Tüm Transkriptom Araştırması
[Tüm Transkriptom Dizilemesi - Kodlamayan RNA ve mRNA Arasındaki Hedeflenen Düzenleme ve Etkileşim İlişkisi Üzerine Araştırma]
Tüm transkriptom yüksek verimli dizileme, ribozom-tükenmiş iplik-spesifik kütüphane inşa yöntemini ve küçük parça zenginleştirme tarama kütüphane inşa yöntemini benimser, bu da kodlayan RNA ve kodlamayan RNA'nın kütüphane inşasını, dizilemesini, bilgi analizini, ortak analizini ve ceRNA'sını vb. başarabilir. bu şekilde olabilir elde etmek Tüm RNA transkript verisi, belirli biyolojik süreçlerle (gelişim, hastalık vb.) ilgili bilgileri hızlı, kapsamlı ve doğru bir şekilde sunar. Veri analizi yoluyla, biyolojik düzenleme mekanizması üzerine yapılan araştırma, biyolojik olayları kapsamlı bir şekilde yorumlamaya yardımcı olan "ağ ve çok seviyeli"yi birleştiren üç boyutlu bir modele genişletilebilir.
Tüm transkriptom dizilemesinin iki yolu vardır, biri LncRNA-Seq + Küçük RNA, diğeri ise CircRNA hakkında daha kapsamlı bilgi elde edilebilen LncRNA-Seq + Küçük RNA + CircRNA'dır.
1. İki kütüphane ile tüm transkriptom dizilemesi: LncRNA-Seq + Küçük RNA
2.Üç kütüphane ile tüm transkriptom dizilemesi: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Tüm Transkriptom Hammadde Çözümü
| Sınıflandırma | Hayvan Kategorisi | Bitki Kategorisi | Bakteriyel ve Mantar Kategorisi | |||
| Örnek Türü | Hayvan Dokusu/Hücresi | Hücre | Tam Kan | Bitki Dokusu | Mantar Dokusu | Kültürlü Bakteriler ve Mantarlar |
| RNA Ekstraksiyonu | Manyetik boncuk yöntemi: 18605/18607/18606; Kolon yöntemi: 19221/19211; Trizol yöntemi: 10606/19202 | Manyetik boncuk yöntemi: 18600/18604; Kolon yöntemi: 19231 | Sütun yöntemi: 19241; Trizol yöntemi: 19201 | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Kolon yöntemi: 19301 (mantarların Lizozim eklemesi gerekir) 10403) |
| miRNA Ekstraksiyonu | Sütun yöntemi: 19331 | Sütun yöntemi: 19331 | Sütun yöntemi: 19332 | Sütun yöntemi: 19331 | — | — |
| miRNA Kütüphanesi Yapımı | Beklenebilir | |||||
| rRNA Kaldırma | RNaz H enzimatik giderim: 12257; 3 dakikalık hızlı giderim: 12258 (insan kaynaklı giderim); Manyetik boncuk yöntemi giderim: 12266 (memeli evrensel türü)/12267 kuş evrensel türü/12268 evcil tavuk/12269 zebra balığı/12270 Drosophila/12275 istiridye/12278 planarya/12285 arı/12286 altın küre ağ örümceği/12289 kene/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12257; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 (insan uzaklaştırma, patojen için uygundur) | RNaz Globin giderimi dahil H enzimatik giderimi: 12257 + 12806; RNaz H globinin enzimatik uzaklaştırılması: 13572; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 + 12260 | RNaz H enzimatik giderim: 12254; Manyetik boncuk yöntemi giderim: 12262 angiosperm | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12271 mantar evrensel tip | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12264 bakteriyel evrensel tip/12265 prokaryotik evrensel tip |
| Kütüphane İnşaatı | Önceden karıştırılmamış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12308 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumludur); Önceden karıştırılmış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12310 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumlu)/12340 (aktinomisin D, dUTP olmadan)/12341 (aktinomisin D, dTTP olmadan) | |||||
LncRNA Araştırması
Uzun kodlamayan RNA (LncRNA), son yıllarda yoğun ilgi gören benzersiz düzenleyici işlevi olan bir tür kodlamayan RNA'dır. LncRNA'nın uzunluğu 200 nt'den fazladır, protein kodlamaz ve türler arasında korunması zayıftır.Bazı dizi yapıları mRNA'ya benzer (poliA kuyruğu ve alternatif ekleme içerir) iken, diğerleri bu özelliklere sahip değildir. Şu anda, LncRNA'nın oluşumu ve işlevsel mekanizması henüz tam olarak anlaşılmamıştır, ancak, Önemli biyolojik fonksiyonlara sahip (kanser oluşumu, X kromozomu susturulması ve diğer düzenleyici faktörlerle karmaşık düzenleyici ağların oluşumu gibi) birçok LncRNA keşfedilmiştir.
