La agarosa es un coloide hidrofílico de galactano lineal purificado extraído de agar o de algas marinas que contienen agar. Estructuralmente, es un polímero lineal compuesto de β-D-galactopiranosilo (1-4) unido a residuos de 3,6-anhidro-α-L-galactopiranosilo. Como reactivo en gel, se utiliza comúnmente para el análisis rutinario de ácidos nucleicos a través de electroforesis en gel o métodos de transferencia (como Northern o Southern), y también es adecuado para aplicaciones proteínicas, como experimentos de inmunodifusión radial (RID).
La electroforesis en gel de agarosa es un método electroforético que utiliza agarosa como medio de soporte, que incluye la preparación del gel, la carga de la muestra y la electroforesis. La principal diferencia en el principio de análisis con respecto a la electroforesis con otros materiales de soporte es que tiene una doble función de "tamiz molecular" y "electroforesis". Cuando el gel se coloca en un campo eléctrico, los ácidos nucleicos cargados migran a través de los poros del gel hacia el polo positivo. Después de la electroforesis en diferentes condiciones durante un tiempo adecuado, los fragmentos de ácidos nucleicos de diferentes tamaños y conformaciones se ubicarán en diferentes posiciones en el gel, logrando así la separación.
Fig.1 Pasos para la operación del experimento de electroforesis de ácidos nucleicos
Fig.2 Diagrama de dirección de migración de electroforesis
¿Cómo elegir la agarosa adecuada?
Juzgue basándose en los parámetros básicos de la agarosa:
- Contenido de sulfato: un indicador de pureza;
- Fuerza del gel: la fuerza externa necesaria para romper el gel;
- Punto de gelificación: la temperatura a la cual una solución de agarosa soluble en agua forma un gel al enfriarse;
- Electroendosmosis (EEO): un tipo de movimiento electrocinético en el que los líquidos penetran en el gel. Los grupos aniónicos dentro del gel de agarosa se adsorben en la matriz y no migran, pero los cationes disociados migrarán hacia el polo negativo, generando así electroósmosis. Dado que la migración electroforética de las muestras generalmente se mueve hacia el polo positivo, la convección interna causada por EEO puede interferir con la eficiencia de separación. Según los parámetros básicos de la agarosa, un gel de agarosa de alta calidad debe tener poros transparentes, ser menos propenso a romperse y tener características como alta pureza (bajo contenido de sulfato), alta resistencia del gel, punto de gel relativamente alto (solidificación rápida a temperatura ambiente) y baja EEO.
Juzgar en función del rango de separación de la agarosa:
Los geles de agarosa tienen un amplio rango de separación y se utilizan comúnmente para la recuperación de geles de ADN, la separación de ADN y para confirmar si el ADN se recombina y si los plásmidos y similares se abren. Diferentes tamaños de fragmentos objetivo corresponden a diferentes concentraciones de agarosa. De acuerdo con el principio de que una alta concentración es adecuada para separar fragmentos pequeños, puede consultar la siguiente tabla para encontrar la concentración de gel óptima que se adapte a sus necesidades.
| Concentración de agarosa (%) | ≥3 | 2-3 | 1-2 | 0,7-1 | ≤0.7 |
| Tamaño del fragmento de ADN (pb) | ≤200 | 200-700 | 700-1500 | 1500-5000 | ≥5000 |
YEASEN Agarosa de alta calidad: cubre una variedad de escenarios de aplicación para satisfacer sus necesidades
| Nombre del producto | Número de producto | Especificaciones del producto | Escenario de aplicación |
| 10208ES60/76 | 100 gramos / 500 gramos | Electroforesis de ácidos nucleicos de rutina |
Ventajas del producto
Baja electroendosmosis (EEO ≤ 0,13), lo que da como resultado una excelente separación de bandas, una distinción clara y una migración más rápida.
Los poros del gel son claros y rectos, con alta resistencia de gel y menos propensos a romperse.
Método de uso de agarosa de alta calidad
La concentración del gel de agarosa suele elegirse entre el 0,7% y el 2%. Cuanto mayor sea la concentración, menor será el tamaño de poro molecular del gel, más lenta será la velocidad de migración del ADN y mayor será la resolución. Por el contrario, cuanto menor sea la concentración, más rápida será la velocidad de migración del ADN y menor será la resolución. Elija la concentración de gel adecuada y el tampón de electroforesis compatible en función de los diferentes propósitos experimentales.
| Concentración de agarosa | Rango de separación efectivo (pb) | Tampón recomendado |
| 0,5% | 2.000-50.000 | 1×TAE |
| 0,8% | 800-10.000 | 1×TAE |
| 1.0% | 400-8.000 | 1×TAE |
| 1,2% | 300-7.000 | 1×TAE |
| 1,5% | 200-3.000 | 1×TAE/0,5×TBE |
| 2.0% | 100-2.000 | 1×TAE/0,5×TBE |
| 3.0% | 25-1.000 | 0,5 × TBE |
Literatura publicada (parcial)
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- Wang M, Zhang S, Zheng G, et al. La mutación con ganancia de función de Card14 conduce a una inflamación cutánea espontánea similar a la psoriasis a través de una respuesta mejorada de los queratinocitos a IL-17A. Inmunidad. 2018;49(1):66-79.e5. doi:10.1016/j.immuni.2018.05.012.SI=19.734
- Zhang Y, Ding H, Wang X, et al. MK2 promueve la degradación de Tfcp2l1 a través de la ubiquitina ligasa β-TrCP para regular la autorrenovación de células madre embrionarias de ratón. Cell Rep. 2021;37(5):109949. doi:10.1016/j.celrep.2021.109949.SI=9.423
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- Zhou J, Xiong R, Zhou J, et al. Participación del factor regulador m6A IGF2BP1 en la transformación maligna de células epiteliales bronquiales humanas Beas-2B inducida por el carcinógeno del tabaco NNK. Toxicol Appl Pharmacol. 2022;436:115849. doi:10.1016/j.taap.2021.115849.SI=5.219
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Guía de selección de productos relacionados
| Posicionamiento del producto | Nombre del producto | Número de producto | Especificaciones del producto | Escenario de aplicación |
| Tinciones de ácidos nucleicos | 10202ES76 | 500 μL | Soluble en agua, con las mismas características espectrales que el EB, detectado bajo excitación de luz UV de 300 nm. | |
| Marcador de ADN | 10501ES60/80 | 100 T/10×100 T | 100-2000 pb | |
| Marcador de ADN GoldBand DL5000 | 10504ES60/80 | 100 T/10×100 T | 100-5000 pb | |
| 10507ES60/80 | 100 T/10×100 T | 100-1.500 pb | ||
| 10510ES60/80 | 100 T/10×100 T | 250-12.000 pb |