کل تحقیق رونوشت
[توالی یابی کل رونوشت - تحقیق در مورد تنظیم هدفمند و رابطه متقابل بین RNA غیر کد کننده و mRNA]
توالی یابی کل رونویسی با توان عملیاتی بالا از روش ساخت کتابخانه اختصاصی رشته های خالی از ریبوزوم و روش ساخت کتابخانه غربالگری غنی سازی قطعات کوچک استفاده می کند که می تواند به ساخت کتابخانه، توالی یابی، تجزیه و تحلیل اطلاعات، تجزیه و تحلیل مشترک و ceRNA و غیره RNA کدکننده و RNA غیرکدکننده دست یابد. به این ترتیب می تواند بدست آوردن کل اطلاعات رونویسی RNA مربوط به فرآیندهای بیولوژیکی خاص (مانند توسعه، بیماری و غیره) به سرعت، جامع و دقیق. از طریق تجزیه و تحلیل داده ها، تحقیق در مورد مکانیسم تنظیم بیولوژیکی را می توان به یک مدل سه بعدی که ترکیبی از "شبکه و چند سطح" است، گسترش داد که برای تفسیر جامع پدیده های بیولوژیکی مفید است.
دو راه برای توالی یابی کل رونوشت وجود دارد، یکی LncRNA-Seq + RNA کوچک و دیگری LncRNA-Seq + RNA کوچک + CircRNA که می تواند اطلاعات جامع تری از CircRNA به دست آورد.
1. توالی یابی کل رونوشت با دو کتابخانه: LncRNA-Seq + RNA کوچک
2.توالی یابی کل رونوشت با سه کتابخانه: LncRNA-Seq + RNA کوچک + CircRNA
راه حل مواد خام کل رونوشت
| طبقه بندی | دسته حیوانات | دسته گیاهان | دسته بندی باکتری و قارچ | |||
| نوع نمونه | بافت / سلول حیوانی | سلول | خون کامل | بافت گیاهی | بافت قارچی | باکتری ها و قارچ های کشت شده |
| استخراج RNA | روش دانه های مغناطیسی: 18605/18607/18606; روش ستون: 19221/19211; روش تریزول: 10606/19202 | روش دانه های مغناطیسی: 18600/18604; روش ستون: 19231 | روش ستون: 19241; روش تریزول: 19201 | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش ستون: 19301 (قارچ ها نیاز به افزودن لیزوزیم دارند 10403) |
| استخراج miRNA | روش ستون: 19331 | روش ستون: 19331 | روش ستون: 19332 | روش ستون: 19331 | - | - |
| ساخت کتابخانه miRNA | قابل انتظار است | |||||
| حذف rRNA | RNase حذف آنزیمی H: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف منبع انسانی); دانه های مغناطیسی حذف به روش: 12266 (نوع جهانی پستانداران)/12267 نوع جهانی پرندگان/12268 مرغ خانگی/12269 گورخرماهی/12270 مگس سرکه /12275 صدف/12278 پلاناریان/12285 زنبور عسل/12286 گلدن اسپیکر/12286 گلدن گوی/12286 نماتد Aedes albopictus/12287 | RNase حذف آنزیمی H: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف انسانی، مناسب برای پاتوژن) | RNase حذف آنزیمی H شامل حذف گلوبین: 12257 + 12806; RNase H حذف آنزیمی گلوبین: 13572; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 + 12260 | RNase حذف آنزیمی H: 12254; روش حذف دانه های مغناطیسی: 12262 آنژیوسپرم | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12271 قارچی نوع جهانی | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12264 باکتری یونیورسال نوع / 12265 نوع جهانی پروکاریوتی |
| ساخت کتابخانه | کیت ساخت کتابخانه RNA غیر مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12308 (سازگار با Illumina و MGI). کیت ساخت کتابخانه RNA پیش مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12310 (سازگار با Illumina و MGI)/12340 (بدون اکتینومایسین D، dUTP)/12341 (بدون اکتینومایسین D، dTTP) | |||||
تحقیقات LncRNA
RNA غیر کد کننده طولانی (LncRNA) نوعی RNA غیر کد کننده با عملکرد تنظیمی منحصر به فرد است که در سال های اخیر توجه زیادی را به خود جلب کرده است. طول LncRNA بیش از 200nt است، پروتئین ها را کد نمی کند، و حفاظت از آن در بین گونه ها ضعیف است.برخی از ساختارهای توالی آن شبیه mRNA هستند (حاوی دم polyA و اتصال جایگزین)، در حالی که برخی دیگر این ویژگی ها را ندارند. در حال حاضر، تولید و مکانیسم عملکردی LncRNA هنوز به طور کامل شناخته نشده است، با این حال، بسیاری از LncRNAها با عملکردهای بیولوژیکی مهم (مانند بروز سرطان، خاموش کردن کروموزوم X و تشکیل شبکه‌های تنظیمی پیچیده با سایر عوامل نظارتی) کشف شده‌اند.