LncRNA Dizileme Teknik Rotası
LncRNA Dizileme Hammadde Çözümü
| Sınıflandırma | Hayvan Kategorisi | Bitki Kategori | Bakteriyel ve Mantar Kategorisi | |||
| Örnek Türü | Hayvan Dokusu/Hücresi | Hücre | Tam Kan | Bitki Dokusu | Mantar Dokusu | Kültürlü Bakteriler ve Mantarlar |
| RNA Ekstraksiyonu | Manyetik boncuk yöntemi: 18605/18607/18606; Kolon yöntemi: 19221/19211; Trizol yöntemi: 10606/19202 | Manyetik boncuk yöntemi: 18600/18604; Kolon yöntemi: 19231 | Kolon yöntemi: 19241; Trizol yöntemi: 19201 | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Kolon yöntemi: 19301 (mantarların Lywallzyme 10403 eklemesi gerekir) |
| rRNA Kaldırma | RNaz H enzimatik giderim: 12257; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 (insan kaynaklı uzaklaştırma); Manyetik boncuk yöntemi uzaklaştırma: 12266 (memeli evrensel türü)/12267 kuş evrensel türü/12268 evcil tavuk/12269 zebra balığı/12270 Drosophila/12275 istiridye/12278 planarya/12285 arı/12286 altın küre ağ örümceği/12289 kene/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12257; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 (insan uzaklaştırma, patojen için uygundur) | RNaz H globin giderimi dahil enzimatik giderim: 12257 + 12806; RNaz H globinin enzimatik uzaklaştırılması: 13572; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 + 12260 | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12254; Manyetik boncuk yöntemi ile uzaklaştırma: 12262 angiosperm | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12271 mantar evrensel tip | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12264 bakteriyel evrensel tip/12265 prokaryotik evrensel tip |
| Kütüphane İnşaatı | Önceden karıştırılmamış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12308 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumludur); Önceden karıştırılmış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12310 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumlu)/12340 (aktinomisin D, dUTP olmadan) | |||||
Ökaryotik Transkriptom Araştırması
Ökaryotik transkriptom araştırmaları, belirli bir işlevsel durumdaki belirli hücreler tarafından transkripsiyona tabi tutulabilen toplam mRNA'yı elde etmek için RNA-seq teknolojisini kullanır.Daha sonra, indirilen ham veriler birleştirilir ve birleştirilir, gen ifadesi seviyesi sayılır ve diferansiyel analiz ve fonksiyonel zenginleştirme analizi gerçekleştirilir. Sadece türün gen bilgisinin çoğunu elde etmekle kalmaz, aynı zamanda gen ifadesi farkını ve fonksiyonel yol değişimini genel düzeyde inceleyebilir ve belirli biyolojik süreçlerin moleküler mekanizmasını ortaya çıkarabilir.
