การวัดปริมาณกรดนิวคลีอิกซึ่งเป็นหนึ่งในการทดลองพื้นฐานที่สุดในชีววิทยาโมเลกุล ส่งผลโดยตรงต่อผลลัพธ์ของการทดลองต่อเนื่อง ความแม่นยำของการวัดปริมาณกรดนิวคลีอิกถือเป็นสิ่งสำคัญ ปัจจุบันมีวิธีหลักสองวิธีในการวัดปริมาณไลบรารี NGS ได้แก่ วิธีการดูดกลืนรังสีอัลตราไวโอเลต และวิธีการใช้สีย้อมเรืองแสง

วิธีการดูดกลืนแสงอัลตราไวโอเลตใช้เครื่องสเปกโตรโฟโตมิเตอร์ในการวัดค่าการดูดกลืนแสงที่ 260 นาโนเมตรสำหรับการวัดปริมาณดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ นอกจากนี้ยังประมาณความบริสุทธิ์ของกรดนิวคลีอิกโดยการคำนวณอัตราส่วน OD260/OD280 อย่างไรก็ตาม ค่าที่ตรวจพบมีความอ่อนไหวสูงต่อการรบกวนจากสารปนเปื้อนอื่นๆ เช่น นิวคลีโอไทด์อิสระ เกลือ และสารประกอบอินทรีย์

การวัดปริมาณฟลูออโรเมตริกของคิวบิตใช้สีย้อมเรืองแสงที่จับกับดีเอ็นเอสายคู่ ดีเอ็นเอสายเดี่ยว อาร์เอ็นเอ หรือโปรตีนโดยเฉพาะ เมื่อถูกกระตุ้นด้วยแหล่งกำเนิดแสงที่มีความยาวคลื่นเฉพาะ สีย้อมจะเปล่งแสงเรืองแสง ซึ่งจะไม่ได้รับผลกระทบจากโมเลกุลสิ่งเจือปนอื่นๆ ที่อาจอยู่ในตัวอย่าง ความเข้มของแสงเรืองแสงจะแปรผันตามความเข้มข้นของโมเลกุลเป้าหมายในตัวอย่าง

ตารางที่ 1 การเปรียบเทียบวิธีการวัดปริมาณกรดนิวคลีอิกแบบหลัก

เป้า

ยูวี เอบีเอส (นาโนดรอป)

คิวบิต ดีเอ็นเอ เอชเอส

คิวบิต ดีเอ็นเอ บีอาร์

คิวบิตอาร์เอ็นเอ

คิวบิต ssDNA

ชนิดของกรดนิวคลีอิก

ดีเอ็นเอ,อาร์เอ็นเอ

ดีเอสดีเอ็นเอ

ดีเอสดีเอ็นเอ

อาร์เอ็นเอ

ssDNA,โอลิโก

ความเข้มข้นของตัวอย่าง (ng/μL)

2 นาโนกรัมต่อไมโครลิตร-15 ไมโครกรัมต่อไมโครลิตร

10 pg/µL-100 ng/µL

0.1 นาโนกรัม/µL-1000 นาโนกรัม/µL

250 พีจี/µl-1000 นาโนกรัม/µl

50 pg/μL-200 ng/μL

ข้อได้เปรียบ

ขีดจำกัดการวัดที่สูงกว่า

ความเฉพาะเจาะจงดี

มีขอบเขตการวัดที่กว้าง

มีการคัดเลือก RNA สูง

ทนทานดี

ข้อจำกัด

ความจำเพาะไม่ดี

ป้องกันแสงขณะใช้งาน

ป้องกันแสงขณะใช้งาน

ป้องกันแสงขณะใช้งาน

ความจำเพาะต่ำและยังจับกับ dsDNA ด้วย

การดูดกลืนแสงยูวีและการวัดปริมาณฟลูออโรเมตริกของ Qubit ต่างก็มีข้อดีและสามารถเสริมซึ่งกันและกันได้ สำหรับการวัดปริมาณเบื้องต้นของตัวอย่างกรดนิวคลีอิกทั่วไปเพื่อกำหนดความเข้มข้น ความบริสุทธิ์ และการมีอยู่ของสารปนเปื้อน สามารถเลือกวิธีการวัดปริมาณการดูดกลืนแสงได้ การวัดปริมาณคิวบิตเหมาะสำหรับตัวอย่างมีค่าที่มีความเข้มข้นต่ำหรือการวัดปริมาณที่แม่นยำซึ่งจำเป็นสำหรับการทดลองปลายน้ำ เช่น การจัดลำดับรุ่นถัดไปและ PCR เชิงปริมาณแบบเรียลไทม์

