1 Verkningsprincipen för genetikomycin

Genetomycin (Geneticin, G418) är ett aminoglykosidantibiotikum som hämmar proteinsyntesen genom att blockera peptidkedjeförlängningen genom att binda till 70S och 80S ribosomerna i prokaryota och eukaryota celler. Denna mekanism är giftig för de inklusive bakterier, jäst, växter och däggdjursceller. När cellerna framgångsrikt transfekterades och integrerades med en neomycinresistensgen (såsom neo-genen), kunde det genkodade aminoglykosidfosfotransferaset (APH (3) II) kovalent modifiera G418 för att inaktivera det, och därigenom ge resistens mot celler odlade i selektivt medium innehållande G418.

I molekylärgenetiska tester är G418 en av de som ofta används för stabil transfektion.

2 Appliceringen av geneomycin

2.1 Screening av stabila transfekterade cellinjer

  • G418 användes för att screena efter celler som innehöll resistensgener (t.ex. neo-gener) genom att hämma proteinsyntes. Aminoglykosidfosfotransferaset som kodas av resistensgenen inaktiverar G418, vilket ger cellresistens till G418. Typiskt är screeningintervallet för däggdjursceller 200 – 2000 μg/mL, med den vanligaste arbetskoncentrationen på 100 – 700 μg/ml. Där växtceller är 10-100 μg/mL och jästceller är 500-1000 μg/ml, är följande koncentrationer som används för vissa celltyper med G418 som referens.

Cell

Ansökan

Aktiveringskoncentration av geneomycin (μg/mL)

Anförda verk

Mucor arter

a) Odlad i tillväxtmedium

b) Odlade på lyofiliserade bakterier

a) 10 μg/ml
b) 30 μg/ml

Hirth, et. al., Proc. Natl. Acad. Sci., v. 79, 7356-7360 (1982).

Däggdjurs

a) För screening

b) För att upprätthålla tillväxten

a) 400 -1000 μg/ml
b) 200 μg/ml

Canaani och Berg, Proc. Natl. Acad. Sci., v. 79, 5166-5170 (1982).

Plantera

a) För screening

b) För att upprätthålla tillväxten

a) 25-50 μg/ml
b) 10 μg/ml

Ursic, et. al., Biochem. Biophys. Res. Komm., v. 101:3, 1031-1037 (1981).

Jäst

a) För screening

b) För att upprätthålla tillväxten

a) 500 μg/ml

b) 125-200 μg/mL

Jimenez och Davies, Natur, v. 287, 869-871 (1980).

Bakterier

För screening

16 μg/ml

Waitz, et. al., Antimikrob. Agenter Chemother., v. 6:5, 579-581 (1974).

2.2 Genknockout och genöverföring

  • I gen knockout kan G418 användas för att screena celler som framgångsrikt knockout målgenen. Vid genöverföring underlättar G418 integreringen av främmande gener i genomet av värdceller.

2.3 Resistensval i cellkultur

  • Under cellodling används G418 för att screena efter celler som är resistenta mot antibiotikan, som ofta bär specifika resistensgener.

3 Relevanta experimentella förfaranden för geneomycin

3.1 Beredning av G418 stamlösning (50 mg/ml, aktiv koncentration)

1) Konvertering av aktivitetsenheter

Konvertera med formeln: (1000/A0) × A1 = A2, där A0 är styrkan för G418, som varierar med batch. Se kvalitetskontrollrapporten för motsvarande batch eller etiketten på flaskan. Al är den önskade aktiva koncentrationen av G418 som ska framställas. A2 är den faktiska koncentrationen av pulver till volym som ska vägas.

Till exempel, om satsen av G418 har en styrka på 750 U/mg och du vill förbereda en aktiv koncentration på 50 mg/mL, då är den faktiska pulverkoncentrationen som ska förberedas 1000/750 × 50 mg/mL = 66,67 mg/ml.

Om man bereder 10 ml G418 stamlösning (aktiv koncentration, 50 mg/ml), krävs 666,7 mg pulver.

  • Sterilisering och förvaring

Baserat på den faktiska pulvervikten som erhållits från ovanstående omvandling, tillsätt det till 10 ml sterilt avjoniserat vatten för att helt lösas upp.

Förvätt först ett 0,22 μm sprutfilter med 5 mL sterilt avjoniserat vatten, ta bort allt vatten. Filtrera sedan med hjälp av detta filter för att sterilisera och alikvotera i små volymer för engångsbruk (t.ex. 1 mL) och förvara vid -20°C under 1 års stabilitet.

3.2 Etablering av Kill Curve

1) Dag ett: Platta otransformerade celler vid 20-25 % celldensitet i lämpliga odlingsplattor och inkubera över natten vid 37°C, CO2.

2) Ställ in en koncentrationsgradient inom ett lämpligt intervall baserat på celltyp, välj minst 6 koncentrationer (G418 är mest aktiv mot celler i delningsfasen, så cellerna bör odlas under en period innan G418 tillsätts), till exempel för däggdjursceller, ställ in 0, 50, 100, 200, 400, 1000 μg/mL.

3) Dag två: Ta bort gammalt odlingsmedium och ersätt med nyberedd medium innehållande motsvarande koncentration av läkemedlet, med tre replikat för varje koncentration.

4) Byt ut med färskt läkemedelsinnehållande medium var 3-4 dag.

5) Utför levande cellräkningar med fasta intervall (t.ex. varannan dag) för att bestämma lämplig koncentration som förhindrar tillväxten av otransfekterade celler. Välj den lägsta koncentrationen som kan döda majoriteten av celler inom det ideala antalet dagar (vanligtvis 7-10 dagar) som arbetskoncentration för stabil transfekterad cellinjescreening.

