I. Principper for Western Blot

Western Blot (WB), eller proteinimmunoblotting, er en klassisk teknik til at detektere specifikke proteiner baseret på antigen-antistof-interaktioner, som er meget brugt inden for molekylærbiologi, immunologi og relaterede områder. Dens kernetrin omfatter:

  • Proteinseparation:

- SDS-PAGE adskiller denaturerede proteiner efter molekylvægt.

- SDS belægger proteiner med en ensartet negativ ladning, hvilket eliminerer strukturelle påvirkninger.

  • Membran overførsel:

- Proteiner overføres fra gelen til en membran (f.eks. PVDF eller nitrocellulose).

  • Antistofpåvisning:

- Primære antistoffer binder specifikt til målproteinet, efterfulgt af enzymkonjugerede sekundære antistoffer (f.eks. HRP), der genererer et detekterbart signal, såsom kemiluminescens.

II. Standard Western Blot Workflow

Trin

Nøgleprocedurer

Anbefalede reagenser

(Yeasen-produkter)

1. Prøveforberedelse

Ekstraher proteiner med RIPA lysisbuffer; tilsæt PMSF for at hæmme proteaser aktivitet.

RIPA Lysis Buffer Series, PMSF

2. Proteinkvantificering

Brug BCA metode (Kat #20200ES) til kvantificering; match standardfortyndingsbuffer til prøvebuffer.

BCA kvantificeringssæt (Kat #20200ES/20201ES)

3. SDS-PAGE Elektroforese

Brug forstøbte geler, kør ved 150 V, indtil farvestoffet når gelbunden.

Forstøbte geler, SDS-PAGE Loading Buffer

4. Membranoverførsel og blokering

Aktiver PVDF-membran (Kat #36125ES) ved iblødsætning i methanol i 1 min; overførsel ved 300 mA i 60 minutter i et isbad; blokere ved stuetemperatur (RT) i 1 time eller brug hurtig blokeringsopløsning (Kat #36122ES) i 10 min.

Transfer Buffer, PVDF-membranserie

5. Antistofinkubation

Inkuber med primært antistof ved 4°C natten over; sekundært antistof ved stuetemperatur i 1-2 timer; vask med TBST 3x grundigt.

Antistoffortynder

6.Proteinpåvisning

Udvikle med ECL (Kat #36208ES).

ECL Chemiluminescence Series

Figure 1: Western Blot Workflow

Figur 1: Western Blot Workflow

III. Fælles problemer og løsninger

Spørgsmål

Mulige årsager

Løsninger

Høj baggrund

High Background

Ufuldstændig blokering

Brug frisk blokeringsløsning og forlænge blokeringstiden.

Utilstrækkelig vask

Øg vaskefrekvensen og -varigheden for at fjerne uspecifik binding.

For høj koncentration af primært antistof

Fortynd antistof til en passende koncentration.

Prøve kvalitetsproblemer

Kontroller prøvens renhed og kvalitet; bruge friske prøver.

Membrantørring

Sørg for, at membranen forbliver hydreret under inkubationstrin; sikre fuld kontakt med reaktionsopløsninger.

Svagt eller intet signal

Weak or No Signal

Ufuldstændig overførsel

Bekræft overførselseffektiviteten og juster tiden efter behov.

Uaktiveret PVDF-membran

Udblød PVDF i methanol for at aktivere før overførsel til buffer.

Primær antistofmismatch med målart

Tjek datablad, sammenlign immunogen- og proteinsekvenser, og medtag en udbredt positiv kontrol (f.eks. β-actin i pattedyrsceller).

Primær og sekundær antistof-inkompatibilitet

Sørg for, at sekundært antistof matcher værtsarten for det primære antistof.

Utilstrækkelig antistofbinding

Forøg antistofkoncentrationen og forlæng inkubationen ved 4°C (f.eks. natten over).

Lave antigenniveauer

Indlæs mindst 20-30 μg protein pr. bane; bruge proteasehæmmere og en positiv kontrol.

Lavt målproteinekspression

Bekræft udtryk i prøve via litteratur/database; koncentrere prøven, eller brug en højekspressionskontrol.

Ikke-specifikke bånd/flere bånd

Non-Specific Bands/Multiple Bands

Overpasserede cellelinjer ændrer proteinprofiler

Brug lavpassageceller (<15 passager) og kør parallelle kontroller med tidlig passage-aktier.

Proteinnedbrydning

Inkluder proteaseinhibitorer i lysisbuffer; Opbevar ved -80°C, undgå fryse-optøning, brug friske prøver.

Post-translationelle modifikationer

Tjek litteraturen for modifikationer, der påvirker båndstørrelsen (f.eks. ubiquitinering, glykosylering).