Yeasen ได้เปิดตัวผลิตภัณฑ์วัดปริมาณ Qubit หลายรายการ: ชุดทดสอบ dsDNA HS สำหรับ Qubit (หมายเลขสินค้า #12640) พร้อมใช้งาน: ชุดทดสอบ dsDNA HS สำหรับ Qubit 1 ชุด (Cat#12642) ชุดทดสอบ ssDNA สำหรับ Qubit (หมายเลขหมวดหมู่ 12645) และ dsDNA BR Assay Kit (หมายเลขหมวดหมู่ 12643) ซึ่งได้รับการยกย่องอย่างกว้างขวางนับตั้งแต่เปิดตัว

โซลูชัน 1 dsDNA HS การวัดค่าความไวสูง

พรีมิกซ์สำหรับวัดปริมาณ dsDNA แบบพร้อมใช้งาน—ชุดทดสอบ dsDNA HS 1× สำหรับ Qubit

ใช้งานง่าย: พรีมิกซ์พร้อมใช้งาน ไม่จำเป็นต้องผสมล่วงหน้า

ความไวสูง: ตรวจจับความเข้มข้นต่ำถึง 50 pg/μL

เสถียรภาพที่ดี: สัญญาณการเรืองแสงคงอยู่ได้นาน 3 ชั่วโมง และการเก็บรักษาที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 20 วันไม่ส่งผลกระทบต่อความแม่นยำของการวัดปริมาณ

A. ความเสถียรที่ยอดเยี่ยม: การจัดเก็บที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 2 สัปดาห์ยังคงมีเสถียรภาพ (ค่าที่วัดได้เบี่ยงเบนจากค่าทางทฤษฎีน้อยกว่า 10%)

ตารางที่ 2 การทดสอบเสถียรภาพของตัวอย่างต่างๆ ที่อุณหภูมิ 4°C และอุณหภูมิห้องเมื่อเปรียบเทียบกับผลิตภัณฑ์คู่แข่ง

สารเคมีเชิงปริมาณ

มุ่งมั่น ความเข้มข้น ของ λDNA(ng/μL)

0วัน

1วัน

3 มิติ

7วัน

10วัน

14วัน

ต* 4℃

0.51

0.496

0.524

0.534

0.495

0.499

Yeasen 4℃

0.51

0.508

0.513

0.475

0.48

0.495

Yeasen อุณหภูมิห้อง พื้นที่จัดเก็บ

0.51

0.517

0.506

0.486

0.506

0.523

สารเคมีเชิงปริมาณ

มุ่งมั่น ความเข้มข้น ของลูกวัว gDNA(ng/μL)

0วัน

1วัน

3 มิติ

7วัน

10วัน

14วัน

ต* 4℃

55.3

53.5

55.40

57.9

55.8

58

Yeasen 4℃

59.4

55.4

57.8

56.1

56.3

59.8

Yeasen อุณหภูมิห้อง พื้นที่จัดเก็บ

59

55.7

61.3

58

58.7

56.1

B. ความไวสูง ความเสถียรของชุดต่อชุดดี

ตารางที่ 3.การทดสอบเสถียรภาพของแบตช์ที่แตกต่างกัน

บีแมทช์

ตัวอย่าง

ล*

Yeasen

ข้อผิดพลาด

ความเข้มข้น1(ng/μL)

ความเข้มข้น2(ng/μL)

ค่าเฉลี่ย (นาโนกรัม/ไมโครลิตร)

ความเข้มข้น1(ng/μL)

ความเข้มข้น2(ng/μL)

ค่าเฉลี่ย (นาโนกรัม/ไมโครลิตร)

D9801060

λDNA

0.3160

0.3250

0.3205

0.320

0.320

0.320

0.16%

D8801050

0.3310

0.3320

0.3315

0.319

0.306

0.3125

5.73%

D7813110

0.345

0.358

0.352

0.334

0.329

0.332

-6.03%

โซลูชัน 2 dsDNA BR การวัดปริมาณแบบช่วงกว้าง

การวัดปริมาณ dsDNA ช่วงกว้าง—ชุดทดสอบ dsDNA BR

ความไวสูง: ตรวจจับความเข้มข้นต่ำถึง 50 pg/μL

ความเป็นเส้นตรงที่ยอดเยี่ยม: ความเป็นเส้นตรงที่ดีในช่วง 2-1000 ng;

