1. Фон
рРНК составляет большую долю общей РНК в организмах, но она может предоставить мало эффективной информации. Эти РНК будут производить большое количество недействительных данных, что имеет мало значения для изучения получения биологической информации. Между тем, рРНК с высокой долей делает мРНК относительно обильной в транскриптах низкой, тем самым влияя на обнаружение транскриптов с низкой распространенностью. Поэтому в традиционном секвенировании РНК (RNA-SEQ) эффективное удаление рРНК имеет важное значение для достижения экономически эффективного секвенирования РНК.
2. Описание продукта
（1）Серия MaxUp, набор для истощения рРНК
Серия реагентов для удаления рРНК MaxUp основана на расщеплении РНКазой H для удаления рибосомальной РНК (рРНК) из общей РНК образца для сохранения матричной РНК (мРНК) и других некодирующих РНК. Типы образцов богаты, начальное количество широкое, весь процесс занимает менее 2 часов, а время ручной операции составляет менее 10 минут. В то же время рРНК может быть эффективно удалена как из обычных образцов, так и из образцов низкого качества (таких как FFPE), что значительно улучшает эффективную информацию данных при секвенировании данных и реализует экономически эффективное секвенирование образцов РНК.
（2）Процессы удаления рРНК серии MaxUp
В настоящее время устранение РНКазы является основным методом удаления рРНК, особенно для некоторых образцов деградации РНК (например, образцов FFPE), устранение РНКазы может показать свои преимущества.
Рисунок 1. Принципиальная схема принципа удаления рРНК серии MaxUp
3. Отображение производительности продукта
（1）Образцы растений
RNase H использовался для переваривания и удаления рибосомальной РНК из общей РНК из растений, а qPCR использовался для сравнения изменений экспрессии гена рРНК и гена мРНК до и после удаления. Результаты показали, что этот продукт может эффективно удалять рРНК из растений.
РИС. 2. 1 мкг РНК листьев Arabidopsis использовался для удаления рРНК, а кПЦР применялась для сравнения изменений экспрессии гена рРНК и гена мРНК до и после удаления.
（2）Образец человека/крысы/мыши
РНКаза H использовалась для переваривания и удаления рибосомальной РНК из общей РНК из растений, создания библиотеки и отправки секвенирования. Анализ данных показал, что этот продукт может эффективно удалять рРНК из таких образцов.
Рисунок 3. В качестве образцов было взято 1 мкг общей РНК человека, мыши и крысы, а остатки рРНК были проанализированы путем секвенирования после удаления рРНК.
（3）Образцы РНК низкого качества (например, РНК FFPE)
Образцы низкого качества, как правило, имеют большую долю последовательностей ITS/ETS (см. FFPE RNA: DV200=20% на следующем рисунке), и эта часть последовательностей также будет производить большое количество недействительных данных, поэтому путем добавления зондов ITS/ETS в образцы низкого качества целевые последовательности могут быть дополнительно эффективно обогащены. В дополнение к зонду для обычной 45S Pre-rRNA, в этот продукт также добавлена конструкция зонда для области ITS/ETS человека 45S, что гарантирует, что удаление рРНК в образцах низкого качества может быть более эффективным, не влияя на эффект удаления рРНК в обычных образцах.
Рисунок 4.Сравнение остатков рРНК и остатков ITS/ETS до и после добавления зондов ITS/ETS
4. Информация о заказе
| Тда | Пназвание продукта | Код продукта | Технические характеристики продукта |
| удаление рРНК набор | Хайфф NGSТМ Набор для истощения человеческой рРНК MaxUp (рРНК и ITS/ETS) | 12257ES08/24/96 | 24.08.96Т |
| 12254ES08/24/96 | 8/24Т/96Т |