La ricerca completa sul trascrittoma
[Sequenziamento dell'intero trascrittoma - Ricerca sulla regolazione mirata e sulla relazione di interazione tra RNA non codificante e mRNA]
Il sequenziamento ad alto rendimento dell'intero trascrittoma adotta il metodo di costruzione della libreria specifica del filamento impoverito di ribosoma e il metodo di costruzione della libreria di screening di arricchimento di piccoli frammenti, che può ottenere la costruzione della libreria, il sequenziamento, l'analisi delle informazioni, l'analisi congiunta e il ceRNA, ecc. di RNA codificante e RNA non codificante, quindi in questo modo può ottenere l'intera informazione sui dati di trascrizione dell'RNA correlata a specifici processi biologici (come sviluppo, malattia, ecc.) in modo rapido, completo e accurato. Attraverso l'analisi dei dati, la ricerca sul meccanismo di regolazione biologica può essere estesa a un modello tridimensionale che combina "rete e multilivello", utile per interpretare in modo completo i fenomeni biologici.
Esistono due metodi per il sequenziamento dell'intero trascrittoma: LncRNA-Seq + Small RNA e LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, che consente di ottenere informazioni più complete sul CircRNA.
1. Sequenziamento dell'intero trascrittoma con due librerie: LncRNA-Seq + Small RNA
2.Sequenziamento dell'intero trascrittoma con tre librerie: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Soluzione di materia prima dell'intero trascrittoma
| Classificazione | Categoria animale | Categoria di piante | Categoria batterica e fungina | |||
| Tipo di campione | Tessuto/cellula animale | Cella | Sangue intero | Tessuto vegetale | Tessuto fungino | Batteri e funghi coltivati |
| Estrazione dell'RNA | Metodo delle sfere magnetiche: 18605/18607/18606; Metodo della colonna: 19221/19211; Metodo Trizol: 10606/19202 | Metodo delle perle magnetiche: 18600/18604; Metodo della colonna: 19231 | Metodo della colonna: 19241; Metodo Trizol: 19201 | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo della colonna: 19301 (i funghi devono aggiungere il lisozima) (10403) |
| Estrazione di miRNA | Metodo della colonna: 19331 | Metodo della colonna: 19331 | Metodo della colonna: 19332 | Metodo della colonna: 19331 | — | — |
| Costruzione della libreria miRNA | Da aspettarselo | |||||
| Rimozione dell'rRNA | RNasi Rimozione enzimatica H: 12257; Rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione di origine umana); Rimozione con metodo di perline magnetiche: 12266 (tipo universale mammifero)/12267 tipo universale aviario/12268 pollo domestico/12269 pesce zebra/12270 Drosophila/12275 ostrica/12278 planaria/12285 ape/12286 ragno dorato/12289 zecca/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNasi Rimozione enzimatica H: 12257; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione umana, adatta per patogeni) | RNasi Rimozione enzimatica H, inclusa la rimozione della globina: 12257 + 12806; RNasi H rimozione enzimatica della globina: 13572; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 + 12260 | RNasi Rimozione enzimatica H: 12254; Rimozione con metodo di perline magnetiche: 12262 angiosperme | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12271 tipo universale fungino | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12264 tipo universale batterico/12265 tipo universale procariotico |
| Costruzione della biblioteca | Kit di costruzione di librerie di RNA non premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12308 (compatibile con Illumina e MGI); Kit di costruzione di librerie di RNA premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12310 (compatibile con Illumina e MGI)/12340 (senza actinomicina D, dUTP)/12341 (senza actinomicina D, dTTP) | |||||
Ricerca LncRNA
Il Long non-coding RNA (LncRNA) è un tipo di RNA non codificante con una funzione regolatrice unica che ha attirato molta attenzione negli ultimi anni. La lunghezza del LncRNA è superiore a 200nt, non codifica proteine e la sua conservazione tra le specie è scarsa.Alcune delle sue strutture di sequenza sono simili all'mRNA (contenente coda di poliA e splicing alternativo), mentre altre non hanno queste caratteristiche. Al momento, la generazione e il meccanismo funzionale del LncRNA non sono ancora completamente compresi, tuttavia, Sono stati scoperti molti LncRNA con importanti funzioni biologiche (come l'insorgenza del cancro, il silenziamento del cromosoma X e la formazione di reti regolatrici complesse con altri fattori regolatori).
