説明
Hieff NGS® RNA Lib Prep 384 CDI Primer for Illumina は、Illumina ハイスループット シーケンシング プラットフォームの RNA ライブラリ構築専用のリンカー プライマー キットです。2 セットに分かれており、各セットには第 2 世代シーケンシング ライブラリで使用される PE アダプターと、i5 インデックス プライマー 8 個、i7 インデックス プライマー 12 個が含まれています。合計 16 個の i5 インデックス プライマーと 24 個の i7 インデックス プライマーが 2 セット用意されており、384 通りの両端インデックス ラベル ライブラリの組み合わせを構築できます。キットで提供されるすべての試薬は、ライブラリ構築の安定性と再現性を最大限に高めるために、厳格な品質管理と機能検証を受けています。
コンポーネント
いいえ。 |
名前 |
音量 |
12414ES02 |
PE アダプター |
320μL |
501-508 印刷 |
各60μL |
|
RP701-712 |
40 μLずつ |
|
12415ES02 |
PE アダプター |
320μL |
509-516 翻訳 |
各60μL |
|
RP713-724 |
40 μLずつ |
配送と保管
すべての部品はドライアイスとともに出荷され、-15℃〜-25℃で18か月間保管できます。
注記:
2) このキットに付属する PE アダプターは、完全なライブラリを取得するために PCR 増幅を必要とする汎用の短いアダプターです。インデックス プライマーは、ハイスループット シーケンス中にサンプルを区別するためのバーコード シーケンス タグを提供します。
3) このキットの各セットには、i5 インデックス プライマー (RP 5xx) が 8 個と i7 インデックス プライマー (RP 7xx) が 12 個含まれており、これらを組み合わせることで、96 通りの異なる両端インデックス ラベル ライブラリの組み合わせを構築できます。2 セットには、合計 16 通りの i5 インデックス プライマーと 24 通りの i7 インデックス プライマーが含まれています。カタログ番号 12414 の i5 インデックス プライマー (または i7 インデックス プライマー) とカタログ番号 12415 の i7 インデックス プライマー (または i5 インデックス プライマー) を使用して、最大 384 通りの異なる両端インデックス ラベル ライブラリの組み合わせを構築できます。
4) アダプターは加熱せず、室温でゆっくり溶かしてください。実験室の温度は 20 ~ 25 °C に設定するのが最適です。アダプターは凍結融解の繰り返しを避ける必要があり、小分けにして 4 °C で短期間保管することをお勧めします。
5) Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina® キットを使用して構築されたシーケンスライブラリ構造は次のとおりです。
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6) 安全と健康のため、白衣と使い捨て手袋を着用してください。
7) この製品は科学研究目的のみにご使用いただけます。
説明書
1. アダプターの使用: 使用するライブラリ構築マニュアルに記載されているさまざまな入力量に対する推奨投与量に従って、適切な濃度に希釈します。
2. インデックスプライマーの使用:ライブラリ構築マニュアルの中国語ライブラリ増幅システムに従って反応系を準備し(下表参照)、反応手順はライブラリ構築マニュアルの手順に従って設定します。
名前 |
容量(μL) |
2 ×高忠実度 DNA PCR ミックス |
25 |
RP500 の検索結果 |
2.5 |
RP7xx の |
2.5 |
アダプター連結DNA |
20 |
合計 |
50 |
配列情報
イルミナ用PEアダプター:
5´-/5Phos/ GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT*C -3´
5´-ACACTCTTTCCCTACACGACGCTTCCTTCGATC*T-3´
イルミナ用i5インデックスプライマー:
5´-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC [i5 インデックス] ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT -3´
イルミナ用i7インデックスプライマー:
5´- CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT [i7 インデックス] GTGACTGGAGTTCAGACCGTGTGCTCTTCCGATC -3´
[i5 インデックス] 8 bp のi5インデックス配列、 [i7 インデックス] 8 bp のi7 インデックス配列。
各プライマーに対応するインデックス名、プライマーに含まれるインデックス配列、およびシーケンス中の対応するインデックス配列情報を次の表に示します。
I5インデックス名 |
I5インデックス 順序 |
シーケンス中のインデックスシーケンス情報 |
|
NovaSeq 6000 v1.0試薬、MiSeq、 ハイシーク2000/2500 |
NovaSeq 6000 v1. 5試薬、 ミニシーク、ネクストシーク、 |
||
RP501 |
タタグCCT |
タタグCCT |
アグクタタ |
RP502 |
アタガグク |
アタガグク |
GCCTCTAT |
RP503 |
CCTATCCT |
CCTATCCT |
アガタグ |
RP504 |
GGCTCTGA |
GGCTCTGA |
TCAGAGCC |
RP505 |
AGGCGAAG |
AGGCGAAG |
CTTCGCCT |
RP506 |
タートッタ |
タートッタ |
タガッタ |
RP507 |
キャグガックト |
キャグガックト |
ACGTCCTG |
RP508 |
GTACTGAC |
GTACTGAC |
GTCAGTAC |
RP509 |
ガクガク |
ガクガク |
タカグットシー |
RP510 |
ATGTAACT |
ATGTAACT |
アグタキャット |
RP511 |
GTTTCAGA |
GTTTCAGA |
TCTGAAAC |
RP512 |
カカガット |
カカガット |
ATCCTGTG |
RP513 |
タグCTGCC |
タグCTGCC |
GGCAGCTA |
RP514 |
AGCGAATG |
AGCGAATG |
CATTCGCT |
RP515 |
タットグクティ |
タットグクティ |
GCAGCATA |
RP516 |
アガアガクト |
アガアガクト |
AGTCTTCT |
I7インデックス名 |
I7インデックスシーケンス |
シーケンス中のインデックスシーケンス情報 |
RP701 |
CGAGTAAT |
攻撃CG |
RP702 |
TCTCCGGA |
TCCGGAGA |
RP703 |
AATGAGCG |
CGCTCATT |
RP704 |
GGAATCTC |
ガガットCC |
RP705 |
TTCTGAAT |
アトカガ |
RP706 |
ACGAATTC |
GAATTCGT |
RP707 |
AGCTTCAG |
CTGAAGCT |
RP708 |
GCGCATTA |
TAATGCGC |
RP709 |
カタログCCG |
CGGCTATG |
RP710 |
TTCGCGGA |
TCCGCGAA |
RP711 |
GCGCGAGA |
TCTCGCGC |
RP712 |
CTATCGCT |
AGCGATAG |
RP713 |
CCTACACG |
CGTGTAGG |
RP714 |
グタグティティーシー |
ガクタク |
RP715 |
TGTATGCA |
TGCATACA |
RP716 |
CCAGACTG |
キャグティグ |
RP717 |
AGGTGCCA |
TGGCACCT |
RP718 |
TCACCTTG |
ガガ |
RP719 |
GTATCTTT |
AAAGATAC |
RP720 |
CAGCTCCA |
TGGAGCTG |
RP721 |
TCGCCTTA |
タグ |
RP722 |
タグタグ |
CGTACTAG |
RP723 |
AGCGTAGC |
GCTACGCT |
RP724 |
ガクシー |
CGAGGCTC |
支払いとセキュリティ
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問い合わせ
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よくある質問
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