Hela transkriptomforskningen
[Hel transkriptomsekvensering - forskning om målinriktad reglering och interaktionsrelation mellan icke-kodande RNA och mRNA]
Sekvensering av hela transkriptomer med hög genomströmning använder den ribosomutarmade strängspecifika bibliotekskonstruktionsmetoden och konstruktionsmetoden för bibliotekskonstruktion för anrikning av små fragment, som kan uppnå bibliotekskonstruktion, sekvensering, informationsanalys, gemensam analys och ceRNA, etc. av kodande RNA och icke-kodande RNA, så på det sättet kan det få hela RNA-transkriptionsinformationen relaterad till specifika biologiska processer (såsom utveckling, sjukdom, etc.) snabbt, heltäckande och exakt. Genom dataanalys kan forskningen om biologisk regleringsmekanism utvidgas till en tredimensionell modell som kombinerar "nätverk och multi-level", vilket är till hjälp för att heltäckande tolka biologiska fenomen.
Det finns två sätt för hel transkriptomsekvensering, ett är LncRNA-Seq + Small RNA, och det andra är LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, som kan få mer omfattande information om CircRNA.
1. Hel transkriptomsekvensering med två bibliotek: LncRNA-Seq + Small RNA
2.Hel transkriptomsekvensering med tre bibliotek: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Hela transkriptom Råmateriallösning
| Klassificering | Djurkategori | Växtkategori | Bakterie- och svampkategori | |||
| Provtyp | Animalisk vävnad/cell | Cell | Helblod | Växtvävnad | Svampvävnad | Odlade bakterier och svampar |
| RNA-extraktion | Magnetiska pärlor metod: 18605/18607/18606; Kolumnmetod: 19221/19211; Trizolmetod: 10606/19202 | Magnetiska pärlor metod: 18600/18604; Kolumnmetod: 19231 | Kolumnmetod: 19241; Trizolmetoden: 19201 | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Kolumnmetod: 19301 (svampar måste tillsätta lysozym 10403) |
| miRNA-extraktion | Kolumnmetod: 19331 | Kolumnmetod: 19331 | Kolumnmetod: 19332 | Kolumnmetod: 19331 | — | — |
| miRNA bibliotekskonstruktion | Att förvänta sig | |||||
| rRNA-borttagning | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (borttagning av mänsklig källa); Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12266 (universell däggdjurstyp)/12267 universell aviär typ/12268 tamkyckling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 ostron/12278 planarian/12285web bee/12285 spindelbi/9228 fästing/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (mänskligt avlägsnande, lämpligt för patogen) | RNase H enzymatisk borttagning, inklusive borttagning av globin: 12257 + 12806; RNase H enzymatiskt avlägsnande av globin: 13572; 3-minuters snabb borttagning: 12258 + 12260 | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12254; Borttagning av magnetiska pärlor: 12262 angiosperm | Magnetiska pärlor metod borttagning: 12271 svamp universal typ | Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12264 bakteriell universaltyp/12265 prokaryot universaltyp |
| Byggande av bibliotek | Icke-förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12308 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI); Förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12310 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI)/12340 (utan actinomycin D, dUTP)/12341 (utan actinomycin D, dTTP) | |||||
LncRNA-forskning
Långt icke-kodande RNA (LncRNA) är ett slags icke-kodande RNA med unik regulatorisk funktion som rönt stor uppmärksamhet de senaste åren. LncRNA:s längd är mer än 200nt, det kodar inte för proteiner och dess bevarande bland arter är dåligt.Vissa av dess sekvensstrukturer liknar mRNA (innehåller polyA-svans och alternativ splitsning), medan andra inte har dessa egenskaper. För närvarande är genereringen och funktionsmekanismen för LncRNA ännu inte helt klarlagda, dock, många LncRNA med viktiga biologiska funktioner (såsom cancerförekomst, tystnad av X-kromosomer och bildandet av komplexa regulatoriska nätverk med andra regulatoriska faktorer) har upptäckts.
