Hieff NGS™Maxup人rRNA耗竭试剂盒（人/鼠标/大鼠）-12257ES
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Hieff NGS™Maxup人rRNA耗竭试剂盒（人/鼠标/大鼠）-12257ES

Hieff NGS™Maxup人rRNA耗竭试剂盒（人/鼠标/大鼠）-12257ES

Sku： 12257ES08
尺寸: 8t
价格:
$205.00

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描述


希夫NGS™ MaxUp 人类 rRNA 去除试剂盒（rRNA & ITS/ETS）旨在基于 RNase H 工作流程从人类、小鼠和大鼠总 RNA 中去除 rRNA 和 45S ITS/ETS，并保留 mRNA 和其他非编码 RNA。该试剂盒适用于完整和部分降解的 RNA 样本（例如 FFPE RNA）。由于降解的 FFPE 样本通常比新鲜组织样本含有更高比例的 ITS/ETS，因此该试剂盒在人类 45S ITS/ETS 区域添加探针，去除 ITS 可以显著增加原始数据中有效数据的比例。

特征

  • 特异性强：专门从人体样本中去除rRNA和ITS/ETS，尤其是FFPE样本
  • 模板起始量兼容性高：适用于100ng~1μg样品
  • 去除效果高：对人\小鼠、大鼠样本中的rRNA、ITS、ETS，去除效果达95%以上
  • 质量稳定：严格的批次性能和稳定性质量控制

应用

  • 基因表达研究
  • 可变剪接分析
  • 非编码RNA的检测和发现
  • 选择性多聚腺苷酸化位点的鉴定
  • 融合基因检测

规格

耗尽技术 核糖核酸酶H
样品类型 人类、小鼠和大鼠的总 RNA
最终产品类型 mRNA 和其他非编码 RNA
反应次数 24/96 准备
起始物料量 100 ng~1 μg 总RNA
目标 从人类总 RNA 中去除 rRNA 和 45S ITS/ETS

成分

部件编号 姓名 12257ES24 （24岁） 12257ES96 （96T）
12257-A 杂交缓冲液 72 微升 288 微升
12257-B 探针混合物（rRNA 和 ITS/ETS） 48 微升 192 微升
12257-C RNase H缓冲液 72 微升 288 微升
12257-D 核糖核酸酶H 48 微升 192 微升
12257-E DNase I 缓冲液 660 微升 2×1320μL
12257-F 脱氧核糖核酸酶 60 μL 240 微升

运输和储存

所有部件均采用干冰运输，可在-15℃~-25℃保存一年。

数字

  • rRNA 去除特异性

对于常规样本，rRNA和ITS/EST可以去除98%以上，而对于完整性在50%左右的FFPE样本，rRNA和ITS/EST可以去除95%以上，同时对于完整性较差的FFPE也能得到有效去除。

表 1. rRNA 去除特异性效果

核糖核酸 质量 移动 方案 输入 核糖体RNA（%） 智能交通系统 / 排放交易系统 (%) 映射 (%)
293T 核糖核酸；  净值=10 消除 核糖体RNA 1微克 0.19 4.6 98.28
消除 核糖体RNA 和 智能交通系统/排放交易系统 1微克 0.15 0.04 98.79
福尔马林聚乙烯 核糖核酸；  DV200 =90% 消除 核糖体RNA 500毫微克 0.23 4.75 95.35
消除 核糖体RNA 和 智能交通系统/排放交易系统 500毫微克 0.21 0.02 95.42
福尔马林聚乙烯 核糖核酸；  DV200 =50% 消除 核糖体RNA 500毫微克 1.4 16.28 95.57
消除 核糖体RNA 和 智能交通系统/排放交易系统 500毫微克 0.56 0.11 95.51
福尔马林聚乙烯 核糖核酸；  DV200 =20% 消除 核糖体RNA 1微克 0.35 67.61 58.4
消除 核糖体RNA 和 智能交通系统/排放交易系统 1微克 0.79 0.84 60.35

注：分别采用不同的人类RNA样本，去除rRNA或rRNA及ITS/ETS，去除ITS/ETS后用RNA library Prep kit进行建库，通过测序分析离线数据中rRNA及ITS/ETS的比例。

  • 测序数据性能

表 2.测序数据性能

样本 DV200 成套工具 干净的 问20 （%） 干净的 问30 （%） 干净的 气相色谱 （%） 核糖体RNA （%） 智能交通系统/排放交易系统 （%） 独特的（％）
1 24% Yeasen 猫号#12257 96.75 92.68 57.05 4.58 2.42 96.90
2 40％ 96.56 92.42 55.31 1.93 0.63 96.45
3 53% 97.4 93.52 45.19 0.23 0.01 98.08
4 76％ 97.67 93.78 51.28 0.44 0.01 93.63
文件：
引文及参考文献：

[1] Tian S, Zhang B, He Y, 等。CRISPR-iPAS：一种基于 dCAS13 的替代多聚腺苷酸化干扰新方法。Nucleic Acids Res. 2022;50(5):e26。doi:10.1093/nar/gkac108（影响因子：16.971）

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