3.3 Screening av stabila transfekterade celler

  • G418 Geneticin (60220ES) som tillhandahålls av Yisheng Biotech har en effekt på ≥720 U/mg, en renhet på ~98%, och batchstabilitet, med ett pris på nästan en tredjedel av andra företags G418-produkter.
  • Screeningsmediet innehållande läkemedlen ersattes var 3-4 dag.
  • Bildandet av cellkloner (kolonier) observerades och bedömdes efter 7 dagars selektion. Kolonier kan ta en vecka eller mer att bilda, beroende på värdcellstyp, transfektion och screeningseffektivitet.
  • 5-10 resistenta kloner plockades och överfördes till 35 mm cellodlingsplattor och hölls vidare med läkemedelsinnehållande screeningmedium i 7 dagar.
  • Efter att ha ändrat den normala mediumkulturen.

4 Produktrekommendation

G418 Geneticin (60220ES) tillhandahållen av Yeasen Biotech har en effekt på ≥720 U/mg, en renhet på ~98% och batchstabilitet, med ett pris på nästan en tredjedel av andra företags G418-produkter.

Specifikation

S*

T*

Yeasen

Yeasen fördel

Innehåll (HPLC)

/

/

~98 %

Hög renhet

Styrka (U/mg)

≥720 µg/mg

707-721 ug/mg

≥720 µg/mg

Hög effektivitet

Pris ($/5 g)

~1000

~1000

~200

Billighet

5 Experimentellt fall

I E. coli var G69 och G99 två olika batcher; koncentrationerna av genomycin var 8 mg/L, 12 mg/L respektive 16 mg/L, och den effektiva minimikoncentrationen var 16 mg/L, vilket helt hämmade tillväxten av diverse bakterier.

Figur 1 Stabilitetstest och validering av effektiva koncentrationer av genomicin mellan olika batcher

6 Försiktighetsåtgärder

  • G418 ska inte användas tillsammans med andra antibiotika/svampmedel (t.ex. penicillin/streptomycin) eftersom de är kompetitiva hämmare av G418. Andra antibiotika kan också producera korsaktivitet.
  • Vid beredning av G418-lösning måste den omvandlas enligt det olika vitalitetsvärdet (styrkan) för G418-satsen, för att erhålla lagringsvätskan och arbetsvätskan som kräver aktiv koncentration.
  • Det är möjligt att otransfekterade celler kompletterade med G418 i odlingssystemet inte kommer att dödas på grund av att läkemedelskoncentrationen är för låg eller för tät. Alternativt är det mer sannolikt att snabbt delande celler dödas i förhållande till långsamt prolifererande celler. Kontrollceller (ej transfekterade) får inte dödas efter 5-7 dagars tillsats av antibiotika, och kloner av transfekterade celler (resistenta kloner) kräver 10-14 dagar för att bildas.
  • Även med dödande dosen av G418 kan cellerna fortsätta att dela sig 2-3 gånger. Effekten av G418 blir vanligtvis uppenbar efter 2 dagar.

7 Publicerade artiklar med våra reagenser

[1] Liu S, Zhang X, Yao X, Wang G, Huang S, Chen P, Tang M, Cai J, Wu Z, Zhang Y, Xu R, Liu K, He K, Wang Y, Jiang L, Wang QA, Rui L, Liu J, Liu Y. Mammalian IRE1α smälter samman dynamiskt och funktionellt med stressgranuler. Nat Cell Biol. 2024 Jun;26(6):917-931. doi: 10.1038/s41556-024-01418-7. (IF:21,3)

[2] Tan K, Mo J, Li M, Dong Y, Han Y, Sun X, Ma Y, Zhu K, Wu W, Lu L, Liu J, Zhao K, Zhang L, Tang Y, Lv Z. SMAD9-MYCN positiv återkopplingsslinga representerar ett unikt beroende för MYCN-förstärkt neuroblastom. J Exp Clin Cancer Res. 2022 Dec 20;41(1):352. doi: 10.1186/s13046-022-02563-3.(IF:11.3)

8 Relaterade produkter

Produktnamn

Katt#

Specifikation

Ciprofloxacinhydroklorid

60201ES05/25/60

5/25/100g

Ampicillin, natriumsalt

60203ES10/60

10/100g

Doxycyklinhyklat

60204ES03/08/25

1/5/25 g

Kloramfenikol, USP-klass

60205ES08/25/60

5/25/100g

Kanamycinsulfat

60206ES10/60

10/100g

Tetracyklin HCl Tetracyklinhydroklorid (USP)

60212ES25/60

25/100g

Vankomycinhydroklorid

60213ES60/80/90

100mg/1g/5g

Gentamycinsulfatsalt

60214ES03/08/25

1/5/25 g

Spectinomycinhydroklorid

60215ES08

5g

Fleomycin (20 mg/ml i lösning)

60217ES20/60

20/5×20mg

Blasticidin S (Blasticidin)

60218ES10/60

10/10×10mg

Nystatin

60219ES08

5g

G418 Sulfate (geneticin)

60220ES03/08

1/5 g

Puromycin (lösning 10 mg/ml)

60209ES10/50/60/76

1 x 1 / 5 x 1 / 1 0 x 1 / 50 x 1 ml

Puromycin dihydroklorid

60210ES25/60/72/76/80

25/100/250/500 mg / 1 g

Hygromycin B (50 mg/ml)

60224ES03

1 g (20 mL)/10 × 1 g (20 mL)

Hygromycin B

60225ES03/10

1/10 g

Erytromycin

60228ES08/25

5/25 g

Timentin

60230ES07/32

3,2/10×3.2g

Aureobasidin A (AbA)

60231ES03/08/10

1/5×1/10×1 mg

Polymyxin B-sulfat

60242ES03/10

1/10MU

Förfrågan