描述
珠蛋白 mRNA 消耗探针(人类) 旨在去除人类珠蛋白mRNA。它可以有效去除成人、婴儿和胚胎中的珠蛋白mRNA网卡 来源,包括 HBA1/2、HBB、HBD、HBM、HBG1/2、HBE1、HBQ1 和 HBZ。本产品与 Hieff NGS 配合使用商标 MaxUp rRNA 耗竭试剂盒(人/小鼠/大鼠)(
产品应用
适用于100 ng~1 μg人类总RNA样本, 小鼠和大鼠血液资源,以及完整或部分降解的 RNA 样本。
产品组件
产品名称 | 规格 | |
珠蛋白探针(人类) | 12806ES24 | 24 T |
12806ES96 | 96吨 |
运输和储存
所有组件均采用干冰运输,可在-20°C 下保存一年。
数字
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分别对500ng和100ng人血总RNA进行rRNA去除和rRNA&Globin联合去除,建库测序后对比Globin mRNA含量。
注意事项
1. 请使用不含RNase污染的耗材,并定期清洁实验区域。建议使用ThermoFisher的RNAZap商标 高效核酸去除喷雾,去除RNase污染。
2. RNA 样本应不含基因组 DNA 污染。如果样本中残留有 gDNA,应使用 DNase I 消化并纯化后再使用。
3. RNA样本最大输入量为10μL,若样本量较大,可先进行浓缩。
4. 为了您的安全和健康,操作时请穿着工作服和戴一次性手套。
5. 仅供研究使用!
指示
1. 探针与 RNA 杂交
1.1 将 10 ng–1 μg 总 RNA 用无核酸酶水稀释至 PCR 管中的最终体积为 10 μL。将 RNA 在冰上。
1.2 集合 以下RNA/探针杂交反应 在冰上 根据表1。
表1 RNA/探针杂交反应
成分 | 容量 (μL) |
杂交缓冲液 | 3 |
探针混合物(身高/体重/R) | 1 |
珠蛋白探针(人类) | 1 |
总 RNA | 10(100 纳克~1 微克) |
全部的 | 15 |
1.3 轻轻上下吹打至少 10 次,充分混合。将管子放入微量离心机短暂旋转,收集管子侧面的液体。
1.4 将管放入热循环仪中并运行表 2 中的以下程序,将加热盖设置为 105°C。
表2 RNA/探针杂交反应程序
温度 | 期间 |
热盖 105°C | 在 |
95°C | 2 分钟 |
95℃至22℃ | 0.1℃/秒 |
22°摄氏度 | 5 分钟 |
4°C | 抓住 |
2. RNase H 消化
2.1 组装以下 RNase H 消化反应 在冰上 根据表3。
表3 RNase H消化反应
成分 | 容量 (μL) |
RNase H缓冲液 | 3 |
核糖核酸酶H | 2 |
杂交 RNA(步骤 1.4) | 15 |
全部的 | 20 |
2.2 轻轻上下吹打至少 10 次,充分混合。将管子放入微量离心机中短暂旋转,收集管子侧面的液体。
2.3 将管放入热循环仪中并运行以下程序: 盖子50°C; 37℃,30分钟; 4°C,保持。
3. 脱氧核糖核酸酶 我 消化
3.1 根据表4在冰上配制以下DNase I消化反应。
表4 DNase Ⅰ酶切反应
成分 | 容量 (μL) |
DNase I 缓冲液 | 27.5 |
脱氧核糖核酸酶 | 2.5 |
RNase H 处理的 RNA(步骤 2.3) | 20 |
全部的 | 50 |
3.2 轻轻上下吹打至少 10 次,充分混合。将管子放入微量离心机短暂旋转,收集管子侧面的液体。
3.3 将管放入热循环仪中并运行以下程序: 关闭盖子; 37℃,30分钟; 4°C,保持。
4. RNA 纯化
4.1 平衡 Hieff NGS商标将 RNA 清洁剂(Cat#12602)恢复至室温,并在使用前通过涡旋彻底重新悬浮珠子。
4.2 添加 110 µL(2.2×) 将珠子加入步骤 3.3 中的 RNA 溶液中,通过上下移液至少 10 次彻底混合。
4.3 室温下孵育 5 分钟,使 RNA 与珠子结合。
4.4 将管放在磁力架上,将磁珠与上清液分离。 当溶液澄清(约 3 分钟)时,弃去上清液。注意不要让移液器吸头接触珠子。
4.5 将管放在磁力架上。 将 200 µL 新鲜配制的 80% 乙醇加入管中。室温下孵育 30 秒,然后弃去上清液。注意不要让移液器吸头碰到珠子。
4.6 重复步骤 4.5 一次,总共清洗两次。
4.7 用 10 µL 去除残留乙醇 - 移液器吸头。 将管子放在磁力架上,打开盖子,让珠子风干长达 5 分钟。
4.8 从磁力架上取下试管。加入 11 μL 无核酸酶水,将 RNA 从磁珠上洗脱下来。上下移液至少 10 次,充分混合,然后短暂旋转试管。
4.9 室温下孵育 5 分钟。将管放在磁力架上直至溶液澄清(约 3 分钟)。
4.10 将10 μL上清液转移到无核酸酶管中。
注意:如果需要在此时停止,样品可以储存在–80°C 下。
付款和安全
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