Dalam beberapa tahun terakhir, insiden penyakit menular global telah meningkat, dengan patogen yang semakin beragam dan kompleks. Tantangan signifikan dalam skenario ini adalah bahwa sekitar setengah dari pasien menghadapi kesulitan memiliki patogen yang tidak diketahui, sehingga diagnosis cepat patogen ini menjadi tugas yang berat. Saat ini, deteksi patogen klinis terutama bergantung pada metode kultur tradisional, teknik PCR, sekuensing metagenomik (mNGS), dan sekuensing yang ditargetkan pada patogen (tNGS).
PCR kuantitatif fluoresensi waktu nyata telah menjadi terkenal dalam deteksi asam nukleat SARS-CoV-2. Demikian pula, mNGS telah menarik perhatian atas kontribusinya dalam memerangi SARS-CoV-2 dan telah beralih dari lingkungan klinis ke penggunaan sehari-hari. tNGS, yang menawarkan keunggulan PCR dan NGS, seperti kecepatan, akurasi, dan efektivitas biaya dalam layanan pengurutan, semakin diminati di bidang pengujian klinis.
Bersamaan dengan itu, penerapan produk biologis telah meluas ke biomedis, pertanian biologis, bioenergi, produksi biologis, perlindungan lingkungan, dan domain lainnya. Karena pangsa pasar produk biologis terus tumbuh, badan pemerintah dan otoritas terkait telah menetapkan sistem dan standar manajemen mutu yang terstandardisasi untuk produk-produk ini. Area fokus tertentu berkaitan dengan keberadaan residu asam nukleat dari sel inang dalam produk biologis.
Produk biologis seperti obat protein rekombinan, obat antibodi, vaksin, dan terapi sel dan gen diproduksi menggunakan galur atau lini sel yang berurutan, yang berpotensi mengakibatkan retensi asam nukleat inang dalam produk akhir. Asam nukleat inang yang tersisa dapat menimbulkan konsekuensi yang merugikan, seperti proliferasi sel yang tidak terkendali yang menyebabkan pembentukan tumor atau memperburuk respons imun dengan memasukkan gen virus. Oleh karena itu, penghilangan residu asam nukleat yang efektif dan deteksi residu yang ketat sangat penting untuk memastikan keamanan produk biologis dan memenuhi persyaratan penelitian. Dalam industri, metode qPCR/RT-qPCR banyak digunakan untuk mengembangkan kit deteksi untuk deteksi residu asam nukleat inang dalam produk biologis.
Lebih jauh lagi, enzim molekuler komersial biasanya diekspresikan menggunakan galur rekayasa rekombinan, seperti E. coli, yang menghasilkan keberadaan DNA genom inang dalam enzim molekuler ini. Selain itu, faktor lingkungan dan manusia dapat memasukkan DNA yang terkontaminasi ke dalam produk enzim molekuler.
Selama proses deteksi patogen, asam nukleat bakteri latar belakang dari kontaminasi dapat menutupi asam nukleat target dengan kelimpahan rendah atau terdeteksi bersamaan dengan asam nukleat target. Hal ini dapat memengaruhi sensitivitas deteksi target atau menyebabkan hasil positif palsu, sehingga mempersulit diagnosis dan keputusan perawatan yang dibuat oleh tenaga medis.
Dalam pengembangan dan produksi produk kontrol kualitas untuk pengujian residu asam nukleat inang, keberadaan residu asam nukleat inang, termasuk yang berasal dari manusia, tikus, E. coli, ragi, dan lainnya, dalam enzim molekuler dapat menyebabkan ketidakakuratan dalam kuantifikasi produk kontrol kualitas residu asam nukleat inang. Hal ini menimbulkan potensi risiko keamanan dalam pembuatan produk biologis.