Teknisk väg för LncRNA-sekvensering
LncRNA-sekvenseringsråmateriallösning
| Klassificering | Djurkategori | Plantera Kategori | Bakterie- och svampkategori | |||
| Provtyp | Animalisk vävnad/cell | Cell | Helblod | Växtvävnad | Svampvävnad | Odlade bakterier och svampar |
| RNA-extraktion | Magnetiska pärlor metod: 18605/18607/18606; Kolumnmetod: 19221/19211; Trizolmetod: 10606/19202 | Magnetiska pärlor metod: 18600/18604; Kolumnmetod: 19231 | Kolumnmetod: 19241; Trizolmetoden: 19201 | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Kolumnmetod: 19301 (svampar måste lägga till lywallzyme 10403) |
| rRNA-borttagning | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (borttagning av mänsklig källa); Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12266 (universell däggdjurstyp)/12267 universell aviär typ/12268 tamkyckling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 ostron/12278 planarian/12285web bee/12285 spindelbi/9228 fästing/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (mänskligt avlägsnande, lämpligt för patogen) | RNase H enzymatisk borttagning, inklusive borttagning av globin: 12257 + 12806; RNase H enzymatiskt avlägsnande av globin: 13572; 3-minuters snabb borttagning: 12258 + 12260 | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12254; Borttagning av magnetiska pärlor: 12262 angiosperm | Magnetiska pärlor metod borttagning: 12271 svamp universal typ | Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12264 bakteriell universaltyp/12265 prokaryot universaltyp |
| Byggande av bibliotek | Icke-förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12308 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI); Förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12310 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI)/12340 (utan aktinomycin D, dUTP) | |||||
Eukaryot transkriptomforskning
Eukaryotisk transkriptomforskning använder RNA-seq-teknologi för att erhålla det totala mRNA som kan transkriberas av specifika celler i ett visst funktionellt tillstånd.Därefter splitsas och sätts de nedladdade rådatana, genuttrycksnivån räknas och differentialanalys och funktionell anrikningsanalys utförs. Den kan inte bara få fram det mesta av artens geninformation, utan också studera skillnaden i genuttryck och funktionsvägsförändring på övergripande nivå, och avslöja den molekylära mekanismen för specifika biologiska processer.
Teknisk väg för eukaryot transkriptomsekvensering
Eukaryot transkriptomsekvensering av råmateriallösning
| Klassificering | Djurkategori | Växtkategori | Svampkategori | |||
| Provtyp | Animalisk vävnad/cell | Cell | Helblod | Växtvävnad | Svampvävnad | Odlade svampar |
| RNA-extraktion | Magnetiska pärlor metod: 18605/18607/18606; Kolumnmetod: 19221/19211; Trizolmetod: 10606/19202 | Magnetiska pärlor metod: 18600/18604; Kolumnmetod: 19231 | Kolumnmetod: 19241; Trizolmetoden: 19201 | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Kolumnmetod: 19301 (lägg till lysozym 10403) |
| mRNA-infångning | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit |
| Byggande av bibliotek | Icke-förblandat RNA Library Kit: 12308 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina och MGI-kompatibel) Icke-förblandat RNA-bibliotekskit med mRNA-infångning: 12309 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina- och MGI-kompatibel) Premixed RNA Library Kit: 12310 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina och MGI-kompatibel)/12340 (utan Actinomycin D, dUTP) | |||||
circRNA forskning
[circRNA Sequencing - Forskning om hur det differentiella uttrycket av circRNA påverkar biologiska processer]
Cirkulärt RNA (circRNA) är en speciell typ av icke-kodande RNA-analys. Sekvensering utförs med hjälp av en sekvenseringsplattform för att utföra exakt circRNA-identifiering och analys av källgenerna för prover med ett referensgenom. circRNA-sekvensering används i allt större utsträckning inom medicinska och jordbruksforskningsområden. Baserat på sekvensering med hög genomströmning och beroende på vanliga databaser och circRNA-identifieringsprogramvara, analyseras circRNA-informationen för projektarten för att djupt utforska de viktiga funktionerna hos circRNA i transkriptionell reglering.