Flere splejsningsvarianter

Bekræft splejsningsvarianter via litteratur eller databaser.

Proteindimere/multimere

Tilføj frisk β-mercaptoethanol eller DTT til SDS loading buffer.

Eksogen proteinforurening

Tjek for eksogene proteiner; skift cellelinjer om nødvendigt.

Overdreven prøvebelastning

Optimer belastning (20-30 μg) baseret på målekspression via gradienttest.

Multimer dannelse

Kog prøver i 10 minutter for at dissociere multimerer

Høj primær antistofkoncentration

Reducer koncentration og/eller inkubationstid for at undgå ekstra bånd.

Høj sekundær antistofkoncentration

Lavere koncentration og inkludere en sekundær-kun kontrol for at reducere ikke-specifik binding.

Påvisning af urapporterede proteiner eller familiemedlemmer

Gennemgå litteratur eller BLAST; brug anbefalede cellelinjer/væv.

Hvis bekræftet, har du muligvis opdaget et nyt protein!

Smilende bands

Smiling Bands

Hurtig migration, høj buffertemperatur, overbelastning, lav buffer

Langsom migration, forafkøling af buffer, reducer proteinbelastningen, sørg for, at buffer dækker brøndene helt.

panderynke bånd

Frowning Bands

Enhedsproblemer (f.eks. bobler under gel)

Juster opsætningen for at fjerne bobler og sikre ensartet gelpolymerisation.

Halebånd

Tailing Bands

Dårlig prøveopløselighed, nedbrydning, genbrugt buffer

Bland prøverne godt, brug friske prøver, klargør frisk kørebuffer.

Håndvægt-formede bånd

Dumbbell-Shaped Bands

Ujævn gel polymerisation, urene prøver

Omstøbt gel for ensartethed; centrifuger prøver før brug.

Bånd udtværing

Band Smearing

Overdreven belastning, dårlig gelkvalitet

Reducer prøvevolumen, forbedre gelforberedelsen.

Boblemærker

Bubble Marks

Luft fanget under overførsel

Fjern bobler, når du samler transfersandwichen.

Ujævne sorte pletter

Uneven Black Spots

Uopløst blokerende opløsning, ujævn antistoffordeling

Opløs blokerende opløsning fuldstændigt, vask 3x med TBST, ryst under inkubation.

Hvide pletter

White Patches

Høj antistofkoncentration udtømmende substrat

Lavere primære/sekundære antistofkoncentrationer.

Ⅳ.Værktøjer til produktvalg og optimering

Yeasen tilbyder en omfattende suite af reagenser til at strømline din arbejdsgang

Relaterede produkter:

Procedurer

Kat. Ingen.

Produktnavn

Specifikationer

Prøveforberedelse

20101ES

RIPA lyseringsbuffer (stærk)

100 ml

20115ES

RIPA lysebuffer (medium)

100 ml

20114ES

RIPA lyseringsbuffer (svag)

100 ml

20118ES

Lysisbuffer til WB/IP-analyser

100 ml

20201ES

BCA Protein Quantification Kit (forbedret)

500 T/2500 T/5000 T

20200ES

BCA Protein Quantification Kit (Klar til brug)

500 T

SDS-SIDE Elektroforese

20350ES

Gold Band Plus 3-farvet Regular Range Protein Marker (8-180 kDa)

250 μL/2×250 μL/10×250 μL

20352ES

GoldBand™ 3-farve High Range Protein Marker (10-245 KDa)

2×250 μL/10×250 μL

20328ES

SDS-PAGE Gelforberedelseskit

1 sæt (30~50 geler)/ 1 sæt (150~250 geler)

20324ES- 20327ES

SIDE Gel Quick Preparation Kit

Koncentrationer: 8 %, 10 %, 12,5 %, 15 %

36259ES-36280ES

Precast Protein Plus Gel

Koncentrationer: 8%, 10%, 12%, 4-12%, 4-20%

Indstillinger for indlæsning af brønd: 10 brønde, 12 brønde, 15 brønde

Membranoverførsel og blokering

36125ES

0,45 μm PVDF-membran (1 rulle, 30 cm×3 m)

1 rulle

36126ES

0,22 μm PVDF-membran (1 rulle, 30 cm×3 m)

1 rulle

Antistofinkubation

36206ES

Primær og sekundær antistoffortynder til WB

100 ml/500 ml

Proteinpåvisning

36208ES

Super ECL-detektionsreagens

100 ml/500 ml

36222ES

Forbedret ECL kemiluminescerende substratsæt

100 ml/500 ml

V.Sådan får du support

Til personlig fejlfinding eller protokoloptimering:

Gylden regel for succes: Standardiserede procedurer + reagenser af høj kvalitet + trin-for-trin validering = reproducerbare WB-resultater!

Forespørgsel