1.Latar Belakang
rRNA menyumbang proporsi yang tinggi dari Total RNA dalam organisme, tetapi dapat memberikan sedikit informasi yang efektif. RNA ini akan menghasilkan sejumlah besar data yang tidak valid, yang tidak terlalu penting untuk studi perolehan informasi biologis. Sementara itu, rRNA dengan proporsi yang tinggi membuat mRNA relatif berlimpah dalam transkrip rendah, sehingga memengaruhi deteksi transkrip dengan kelimpahan rendah. Oleh karena itu, dalam sekuensing RNA konvensional (RNA-SEQ), penghilangan rRNA yang efektif sangat penting untuk mencapai sekuensing RNA yang hemat biaya.
2.Deskripsi produk
(1) Seri MaxUp, Kit Deplesi rRNA
Rangkaian reagen penghilang rRNA MaxUp didasarkan pada pencernaan RNase H untuk menghilangkan RNA ribosom (rRNA) dari Total RNA sampel untuk mempertahankan RNA pembawa (mRNA) dan RNA non-coding lainnya. Jenis sampelnya beragam, jumlah awalnya beragam, seluruh proses memakan waktu kurang dari 2 jam, dan waktu operasi manualnya kurang dari 10 menit. Pada saat yang sama, rRNA dapat dihilangkan secara efisien untuk sampel konvensional dan sampel berkualitas rendah (seperti FFPE), yang secara signifikan meningkatkan informasi data yang efektif dalam pengurutan data, dan mewujudkan pengurutan sampel RNA yang hemat biaya.
（2）Proses penghapusan rRNA seri MaxUp
Saat ini, eliminasi RNase adalah metode utama penghilangan rRNA, terutama untuk beberapa sampel degradasi RNA (seperti sampel FFPE), eliminasi RNase dapat menunjukkan kelebihannya.
Gambar 1. Diagram skema prinsip penghilangan rRNA seri MaxUp
3. Tampilan Kinerja Produk
（1）Sampel tanaman
RNase H digunakan untuk mencerna dan menghilangkan RNA ribosom dari total RNA dari tanaman, dan qPCR digunakan untuk membandingkan perubahan ekspresi gen rRNA dan gen mRNA sebelum dan sesudah penghilangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa produk ini dapat secara efektif menghilangkan rRNA dari tanaman.
GAMBAR 2. 1μg RNA daun Arabidopsis digunakan untuk penghapusan rRNA, dan qPCR digunakan untuk membandingkan perubahan ekspresi gen rRNA dan gen mRNA sebelum dan setelah penghapusan.
（2）Sampel manusia/tikus/mencit
RNase H digunakan untuk mencerna dan membuang RNA ribosom dari total RNA tanaman, membangun perpustakaan, dan mengirim sekuensing. Analisis data menunjukkan bahwa produk ini dapat secara efisien membuang rRNA dari sampel tersebut.
Gambar 3. Total RNA manusia, tikus dan mencit diambil sebanyak 1μg sebagai sampel, dan residu rRNA dianalisis dengan sequencing setelah penghilangan rRNA.
（3）Sampel RNA kualitas rendah (misalnya RNA FFPE)
Sampel berkualitas rendah cenderung memiliki proporsi besar sekuens ITS/ETS (lihat RNA FFPE: DV200=20% pada gambar berikut), dan bagian sekuens ini juga akan menghasilkan sejumlah besar data yang tidak valid, jadi dengan menambahkan probe ITS/ETS pada sampel berkualitas rendah, sekuens target dapat diperkaya lebih efektif. Selain probe untuk Pra-rRNA 45S konvensional, desain probe untuk wilayah ITS/ETS 45S Manusia juga ditambahkan dalam produk ini, yang memastikan bahwa penghilangan rRNA pada sampel berkualitas rendah dapat lebih efisien tanpa memengaruhi efek penghilangan rRNA pada sampel konvensional.
Gambar 4.Perbandingan residu rRNA dan residu ITS/ETS sebelum dan sesudah penambahan probe ITS/ETS
4、Informasi pemesanan
| Tjenis | Pnama produk | Kode Produk | Spesifikasi produk |
| penghapusan rRNA perlengkapan | NGS yang kuatWaktu Standar Kit Deplesi rRNA Manusia MaxUp (rRNA & ITS/ETS) | Tanggal 12257ES08/24/96 | 24/8/96T |
| Tanggal 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |