嘌呤霉素 是由白黑链霉菌产生的一种氨基糖苷类抗生素,是氨酰基-tRNA分子3’端的类似物,能与核糖体的A位结合,掺入延长的肽链中,破坏核糖体上肽的易位,导致翻译过程中链过早终止,从而抑制蛋白质的合成。

图1 嘌呤霉素(CAS NO.53-79-2)结构式

pac基因编码嘌呤霉素N-乙酰转移酶(pac),是在产生嘌呤霉素的细菌Streptomyces alboniger中发现的,该基因赋予了嘌呤霉素抗性。这一特性目前被广泛用于筛选携带带pac基因质粒的哺乳动物稳定转染细胞株。嘌呤霉素在稳定细胞株筛选中的广泛应用与慢病毒载体的特性有关,商业化的慢病毒载体中大部分都带有pac基因。在某些特定情况下,嘌呤霉素也可用于筛选转化了携带pac基因质粒的大肠杆菌菌株。嘌呤霉素作用迅速,低浓度下即可迅速导致细胞死亡。贴壁哺乳动物细胞对2-5µg/mL浓度敏感 嘌呤霉素对悬浮细胞具有较高的耐药性,而对0.5-2 µg/mL浓度的嘌呤霉素,悬浮细胞就已经很敏感,一周之内就能产生对嘌呤霉素具有稳定耐药性的哺乳动物细胞。

稳定细胞系筛选

实验原理

通过将外源DNA/shRNA克隆到携带pac基因的载体中,重组载体转染到宿主细胞中并整合到其染色体上,随细胞分裂而稳定传递,最后用嘌呤霉素进行筛选。

准备和预实验

1 建议使用浓度

哺乳动物细胞:1-10 μg/mL,最佳浓度需通过预实验确定。

大肠杆菌:在 LB 琼脂培养基上筛选携带 pac 基因的稳定转化大肠杆菌时,使用浓度 125 μg/mL。大肠杆菌稳定转化子的嘌呤霉素筛选需要精确的 pH 调节。

2 溶解方法

将嘌呤霉素溶解于蒸馏水中,制成50 mg/mL的原液,用0.22 μm滤膜过滤除菌,分装,-20°C保存。

3 嘌呤霉素杀伤曲线测定(以shRNA转染或慢病毒转导为例)

嘌呤霉素的有效筛选浓度与细胞种类、生长状态、细胞密度、细胞代谢、细胞周期位置等有关,确定嘌呤霉素杀死未转染细胞的最低浓度至关重要,首次实验必须进行嘌呤霉素梯度筛选预实验,建立杀伤曲线。

  • 接种密度为5~8×104将 24 孔板中的每孔细胞放入培养箱中并培养过夜。
  • 制备筛选培养基:含有不同浓度嘌呤霉素(例如0-15μg/mL,至少5个梯度)的新鲜培养基。
  • 换上新鲜配制的筛选培养基,继续培养,观察细胞生长情况,每2-3天更换一次新鲜的筛选培养基。
  • 每日观察细胞存活情况,4-6天内能有效杀死所有未转染细胞的药物浓度为最低浓度。

稳定转染子的筛选

  • 慢病毒感染48-72h(70-80%汇合度)后,将细胞放入含有适当浓度Puromycin的培养基中培养至少48h,当未转染Puromycin对照组细胞全部死亡后,病毒感染组剩余细胞均为阳性细胞。

【注】:①抗生素在细胞处于活跃分裂期时效果最明显,细胞过于密集会显著降低抗生素疗效,细胞密度不宜超过25%。②每天观察细胞生长情况;嘌呤霉素筛选至少需要48h,嘌呤霉素筛选有效浓度通常持续3~10天。病毒的MOI越高,每个细胞含有的shRNA和嘌呤霉素抗性基因拷贝数越多。在进行嘌呤霉素筛选时,MOI越高,细胞含有的pac拷贝数越多,能耐受的嘌呤霉素浓度越高。调整嘌呤霉素浓度来筛选转染细胞,但嘌呤霉素浓度不能低于杀伤曲线的最低有效浓度;

  • 加入含最低浓度Puromycin的培养基扩增细胞,qPCR检测结果合格后进行冻存。

产品s 姓名

猫#

规格

外貌

嘌呤霉素 二盐酸盐

CAS:58-58-2

60210ES25

25 毫克

白色至类白色粉末

60210ES60

100毫克

60210ES72

250毫克

60210ES76

500 毫克

60210ES80

1 克

嘌呤霉素

(溶液 10 毫克/毫升)

CAS:58-58-2

60209ES10

1×1毫升

溶液(10 mg/mL于H2中)2(哦)

60209ES50

5×1毫升

60209ES60

10×1毫升

60209ES76

50×1毫升

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60220ES03/08

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60209ES10/50/60/76

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60210ES25/60/72/76/80

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潮霉素 B(50 毫克/毫升)

60224ES03

1克(20毫升)/10×1克(20毫升)

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1/10克

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60230ES07/32

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