Ökaryotik Transkriptom Dizileme Teknik Rotası
Ökaryotik Transkriptom Dizileme Hammadde Çözümü
| Sınıflandırma | Hayvan Kategorisi | Bitki Kategorisi | Mantar Kategorisi | |||
| Örnek Türü | Hayvan Dokusu/Hücresi | Hücre | Tam Kan | Bitki Dokusu | Mantar Dokusu | Kültür mantarları |
| RNA Ekstraksiyonu | Manyetik boncuk yöntemi: 18605/18607/18606; Kolon yöntemi: 19221/19211; Trizol yöntemi: 10606/19202 | Manyetik boncuk yöntemi: 18600/18604; Kolon yöntemi: 19231 | Kolon yöntemi: 19241; Trizol yöntemi: 19201 | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Kolon yöntemi: 19301 (lizozim 10403 ekleyin) |
| mRNA Yakalama | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti | 12629 mRNA İzolasyon Ana Kiti |
| Kütüphane İnşaatı | Önceden karıştırılmamış RNA Kütüphane Kiti: 12308 Dual-Mode RNA Kütüphane Kiti (Illumina ve MGI uyumlu) mRNA Yakalama Özellikli Önceden Karıştırılmamış RNA Kütüphane Kiti: 12309 Çift Modlu RNA Kütüphane Kiti (Illumina ve MGI uyumlu) Önceden Karıştırılmış RNA Kütüphane Kiti: 12310 Çift Modlu RNA Kütüphane Kiti (Illumina ve MGI uyumlu)/12340 (Aktinomisin D, dUTP olmadan) | |||||
circRNA Araştırması
[circRNA Dizilemesi - circRNA'nın Farklı İfadesinin Biyolojik Süreçleri Nasıl Etkilediğine Dair Araştırma]
Dairesel RNA (circRNA), özel bir kodlamayan RNA analizi türüdür. Dizileme, referans genomlu örnekler için kaynak genlerin doğru circRNA tanımlamasını ve analizini gerçekleştirmek için bir dizileme platformu kullanılarak gerçekleştirilir. circRNA dizilemesi, tıbbi ve tarımsal araştırma alanlarında giderek daha yaygın olarak kullanılmaktadır. Yüksek verimli dizilemeye dayalı olarak ve ana akım veri tabanlarına ve circRNA tanımlama yazılımlarına güvenerek, proje türünün circRNA bilgisi, circRNA'nın transkripsiyonel düzenlemedeki önemli işlevlerini derinlemesine keşfetmek için analiz edilir.
circRNA Araştırma Hammadde Çözümü
| Sınıflandırma | Hayvan Kategorisi | Bitki Kategorisi | Bakteriyel ve Mantar Kategorisi | |||
| Örnek Türü | Hayvan Dokusu/Hücresi | Hücre | Tam Kan | Bitki Dokusu | Mantar Dokusu | Kültürlü Bakteriler ve Mantarlar |
| RNA Ekstraksiyonu | Manyetik boncuk yöntemi: 18605/18607/18606; Kolon yöntemi: 19221/19211; Trizol yöntemi: 10606/19202 | Manyetik boncuk yöntemi: 18600/18604; Kolon yöntemi: 19231 | Kolon yöntemi: 19241; Trizol yöntemi: 19201 | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Manyetik boncuk yöntemi: 18534/18535/18537; Kolon yöntemi: 19291ES/19292ES | Kolon yöntemi: 19301 (mantarların lizozim 10403 eklemesi gerekir) |
| rRNA Kaldırma | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12257; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 (insan kaynaklı uzaklaştırma); Manyetik boncuk yöntemi uzaklaştırma: 12266 (memeli evrensel türü)/12267 kuş evrensel türü/12268 evcil tavuk/12269 zebra balığı/12270 Drosophila/12275 istiridye/12278 planarya/12285 arı/12286 altın küre ağ örümceği/12289 kene/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12257; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 (insan uzaklaştırma, patojen için uygundur) | RNaz H globin giderimi dahil enzimatik giderim: 12257 + 12806; RNaz H globinin enzimatik uzaklaştırılması: 13572; 3 dakikalık hızlı uzaklaştırma: 12258 + 12260 | RNaz H enzimatik uzaklaştırma: 12254; Manyetik boncuk yöntemi ile uzaklaştırma: 12262 angiosperm | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12271 mantar evrensel tip | Manyetik boncuk yöntemiyle çıkarma: 12264 bakteriyel evrensel tip/12265 prokaryotik evrensel tip |
