เพื่อนที่รัก คุณรู้สึกสูญเสียเมื่อต้องเผชิญกับ Loading Control และ Epitope Tagging Antibodies ต่างๆ ในระหว่างการทำ Protein Immunoblotting หรือไม่? Loading Control โปรตีนถูกเข้ารหัสโดยยีนควบคุมภายในสิ่งมีชีวิตและแสดงออกอย่างเสถียรในเนื้อเยื่อหลายชนิด โปรตีนถูกใช้เพื่อตรวจสอบว่าการทดลองทางภูมิคุ้มกันดำเนินไปตามปกติหรือไม่ และเป็นมาตรฐานการตรวจจับแบบกึ่งเชิงปริมาณสำหรับการแสดงออกของโปรตีน ดังนั้น คุณจะเลือกแอนติบอดีควบคุมการโหลดอย่างถูกต้องได้อย่างไร คุณสามารถอ้างอิงถึงประเด็นต่อไปนี้

I. ตัวอย่างสายพันธุ์ต้นกำเนิด

  1. สำหรับตัวอย่างจากเนื้อเยื่อหรือเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม โดยทั่วไปให้เลือก β-actin, α-tubulin, GAPDH, Lamin-B, Histone H3, Na+/K+-ATPase
  2. สำหรับตัวอย่างที่ได้จากพืช โดยทั่วไปให้เลือกแอกตินจากพืช รูบิสโก ฯลฯ
  3. สำหรับตัวอย่างอื่นที่มีการวิจัยน้อยกว่า ให้เลือกโปรตีนที่เหมาะสมเป็นข้อมูลอ้างอิงภายในโดยศึกษาเอกสารหรือฐานข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
II. น้ำหนักโมเลกุลของโปรตีนเป้าหมาย

ให้แน่ใจว่าน้ำหนักโมเลกุลของโปรตีนเป้าหมายแตกต่างจากน้ำหนักโมเลกุลของการควบคุมการโหลด มากกว่า 5KDa เพื่อป้องกันการรบกวนระหว่างการตรวจจับ ตัวอย่างเช่น หากโปรตีนเป้าหมายคือ 40KDa จะไม่เหมาะสมที่จะเลือก β-actin (42KDa) เป็นตัวควบคุมการโหลด พิจารณาใช้ GAPDH (36KDa) หรือ β-tubulin (55KDa) เป็นตัวควบคุมการโหลด

III. ไซต์การแสดงออกของโปรตีนอ้างอิงภายใน

ดังนั้นการเลือกการควบคุมการโหลด โปรตีนจะแตกต่างกันไปตามแหล่งสกัดโปรตีน ตัวอย่างเช่น เมื่อสกัดโปรตีนในไซโทพลาสซึมและโปรตีนในนิวเคลียสแยกกันแทนที่จะสกัดโปรตีนทั้งหมด ให้เลือกการควบคุมการโหลด โปรตีนที่แสดงออกในไซต์ที่เกี่ยวข้อง ตัวอย่างเช่น H3 แสดงออกอย่างมากและเสถียรในนิวเคลียสของเซลล์ และในทางทฤษฎีจะไม่แสดงออกในไซโทพลาซึม ดังนั้น สำหรับการสกัดโปรตีนในไซโทพลาซึม จึงไม่ควรใช้ H3 เป็นโปรตีนอ้างอิงภายใน ให้เลือก β-actin, GAPDH, α-Tubulin เป็นต้น ซึ่งแสดงออกในไซโทพลาซึมเป็นโปรตีนอ้างอิงภายในแทน

หมายเหตุ: หลีกเลี่ยงสถานการณ์ต่อไปนี้เมื่อใช้งาน โหลดควบคุมแอนติบอดี

การระบุตำแหน่งย่อยของเซลล์

โหลดโปรตีนควบคุม

น้ำหนักโมเลกุล (KDa)

หมายเหตุ

ไซโทพลาซึม เซลล์ทั้งหมด

เบต้า-แอกติน

42

ไม่เหมาะสำหรับสารสกัดนิวเคลียร์ β-แอกตินเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์การปรับโครงสร้างโครมาติน อาจไม่เหมาะสำหรับสถานการณ์ที่ความแตกต่างของอายุในกลุ่มผู้เข้าร่วมการวิจัยมีนัยสำคัญ

อัลฟา-ทูบูลิน

55

ไม่เหมาะสำหรับสถานการณ์ที่อายุของผู้เข้าร่วมการวิจัยแตกต่างกันอย่างมาก การแสดงออกของทูบูลินจะเปลี่ยนไปเมื่อใช้ยาต้านจุลชีพและยาต้านไมโทซิส ดังนั้นจึงไม่เหมาะสำหรับใช้ร่วมกับยาต้านมะเร็งและยาต้านเชื้อรา

