描述
细胞凋亡时,内切酶激活,将基因组DNA在核小体之间切割,凋亡过程中DNA提取后,可发现180-200bp的DNA梯状结构。
TUNEL(TdT 介导的 dUTP 缺口末端标记)凋亡检测试剂盒(Alexa Fluor 640)可用于检测组织细胞凋亡后期过程中的核 DNA 碎片化。其原理是在末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)的作用下,Alexa Fluor 640-12-DUTP 掺入基因组 DNA 断裂时暴露的 3'-羟基(3'-OH)末端。从而可以通过荧光显微镜或流式细胞仪检测。Alexa Fluor 640 是一种红色荧光染料,稳定性高,亮度强。
该试剂盒适用范围广泛,可用于检测冰冻或石蜡切片中的细胞凋亡,以及培养的贴壁或悬浮细胞中的细胞凋亡。
产品组件
成分 |
| 40308ES20(20吨) | 40308ES50(50吨) | 40308ES60(100吨) |
40308-A | 5×平衡缓冲液 | 750 微升 | 1.25毫升×2 | 1.25毫升×3 |
40308-B | Alexa Fluor 640-12-dUTP 标记混合物 | 100 μL | 250 微升 | 250 μL×2 |
40308-C | 重组TdT酶 | 20 μL | 50 μL | 50 μL×2 |
40308-D | 蛋白酶K(2毫克/毫升) | 40 微升 | 100 μL | 100 μL×2 |
40308-E | DNase I(1 单位/μL) | 5 微升 | 12.5 微升 | 25 微升 |
40308-F | 含 MgCl2 的 10 × DNase I 缓冲液 | 100 μL | 250 微升 | 500 μL |
运输和储存
这些组件随附冰袋,可以在 -20°C 下保存 1 年。
注意事项
1.需自行配制PBS用于洗细胞,抗荧光淬灭液用于封片,4%多聚甲醛用于固定。白细胞可能需要培养较长时间。
2.仅供研究使用!
指示
1. 样品制备
1.1 石蜡包埋组织切片
1.1.1.将石蜡组织切片放入二甲苯中,室温下浸泡5分钟,重复1次,以彻底去除石蜡。
1.1.2.将切片浸泡在 100% 乙醇中,室温下 5 分钟,重复一次。
1.1.3.室温下,用梯度乙醇(90,80,70%)浸泡样品,每次3分钟。
1.1.4.用PBS轻轻冲洗切片,用滤纸小心吸干载玻片上样本周围多余的液体。此时可用石蜡笔或疏水笔在样本周围勾勒出样本分布的轮廓,方便后续的通透性处理和平衡标记操作。实验过程中不要让样本干燥。将处理好的样本放入湿盒中,保持样本湿润。
1.1.5.2 mg/mL蛋白酶K溶液用PBS按1:100的比例稀释,达到终浓度为20 μg/mL。
1.1.6.每个样品加入100 μL浓度为20 μg/mL的蛋白酶K溶液至完全覆盖,室温下孵育20分钟。
【注意事项】:蛋白酶K有助于组织和细胞在后续步骤中对染色试剂具有渗透性。孵育时间过长会增加后续洗涤步骤中组织切片从载板上脱落的风险,孵育时间过短则可能造成渗透性处理不充分,影响标记效率。为获得更好的结果,可能需要优化蛋白酶K的孵育时间。
1.1.7.用PBS溶液冲洗样品2-3次,轻轻吸去多余液体,用滤纸仔细吸干载玻片上样品周围的液体。将处理好的样品放入湿盒中,保持样品湿润。
1.2 组织冰冻切片
1.2.1.取出冷冻切片,恢复至室温。将载玻片浸入4%多聚甲醛溶液(溶于PBS)中,固定并在室温下孵育30分钟。
1.2.2. 轻轻去除多余的液体,并用滤纸仔细吸干载玻片上样品周围多余的液体。
1.2.3. 将载玻片浸入PBS溶液中,室温下孵育15分钟,然后用PBS再次清洗共2次。
1.2.4. 轻轻吸去多余液体,用滤纸小心吸干载玻片,去除样品周围多余的液体。此时可用石蜡笔或疏水笔在样品周围勾勒出样品分布轮廓,方便后续渗透处理和平衡标记操作。实验过程中,不要让样品干燥,将处理好的样品放入润湿盒中,保持样品湿润。
1.2.5. 将2 mg/mL蛋白酶K溶液用PBS以1:100的比例稀释至终浓度为20 μg/mL。
1.2.6. 每个样品加入100 μL浓度为20 μg/mL的蛋白酶K溶液至完全覆盖样品,室温下孵育10分钟。