مسیر فنی توالی یابی LncRNA
محلول مواد اولیه توالی یابی LncRNA
| طبقه بندی | دسته حیوانات | گیاه دسته بندی | دسته بندی باکتری و قارچ | |||
| نوع نمونه | بافت / سلول حیوانی | سلول | خون کامل | بافت گیاهی | بافت قارچی | باکتری ها و قارچ های کشت شده |
| استخراج RNA | روش دانه های مغناطیسی: 18605/18607/18606; روش ستون: 19221/19211; روش تریزول: 10606/19202 | روش دانه های مغناطیسی: 18600/18604; روش ستون: 19231 | روش ستون: 19241; روش تریزول: 19201 | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش ستون: 19301 (قارچ ها باید lywallzyme 10403 را اضافه کنند) |
| حذف rRNA | RNase H حذف آنزیمی: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف منبع انسانی); دانه های مغناطیسی حذف به روش: 12266 (نوع جهانی پستانداران)/12267 نوع جهانی پرندگان/12268 مرغ خانگی/12269 گورخرماهی/12270 مگس سرکه /12275 صدف/12278 پلاناریان/12285 زنبور عسل/12286 گلدن اسپیکر/12286 گلدن گوی/12286 نماتد Aedes albopictus/12287 | RNase H حذف آنزیمی: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف انسانی، مناسب برای پاتوژن) | RNase H حذف آنزیمی، از جمله حذف گلوبین: 12257 + 12806; RNase H حذف آنزیمی گلوبین: 13572; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 + 12260 | RNase H حذف آنزیمی: 12254; روش حذف دانه های مغناطیسی: 12262 آنژیوسپرم | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12271 قارچی نوع جهانی | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12264 باکتری یونیورسال نوع / 12265 نوع جهانی پروکاریوتی |
| ساخت کتابخانه | کیت ساخت کتابخانه RNA غیر مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12308 (سازگار با Illumina و MGI). کیت ساخت کتابخانه RNA پیش مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12310 (سازگار با Illumina و MGI)/12340 (بدون اکتینومایسین D، dUTP) | |||||
تحقیق رونوشت یوکاریوتی
تحقیقات رونویسی یوکاریوتی از فناوری RNA-seq برای به دست آوردن mRNA کل که می تواند توسط سلول های خاص در یک حالت عملکردی خاص رونویسی شود، استفاده می کند.سپس داده‌های خام دانلود شده با هم پیوند و مونتاژ می‌شوند، سطح بیان ژن شمارش می‌شود و تجزیه و تحلیل افتراقی و آنالیز غنی‌سازی عملکردی انجام می‌شود. این نه تنها می تواند بیشتر اطلاعات ژنی گونه را به دست آورد، بلکه تفاوت بیان ژن و تغییر مسیر عملکردی را در سطح کلی مطالعه می کند و مکانیسم مولکولی فرآیندهای بیولوژیکی خاص را آشکار می کند.
