CHO宿主细胞DNA残基检测试剂盒(3G)_ 41332ES

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Sku: 41332ES50

尺寸: 50 t
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描述

胆固醇 宿主细胞DNA残留检测试剂盒用于CHO的定量分析 各类生物制品的中间样品、半成品、成品中宿主细胞DNA残留。

本试剂盒采用Taqman荧光探针和聚合酶链式反应(PCR)方法,具有fg级最低检测限,可特异性、快速地检测出残留的CHO 细胞DNA。该试剂盒需与残留DNA样品制备试剂盒(Cat# 18461ES)一起使用。

验证报告

产品 成分

不。

姓名

41332ES5050吨

41332ES60100吨

41332-A

胆固醇 定量PCR 混合

0.75 毫升

1.5 毫升

41332-B

胆固醇 引物和探针 混合

250 微升

500 μL

41332-C

DNA稀释 缓冲

2×1.8 毫升

4×1.8 毫升

41332-D

胆固醇 DNA 控制 (30 纳克/微升)

25 微升

50 μL


运输和储存

1. 使用干冰运输 并储存于-20°C 2 人份 年

本产品储存于-25~-15℃,保存期限为2年。

41332-A 和 41332-B 均应避光保存。

适用仪器型号

包括但不限于:

Bio-Rad:CFX96 光学模块。

赛默飞世尔科技:ABI 7500;ABI Quant Studio 5。

指示

  1. 胆固醇 DNA标准稀释及标准曲线制作

CHO 使用试剂盒中提供的 DNA 稀释缓冲液对 DNA 对照进行梯度稀释*以及稀释

浓度为3ng/μL、300pg/μL、30pg/μL、3pg/μL、300fg/μL、30fg/μL、3fg/μL。

请参阅下面的详细说明:

  • 将 CHO DNA 对照和 DNA 稀释缓冲液在冰上解冻。完全解冻后,轻轻涡旋混匀,低速离心 10 秒。
  • 取出七只干净的 1.5 mL 试管,分别标记为 Std0、Std1、Std2、Std3、Std4、Std5、Std6。
  • 将90 μL DNA稀释缓冲液和10 μL CHODNA对照加入到标记为Std0的1.5 mL微量离心管中,即 稀释至3ng/μL,混匀后离心10秒,将稀释后的DNA标准品分装,可在-25~-15℃短期保存(不超过3个月)**.请避免反复冻融。
  • 将 90 μL DNA 稀释缓冲液加入其他管中***,然后按照以下步骤进行连续稀释****

管子

稀释比例

标准浓度

标准1

10 μL Std0 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

300 皮克/微升

标准2

10 μL 标准 1 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

三十 皮克/微升

标准3

10 μL Std2 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

3 皮克/微升

标准4

10 μL Std3 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

300 克/微升

标准5

10 μL Std4 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

三十 克/微升

标准6

10 μL 标准5 + 90 μL DNA 稀释缓冲液

3 克/微升

表1 标准梯度稀释

*每个浓度需设置3个复孔,检测范围为3 fg/μL~300pg/μL,且可以扩大范围。

**为了减少重复冻融次数及避免污染,建议首次将DNA对照分装于-25~-15℃保存。

***DNA稀释缓冲液解冻后可在2-8°C保存7天,若长期不使用,请保存在-25~-15℃。

****确保模板完全混合,每个梯度稀释时轻轻摇晃混合物 15 秒至 1 分钟。

  1. 提取回收控制 (ERC) 准备

根据需要设定ERC中CHO DNA的浓度(ERC样品制备30 pg CHO DNA为例),如下:

  • 取100 μL检测样品于一个干净的1.5 mL管中,加入10 μL 3pg/μL CHO DNA Standard(Std3),混匀,标记为ERC。
  • 将ERC样本的DNA提取与测试样本一起进行,制备纯化的ERC样本。
  1. 阴性对照溶液 (NCS) 制备

实验中设置阴性对照,具体操作步骤如下:

1) 将100 μL样品基质(或DNA稀释缓冲液)加入到一个干净的1.5 mL管中,然后标记为NCS。

2) 将NCS样本的DNA提取与检测样本同时进行,制备纯化的NCS样本。

  1. 无模板对照 (NTC) 制备

实验中设置无模板对照,具体操作步骤如下:

1) NTC不需要样品预处理,可以配置在qPCR检测残留DNA的阶段。

2)每管或每孔NTC样品为20 μL Mix(即15 μL CHO qPCR Mix + 4 μL CHO Primer&probe Mix + 1 μL IC)+ 10 μL DNA Dilution Buffer。建议配置三个重复孔。

  1. PCR反应体系

成分

容量(μL)