Percorso tecnico di sequenziamento LncRNA
Soluzione di materie prime per il sequenziamento di LncRNA
| Classificazione | Categoria animale | Pianta Categoria | Categoria batterica e fungina | |||
| Tipo di campione | Tessuto/cellula animale | Cella | Sangue intero | Tessuto vegetale | Tessuto fungino | Batteri e funghi coltivati |
| Estrazione dell'RNA | Metodo delle perle magnetiche: 18605/18607/18606; Metodo della colonna: 19221/19211; Metodo del trizolo: 10606/19202 | Metodo delle perle magnetiche: 18600/18604; Metodo della colonna: 19231 | Metodo colonna: 19241; Metodo Trizol: 19201 | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo della colonna: 19301 (i funghi devono aggiungere lywallzyme 10403) |
| Rimozione dell'rRNA | RNasi H rimozione enzimatica: 12257; Rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione di origine umana); Rimozione con metodo di perline magnetiche: 12266 (tipo universale mammifero)/12267 tipo universale aviario/12268 pollo domestico/12269 pesce zebra/12270 Drosophila/12275 ostrica/12278 planaria/12285 ape/12286 ragno dorato/12289 zecca/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNasi H rimozione enzimatica: 12257; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione umana, adatta per patogeni) | RNasi H rimozione enzimatica, compresa la rimozione della globina: 12257 + 12806; RNasi H rimozione enzimatica della globina: 13572; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 + 12260 | RNasi H rimozione enzimatica: 12254; Metodo di rimozione con perline magnetiche: 12262 angiosperme | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12271 tipo universale fungino | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12264 tipo universale batterico/12265 tipo universale procariotico |
| Costruzione della biblioteca | Kit di costruzione di librerie di RNA non premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12308 (compatibile con Illumina e MGI); Kit di costruzione di librerie di RNA premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12310 (compatibile con Illumina e MGI)/12340 (senza actinomicina D, dUTP) | |||||
Ricerca sul trascrittoma eucariotico
La ricerca sul trascrittoma eucariotico utilizza la tecnologia RNA-seq per ottenere l'mRNA totale che può essere trascritto da cellule specifiche in un determinato stato funzionale.Quindi, i dati grezzi scaricati vengono uniti e assemblati, viene contato il livello di espressione genica e vengono eseguite analisi differenziali e analisi di arricchimento funzionale. Non solo può ottenere la maggior parte delle informazioni geniche della specie, ma anche studiare la differenza di espressione genica e il cambiamento del percorso funzionale a livello generale e rivelare il meccanismo molecolare di specifici processi biologici.
Percorso tecnico del sequenziamento del trascrittoma eucariotico
Soluzione di materie prime per il sequenziamento del trascrittoma eucariotico
| Classificazione | Categoria animale | Categoria di piante | Categoria fungina | |||
| Tipo di campione | Tessuto/cellula animale | Cella | Sangue intero | Tessuto vegetale | Tessuto fungino | Funghi coltivati |
| Estrazione dell'RNA | Metodo delle perle magnetiche: 18605/18607/18606; Metodo della colonna: 19221/19211; Metodo del trizolo: 10606/19202 | Metodo delle perle magnetiche: 18600/18604; Metodo della colonna: 19231 | Metodo colonna: 19241; Metodo Trizol: 19201 | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo della colonna: 19301 (aggiungere lisozima 10403) |
| Cattura mRNA | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 | Kit master per l'isolamento di mRNA 12629 |
| Costruzione della biblioteca | Kit libreria RNA non premiscelata: 12308 Kit libreria RNA a doppia modalità (compatibile con Illumina e MGI) Kit libreria RNA non premiscelata con cattura mRNA: kit libreria RNA a doppia modalità 12309 (compatibile con Illumina e MGI) Kit libreria RNA premiscelata: kit libreria RNA a doppia modalità 12310 (compatibile con Illumina e MGI)/12340 (senza Actinomicina D, dUTP) | |||||
Ricerca circRNA
[Sequenziamento del circRNA - Ricerca su come l'espressione differenziale del circRNA influenza i processi biologici]
L'RNA circolare (circRNA) è un tipo speciale di analisi dell'RNA non codificante. Il sequenziamento viene eseguito utilizzando una piattaforma di sequenziamento per condurre un'identificazione e un'analisi accurate del circRNA dei geni sorgente per campioni con un genoma di riferimento. Il sequenziamento del circRNA è sempre più ampiamente utilizzato nei campi della ricerca medica e agricola. Sulla base del sequenziamento ad alto rendimento e affidandosi a database tradizionali e software di identificazione del circRNA, le informazioni sul circRNA delle specie del progetto vengono analizzate per esplorare in profondità le importanti funzioni del circRNA nella regolazione trascrizionale.