مسیر فنی توالی یابی رونوشت یوکاریوتی
محلول مواد خام تعیین توالی رونوشت یوکاریوتی
| طبقه بندی | دسته حیوانات | دسته گیاهان | دسته قارچ | |||
| نوع نمونه | بافت / سلول حیوانی | سلول | خون کامل | بافت گیاهی | بافت قارچی | قارچ های پرورشی |
| استخراج RNA | روش دانه های مغناطیسی: 18605/18607/18606; روش ستون: 19221/19211; روش تریزول: 10606/19202 | روش دانه های مغناطیسی: 18600/18604; روش ستون: 19231 | روش ستون: 19241; روش تریزول: 19201 | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش ستون: 19301 (لیزوزیم 10403 را اضافه کنید) |
| ضبط mRNA | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit |
| ساخت کتابخانه | کیت کتابخانه RNA غیر مخلوط: کیت کتابخانه RNA دو حالته 12308 (سازگار با Illumina و MGI) کیت کتابخانه RNA غیر مخلوط با mRNA ضبط: کیت کتابخانه RNA دو حالته 12309 (سازگار با Illumina و MGI) کیت کتابخانه RNA پیش مخلوط: کیت کتابخانه RNA دو حالته 12310 (سازگار با Illumina و MGI)/12340 (بدون اکتینومایسین D، dUTP) | |||||
تحقیقات circRNA
[توالی یابی circRNA - تحقیق در مورد چگونگی تأثیر بیان دیفرانسیل circRNA بر فرآیندهای بیولوژیکی]
RNA دایره ای (circRNA) نوع خاصی از آنالیز RNA غیر کدکننده است. توالی یابی با استفاده از یک پلت فرم توالی یابی برای انجام شناسایی دقیق circRNA و تجزیه و تحلیل ژن های منبع برای نمونه هایی با ژنوم مرجع انجام می شود. توالی یابی circRNA به طور فزاینده ای در زمینه های تحقیقاتی پزشکی و کشاورزی استفاده می شود. بر اساس توالی یابی بالا و با تکیه بر پایگاه های داده اصلی و نرم افزار شناسایی circRNA، اطلاعات circRNA گونه های پروژه برای بررسی عمیق عملکردهای مهم circRNA در تنظیم رونویسی تجزیه و تحلیل می شود.
راه حل مواد خام تحقیقاتی circRNA
| طبقه بندی | دسته حیوانات | دسته گیاهان | دسته بندی باکتری و قارچ | |||
| نوع نمونه | بافت / سلول حیوانی | سلول | خون کامل | بافت گیاهی | بافت قارچی | باکتری ها و قارچ های کشت شده |
| استخراج RNA | روش دانه های مغناطیسی: 18605/18607/18606; روش ستون: 19221/19211; روش تریزول: 10606/19202 | روش دانه های مغناطیسی: 18600/18604; روش ستون: 19231 | روش ستون: 19241; روش تریزول: 19201 | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش دانه های مغناطیسی: 18534/18535/18537; روش ستون: 19291ES/19292ES | روش ستون: 19301 (قارچ ها نیاز به افزودن لیزوزیم 10403 دارند) |
| حذف rRNA | RNase H حذف آنزیمی: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف منبع انسانی); دانه های مغناطیسی حذف به روش: 12266 (نوع جهانی پستانداران)/12267 نوع جهانی پرندگان/12268 مرغ خانگی/12269 گورخرماهی/12270 مگس سرکه /12275 صدف/12278 پلاناریان/12285 زنبور عسل/12286 گلدن اسپیکر/12286 گلدن گوی/12286 نماتد Aedes albopictus/12287 | RNase H حذف آنزیمی: 12257; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف انسانی، مناسب برای پاتوژن) | RNase H حذف آنزیمی، از جمله حذف گلوبین: 12257 + 12806; RNase H حذف آنزیمی گلوبین: 13572; حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 + 12260 | RNase H حذف آنزیمی: 12254; روش حذف دانه های مغناطیسی: 12262 آنژیوسپرم | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12271 قارچی نوع جهانی | روش حذف دانه های مغناطیسی: 12264 باکتری یونیورسال نوع / 12265 نوع جهانی پروکاریوتی |
