Hieff NGS™OnePot Flash DNA库预备套件(酶)_ 12316ES

Sku: 12316ES24

尺寸: 24 t
价格:
销售价格$485.00

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描述

希夫NGS™ One Pot Flash DNA Library PrepKit 是一种快速酶法 DNA 文库制备试剂盒巫婆 含有高质量的 DNA 片段化酶,将 DNA 片段化、末端修复和 dA 加尾结合为一个步骤,大大减少了文库制备的时间和成本。

本文库制备试剂盒兼容所有常见动物、植物、微生物等100 pg-500 ng样本。

单管快速实现DNA片段化、末端修复及A尾添加反应。该试剂盒需配套接头及引物,兼容Illumina 和麦肯锡 高通量测序平台。

特征

1) 适用于100 pg-500 ng的基因组DNA样本。

2与 Illumina 兼容 和麦肯锡 高通量测序平台。

3碎片化、末端修复和 A 尾添加 内部反应 5 分钟

4高效的文库转化率和扩增效率。

规格

货号

12316ES24 / 12316ES96

尺寸

24 96 年 电视

成分

部件编号

姓名

12316ES24

12316ES96

12316-A

涂抹酶 混合

240 μ大号

960 μ大号

12316-B

连接增强剂

720 μ大号

4×720 μ大号

12316-C

快速T4 DNA连接酶

120 μ大号

480 μ大号

12316-D

2×创世纪 高频 放大混合

600 μ大号

4×600 μ大号

*

引物混合物*

120 μ大号

480 μ大号

笔记: * 表示该试剂不包含在该试剂盒中,需要额外试剂套件 兼容双平台 Illumina 与 MGI,但额外的引物混合物(CAT # 13334 MGI 引物混合物 需要 Illumina 的 Cat# 13335 Primer Mix。

贮存

本产品应储存在-25~-151 年。

数字

图1 10种微生物DNA检测

使用以下方法制备文库: 猫号#12316 协议 10 ng ZymoBIOMICS 微生物群落 DNA 标准 (Zymo Research® #D6306)。将文库汇集并在 Illumina 上测序 (SE75)。测序数据均质化至20M 并对两种输入水平的预期和检测组成进行了比较。特定微生物 gDNA 的检测与预期组成一致。预期组成:新型隐球菌 2%、酿酒酵母 2%、枯草芽孢杆菌 12%、大肠杆菌 12%、粪肠球菌 12%、发酵乳杆菌 12%、单核细胞增生李斯特菌 12%、铜绿假单胞菌 12%、金黄色葡萄球菌 12% 和肠道沙门氏菌 12%。

关于手术

1. 请穿戴工作服和一次性手套进行操作为了您的安全。

2. 在室温下解冻组件。 解冻后,通过涡旋充分混合,短暂旋转管子并将它们放在冰上以备后用。

3.各步配制反应液时建议用移液器吹打混合均匀或轻轻震荡,剧烈震荡可能会造成文库产量下降。

4. 为避免样品交叉污染,建议使用带过滤元件的枪头,吸取不同样品时请更换枪头。

5. 建议各反应步骤在配有加热盖的PCR仪上进行,使用前应将PCR仪预热至设定温度。

6. 操作不当极易造成气溶胶污染,影响结果准确性。建议对PCR反应混合区域和PCR产物纯化检测区域进行强制物理隔离。配备建库专用移液器等设备。

7.本产品仅供研究使用。

关于 DNA 碎片

1. 本试剂盒兼容范围为100 pg500 ng 输入 DNA。应尽可能使用 A260/A280 = 1.8-2.0 的高质量输入 DNA。

2. 如果Input DNA中含有高浓度的金属离子螯合剂或其他盐类,可能会影响后续实验,建议用ddH2O或Tebuffer(10 mm tris-HCl,pH 8.0-8.5;0.1 mM EDTA)稀释DNA。

3. 对于大多数高质量基因组DNA,酶切时间如表1所示。该试剂盒偏好性较低,能耐受各种GC含量的模板。

表 1. 常规基因组 DNA 片段化建议时间

插入峰大小

碎片时间

优化范围

200 基点

5 分钟

3-8 分钟

150 基点

8 分钟

5-10分钟

接头连接

1. 接头的浓度直接影响连接效率和文库产量。接头用量过多可能产生较多接头二聚体;用量过低可能影响 结扎 效率和文库产量。表 2 和表 3 列出了推荐用量 使用此试剂盒为不同的输入 DNA 输入提供适配器。

表 2. 推荐的 Illumina 不同输入 DNA 的接头数量

输入DNA

15 μM 适配器稀释倍数

体积

50 纳克至 500 纳克

10

5 μ大号

1 -50 鄰

20

5 μ大号

100 前列腺素-1 鄰

30

5 μ大号

表 3. 推荐的 MGI 不同输入 DNA 的接头数量

输入DNA

10 μ适配器稀释倍数

体积

50 纳克至 500 纳克

稀释倍数

5 μ大号

10 -50 鄰

10

5 μ大号

100 前列腺素-10 鄰

5

5 μ大号

文库扩增

应严格控制扩增循环数。扩增不足可能导致文库产量低;过度扩增可能引入偏差、错误、重复读取和嵌合产物增加。表 4 列出针对库产量 1 的推荐循环次数 μg.

表 4. 建议循环 100 pg-500 ng 输入 DNA

输入 DNA(ng)

生成 1 所需的循环次数 μ

500 纳克

2-4

250 纳克

4-6

100 纳克

5-7

50 纳克

7-9

5

11-十三

100 包

14-16

基于珠子的 DNA 清理和尺寸选择

1 文库构建过程中有多个步骤需要使用 DNA 纯化磁珠。我们推荐 Hieff NGS DNA 选择珠(Yeasen 目录号 12601) 或 AMPure XP 磁珠(Beckman Cat#A63880)用于 DNA 纯化和尺寸选择。

2 磁珠使用前应先在室温下平衡,否则产量会下降,并且影响大小选择效果。

3 使用前应通过涡旋或移液将磁珠混合均匀。

4 转移上清液时不要吸出珠子,即使是微量的珠子也可能影响接下来的反应。

5 80%乙醇应新鲜配制,否则影响回收效率。

6 磁珠在洗脱产品前需室温干燥,干燥不充分易造成乙醇残留影响后续反应;干燥过度则易造成磁珠破裂,降低纯化产率。一般室温干燥3-5分钟即可使磁珠充分干燥。

7 如果需要,纯化或大小选择的 DNA 样本洗脱于 0.1× TE 缓冲液可在 4°C 下保存 1-2 周,或在 -20°C 下保存一个月。

图书馆质量分析

1. 构建的文库质量一般通过测量浓度和粒径分布来分析。

2. 可以通过基于荧光的方法(例如 Qubit 和 PicoGreen 或 qPCR)测量文库浓度。

3. 不建议使用基于吸光度的定量方法,例如NanoDrop。

4. 建议使用qPCR方法进行文库定量:Qubit、PicoGreen等荧光方法无法区分不完整的dsDNA结构(无接头或仅一端连接接头的插入片段)和完整的文库,而qPCR方法只会对两端连接接头的完整文库(可测序文库)进行扩增和测定,从而为上样提供更准确的测量。

5. 可以使用Agilent Bioanalyzer或其他基于毛细管电泳或微流体原理的设备来分析文库的大小分布。

文件:

安全数据表

12316_MSDS_HB250211_EN.PDF

手册

12316_手册_版本 E20241225.pdf


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