Seluruh Penelitian Transkriptom
[Whole Transcriptome Sequencing - Penelitian tentang Regulasi Terarah dan Hubungan Interaksi antara Non-coding RNA dan mRNA]
Pengurutan throughput tinggi seluruh transkriptom mengadopsi metode konstruksi perpustakaan khusus untai yang dikurangi ribosom dan metode konstruksi perpustakaan penyaringan pengayaan fragmen kecil, yang dapat mencapai konstruksi perpustakaan, pengurutan, analisis informasi, analisis gabungan dan ceRNA, dll. dari RNA pengkode dan RNA non-pengkode, Jadi dengan cara itu bisa memperoleh seluruh data transkrip RNA yang terkait dengan proses biologis tertentu (seperti perkembangan, penyakit, dll.) secara cepat, komprehensif, dan akurat. Melalui analisis data, penelitian tentang mekanisme regulasi biologis dapat diperluas ke model tiga dimensi yang menggabungkan "jaringan dan multilevel", yang membantu menafsirkan fenomena biologis secara komprehensif.
Ada dua cara pengurutan transkriptom secara keseluruhan, satu adalah LncRNA-Seq + Small RNA, dan yang lainnya adalah LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, yang dapat memperoleh informasi CircRNA yang lebih komprehensif.
1. Pengurutan seluruh transkriptom dengan dua perpustakaan: LncRNA-Seq + Small RNA
2.Pengurutan seluruh transkriptom dengan tiga perpustakaan: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Solusi Bahan Baku Transkriptom Utuh
| Klasifikasi | Kategori Hewan | Kategori Tanaman | Kategori Bakteri dan Jamur | |||
| Jenis Sampel | Jaringan/Sel Hewan | Sel | Darah Utuh | Jaringan Tumbuhan | Jaringan Jamur | Bakteri dan Jamur yang Dikulturkan |
| Ekstraksi RNA | Metode manik magnetik: 18605/18607/18606; Metode kolom: 19221/19211; Metode Trizol: 10606/19202 | Metode manik magnetik: 18600/18604; Metode kolom: 19231 | Metode kolom: 19241; Metode Trizol: 19201 | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode kolom: 19301 (jamur perlu menambahkan Lisozim 10403) |
| Ekstraksi miRNA | Metode kolom: 19331 | Metode kolom: 19331 | Metode kolom: 19332 | Metode kolom: 19331 | — | — |
| Konstruksi Perpustakaan miRNA | Yang diharapkan | |||||
| Penghapusan rRNA | RNase Penghapusan enzimatik H: 12257; Penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan sumber manusia); Penghapusan metode manik magnetik: 12266 (tipe universal mamalia)/12267 tipe universal unggas/12268 ayam peliharaan/12269 ikan zebra/12270 lalat buah/12275 tiram/12278 planaria/12285 lebah/12286 laba-laba jaring bola emas/12289 kutu/12290 Aedes albopictus/12287 nematoda | RNase Penghapusan enzimatik H: 12257; Penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan manusia, cocok untuk patogen) | RNase Penghapusan enzimatik H, termasuk penghapusan globin: 12257 + 12806; RNase H penghapusan enzimatik globin: 13572; penghapusan cepat 3 menit: 12258 + 12260 | RNase Penghapusan enzimatik H: 12254; Penghapusan metode manik-manik magnetik: 12262 angiospermae | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12271 jenis jamur universal | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12264 tipe universal bakteri/12265 tipe universal prokariotik |
| Pembangunan Perpustakaan | Kit konstruksi pustaka RNA non-campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12308 (kompatibel dengan Illumina dan MGI); Kit konstruksi pustaka RNA campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12310 (kompatibel dengan Illumina dan MGI)/12340 (tanpa aktinomisin D, dUTP)/12341 (tanpa aktinomisin D, dTTP) | |||||
Penelitian LncRNA
Long non-coding RNA (LncRNA) merupakan jenis RNA non-coding dengan fungsi regulasi unik yang telah menarik perhatian luas dalam beberapa tahun terakhir. Panjang LncRNA lebih dari 200nt, tidak mengkode protein, dan konservasinya di antara spesies buruk.Beberapa struktur sekuensnya mirip dengan mRNA (mengandung ekor poliA dan penyambungan alternatif), sementara yang lain tidak memiliki karakteristik ini. Saat ini, pembentukan dan mekanisme fungsional LncRNA belum sepenuhnya dipahami, namun, banyak LncRNA dengan fungsi biologis penting (seperti terjadinya kanker, pembungkaman kromosom X dan pembentukan jaringan pengatur kompleks dengan faktor pengatur lainnya) telah ditemukan.
