وصف
هييف NGS™ تم تصميم مجموعة MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) لإزالة rRNA و45S ITS/ETS من إجمالي RNA لدى البشر والفئران والجرذان بناءً على سير عمل قائم على RNase H وللاحتفاظ بـ mRNA وRNA غير المشفر الآخر. هذه المجموعة مناسبة لكل من عينات RNA السليمة والمتحللة جزئيًا (على سبيل المثال، FFPE RNA). نظرًا لأن عينات FFPE المتحللة تحتوي عادةً على نسبة أعلى من ITS/ETS مقارنة بعينات الأنسجة الطازجة، فإن هذه المجموعة تضيف مجسات في منطقة Human 45S ITS/ETS، ويمكن أن يؤدي إزالة ITS إلى زيادة نسبة البيانات الصالحة في البيانات الخام بشكل كبير.
سمات
- خصوصية قوية: إزالة rRNA وITS/ETS بشكل خاص من العينات البشرية، وخاصة لعينات FFPE
- توافقية عالية لكمية البدء للقالب: تنطبق على عينة 100 نانوجرام ~ 1 ميكروجرام
- تأثير إزالة مرتفع: بالنسبة لـ rRNA وITS وETS في عينات الإنسان والفئران والجرذان، فإن تأثير الإزالة يزيد عن 95%
- جودة مستقرة: أداء الدفعة الصارم ومراقبة جودة الاستقرار
التطبيقات
- بحث التعبير الجيني
- تحليل الوصل البديل
- الكشف عن الحمض النووي الريبوزي غير المشفر واكتشافه
- تحديد مواقع البولي أدينيل الانتقائية
- الكشف عن الجينات المندمجة
تحديد
| تكنولوجيا الاستنزاف | RNase H |
| نوع العينة | مجموع الحمض النووي الريبوزي للإنسان والفئران والجرذان |
| نوع المنتج النهائي | mRNA وRNAs غير المشفرة الأخرى |
| عدد التفاعلات | 24/96 تحضيرات |
| كمية المواد الأولية | 100 نانوجرام ~ 1 ميكروجرام من إجمالي الحمض النووي الريبي |
| هدف | إزالة rRNA و45S ITS/ETS من RNA البشري الكلي |
عناصر
| المكونات رقم | اسم | 12257ES24 (24T) | 12257ES96 (96ت) |
| 12257-أ | مخزن التهجين | 72 ميكرولتر | 288 ميكرولتر |
| 12257-ب | مزيج المجس (rRNA & ITS/ETS) | 48 ميكرولتر | 192 ميكرولتر |
| 12257-ج | مخزن RNase H | 72 ميكرولتر | 288 ميكرولتر |
| 12257-د | RNase H | 48 ميكرولتر | 192 ميكرولتر |
| 12257-E | مخزن DNase I | 660 ميكرولتر | 2×1320 ميكرولتر |
| 12257-ف | DNase I | 60 ميكرولتر | 240 ميكرولتر |
الشحن والتخزين
يتم شحن جميع المكونات مع الثلج الجاف ويمكن تخزينها في درجة حرارة تتراوح بين -15 درجة مئوية إلى -25 درجة مئوية لمدة عام واحد.
الأرقام
- خصوصية إزالة rRNA
بالنسبة للعينات التقليدية، يمكن إزالة rRNA وITS/EST بنسبة تزيد عن 98%، بينما بالنسبة لعينات FFPE ذات سلامة تبلغ حوالي 50%، يمكن إزالة rRNA وITS/EST بنسبة تزيد عن 95%. في الوقت نفسه، يمكن أيضًا إزالة FFPE ذات السلامة الضعيفة بشكل فعال.
