Qubit,多么强大的NGS文库定量工具啊!

NGS文库定量的本质是核酸(DNA或RNA)的定量,准确的NGS文库定量分析对于获得高质量的测序数据至关重要。如果NGS文库定量浓度较高,可能因聚类不充分而导致测序数据产量较低,而定量浓度较低则可能造成簇间信号干扰而产生低质量数据,甚至导致测序失败。另外,随着测序仪测序通量的增加,往往会将多个NGS文库联合进行测序,根据测序数据大小的要求,在定量结果的基础上混合相应摩尔量的NGS文库,以稳定每个样本数据大小的输出。因此,准确的NGS文库定量对于文库的定量至关重要。

目前NGS文库定量主要有两种方法,紫外吸收法、荧光染料法。NanoDrop是基于紫外吸收原理设计的DNA定量仪;Qubit是根据荧光染料原理开发的DNA定量仪。这两种方法定量精度和成本都不一样。这里主要推荐Qubit法。那么我们为什么要向大家推荐Qubit呢?Qubit提供的产品有什么特点呢? Yeasen?请继续阅读...

1.我们为什么向您推荐Qubit?

2. Qubit 提供的产品有哪些特点 Yeasen

  • Qubit 如何工作?
  • 热门产品由 Yeasen
  • 产品特性

3. 针对不同的样本,如何选择Qubit?

1.我们为什么向您推荐Qubit?

毫无疑问,Qubit 优于 Nanodrop。那么为什么 qubit 优于 nanodrop 呢?qubit 和 nanodrop 有什么区别呢?首先,如前所述,它们在 DNA 定量的原理上有所不同,NanoDrop 是基于紫外吸收设计的。紫外吸收法的原理是核酸成分中存在嘌呤和嘧啶碱基,这些碱基具有共轭双键,在紫外区 250-280nm 处有较强的光吸收,最大吸收值在 260nm 左右。因此,可以利用核酸的紫外吸收进行浓度定量。NanoDrop 操作简便快捷,但无法区分 DNA、RNA、降解核酸、游离核苷酸等杂质,不适合获得准确的文库定量数据。而对于准确的 NGS 文库定量,尤其是 DNA 定量,Qubit 定量是最佳选择。那么 qubit DNA 定量有哪些特点呢?请查看下表:

特异性 荧光染料优先结合双链 DNA
DNA片段长度 无具体限制
准确性 高的
样本量要求 稀释1-20μl样品
检测浓度范围 0.2-100ng
标准数量 通常两个
试验手动操作时间 设置时间为5分钟,单个样品测量时间为3秒
检测时间 5分钟-30分钟(取决于样本大小)
适用仪器 Qubit(3.0/4.0);具有相应波长的微孔板读数仪
适用场景 dsDNA定量;NGS文库构建中的dsDNA定量和常规文库中的快速定量

2. Qubit 提供的产品有哪些特点 Yeasen

在介绍Qubit产品的特点之前 Yeasen,让我们了解一下它是如何工作的。

2.1 Qubit 如何工作?

Qubit的原理是利用荧光染料与DNA分子结合后发出荧光,然后测量荧光强度来得到核酸的浓度。荧光染料只有与DNA双链结合后才会发出荧光,产生的荧光与DNA浓度成正比。

2.2 热门产品由 Yeasen

1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit®(货号:12642ES),基于 dsDNA HS Assay Kit for Qubit® kit (Cat#: 12640ES),是即用的Qubit预混液,将原装试剂盒中的浓缩染料预先稀释成工作液,操作时只需将工作液与待测样本混合即可通过Qubit®荧光计测定样本浓度,使用更加便捷。

2.3 产品特点

简便易操作:即取即用的预混液,无需配制工作液,操作简单、定量更省时;

图 1. Qubit dsDNA HS 检测试剂盒流程

超高灵敏度:64倍梯度稀释精确定量,0.2-100 ng dsDNA具有良好的线性关系;

超强特异性:特异性检测dsDNA,对一些常规污染物有极好的耐受性;

染料结合速度快:2分钟内即可达到饱和,无需等待即可快速读取准确的定量结果;

稳定性高:荧光信号可持续3h,室温下放置20天后定量准确性不受影响。

图1. 产品稳定性试验。结果表明其 室温下放置2周后稳定(测量值与理论值偏差<10%)

注:选取两种浓度的dsDNA,Thermo#Q33230 4℃保存, Yeasen#12642 储存于 4℃, Yeasen使用保存于室温(约25℃)的#12642测定不同时刻的浓度值,计算每次测量与第一次测量的偏差率(记为0d)。

图2. 产品稳定性测试。稳定性超强,有效期内测试结果相关性高

3. 针对不同的样本,如何选择Qubit?

Qubit,快速定量!使用Qubit进行文库定量有很多优势。其检测过程快速有效。单个样本数秒内即可得到测序结果并直接输出浓度,十分直观;同时还可兼容大部分酶标仪进行批量样本定量,是常规文库定量、dsDNA定量的首选。

产品名称 目录编号 尺寸 应用
1×dsDNA HS 检测试剂盒(适用于 Qubit) 12642ES 100吨/500吨

双链DNA定量

文库定量

Qubit 的 dsDNA HS 检测试剂盒 12640ES 100吨/500吨
单链DNA检测试剂盒 12645ES 100吨/500吨

单链DNA定量

文库定量

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