Rute Teknis Pengurutan LncRNA
Solusi Bahan Baku Pengurutan LncRNA
| Klasifikasi | Kategori Hewan | Tanaman Kategori | Kategori Bakteri dan Jamur | |||
| Jenis Sampel | Jaringan/Sel Hewan | Sel | Darah Utuh | Jaringan Tumbuhan | Jaringan Jamur | Bakteri dan Jamur yang Dikulturkan |
| Ekstraksi RNA | Metode manik magnetik: 18605/18607/18606; Metode kolom: 19221/19211; Metode trizol: 10606/19202 | Metode manik magnetik: 18600/18604; Metode kolom: 19231 | Metode kolom: 19241; Metode Trizol: 19201 | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode kolom: 19301 (jamur perlu menambahkan lywallzyme 10403) |
| Penghapusan rRNA | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik: 12257; Penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan oleh manusia); Penghapusan metode manik-manik magnetik: 12266 (jenis universal mamalia)/12267 jenis universal unggas/12268 ayam peliharaan/12269 ikan zebra/12270 lalat buah/12275 tiram/12278 planaria/12285 lebah/12286 laba-laba jaring bola emas/12289 kutu/12290 Aedes albopictus/12287 nematoda | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik: 12257; penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan manusia, cocok untuk patogen) | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik, termasuk penghapusan globin: 12257 + 12806; RNase H penghapusan enzimatik globin: 13572; penghapusan cepat 3 menit: 12258 + 12260 | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik: 12254; metode penghapusan manik-manik magnetik: 12262 angiospermae | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12271 jenis jamur universal | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12264 tipe universal bakteri/12265 tipe universal prokariotik |
| Pembangunan Perpustakaan | Kit konstruksi pustaka RNA non-campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12308 (kompatibel dengan Illumina dan MGI); Kit konstruksi pustaka RNA campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12310 (kompatibel dengan Illumina dan MGI)/12340 (tanpa aktinomisin D, dUTP) | |||||
Penelitian Transkriptom Eukariotik
Penelitian transkriptom eukariotik menggunakan teknologi RNA-seq untuk memperoleh total mRNA yang dapat ditranskripsi oleh sel-sel tertentu dalam keadaan fungsional tertentu.Kemudian, data mentah yang diunduh disambung dan disusun, tingkat ekspresi gen dihitung, dan analisis diferensial serta analisis pengayaan fungsional dilakukan. Tidak hanya dapat memperoleh sebagian besar informasi gen spesies, tetapi juga mempelajari perbedaan ekspresi gen dan perubahan jalur fungsional pada tingkat keseluruhan, dan mengungkap mekanisme molekuler dari proses biologis tertentu.
Rute Teknis Pengurutan Transkriptom Eukariotik
Solusi Bahan Baku Pengurutan Transkriptom Eukariotik
| Klasifikasi | Kategori Hewan | Kategori Tanaman | Kategori Jamur | |||
| Jenis Sampel | Jaringan/Sel Hewan | Sel | Darah Utuh | Jaringan Tumbuhan | Jaringan Jamur | Jamur yang dibudidayakan |
| Ekstraksi RNA | Metode manik magnetik: 18605/18607/18606; Metode kolom: 19221/19211; Metode trizol: 10606/19202 | Metode manik magnetik: 18600/18604; Metode kolom: 19231 | Metode kolom: 19241; Metode Trizol: 19201 | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode kolom: 19301 (tambahkan lisozim 10403) |
| Penangkapan mRNA | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 | Kit Isolasi Utama mRNA 12629 |
| Pembangunan Perpustakaan | Kit Perpustakaan RNA Non-campuran: Kit Perpustakaan RNA Mode Ganda 12308 (kompatibel dengan Illumina dan MGI) Kit Perpustakaan RNA Non-Premixed dengan Penangkapan mRNA: Kit Perpustakaan RNA Mode Ganda 12309 (kompatibel dengan Illumina dan MGI) Kit Pustaka RNA Campuran: Kit Pustaka RNA Mode Ganda 12310 (kompatibel dengan Illumina dan MGI)/12340 (tanpa Actinomycin D, dUTP) | |||||
Penelitian circRNA
[circRNA Sequencing - Penelitian tentang Bagaimana Ekspresi Diferensial circRNA Mempengaruhi Proses Biologis]
RNA sirkular (circRNA) adalah jenis khusus analisis RNA non-coding. Pengurutan dilakukan menggunakan platform pengurutan untuk melakukan identifikasi dan analisis circRNA yang akurat terhadap gen sumber untuk sampel dengan genom referensi. Pengurutan circRNA semakin banyak digunakan dalam bidang penelitian medis dan pertanian. Berdasarkan pengurutan throughput tinggi dan mengandalkan basis data utama dan perangkat lunak identifikasi circRNA, informasi circRNA dari spesies proyek dianalisis untuk mengeksplorasi secara mendalam fungsi penting circRNA dalam regulasi transkripsi.
