) در پاسخ به ترانس آنتول. J Insect Sci. 2022؛ 22 (1): 3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)
پرداخت و امنیت
اطلاعات پرداخت شما با اطمینان پردازش می شود. ما جزئیات کارت اعتباری را ذخیره نمی کنیم و به اطلاعات کارت اعتباری شما دسترسی نداریم.
تحقیق
شما همچنین ممکن است دوست داشته باشید
پرسش
این محصول فقط برای اهداف تحقیقاتی است و برای استفاده درمانی یا تشخیصی در انسان یا حیوانات در نظر گرفته نشده است. محصولات و محتوا توسط پتنت ها، علائم تجاری، و حق چاپ متعلق به Yeasen Biotechnology محافظت می شوند. نمادهای علامت تجاری نشان دهنده کشور مبدا هستند، نه لزوما ثبت در همه مناطق.
برخی از برنامه‌های کاربردی ممکن است به حقوق مالکیت معنوی شخص ثالث دیگری نیاز داشته باشند.
Yeasen به علم اخلاق اختصاص داده شده است و معتقد است که تحقیقات ما باید به سؤالات مهم و در عین حال اطمینان از ایمنی و استانداردهای اخلاقی بپردازد.