الجدول 1. تأثير خصوصية إزالة rRNA
| الحمض النووي الريبوزي جودة | إزالة مخطط | مدخل | الرنا الريبوسومي (%) | نظام النقل الذكي/نظام تداول الانبعاثات (%) | رسم الخرائط (%) |
| 293T الحمض النووي الريبوزي؛ رين=10 | يزيل الرنا الريبوسومي | 1ميكروجرام | 0.19 | 4.6 | 98.28 |
| يزيل الرنا الريبوسومي و أنظمة النقل الذكية/أنظمة تداول الانبعاثات | 1ميكروجرام | 0.15 | 0.04 | 98.79 | |
| اف اف بي اي الحمض النووي الريبوزي؛ دي في 200 =90% | يزيل الرنا الريبوسومي | 500 نانوجرام | 0.23 | 4.75 | 95.35 |
| يزيل الرنا الريبوسومي و أنظمة النقل الذكية/أنظمة تداول الانبعاثات | 500 نانوجرام | 0.21 | 0.02 | 95.42 | |
| اف اف بي اي الحمض النووي الريبوزي؛ دي في 200 =50% | يزيل الرنا الريبوسومي | 500 نانوجرام | 1.4 | 16.28 | 95.57 |
| يزيل الرنا الريبوسومي و أنظمة النقل الذكية/أنظمة تداول الانبعاثات | 500 نانوجرام | 0.56 | 0.11 | 95.51 | |
| اف اف بي اي الحمض النووي الريبوزي؛ دي في 200 =20% | يزيل الرنا الريبوسومي | 1ميكروجرام | 0.35 | 67.61 | 58.4 |
| يزيل الرنا الريبوسومي و أنظمة النقل الذكية/أنظمة تداول الانبعاثات | 1ميكروجرام | 0.79 | 0.84 | 60.35 |
ملاحظة: تم استخدام عينات مختلفة من الحمض النووي الريبي البشري لإزالة الحمض النووي الريبي الريبوزي أو الحمض النووي الريبوزي الريبوزي وITS/ETS، ولإنشاء مكتبات باستخدام مجموعة أدوات تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي بعد ITS/ETS. وتم تحليل نسب الحمض النووي الريبوزي الريبوزي وITS/ETS في البيانات غير المتصلة بالإنترنت عن طريق التسلسل.
- أداء تسلسل البيانات
الجدول 2.أداء تسلسل البيانات
| عينة | دي في 200 | عدة | ينظف س20 (%) | ينظف س30 (%) | ينظف جي سي (%) | الرنا الريبوسومي (%) | أنظمة النقل الذكية/أنظمة تداول الانبعاثات (%) | فريد(٪) |
| 1 | 24% | ييسن القطة رقم 12257 | 96.75 | 92.68 | 57.05 | 4.58 | 2.42 | 96.90 |
| 2 | 40% | 96.56 | 92.42 | 55.31 | 1.93 | 0.63 | 96.45 | |
| 3 | 53% | 97.4 | 93.52 | 45.19 | 0.23 | 0.01 | 98.08 | |
| 4 | 76% | 97.67 | 93.78 | 51.28 | 0.44 | 0.01 | 93.63 |
[1] Tian S, Zhang B, He Y, et al. CRISPR-iPAS: طريقة جديدة تعتمد على dCAS13 للتداخل البديل للبولي أدينيلات. Nucleic Acids Res. 2022؛50(5):e26. doi:10.1093/nar/gkac108(IF:16.971)
الدفع والأمن
تتم معالجة معلومات الدفع الخاصة بك بشكل آمن. لا نقوم بتخزين تفاصيل بطاقة الائتمان ولا يمكننا الوصول إلى معلومات بطاقة الائتمان الخاصة بك.
سؤال
قد تعجبك أيضًا
التعليمات
المنتج مخصص لأغراض البحث فقط وليس مخصصًا للاستخدام العلاجي أو التشخيصي لدى البشر أو الحيوانات. المنتجات والمحتوى محميان بموجب براءات الاختراع والعلامات التجارية وحقوق الطبع والنشر المملوكة لشركة Yeasen Biotechnology. تشير رموز العلامة التجارية إلى بلد المنشأ، وليس بالضرورة التسجيل في جميع المناطق.
قد تتطلب بعض التطبيقات حقوق الملكية الفكرية الإضافية لجهات خارجية.
تلتزم شركة Yeasen بالعلوم الأخلاقية، حيث تؤمن بأن أبحاثنا يجب أن تعالج الأسئلة الحرجة مع ضمان معايير السلامة والأخلاق.