【备注】:蛋白酶K可帮助组织和细胞在后续步骤中对染色试剂进行通透处理。孵育时间过长会增加后续洗涤步骤中组织切片从载板上脱落的风险,孵育时间过短则可能造成通透处理不充分,影响标记效率。若未获得较好的效果,可能需要优化蛋白酶K的孵育时间。
1.2.7. 将样品放入盛有PBS溶液的开口烧杯中冲洗2-3次。
【注意事项】:为避免清洗步骤中样本剥离造成损失,建议不要清洗瓶子,而是将载玻片浸泡在PBS溶液中2-3次进行清洗。
1.2.8. 轻轻除去多余的液体,并用滤纸仔细吸干载玻片上样品周围的液体。将处理好的样品放入湿盒内,以保存样品的水分。
1.3 细胞爬行片的制备
将贴壁细胞培养于Lab-Tek Chamber Slides上,进行凋亡诱导处理后,用PBS清洗载玻片两次。
1.4 细胞涂片的制备(以聚赖氨酸包被的玻片为例)
1.4.1. 将细胞悬浮于PBS中,浓度约为2×107细胞/mL,吸取50~100μL细胞悬液于聚赖氨酸包被的载玻片上,用干净的载玻片将细胞悬液轻轻铺开。
1.4.2. 固定细胞,将载玻片浸入含有新鲜配制的4%多聚甲醛的PBS染色槽中,4℃放置25分钟。
1.4.3. 洗净载玻片,浸入PBS中,室温放置5分钟,再用PBS清洗。
1.4.4. 轻轻吸去多余的液体,用滤纸小心地吸干载玻片,以除去样品周围多余的液体。此时可用石蜡笔或疏水笔在样品周围勾勒出样品分布情况,以方便后续的渗透性处理和平衡标记操作。实验过程中,不要让样品干燥,将处理好的样品放入湿盒中,保持样品湿润。
1.4.5. 将2 mg/mL蛋白酶K溶液用PBS以1:100的比例稀释至终浓度为20 μg/mL。
1.4.6. 每个样品加入100 μL浓度为20 μg/mL的蛋白酶K溶液,使之完全覆盖,室温孵育5 min(也可将其浸入用PBS配制的0.2%Triton X-100溶液中,室温孵育5 min,进行通透性处理)。
【备注】:蛋白酶K可帮助组织和细胞在后续步骤中对染色试剂进行通透处理。孵育时间过长会增加后续洗涤步骤中组织切片从载板上脱落的风险,孵育时间过短则可能造成通透处理不充分,影响标记效率。若未获得较好的效果,可能需要优化蛋白酶K的孵育时间。
1.4.7. 用PBS冲洗样品2-3次,轻轻吸去多余液体,用滤纸小心吸干载玻片上样品周围的液体。将处理好的样品放入湿盒中。
2. 阳性对照的 DNase 处理步骤
样品渗透后, 用 DNase I 处理细胞以制备阳性对照载玻片。此过程通常会导致大多数细胞 经过处理后呈现绿色荧光。
[注释]:Dnase I处理固定化细胞会导致染色体DNA断裂,产生许多可标记的DNA 3'端。
2.1.用去离子水按1:10的比例稀释10×DNase I Buffer(每个样品需200 µL 1×DNase I Buffer,即20 µL 10×DNase I Buffer和180 µL去离子水稀释)。取100 µl加入透性样品中,室温孵育5min。在剩余的100 µL 1×DNase I Buffer中加入1 µL DNase I(1U/µL),使终浓度为10 U/mL。
2.2.轻轻拍去液体,然后加入100μL含10U/mL DNase I的缓冲液,室温下孵育10分钟。
2.3.轻拍载玻片以去除多余的液体,然后用去离子水在染槽中彻底清洗载玻片3-4次。
[注意]:阳性对照玻片必须使用单独的染色槽,否则阳性对照玻片上残留的 DNase I 可能会在实验玻片上引入高背景。
3. 标记与检测
3.1.平衡缓冲液(5 x 平衡缓冲液)用去离子水按 1:5 的比例稀释(每个样品需要 100 μL 1 x 平衡缓冲液)。
3.2. 每份样本加入平衡缓冲液(100 μL 1×平衡缓冲液)使面积完全平衡,室温孵育 10-30 分钟。或者,将玻片放入含有 1 x 平衡缓冲液的容器中,以确保玻片不会平衡样本。在冰上解冻 Alexa Fluor 640-12-dUTP Labeling Mix 并平衡细胞,并根据表 1 为所有实验和可选的阳性对照反应准备足够的 TdT 孵育缓冲液。对于面积小于 5 cm2 的标准反应,体积为 50 μl,将 50 μL 乘以实验和阳性对照反应的数量,以确定所需的 TdT 孵育缓冲液总体积。对于表面积较大的样本,试剂体积可按比例增加。
表 1. 为实验准备的 TdT 孵育缓冲液和可选的阳性对照反应
成分 | 体积(μL/50 μL) 系统) |
水 | 三十四 |
