Какова роль ДНК-полимеразы Bst в LAMP?
Технология изотермической амплификации нуклеиновых кислот может быть разделена на множество категорий в соответствии с различными принципами амплификации. В настоящее время наиболее распространенной и широко используемой является технология петлевой изотермической амплификации (LAMP), разработанная японским ученым Нотоми и др. в 2000 году. Bst ДНК-полимераза является основным ферментом технологии изотермической амплификации. Каковы функция и производительность Bst ДНК-полимеразы в LAMP?
1. Какую роль играет ДНК-полимераза Bst в LAMP?
2. Что такое лиофилизированная ДНК-полимераза Bst Plus?
3. Какова особенность продукта? Лиофилизированный Бст Плюс ДНК Полимераза(14405ES)?
4. Каковы эксплуатационные характеристики лиофилизированного продукта? Бст Плюс ДНК Полимераза (14405ES)?
5. Сопутствующие товары
6. О чтении
1. Какую роль играет ДНК-полимераза Bst в LAMP?
Техническая особенность LAMP заключается в разработке четырех праймеров для шести областей целевого гена и проведении реакции амплификации с использованием ДНК-полимеразы BST в условиях постоянной температуры 60~65 ℃, достигая 109-1010-кратной амплификации в течение 15-60 минут. ДНК-полимераза BST обладает высокой термостабильностью, активностью смещения цепи и полимеразной активностью. Она может быть быстрой, эффективной и специфической матрицей амплификации в условиях постоянной температуры без цикла амплификации тепловой денатурации ПЦР и завершить весь эксперимент LAMP в течение 1 часа.
2. Что такое лиофилизированная ДНК-полимераза Bst Plus?
Лиофилизированная ДНК-полимераза Bst Plus используется для замораживания ДНК-полимеразы Bst Plus без глицерина, что решает проблему нестабильности фермента Bst без глицерина. В то же время этот продукт обладает сильной 5'-3' ДНК-полимеразной активностью, активностью смещения цепи и толерантностью к dUTP, что больше подходит для реакции изотермической амплификации против загрязнения. Его удобно использовать клиентам при производстве лиофилизированных продуктов.
Рисунок 1: 14405ES-лиофилизированная ДНК-полимераза Bst Plus (60 ед./мкл, без глицерина)
3. Какова особенность продукта Лиофилизированный? Бст Плюс ДНК Полимераза (14405ES)?
- Фермент без глицерина, подходит для лиофилизации
- Транспортировка при нормальной температуре для снижения затрат
- Сильная активность смещения нитей, чувствительная и стабильная
- Быстрое повторное растворение и удобство эксплуатации
4. Каковы эксплуатационные характеристики лиофилизированного продукта? Бст Плюс ДНК Полимераза (14405ES)?
4.1 Форма лиофилизированного порошка: по сравнению с моментом T0 форма порошка остается неизменной после лиофилизации при 45 ℃ - 15 ДНЕЙ.
Рисунок 2. Форма лиофилизированного порошка
4.2 стабильность
Эффективность лиофилизированного порошка после термического ускорения может по-прежнему соответствовать эффективности жидкого реагента, а лиофилизированный порошок (14405ES)
универсален и может использоваться для метода флуоресцентного красителя и метода индикатора pH.
4.2.1 Метод флуоресцентного красителя — стабильность
В системе амплификации флуоресцентного красителя RT-LAMP эффективность лиофилизированного порошка Bst без глицерина после T0, 45℃-7 дней и 45℃-15 дней теплового ускорения соответствует эффективности жидкой версии фермента Bst без глицерина, а NTC не достигает пика.
Условия эксперимента:
Система | RT-LAMP Флуоресцентный краситель метод | Инструмент | Q5, СЛАН |
Шаблон | РНК COVID-19 | Концентрация | 50экз./т |
Процедура | 37℃, 2 минуты. 65℃, 60 минут |
Примечание: Контрольная группа представляет собой жидкую версию без глицеринового фермента Bst той же концентрации.
Рисунок 3. Результаты стабильности
4.2.2 Метод флуоресцентного красителя ——Характеристики фермента Bst после лиофилизации системы RT-LAMP
В системе амплификации флуоресцентного красителя RT-LAMP производительность продукта безглицеринового лиофилизированного порошка Bst, лиофилизированного в системе RT-LAMP после 45 ℃ - 15 дней, соответствовала производительности жидкой версии безглицеринового фермента Bst. Уровень обнаружения продукта в контрольной группе и системе RT-LAMP после лиофилизации составил 100% (16/16) и 94% (15/16) соответственно.
