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Glycosidase
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Les glycoprotéines peuvent être classées en glycopeptides N-liés et O-liés en fonction de leurs types de chaînes glycaniques. Pour les glycopeptides N-liés, les enzymes couramment utilisées comprennent la peptide N-glycosidase F (PNGase F), l'endoglycosidase H (Endo H) et l'endoglycosidase S (Endo S). La PNGase F hydrolyse la liaison GlcNAc-Asn et peut éliminer les chaînes glycaniques à haute teneur en mannose, complexes et hybrides. L'Endo H coupe les liaisons glycosidiques au sein du noyau pentasaccharide de la chaîne N-glycanique. L'Endo S coupe spécifiquement les glycanes N-liés du noyau chitobiose de la chaîne lourde de l'IgG native.
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