全转录组研究

【全转录组测序-非编码RNA与mRNA的靶向调控及相互作用关系研究】

全转录组高通量测序采用核糖体耗尽的链特异性文库构建方法和小片段富集筛选文库构建方法,可实现编码RNA和非编码RNA的文库构建、测序、信息分析、联合分析及ceRNA等,因此 这样就可以 获得 快速、全面、准确地获取特定生物过程(如发育、疾病等)相关的全RNA转录本数据信息,通过数据分析可将生物调控机制研究拓展至“网络化、多层次”相结合的三维模型,有助于全面解释生物现象。

全转录组测序有两种方式,一种是LncRNA-Seq+Small RNA,另一种是LncRNA-Seq+Small RNA+CircRNA,可以获得更全面的CircRNA信息。

1.全转录组测序,包含两个文库:LncRNA-Seq + Small RNA

2.使用三个文库进行全转录组测序:LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA

全转录组原材料解决方案

分类

动物类别

植物类别

细菌和真菌类别

样品类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211;

Trizol 方法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;柱法:19231

柱法:19241;

Trizol方法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶菌酶 10403)

miRNA提取

列方法:19331

列方法:19331

列方法:19332

列方法:19331

miRNA文库构建

值得期待

rRNA去除

核糖核酸酶 H酶法去除:12257;3分钟快速去除:12258(人源去除);磁珠法去除:12266(哺乳类通用型)/12267禽类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇/12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286金丝桃网蜘蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

核糖核酸酶 H酶去除:12257;3分钟快速去除:12258(人体去除,适用于病原体)

核糖核酸酶 H 酶法去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶 H 酶法去除珠蛋白:13572;3分钟快速去除:12258+12260

核糖核酸酶 H酶法去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核通用型

图书馆建设

非预混RNA文库构建试剂盒:12308双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina、MGI);

预混合RNA文库构建试剂盒:12310双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D、dUTP)/12341(不含放线菌素D、dTTP)

LncRNA研究

长链非编码RNA(LncRNA)是近年来受到广泛关注的一类具有独特调控功能的非编码RNA,其长度超过200nt,不编码蛋白质,物种间保守性较差。其序列结构有些与mRNA相似(含有polyA尾巴和可变剪接),有些则不具备这些特征。目前LncRNA的产生和功能机制尚不完全清楚,但 许多具有重要生物学功能(如癌症发生、X染色体沉默以及与其他调控因子形成复杂的调控网络)的LncRNA被发现。

LncRNA测序技术路线

LncRNA测序原材料解决方案

分类

动物类别

植物

类别

细菌和真菌类别

样品类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211;Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;柱法:19231

柱法:19241;Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶壁酶10403)

rRNA去除

核糖核酸酶H 酶去除:12257; 3分钟快速去除:12258(人源去除);磁珠法去除:12266(哺乳类通用型)/12267鸟类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇/12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286金丝桃网蜘蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

核糖核酸酶H 酶法去除:12257;3分钟快速去除:12258(人体去除,适用于病原体)

核糖核酸酶H 酶法去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶 H 酶法去除珠蛋白:13572;3分钟快速去除:12258+12260

核糖核酸酶H 酶法去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核通用型

图书馆建设

非预混RNA文库构建试剂盒:12308双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina、MGI);

预混合RNA文库构建试剂盒:12310双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D、dUTP)

真核转录组研究

真核转录组研究利用RNA-seq技术获取特定细胞在某一功能状态下可转录的总mRNA。然后将下载的原始数据进行拼接组装,统计基因表达水平,并进行差异分析和功能富集分析,不仅可以获得物种大部分的基因信息,还可以在整体水平上研究基因表达差异、功能通路变化,揭示特定生物过程的分子机制。

真核生物转录组测序技术路线

真核转录组测序原材料解决方案

分类

动物类别

植物类别

真菌种类

样品类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211;Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;柱法:19231

柱法:19241;Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(添加溶菌酶10403)

mRNA捕获

12629 mRNA 分离主试剂盒

12629 mRNA 分离主试剂盒

12629 mRNA 分离主试剂盒

12629 mRNA 分离主试剂盒

12629 mRNA 分离主试剂盒

12629 mRNA 分离主试剂盒

图书馆建设

非预混 RNA 文库试剂盒: 12308 双模式 RNA 文库试剂盒(兼容 Illumina 和 MGI)