ความทนทานต่อสารปนเปื้อนที่แข็งแกร่ง: สามารถทนต่อสารปนเปื้อนทั่วไปได้

ตารางที่ 4 ความเสถียรและความทนทานต่อสารปนเปื้อนเมื่อเทียบกับคู่แข่ง

Yeasen บีอาร์

ต* บีอาร์

มาตรฐาน

รฟยู1

รฟยู2

ค่าเฉลี่ย

ข้อผิดพลาด

มาตรฐาน

รฟยู1

รฟยู2

ค่าเฉลี่ย

ข้อผิดพลาด

เอสวัน

159.63

160.71

160.17

1%

เอสวัน

216.17

211.56

213.865

-2%

S2

24497.0

25078.64

24787.82

2%

S2

20532.46

20452.26

20492.36

0%

การวัด

การวัด

สารปนเปื้อน

ความเข้มข้นในตัวอย่าง 10 μL

ความเข้มข้น1

ความเข้มข้น2

ค่าเฉลี่ย

ที่ต้องทดสอบ/ควบคุม

สารปนเปื้อน

ความเข้มข้นในตัวอย่าง 10 μL

ความเข้มข้น1

ความเข้มข้น2

ค่าเฉลี่ย

ที่ต้องทดสอบ/ควบคุม

การควบคุม (เอช2โอ)

-

49

48.6

48.8

0.0%

การควบคุม (เอช2โอ)

-

49.8

48

48.9

0.0%

บีเอสเอ

1มก./มล.

51.8

52

51.9

6.4%

บีเอสเอ

1มก./มล.

54

51.2

52.6

7.6%

เอธานอล

20%

44.6

44

44.3

-9.2%

เอธานอล

20%

44.8

43.4

44.1

-9.8%

คลอโรฟอร์ม

4.00%

49.0

49.8

49.4

1.2%

คลอโรฟอร์ม

4.00%

50.0

47

48.5

-0.8%

เอสดีเอส

0.2%

46.6

45.8

46.2

-5.3%

เอสดีเอส

0.2%

53.2

51.6

52.4

7.2%

ไทรชั่น-X100

0.20%

41.6

40.6

41.1

-15.8%

ไทรชั่น-X100

0.20%

53

51

52.0

6.3%

dNTPs

2ม.ม.

44.2

45

44.6

-8.6%

dNTPs

2ม.ม.

47.8

46.4

47.1

-3.7%

โซลูชันที่ 3 การหาปริมาณ ssDNA

ตัวเลือกที่เหมาะสำหรับการวัดปริมาณ ssDNA—ชุดทดสอบ ssDNA ที่มีประสิทธิภาพคุ้มต้นทุนสูงสำหรับ Qubit

ความไวสูง: ตรวจจับความเข้มข้นต่ำถึง 50 pg/μL
ความเป็นเส้นตรงที่ยอดเยี่ยม: ความเป็นเส้นตรงที่ดีในช่วง 0-200 ng;
สัญญาณเสถียร: สีย้อมคุณภาพเยี่ยมที่ใช้ร่วมกับบัฟเฟอร์ที่ได้รับการอัพเกรดให้เหมาะสม สามารถรักษาความเข้มของการเรืองแสงให้คงที่ที่อุณหภูมิห้อง และสามารถใช้ได้อย่างมีประสิทธิภาพแม้ในสภาพแวดล้อมที่มีมลพิษทั่วไป เช่น เกลือ นิวคลีโอไทด์อิสระ ตัวทำละลาย ผงซักฟอก หรือโปรตีน ช่วยให้วัดปริมาณได้อย่างแม่นยำ
ความเสถียรที่ดี: ไม่มีการเปลี่ยนแปลงประสิทธิภาพที่สำคัญหลังการบำบัดที่อุณหภูมิ 4°C หรือ 25°C เป็นเวลา 6 เดือน
ขอบเขตการใช้งานที่กว้างขวาง: กระบวนการทำงานที่เรียบง่าย ช่วยให้สามารถวัดปริมาณโอลิโคนิวคลีโอไทด์ ไพรเมอร์ DNA ที่ถูกเปลี่ยนสภาพ DNA วงจรสายเดี่ยว ฯลฯ ได้อย่างรวดเร็ว

A. ความสามารถในการทำซ้ำได้ดี: การวัดปริมาณในเครื่องมือคิวบิตที่แตกต่างกัน ประเภทของตัวอย่างที่แตกต่างกันโดยใช้ Yeasen ทดสอบ Cat#12645 หลายชุดแล้ว อยู่ในช่วง 0-200ng ความสามารถในการทำซ้ำได้ดีในการวัดจากเครื่องมือ Qubit ต่างๆ