| هضم RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی | 14606 RNase R برای حذف مولکول های RNA خطی |
| ساخت کتابخانه | کیت ساخت کتابخانه RNA غیر مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12308 (سازگار با Illumina و MGI). کیت ساخت کتابخانه RNA پیش مخلوط: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12310 (سازگار با Illumina و MGI)/12340 (بدون اکتینومایسین D، dUTP) | |||||
متاترانسکریپتوم
[متاترانسکیپتوم - ثبت تغییرات دینامیکی میکروارگانیسم‌های فعال در محیط میکرواکولوژیکی]
توالی‌یابی متاترانسکیپتوم: قوانین رونویسی و تنظیم همه ژنوم‌ها را در یک محیط خاص در سطح کلی مطالعه می‌کند.با در نظر گرفتن تمام RNA موجود در ریزمحیط میکرواکولوژیکی به عنوان هدف تحقیق، توالی یابی با توان عملیاتی بالا را برای مطالعه تغییرات جوامع میکروبی پیچیده در سطح رونویسی و استخراج ژن های فعالی که نقش دارند، ترکیب می کند.
راه حل مواد اولیه تحقیقاتی متاترانسکیپتوم
| نوع نمونه | باکتری ها و قارچ های کشت شده | نمونه های بالینی |
| استخراج RNA | روش ستون: 19301 (قارچ ها باید lywallzyme 10403 را اضافه کنند) | روش ستون: 19321 (استخراج DNA/RNA ویروسی). روش دانه های مغناطیسی: 18521 (استخراج DNA/RNA ویروسی). 18306 (استخراج DNA/RNA پاتوژن) |
| حذف rRNA | حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف منبع انسانی) | حذف سریع 3 دقیقه ای: 12258 (حذف منبع انسانی) |
| ساخت کتابخانه | گزینه 1. ساخت کل کتابخانه RNA: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12308ES (سازگار با Illumina و MGI). گزینه 2. ساخت کتابخانه هضم آنزیمی cDNA: ماژول سنتز cDNA 13488 + کیت ساخت کتابخانه هضم آنزیمی سریع 12316ES | گزینه 1. ساخت کل کتابخانه RNA: کیت ساخت کتابخانه RNA دو حالته 12308ES (سازگار با Illumina و MGI). گزینه 2.ساخت کتابخانه هضم آنزیمی cDNA: ماژول سنتز cDNA 13488 + کیت ساخت کتابخانه هضم آنزیمی سریع 12316ES |
توصیه محصول
| نام محصول | شماره کاتالوگ | مشخصات |
| هیف NGS TM کیت آماده سازی کتابخانه EvoMax RNA (dUTP) | 12340ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت آماده سازی کتابخانه RNA EvoMax (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت آماده سازی کتابخانه RNA دو حالته Ultima (Illumina و MGI) | 12308ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت آماده سازی کتابخانه RNA دو حالته Ultima (نسخه پیش مخلوط) | 12310ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM mRNA Isolation Master Kit V2 | 12629ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت تخلیه rRNA انسانی MaxUp (rRNA و ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت تخلیه MaxUp rRNA (گیاه) | 12254ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت حذف یک مرحله‌ای rRNA (انسان، 100-100 نانوگرم) | 12258ES24/96 | 24 T / 96 T |
| هیف NGSTM کیت حذف MagSP rRNA (باکتری ها (G- و G+)) با دانه های تصفیه | 12264ES24/96 | 24 T / 96 T |