Untuk mengatasi masalah bakteri latar belakang dan gangguan residu asam nukleat inang,
Meja 1 Daftar
Klasifikasi Produk | Nama Produk | Nomor Katalog. | Kriteria Bakteri E.coli Kontrol kualitas gDNA |
UCF.MEWaktu Standar produk enzim residu ultra rendah untuk qPCR/RT-qPCR | Hieff UCF.MEWaktu Standar DNA Polimerase Taq Sensitif Hotstart (5 (U/μL) | 14314ES | <0,005 salinan/U |
Hifair UCF.MEWaktu Standar Transkriptase Balik V (200 U/μL) | 14608ES | <0,005> salinan/U | |
UCF.MEWaktu Standar Penghambat RNase Murine (40 U/μL) | 14672ES | <0,001 salinan/U | |
UCF.MEWaktu Standar Inhibitor RNase Afinitas Tinggi (40 U/μL) | 14675ES | <0,001 salinan/U | |
UCF.MEWaktu Standar Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), tidak tahan panas, 1 U/μL | 14466ES | <0,1 salinan/U | |
UCF.MEWaktu Standar Urasil DNA Glikosilase (UDG/UNG), 1 U/μL | 14454ES | <0,1 salinan/U |
Presentasi data parsial (UCF.ME)Waktu Standar Hotstart Sensitive Taq DNA Polymerase sebagai contoh)
- Rsisadari koli DNA <0.05>005 eksemplar/U
- koliResidu gDNA dari berbagai batch UCF.MEWaktu StandarEnzim Taq (Cat#14314ES) terdeteksi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Bakteri E.coli Residu gDNA residu polimerase DNA Taq jauh di bawah 0,005 salinan/AS.
Angka 1: Deteksi Bakteri E.coli GResidu DNA UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES)
- Tidak terdeteksi adanya sisa DNA plasmid
Residu DNA plasmid UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES) dan DNA polimerase Taq merek A terdeteksi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat residu DNA plasmid pada DNA polimerase Taq merek A. Tidak terdeteksi DNA plasmid pada UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES).
Gambar 2: Hasil deteksi residu DNA plasmid
- Sebelas jenis bakteri latar belakang umum tidak terdeteksi
Gunakan UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES) digabungkan dengan primer dan probe Bakteri Pseudomonas aeruginosaBahasa Indonesia: Bakteri Acinetobacter baumanniiBahasa Indonesia: Bunga Serratia marcescensBahasa Indonesia: Klebsiella pneumoniaeBahasa Indonesia: Stenotrophomonas maltophilBahasa Indonesia: Bakteri streptokokus pneumoniaBahasa Indonesia: Bakteri Enterococcus faeciumBahasa Indonesia: Stafilokokus aureusBahasa Indonesia: Bakteri E.coliBahasa Indonesia: Bakteri Enterococcus faecalis untuk menyiapkan premix qPCR. NTC (No Template Control) terdeteksi, hasilnya menunjukkan bahwa tidak ada sisa dari 11 bakteri latar belakang umum di atas yang terdeteksi di UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES).
Gambar 3: Hasil pengujian 11 bakteri latar belakang umum (dibatasi oleh ruang, Bakteri Pseudomonas aeruginosaBahasa Indonesia: Bakteri Acinetobacter baumanniiBahasa Indonesia: Bunga Serratia marcescens Dan Klebsiella pneumoniae ditampilkan sebagai contoh)
- Presentasi kasus uji pelanggan
Enzim Taq komersial dan
Angka 4: DEksekusi hasil dari Bahasa Indonesia: E.koli Residu gDNA (kasus uji pelanggan)
Kiri: Enzim Taq konvensional yang tersedia secara komersial; Kanan: UCF.MEWaktu Standar Enzim Taq (Cat#14314ES)
Rekomendasi produk terkait
Klasifikasi Produk | Nama Produk | Nomor Katalog. |
Kit deteksi residu asam nukleat inang | 41332ES | |
41331ES | ||
41307ES | ||
41308ES | ||
Kit Deteksi Residu DNA Sel Inang Hansenula polymorpha | 41317ES | |
Bakteri E.coli Kit Deteksi Residu RNA Sel Inang | 41318ES |