5×平衡缓冲液 | 10 |
Alexa Fluor 640-12-dUTP 标记混合物 | 5 |
重组TdT酶 | 1 |
[阴性对照体系]:配制不含TdT酶的对照孵育缓冲液,用ddH2O代替TdT酶。
3.3. 用吸水纸将平衡区域周围的100 μL 1×Equilibration Buffer大部分洗掉,然后将50 μLTdT incubation Buffer加入到5 cm2的细胞区域,注意不要让细胞变干,之后应将载玻片避光保存。
3.4. 在细胞上盖上塑料盖玻片,确保试剂分布均匀,并在湿盒底部放置一块用水浸湿的纸巾。将载玻片放入湿盒中,在 37°C 下孵育 60 分钟。用铝箔包裹湿盒以防光照。
[注意]:塑料盖玻片使用前可以剪成两半,折叠盖玻片边缘,方便取下和操作。
3.5. 取下塑料盖玻片,将切片放入PBS溶液中室温孵育5分钟,然后用新鲜PBS清洗切片两次。
3.6. 用滤纸轻轻擦拭样品周围和背面的 PBS 溶液。
[注]:为了降低背景,用PBS清洗载玻片一次后,可以用含有0.1%Triton X-100和5mg / mL BSA的PBS清洗3次,每次5分钟,以使游离的未反应的标记物清晰干净。
3.7. 样品放入染色槽中染色,将载玻片放入装有PI溶液(1 μg/mL,新鲜配制并用PBS稀释)的染色槽中避光、室温下放置5分钟。(可选):样品放入染色槽中染色,将载玻片放入装有DAPI溶液(2 μg/mL,新鲜配制并用PBS稀释)的染色槽中避光、室温下放置5分钟。
3.8.清洗样品,将载玻片浸入去离子水中,室温下放置 5 分钟。重复两次,共清洗三次。
3.9. 将载玻片上多余的水分敲干,并向样品区域添加100 μl PBS,以保持样品湿润。
3.10. 样本立即在荧光显微镜下分析,在620nm处检测到Alexa Fluor 640红色荧光,在460nm处观察到蓝色DAPI。DAPI可将凋亡和非凋亡细胞染成蓝色,仅在凋亡细胞核中Alexa Fluor 640-12-dUTP掺入并局部呈现红色荧光。如有必要,可将载玻片在4℃下避光保存过夜。
4. 流式细胞仪检测悬浮细胞
4.1. 将3~5×106个细胞用PBS在4℃离心(300×g)两次,再在4℃以300g离心10分钟,然后用0.5 mL PBS重悬。
4.2. 固定细胞,加入5 mL PBS 配制的1%多聚甲醛溶液,冰上放置20 min。
4.3. 细胞在4℃下以300×g离心10分钟,除去上清液,并用5 mL PBS重悬。重复洗涤一次,并用0.5 mL PBS重悬细胞。
4.4. 细胞透化,加入5 mL冰预冷的70%乙醇,-20℃孵育4小时。细胞可置于-20℃的70%乙醇中保存一周,或用PBS配制的0.2%Triton X-100溶液进行细胞透化,室温保存5分钟。
4.5. 细胞以 300 × g 离心 10 分钟,并悬浮于 5 mL PBS 中。重复离心,并悬浮于 1 mL PBS 中。
4.6. 将 2 × 106 个细胞转移至 1.5 ml 微量离心管中。
4.7. 平衡液以 300 × g 离心 10 分钟,弃上清,加入 80 μL 1 × Equilibration Buffer 重悬,室温孵育 5 分钟。
4.8. 平衡细胞的同时,将 Alexa Fluor 640-12-dUTP Labeling Mix 在冰上融化,并根据表 1 制备足够所有反应的 TdT 孵育缓冲液。对于 2 × 106 个细胞的标准反应,体积为 50 μL,将 50 μL 乘以反应次数,以确定所需的 TdT 孵育缓冲液总量。
4.9. 300×g离心细胞10分钟,弃上清,将沉淀重悬于50μL TdT孵育缓冲液中,37℃避光孵育60分钟,每15分钟用微量移液器轻轻重悬细胞一次。
4.10.加入 1 mL 20 mM EDTA 并用微量移液器轻轻混合以终止反应。
4.11. 300g 离心 10 min,弃上清,将沉淀重悬于 1 mL 用 PBS 制备的 0.1% Triton X-100 溶液中,该溶液含有 5 mg/mL BSA。重复该溶液一次,共洗涤两次。
4.12.通过流式细胞术分析细胞并测量620nm处的Alexa Fluor 640红色荧光。
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