Условия эксперимента:
Система | RT-LAMP Флуоресцентный краситель метод | Инструмент | Q5, СЛАН |
Шаблон | РНК COVID-19 | Концентрация | 50экз./т |
Процедура | 37℃, 2 минуты. 65℃, 60 минут |
Примечание: Контрольная группа представляет собой жидкую версию без глицеринового фермента Bst той же концентрации.
Рисунок 4. Эффективность фермента Bst после лиофилизации системы RT-LAMP
4.2.3 Метод индикатора pH ——Стабильность
В системе амплификации индикатора pH RT-LAMP по сравнению со временем T0 уровень обнаружения лиофилизированного порошка Bst составил 88% (7/8) после 45 ℃ - 15 дней термического ускорения.
Условия эксперимента:
Система | Метод индикации РТ-ЛАМП PH | Шаблон | РНК COVID-19 |
Процедура | 37℃, 2 минуты. 65℃, 60 минут | Концентрация | 50экз./т |
Примечание: Контрольная группа представляет собой жидкую версию без глицеринового фермента Bst той же концентрации.
Рисунок 5. Результаты стабильности
4.2.4 Метод индикатора PH ——Устойчивость к повторному замораживанию
В системе амплификации индикатора pH RT-LAMP после 45 ℃ - 7 дней повторного замораживания производительность стабильна. Контрольная группа - жидкий фермент Bst. По сравнению с контрольной группой, уровень обнаружения 14405ES после термического ускорения составляет 94% (30/32).
Условия эксперимента:
Система | Метод индикации РТ-ЛАМП PH | Шаблон | РНК COVID-19 |
Процедура | 37℃, 2 минуты. 65℃, 60 минут | Концентрация | 50экз./т |
Примечание: Контрольная группа представляет собой жидкую версию без глицеринового фермента Bst той же концентрации.
Рисунок 6. Результаты стабильности при повторном замораживании
4.3 Специфичность
В системе амплификации флуоресцентного красителя RT-LAMP 48-луночный NTC не достиг пика, а специфичность 14405ES составила 100%.
Условия эксперимента:
Система | RT-LAMP Флуоресцентный краситель метод | Инструмент | Q5, СЛАН |
Шаблон | РНК COVID-19 | Концентрация | 50экз./т |
Процедура | 37℃, 2 минуты. 65℃, 60 минут |
Примечание: Контрольная группа представляет собой жидкую версию без глицеринового фермента Bst той же концентрации.
Рисунок 7. Конкретные результаты
5. Сопутствующие товары
Сопутствующие продукты, которые может предоставить Yeasen, показаны в Таблице 1.
Таблица 1.Сопутствующие товары
Позиционирование продукта | Название продукта | Кот# |
Высокочувствительный фермент Bst | ДНК-полимераза Hieff™ Bst Plus (40 ед./мкл) | 14402ES |
ДНК-полимераза Hieff™ Bst Plus (2000 ед./мкл) (Запросить) | 14403ES | |
Лиофилизированный Бст Плюс ДНК Полимераза ( 60 Ед/мкл, без глицерина) | 14405ES | |
Метод флуоресцентного красителя | Набор для анализа красителей RT-LAMP (UDG plus) | 13762ES |
Метод индикации pH | РТ-ЛАМПА рН Чувствительный Краситель Хромогенный Версия Сублимируемая Реагент (Запросить) | 13920ES |
COVID-19 | РТ-ЛАМПА COVID-19 (рН Индикатор Метод) Лиофилизированный Бусины (Запросить) | 13919ES |
РТ-ЛАМПА COVID-19 Праймер Владелец Смешивание (Н) (Запросить) | 13995ES | |
Обратная транскриптаза, подходящая для RT-Lamp | Hifair™ Ⅲ Обратная транскриптаза (Запросить) | 11111ES |
Hifair™ Ⅲ Обратная транскриптаза, без глицерина (Запросить) | 11297ES | |
Ингибитор мышиной РНКазы | Ингибитор мышиной РНКазы (40 ЕД/мкл) | 10603ES |
Ингибитор мышиной РНКазы (200 ЕД/мкл, без глицерина) | 10703ES | |
Термолабильный УДГ | Урацил-ДНК-гликозилаза (УДГ/УНГ), термолабильная, 1 ед/мкл (Запросить) | 10303ES |
Высокочистый dUTP | dUTP (100 мМ раствор) | 10128ES |
6. О чтении
Выбор правильного ключевого ферментного сырья для повышения чувствительности и скорости LAMP/RT-LAMP!
Руководство по выбору обратной транскриптазы
ЙЕСЕН УДГ: «Эксперт по борьбе с обрастанием» в реакциях ПЦР