| Doğrusal RNA Sindirimi | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için | 14606 RNase R doğrusal RNA moleküllerini çıkarmak için |
| Kütüphane İnşaatı | Önceden karıştırılmamış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12308 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumludur); Önceden karıştırılmış RNA kütüphanesi yapım kiti: 12310 çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumlu)/12340 (aktinomisin D, dUTP olmadan) | |||||
Metatranskriptom
[Metatranscriptome - Mikroekolojik Mikroçevredeki Aktif Mikroorganizmaların Dinamik Değişimlerinin Yakalanması]
Metatranskriptome dizileme: Belirli bir ortamdaki tüm genomların transkripsiyon ve regülasyon kurallarını genel düzeyde inceler.Mikroekolojik mikroçevredeki tüm RNA'ları araştırma nesnesi olarak alarak, yüksek verimli dizilemeyi birleştirerek karmaşık mikrobiyal toplulukların transkripsiyonel düzeydeki değişimlerini incelemek ve rol oynayan aktif genleri çıkarmak amaçlanmaktadır.
Metatranskriptome Araştırma Hammadde Çözümü
| Örnek Türü | Kültürlü Bakteriler ve Mantarlar | Klinik Örnekler |
| RNA Ekstraksiyonu | Kolon yöntemi: 19301 (mantarların Lywallzyme 10403 eklemesi gerekir) | Kolon yöntemi: 19321 (viral DNA/RNA ekstraksiyonu); Manyetik boncuk yöntemi: 18521 (viral DNA/RNA ekstraksiyonu); 18306 (patojen DNA/RNA ekstraksiyonu) |
| rRNA Kaldırma | 3 dakikada hızlı kaldırma: 12258 (insan kaynaklı kaldırma) | 3 dakikada hızlı kaldırma: 12258 (insan kaynaklı kaldırma) |
| Kütüphane İnşaatı | Seçenek 1. Toplam RNA kütüphanesi yapımı: 12308ES çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumlu); Seçenek 2. cDNA enzimatik sindirim kütüphanesi yapımı: 13488ES cDNA sentez modülü + 12316ES hızlı enzimatik sindirim kütüphanesi yapım kiti | Seçenek 1. Toplam RNA kütüphanesi yapımı: 12308ES çift modlu RNA kütüphanesi yapım kiti (Illumina ve MGI ile uyumlu); Seçenek 2.cDNA enzimatik sindirim kütüphanesi yapımı: 13488ES cDNA sentez modülü + 12316ES hızlı enzimatik sindirim kütüphanesi yapım kiti |
Ürün Önerisi
| Ürün Adı | Katalog Numarası | Şartname |
| Yüksek NGS T.M. EvoMax RNA Kütüphane Hazırlık Kiti（dUTP） | 12340ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. EvoMax RNA Kütüphane Hazırlık Kiti (dNTP) | 12341ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. Ultima Dual-mode RNA Kütüphane Hazırlık Kiti (Illumina ve MGI) | 12308ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. Ultima Dual-mode RNA Kütüphane Hazırlık Kiti (Önceden karıştırılmış versiyon) | 12310ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. mRNA İzolasyon Ana Kiti V2 | 12629ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. MaxUp İnsan rRNA Tükenme Kiti (rRNA ve ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. MaxUp rRNA Tükenme Kiti (Bitki) | 12254ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. Tek Adımlı rRNA Temizleme Kiti (İnsan,100-1.000 ng) | 12258ES24/96 | 24T/ 96T |
| Yüksek NGST.M. MagSP rRNA Kaldırma Kiti (Bakteri(G- ve G+)) saflaştırma boncuklarıyla | 12264ES24/96 | 24T/ 96T |