带 mRNA 捕获的非预混 RNA 文库试剂盒:12309 双模式 RNA 文库试剂盒(兼容 Illumina 和 MGI)

预混合RNA文库试剂盒:12310双模式RNA文库试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D、dUTP)

circRNA 研究

【circRNA测序-研究circRNA的差异表达如何影响生物过程】

环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,利用测序平台进行测序,针对有参考基因组的样本进行准确的环状RNA鉴定和源基因分析。环状RNA测序在医学、农业研究领域应用越来越广泛。基于高通量测序,依托主流数据库和环状RNA鉴定软件,对项目物种的环状RNA信息进行分析,深入探究环状RNA在转录调控中的重要作用。

circRNA研究原料解决方案

分类

动物类别

植物类别

细菌和真菌类别

样品类型

动物组织/细胞

细胞

全血

植物组织

真菌组织

培养细菌和真菌

RNA提取

磁珠法:18605/18607/18606;柱法:19221/19211;Trizol法:10606/19202

磁珠法:18600/18604;柱法:19231

柱法:19241;Trizol法:19201

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

磁珠法:18534/18535/18537;柱法:19291ES/19292ES

柱法:19301(真菌需加溶菌酶10403)

rRNA去除

核糖核酸酶H 酶法去除:12257;3分钟快速去除:12258(人源去除);磁珠法去除:12266(哺乳类通用型)/12267禽类通用型/12268家鸡/12269斑马鱼/12270果蝇/12275牡蛎/12278涡虫/12285蜜蜂/12286金丝桃网蜘蛛/12289蜱虫/12290白纹伊蚊/12287线虫

核糖核酸酶H 酶法去除:12257;3分钟快速去除:12258(人体去除,适用于病原体)

核糖核酸酶H 酶法去除,包括珠蛋白去除:12257 + 12806;核糖核酸酶 H 酶法去除珠蛋白:13572;3分钟快速去除:12258+12260

核糖核酸酶H 酶法去除:12254;磁珠法去除:12262被子植物

磁珠法去除:12271真菌通用型

磁珠法去除:12264细菌通用型/12265原核通用型

线性 RNA 消化

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

14606 RNase R 去除线性 RNA 分子

图书馆建设

非预混RNA文库构建试剂盒:12308双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina、MGI);

预混合RNA文库构建试剂盒:12310双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina和MGI)/12340(不含放线菌素D、dUTP)

宏转录组

【宏转录组——捕捉微生态微环境中活性微生物的动态变化】

宏转录组测序:在整体水平上研究特定环境下全部基因组的转录调控规律。以微生态微环境中所有RNA为研究对象,结合高通量测序,在转录水平上研究复杂微生物群落的变化,挖掘发挥作用的活性基因。

宏转录组研究原材料解决方案

样品类型

培养细菌和真菌

临床样本

RNA提取

柱法:19301(真菌需加溶壁酶10403)

柱法:19321(病毒DNA/RNA提取);磁珠法:18521(病毒DNA/RNA提取);18306(病原体DNA/RNA提取)

rRNA去除

3分钟快速清除:12258(人源清除)

3分钟快速清除:12258(人源清除)

图书馆建设

方案1.总RNA文库构建:12308ES双模RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina和MGI);方案2.cDNA酶切文库构建:13488ES cDNA合成模块+12316ES快速酶切文库构建试剂盒

选项1.总RNA文库构建:12308ES双模式RNA文库构建试剂盒(兼容Illumina和MGI);选项2.cDNA酶切文库构建:13488ES cDNA合成模块+12316ES快速酶切文库构建试剂盒

产品推荐

产品名称

目录编号

规格

希夫NGS 商标 EvoMax RNA文库制备试剂盒(dUTP)

12340ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 EvoMax RNA 文库制备试剂盒 (dNTP)

12341ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 Ultima 双模式RNA文库制备试剂盒(Illumina和MGI)

12308ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 Ultima 双模式 RNA 文库制备试剂盒(预混版)

12310ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 mRNA 分离主试剂盒 V2

12629ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 MaxUp 人类 rRNA 耗竭试剂盒 (rRNA 和 ITS/ETS)

12257ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 MaxUp rRNA 耗竭试剂盒(植物)

12254ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 一步式 rRNA 去除试剂盒(人,100-1,000 ng)

12258ES24/96

24吨/ 96吨

希夫NGS商标 MagSP rRNA 去除试剂盒(细菌(G- 和 G+))带纯化珠

12264ES24/96

24吨/ 96吨

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