胆固醇 qPCR 混合物*

15

胆固醇 引物和探针混合物

5

DNA模板

10

总体积**

三十

表2 反应体系

*根据反应次数计算PCR总反应体积:qPCR Mix=(反应次数+2)×(15+4+1)μL(包含两个反应孔的损失)。建议每个样本实验重复三次以上。

**盖上管盖或封上板后,低速离心反应管或板10秒,充分震荡混匀5秒后,再重复离心,使液体从管盖或管壁收集至底部,操作时避免产生气泡。

请参阅下表以了解推荐的板材设置:

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

一个

负温度系数 (NTC)

TS 1

TS 1

TS 1

标准 1

标准 1

标准 1

负温度系数 (NTC)

TS 2

TS 2

TS 2

标准 2

标准 2

标准 2

负温度系数 (NTC)

TS 3

TS 3

TS 3

标准 3

标准 3

标准 3

标准 4

标准 4

标准 4

国家计算机系统公司

ERC 1

ERC 1

ERC 1

标准 5

标准 5

标准 5

F

国家计算机系统公司

ERC 2

ERC 2

ERC 2

标准 6

标准 6

标准 6

国家计算机系统公司

ERC 3

ERC 3

ERC 3

表3 电脑上参考板

板布局包括:6个Std(6个标准浓度的标准曲线),1个NTC(无模板对照),1个NCS(阴性对照溶液),3个TS(测试样品),3个ERC(提取回收对照)。每个样品设三个重复孔。

  1. 设置 PCR 仪器指南(2步法)(例如:Thermo ABI 7500 qPCR仪,Version 2.0软件)

以下说明仅适用于 Thermo ABI 7500 qPCR 仪器(软件版本 2.0)。如果您使用其他仪器,请参阅适用仪器指南以获取设置指南。

1) 生成新实验,选择绝对定量或用户定义的模板。

2) 创建1个检测探针,命名为“CHO-DNA”,选择报告荧光团为“FAM”,淬灭荧光团为“None”; 再创建1个检测探针,命名为“IC”,选择报告荧光团为“CY5”,淬灭荧光团为“None”,参考荧光为“ROX”(参考荧光可根据仪器型号等选择是否需要添加)。

3) 在“样本”窗格中,依次添加所有样本信息。然后选择孔,选择目标和相应的样本。设置CHO任务 DNA标准为标准,并赋值300000、30000、3000、300、30、3 在 Quantity 栏中填写每孔 D​​NA 浓度(单位为 fg/μL),并将孔命名为 Std 1、标准 2、标准 3、标准 4、标准 5、Std 6,对应设置NTC的任务为NTC,设置NCS、TS、ERC 为 Unknown,并根据上面的 Plate 布局进行相应的命名。然后点击 Next。

4) 设定扩增程序:设定反应体积为30 μL。

循环步骤

温度(℃)

时间

周期

初始变性

95℃

5 分钟

1

变性

95℃

15 秒

40

退火/延伸(荧光收集)

60℃

30 秒

表4 扩增步骤

  1. qPCR 结果分析

1) 在Analysis的Amplification Plot面板中系统会自动给出Threshold,系统给出的Threshold有时过于靠近基线,导致重复孔之间的Ct值相差较大,您可以手动调整Threshold到合适的位置后点击Analyze,然后可以在Multicomponent Plot中初步检查扩增曲线是否正常。

2) 在“结果分析”选项卡中,查看标准曲线图。验证 R 的值2、效率、坡度 和 Y 截距。对于正态标准曲线,R²>0.99, 90%≤Eff%≤110%,-3.6≤斜率≤-3.1。

3) 在分析中的“查看孔表”窗格中,每个样本的浓度以数量显示,单位为 fg/μL,可以在检测报告中转换单位。

4)结果分析的参数设置需要根据具体机型和使用的软件版本而定,一般可以由仪器自动解读。

5)根据待测样品TS的测试结果和样品加标回收率ERC计算加标回收率,要求加标回收率在50%~150%之间。加标回收率测定公式:回收率(%)= {Sample spiked assay (eg.pg/μL) - Sample assay (eg.pg/μL)} x 洗脱体积(μL) / DNA加入量理论值(eg.pg) x 100%。

6)阴性对照NCS的Ct值应大于标准品最低浓度C​​t的平均值。

  • 无模板对照NTC应为未确定或Ct值≥3

笔记

  1. 本产品仅供研究使用。
  2. 为了您的安全,请穿着实验服和戴上一次性手套进行操作。

3.使用该试剂前请仔细阅读本说明书,实验应规范化,包括样品处理、反应体系制备、样品的添加等。

4.使用前确保各组分充分涡旋并低速离心。

付款和安全

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