circRNA Research Raw Material Solution
| Klassificering | Djurkategori | Växtkategori | Bakterie- och svampkategori | |||
| Provtyp | Animalisk vävnad/cell | Cell | Helblod | Växtvävnad | Svampvävnad | Odlade bakterier och svampar |
| RNA-extraktion | Magnetiska pärlor metod: 18605/18607/18606; Kolumnmetod: 19221/19211; Trizolmetod: 10606/19202 | Magnetiska pärlor metod: 18600/18604; Kolumnmetod: 19231 | Kolumnmetod: 19241; Trizolmetoden: 19201 | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Magnetiska pärlor metod: 18534/18535/18537; Kolumnmetod: 19291ES/19292ES | Kolumnmetod: 19301 (svampar måste lägga till lysozym 10403) |
| rRNA-borttagning | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (borttagning av mänsklig källa); Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12266 (universell däggdjurstyp)/12267 universell aviär typ/12268 tamkyckling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 ostron/12278 planarian/12285web bee/12285 spindelbi/9228 fästing/12290 Aedes albopictus/12287 nematod | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12257; 3-minuters snabbt avlägsnande: 12258 (mänskligt avlägsnande, lämpligt för patogen) | RNase H enzymatisk borttagning, inklusive borttagning av globin: 12257 + 12806; RNase H enzymatiskt avlägsnande av globin: 13572; 3-minuters snabb borttagning: 12258 + 12260 | RNase H enzymatiskt avlägsnande: 12254; Borttagning av magnetiska pärlor: 12262 angiosperm | Magnetiska pärlor metod borttagning: 12271 svamp universal typ | Avlägsnande av magnetiska pärlor: 12264 bakteriell universaltyp/12265 prokaryot universaltyp |
| Linjär RNA-digestion | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler | 14606 RNase R för att avlägsna linjära RNA-molekyler |
| Byggande av bibliotek | Icke-förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12308 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI); Förblandat RNA-biblioteksbyggsats: 12310 dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI)/12340 (utan aktinomycin D, dUTP) | |||||
Metatranskriptom
[Metatranskriptom - fånga de dynamiska förändringarna av aktiva mikroorganismer i den mikroekologiska mikromiljön]
Metatranskriptomsekvensering: studerar transkriptions- och regleringsreglerna för alla genom i en specifik miljö på övergripande nivå.Genom att ta allt RNA i den mikroekologiska mikromiljön som forskningsobjekt, kombinerar den sekvensering med hög genomströmning för att studera förändringar av komplexa mikrobiella samhällen på transkriptionsnivå och bryta de aktiva gener som spelar en roll.
Metatranskriptomforskning Råmateriallösning
| Provtyp | Odlade bakterier och svampar | Kliniska prover |
| RNA-extraktion | Kolumnmetod: 19301 (svampar måste lägga till lywallzyme 10403) | Kolumnmetod: 19321 (viral DNA/RNA-extraktion); Magnetiska pärlor metod: 18521 (viral DNA/RNA-extraktion); 18306 (patogen DNA/RNA-extraktion) |
| rRNA-borttagning | 3-minuters snabb borttagning: 12258 (borttagning av mänsklig källa) | 3-minuters snabb borttagning: 12258 (borttagning av mänsklig källa) |
| Byggande av bibliotek | Alternativ 1. Total RNA-bibliotekskonstruktion: 12308ES dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI); Alternativ 2. Konstruktion av cDNA-bibliotek för enzymatisk digestion: 13488ES cDNA-syntesmodul + 12316ES konstruktionssats för bibliotek för snabb enzymatisk digestion | Alternativ 1. Total RNA-bibliotekskonstruktion: 12308ES dual-mode RNA-biblioteksbyggsats (kompatibel med Illumina och MGI); Alternativ 2.cDNA enzymatisk digestion bibliotek konstruktion: 13488ES cDNA syntes modul + 12316ES snabb enzym digestion bibliotek byggsats |
Produktrekommendation
| Produktnamn | Katalognummer | Specifikation |
| Hieff NGS TM EvoMax RNA Library Prep Kit（dUTP） | 12340ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM EvoMax RNA Library Prep Kit (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit (Illumina och MGI) | 12308ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit (förblandad version) | 12310ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM mRNA Isolation Master Kit V2 | 12629ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MaxUp rRNA-utarmningskit (växt) | 12254ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Enstegs rRNA-borttagningskit (mänsklig, 100-1 000 ng) | 12258ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MagSP rRNA-borttagningskit (bakterier (G- och G+)) med reningskulor | 12264ES24/96 | 24 T/ 96 T |