เบต้า-ทูบูลิน

55

GAPDH

36

ภาวะเซลล์ขาดออกซิเจนจะทำให้การแสดงออกของ GAPDH เพิ่มขึ้น ดังนั้นจึงไม่เหมาะสำหรับการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับออกซิเจน ปัจจัยต่างๆ เช่น เบาหวาน อาจทำให้การแสดงออกของ GAPDH เพิ่มขึ้น

วินคูลิน

117

สามารถอ้างถึงโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลขนาดใหญ่ได้

ไมโตคอนเดรีย

ซีรีย์ COXIV

15-17

โปรตีนซีรีส์นี้ส่วนใหญ่มีความเข้มข้นที่ 15-17KDa หากน้ำหนักโมเลกุลของโปรตีนเป้าหมายใกล้เคียงกัน ให้พิจารณาแอนติบอดีควบคุมการโหลดอื่น

HSP60

60

นิวเคลียส

วีดีเอซี1/2

31-37

โปรตีนในกลุ่มนี้มีความเข้มข้นอยู่ที่ 31-37KDa เป็นหลัก

ลามิน บี1

66

ไม่เหมาะสำหรับเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อน ไม่เหมาะสำหรับเป็นตัวควบคุมการโหลด ในการทดลองเรื่องอะพอพโทซิส

พีซีเอ็นเอ

36

ไม่เหมาะสำหรับเซลล์ที่ไม่เจริญเติบโต

ทีบีพี

33-43

TBP มีค่า 37-43KDa ในมนุษย์ และ 33-36KDa ในหนูและหนูทดลอง ซึ่งไม่เหมาะสำหรับการทดลองอะพอพโทซิส

ปี1

65-70

ฮิสโตน เอช 3

17

โปรตีนส่วนใหญ่มีน้ำหนักโมเลกุลประมาณ 17KDa หากน้ำหนักโมเลกุลของโปรตีนเป้าหมายใกล้เคียงกัน ให้พิจารณาใช้แอนติบอดีควบคุมโหลดอื่นๆ

เลือดทั้งหมด ซีรั่ม พลาสมา

ทรานสเฟอริน

77

การแสดงออกได้รับผลกระทบจากภาวะโรคและการรักษาบางอย่าง เช่น กรดเรตินอยด์

อัลบูมิน

66

เนื้อหาค่อนข้างสูง ควรใส่ใจกับการลดการโหลดตัวอย่างในการทดลอง WB

ฉลากแอนติบอดีทำงานได้ดีขึ้นเมื่อใช้ร่วมกัน

ในการทดลองศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน เช่น การดึงลง แท็กเอพิโทปสามารถรวมเข้ากับปลาย N หรือ C ของโปรตีนเป้าหมายได้โดยใช้วิธีทางชีววิทยาโมเลกุล แท็กเอพิโทปที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่ His, HA, Myc และ GST โดยปกติแล้วแท็กเอพิโทปเหล่านี้จะไม่ส่งผลต่อกิจกรรมทางชีวภาพและตำแหน่งภายในเซลล์ของโปรตีนเป้าหมาย การเกิดขึ้นของแท็กเอพิโทปทำให้การวิจัยทางวิทยาศาสตร์และการผลิตทางอุตสาหกรรมสะดวกยิ่งขึ้น

แท็กเอพิโทป

ลำดับแท็ก

น้ำหนักโมเลกุล -เคดีเอ-

แท็ก HA

ยพยดวปดยา

1.1

แท็ก MYC

อีคิวเคลิสซีดล์

1.2

ป้ายธง

DYKDDDDK

1

ป้ายภาษี GST

-

26

แท็ก GFP

-

26.9

แท็ก V5

จีเคพีพีเอ็นพีแอลจีดีเอสที

1.4

เอสแท็ก

เคตาอักเฟอร์กฮมดีส

1.8

อีแท็ก

GAPVPYPDPLEPR

1.4

ข้อมูลสินค้า

พิมพ์

ชื่อสินค้า

น้ำหนักโมเลกุล -เคดีเอ-

หมายเลขสินค้า

โหลดควบคุมแอนติบอดี

β-แอกติน, mAb ของเมาส์

42

30101ES

เบต้า-แอกติน กระต่าย pAb

42

30102ES

GAPDH (โคลน:1A6), mAb ของเมาส์

36

30201ES

GAPDH, กระต่าย pAb

36

30202ES

α-Tubulin, mAb ของเมาส์

50-55

30304ES

β-ทูบูลิน, mAb ของเมาส์

50-55

30301ES

เบต้า-ทูบูลิน กระต่าย pAb

50-55

30302ES

การสอบถาม