Solusi Bahan Baku Penelitian circRNA
| Klasifikasi | Kategori Hewan | Kategori Tanaman | Kategori Bakteri dan Jamur | |||
| Jenis Sampel | Jaringan/Sel Hewan | Sel | Darah Utuh | Jaringan Tumbuhan | Jaringan Jamur | Bakteri dan Jamur yang Dikulturkan |
| Ekstraksi RNA | Metode manik magnetik: 18605/18607/18606; Metode kolom: 19221/19211; Metode trizol: 10606/19202 | Metode manik magnetik: 18600/18604; Metode kolom: 19231 | Metode kolom: 19241; Metode Trizol: 19201 | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode manik magnetik: 18534/18535/18537; Metode kolom: 19291ES/19292ES | Metode kolom: 19301 (jamur perlu menambahkan lisozim 10403) |
| Penghapusan rRNA | RNAse H (asam amino) penghilangan enzimatik: 12257; penghilangan cepat 3 menit: 12258 (penghilangan sumber manusia); penghilangan metode manik magnetik: 12266 (tipe universal mamalia)/12267 tipe universal unggas/12268 ayam peliharaan/12269 ikan zebra/12270 lalat buah/12275 tiram/12278 planaria/12285 lebah/12286 laba-laba jaring bola emas/12289 kutu/12290 Aedes albopictus/12287 nematoda | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik: 12257; penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan manusia, cocok untuk patogen) | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik, termasuk penghapusan globin: 12257 + 12806; RNase H penghapusan enzimatik globin: 13572; penghapusan cepat 3 menit: 12258 + 12260 | RNAse H (asam amino) penghapusan enzimatik: 12254; metode penghapusan manik-manik magnetik: 12262 angiospermae | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12271 jenis jamur universal | Metode penghilangan manik-manik magnetik: 12264 tipe universal bakteri/12265 tipe universal prokariotik |
| Pencernaan RNA Linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier | 14606 RNase R untuk menghilangkan molekul RNA linier |
| Pembangunan Perpustakaan | Kit konstruksi pustaka RNA non-campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12308 (kompatibel dengan Illumina dan MGI); Kit konstruksi pustaka RNA campuran: Kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12310 (kompatibel dengan Illumina dan MGI)/12340 (tanpa aktinomisin D, dUTP) | |||||
Metatranskriptom
[Metatranscriptome - Menangkap Perubahan Dinamis Mikroorganisme Aktif di Lingkungan Mikro Ekologi Mikro]
Pengurutan metatranskriptom: mempelajari aturan transkripsi dan regulasi semua genom dalam lingkungan tertentu pada tingkat keseluruhan.Mengambil semua RNA di lingkungan mikroekologi sebagai objek penelitian, ia menggabungkan pengurutan berthroughput tinggi untuk mempelajari perubahan komunitas mikroba kompleks pada tingkat transkripsi dan menambang gen aktif yang berperan.
Solusi Bahan Baku Penelitian Metatranskriptom
| Jenis Sampel | Bakteri dan Jamur yang Dikulturkan | Sampel Klinis |
| Ekstraksi RNA | Metode kolom: 19301 (jamur perlu menambahkan lywallzyme 10403) | Metode kolom: 19321 (ekstraksi DNA/RNA virus); Metode manik magnetik: 18521 (ekstraksi DNA/RNA virus); 18306 (ekstraksi DNA/RNA patogen) |
| Penghapusan rRNA | Penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan sumber manusia) | Penghapusan cepat 3 menit: 12258 (penghapusan sumber manusia) |
| Pembangunan Perpustakaan | Opsi 1. Konstruksi pustaka RNA total: kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12308ES (kompatibel dengan Illumina dan MGI); Opsi 2. Konstruksi pustaka pencernaan enzimatik cDNA: modul sintesis cDNA 13488ES + kit konstruksi pustaka pencernaan enzimatik cepat 12316ES | Pilihan 1. Konstruksi pustaka RNA total: kit konstruksi pustaka RNA mode ganda 12308ES (kompatibel dengan Illumina dan MGI); Pilihan 2.Konstruksi pustaka pencernaan enzimatik cDNA: modul sintesis cDNA 13488ES + kit konstruksi pustaka pencernaan enzimatik cepat 12316ES |
Rekomendasi Produk
| Nama Produk | Nomor Katalog | Spesifikasi |
| NGS yang kuat Waktu Standar Kit Persiapan Perpustakaan RNA EvoMax (dUTP) | Nomor telepon 12340ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Persiapan Pustaka RNA EvoMax (dNTP) | Nomor telepon 12341ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Persiapan Perpustakaan RNA Mode Ganda Ultima (Illumina dan MGI) | Nomor telepon 12308ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Persiapan Perpustakaan RNA Mode Ganda Ultima (versi campuran) | Nomor telepon 12310ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Isolasi mRNA Master V2 | Nomor telepon 12629ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Deplesi rRNA Manusia MaxUp (rRNA & ITS/ETS) | Nomor telepon 12257ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Deplesi rRNA MaxUp (Tanaman) | Nomor telepon 12254ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Penghapusan rRNA Satu Langkah (Manusia, 100-1.000 ng) | Nomor telepon 12258ES24/96 | 24T/ 96T |
| NGS yang kuatWaktu Standar Kit Penghapusan rRNA MagSP (Bakteri (G- dan G+)) dengan manik-manik pemurnian | Nomor telepon 12264ES24/96 | 24T/ 96T |