Soluzione di materie prime per la ricerca di circRNA
| Classificazione | Categoria animale | Categoria di piante | Categoria batterica e fungina | |||
| Tipo di campione | Tessuto/cellula animale | Cella | Sangue intero | Tessuto vegetale | Tessuto fungino | Batteri e funghi coltivati |
| Estrazione dell'RNA | Metodo delle perle magnetiche: 18605/18607/18606; Metodo della colonna: 19221/19211; Metodo del trizolo: 10606/19202 | Metodo delle perle magnetiche: 18600/18604; Metodo della colonna: 19231 | Metodo colonna: 19241; Metodo Trizol: 19201 | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo delle perle magnetiche: 18534/18535/18537; Metodo della colonna: 19291ES/19292ES | Metodo della colonna: 19301 (i funghi devono aggiungere lisozima 10403) |
| Rimozione dell'rRNA | RNasi H rimozione enzimatica: 12257; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione di origine umana); rimozione con metodo di perline magnetiche: 12266 (tipo universale mammifero)/12267 tipo universale aviario/12268 pollo domestico/12269 pesce zebra/12270 Drosophila/12275 ostrica/12278 planaria/12285 ape/12286 ragno dorato/12289 zecca/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNasi H rimozione enzimatica: 12257; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione umana, adatta per patogeni) | RNasi H rimozione enzimatica, compresa la rimozione della globina: 12257 + 12806; RNasi H rimozione enzimatica della globina: 13572; rimozione rapida in 3 minuti: 12258 + 12260 | RNasi H rimozione enzimatica: 12254; Metodo di rimozione con perline magnetiche: 12262 angiosperme | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12271 tipo universale fungino | Metodo di rimozione delle perle magnetiche: 12264 tipo universale batterico/12265 tipo universale procariotico |
| Digestione lineare dell'RNA | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare | 14606 RNasi R per rimuovere le molecole di RNA lineare |
| Costruzione della biblioteca | Kit di costruzione di librerie di RNA non premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12308 (compatibile con Illumina e MGI); Kit di costruzione di librerie di RNA premiscelate: kit di costruzione di librerie di RNA a doppia modalità 12310 (compatibile con Illumina e MGI)/12340 (senza actinomicina D, dUTP) | |||||
Metatrascrittoma
[Metatrascrittoma - Catturare i cambiamenti dinamici dei microrganismi attivi nel microambiente microecologico]
Sequenziamento del metatrascrittoma: studia le regole di trascrizione e regolazione di tutti i genomi in un ambiente specifico a livello complessivo.Prendendo come oggetto di ricerca tutto l'RNA presente nel microambiente microecologico, combina il sequenziamento ad alto rendimento per studiare i cambiamenti delle comunità microbiche complesse a livello trascrizionale ed estrarre i geni attivi che svolgono un ruolo.
Soluzione di materie prime per la ricerca sul metatrascrittoma
| Tipo di campione | Batteri e funghi coltivati | Campioni clinici |
| Estrazione dell'RNA | Metodo della colonna: 19301 (i funghi devono aggiungere lywallzyme 10403) | Metodo della colonna: 19321 (estrazione di DNA/RNA virale); Metodo delle biglie magnetiche: 18521 (estrazione di DNA/RNA virale); 18306 (estrazione di DNA/RNA patogeno) |
| Rimozione dell'rRNA | Rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione da fonte umana) | Rimozione rapida in 3 minuti: 12258 (rimozione da fonte umana) |
| Costruzione della biblioteca | Opzione 1. Costruzione della libreria di RNA totale: kit di costruzione della libreria di RNA a doppia modalità 12308ES (compatibile con Illumina e MGI); Opzione 2. Costruzione della libreria di digestione enzimatica di cDNA: modulo di sintesi di cDNA 13488ES + kit di costruzione della libreria di digestione enzimatica rapida 12316ES | Opzione 1. Costruzione della libreria di RNA totale: kit di costruzione della libreria di RNA a doppia modalità 12308ES (compatibile con Illumina e MGI); Opzione 2.Costruzione di librerie di digestione enzimatica di cDNA: modulo di sintesi di cDNA 13488ES + kit di costruzione di librerie di digestione enzimatica rapida 12316ES |
Raccomandazione del prodotto
| Nome del prodotto | Numero di catalogo | Specificazione |
| Hieff NGS TM Kit di preparazione della libreria RNA EvoMax (dUTP) | 12340ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di preparazione della libreria RNA EvoMax (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di preparazione della libreria RNA a doppia modalità Ultima (Illumina e MGI) | 12308ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di preparazione della libreria RNA a doppia modalità Ultima (versione premiscelata) | 12310ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit master di isolamento mRNA V2 | 12629ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di deplezione dell'rRNA umano MaxUp (rRNA e ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di deplezione dell'rRNA MaxUp (pianta) | 12254ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit per la rimozione dell'rRNA in un solo passaggio (umano, 100-1.000 ng) | 12258ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |
| Hieff NGSTM Kit di rimozione rRNA MagSP (batteri (G- e G+)) con perle di purificazione | 12264ES24/96 | 24 tonnellate/ 96 tonnellate |