รูปที่ 1 การทดสอบเสถียรภาพของแบตช์ต่างๆ ในอุปกรณ์คิวบิตต่างๆ

B. ความเสถียรที่ดี: การทดสอบความเสถียรของสารละลายทำงานมาตรฐานและ 1 เท่า เป็นเวลา 10 วันที่อุณหภูมิ 37°C สัญญาณการเรืองแสงมีเสถียรภาพ การตรวจสอบความเสถียรในระยะยาวเก็บไว้ที่อุณหภูมิ 25°C เป็นเวลา 6 เดือน ประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สอดคล้องกับการควบคุมที่ 4°C

ตารางที่ 5 การทดสอบเสถียรภาพมาตรฐานและตัวอย่าง

เก็บที่อุณหภูมิ 4℃ เป็นเวลาหนึ่งเดือน

เก็บที่อุณหภูมิ 4℃ เป็นเวลา 2 เดือน

เก็บที่อุณหภูมิ 25℃ เป็นเวลา 2 เดือน

เก็บที่อุณหภูมิ 25℃ เป็นเวลา 6 เดือน

มาตรฐาน

ค่า 1

ค่า 2

เฉลี่ย

ค่า 1

ค่า 2

เฉลี่ย

ค่า 1

ค่า 2

เฉลี่ย

ค่า 1

ค่า 2

เฉลี่ย

มาตรฐาน#1

116.06

14.76 น.

115.41

124.31

125.04

124.68

112.08

110.24

111.16

131.91

135.41

133.66

มาตรฐาน#2

18160.57

18348.57

18254.60

21006.58

20974.62

20990.60

19668.22

19078.36

19373.30

22421.78

22205.65

22313.72

ตัวอย่าง

คอนซี 1

คอนซี 2

เฉลี่ย

คอนซี 1

คอนซี 2

เฉลี่ย

คอนซี 1

คอนซี 2

เฉลี่ย

คอนซี 1

คอนซี 2

เฉลี่ย

ตัวอย่างที่ 1

11.70

12.20

11.95

13.30

13.00

13.15

12.70

11.70

12.20

12.90

12.40

12.65

ตัวอย่างที่ 2

18.80

18.80

18.80

19.00

18.60

18.80

19.20

18.00

18.60

17.90

18.40

18.15

ตัวอย่างที่ 3

1.43

1.48

1.46

1.38

1.34

1.36

1.40

1.36

1.38

1.30

1.24

1.27

ตัวอย่างที่ 4

5.28

5.12

5.20

5.76

5.78

5.77

6.10

5.72

5.91

5.62

5.72

5.67

ตัวอย่างที่ 5

2.20

2.16

2.18

2.02

2.00

2.01

2.10

2.14

2.12

1.95

1.94

1.95

ตัวอย่างที่ 6

1.64

1.61

1.63

1.50

1.47

1.49

1.68

1.67

1.68

1.45

1.42

1.44

Yeasenผลิตภัณฑ์เชิงปริมาณของเราจะผ่านมาตรฐานการควบคุมคุณภาพที่เข้มงวดก่อนออกจากโรงงาน ทำให้การวัดปริมาณมีความเสถียรและแม่นยำ คุณจึงวัดปริมาณได้โดยไม่ต้องกังวล!

Yeasen คู่มือการเลือกผลิตภัณฑ์เชิงปริมาณ NGS

หมวดหมู่สินค้า

ผลิตภัณฑ์

หมายเลขแคตตาล็อก

ช่วงเชิงปริมาณ

ดีเอสดีเอ็นเอเอชเอส

ชุดทดสอบ dsDNA HS สำหรับ Qubit

12640ES

0.2-100 นาโนกรัม;

10 pg/µL-100 ng/µL

น้ำยาทดสอบปริมาณ Picogreen dsDNA

12641ES

ชุดทดสอบ dsDNA HS 1×

12642ES

ดีเอสดีเอ็นเอ บีอาร์

ชุดทดสอบ dsDNA BR

12643ES

2-1000 มก.;        0.1 นาโนกรัม/µL-1000 นาโนกรัม/µL

คิวบิต ssDNA

ชุดทดสอบ ssDNA สำหรับ Qubit

12645ES

1–200นาโนกรัม;

50 pg/μL-200 ng/μL

การสอบถาม