描述
HEK293 宿主细胞残留 DNA 片段分析试剂盒专为 定量分析生物制剂中间体、半成品、最终产品中不同长度的HEK293残留DNA片段。本试剂盒采用qPCR荧光探针原理,特异、快速地检测200碱基对以下和200碱基对以上的HEK293 DNA残留,定量限低至10 fg/μL。其中还包含HEK293 DNA Control(DNA定量参考品)。本试剂盒可与本公司基于磁珠的残留DNA样本制备试剂盒(编号:18461ES/18462ES)。
产品信息
库存单位 | 41316ES70 / 41316ES74 |
尺寸 | 4×50吨 / 4×100 电视 |
成分
部件编号 | 姓名 | 41316ES70 | 41316ES74 |
41316-A | HEK293 qPCR 混合物 | 0.75 毫升×4 管子s | 1.5 毫升×4 管子s |
41316-B1 | HEK293 引物和探针混合物-82 | 250 μL×1 管子 | 500 μL×1 管子 |
41316-B2 | HEK293 引物和探针混合物-133 | 250 μL×1 管子 | 500 μL×1 管子 |
41316-B3 | HEK293 引物和探针混合物-227 | 250 μL×1 管子 | 500 μL×1 管子 |
41316-B4 | HEK293 引物和探针混合物-515 | 250 μL×1 管子 | 500 μL×1 管子 |
41316-C | DNA稀释 缓冲 | 1.8 毫升×2 管子s | 1.8 毫升×4 管子s |
41316-D | HEK293 DNA 对照(30 纳克/微升) | 25 μL×1 管子 | 50 μL×1 管子 |
储存和运输:
1. 所有组件均在干冰上运输,收到后应储存在 -25°C 至 -15°C 的环境中。保质期为 2 年。组件 A 和 B1、B2、B3 和 B4 应避光保存。
2. 收到后,请检查所有 7 个组件是否存在,并立即将它们存放在建议的温度下。
防范措施:
1. 本产品仅供研究目的使用。
2. 为了安全和健康原因,操作时请穿着实验服和戴一次性手套。
3. 使用该试剂前,请仔细阅读使用说明书。实验应按照标准程序进行,包括样品处理、反应混合物的制备和移液。
4. 使用前应将各成分轻轻摇晃并短暂离心,充分混合。
兼容仪器:
包括但不限于以下仪器: 赛默飞世尔科技:ABI 7500、ABI Quant Studio 5、ABI Step OnePlus, Bio-Rad:CFX96 光学模块, 上海红石医疗科技:SLAN-96S
使用说明
1. HEK293 DNA 对照定量参考的稀释及标准曲线的制备
HEK293片段分析试剂盒包含4个不同长度的扩增片段:82bp、133bp、227bp、515bp,建立标准曲线时,对每个扩增片段分别建立曲线,并根据对应的标准曲线计算其残留量及相对分布。
使用试剂盒提供的DNA稀释缓冲液对HEK293 DNA对照定量参考进行梯度稀释,稀释浓度分别为:3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL、30 fg/μL。
详情如下
1). 将试剂盒中的HEK293 DNA Control和DNA Dilution Buffer置于冰上解冻。完全解冻后,轻轻涡旋混匀并短暂离心(10秒)以收集管底的溶液。
2).准备六个干净的1.5 mL离心管,分别标记为Std0、Std1、Std2、Std3、Std4、Std5。
3)。在标有 Std0 的试管中,加入 90 μL DNA 稀释缓冲液和 10 μL HEK293 DNA 对照,以达到 3 ng/μL 的浓度。轻轻涡旋混合并短暂离心(10 秒)。此浓度可分装并储存在 -20°C 下以供短期使用(最长 3 个月)。避免反复冻融。
4)。 在标有 Std0、Std1、Std2、Std3、Std4 和 Std5 的试管中,首先向每个试管添加 90 μL DNA 稀释缓冲液。每个稀释步骤都应轻轻混合并短暂离心以确保均匀性。 然后进行渐变 稀释如下:
电视宇部 | 稀释 | 最终浓度 |
标准1 | 10 μL Std0 + 90 μL DNA 稀释液 缓冲 | 300 皮克/微升 |
标准2 | 10 μL 标准品 1 + 90 μL DNA 稀释 缓冲 | 30 皮克/微升 |
标准3 | 10 μL 标准品2 + 90 μL DNA 稀释 缓冲 | 3 皮克/微升 |
标准4 | 10 μL Std3 + 90 μL DNA 稀释液 缓冲 | 300 克/微升 |
标准5 | 10 μL 标准4 + 90 μL DNA 稀释 缓冲 | 三十 克/微升 |
表 1:标准梯度稀释
* 每个浓度重复测定3次,本试剂可检测300 pg/μL~30 fg/μL的线性范围,如有必要可适当扩大或缩小线性范围。
** 为了减少反复冻融循环并避免污染,建议分装并储存 DNA 定量 s首次使用时标准温度为-20°C。
*** 未使用的解冻 DNA 稀释液可在 2-8°C 下保存最多 7 天。如果长时间不使用,请将其保存在 -20°C 下。
**** 为了确保模板完全混合,轻轻摇晃每个梯度稀释液约 1 分钟。
2. 测试样品(TS)的制备
根据实验设置准备测试样品 TS,如下所示:
1) 取100 μL待测样品,加入1.5 mL洁净离心管中,贴上TS标签,进行样品前处理,制备o 普利夫是 測試樣本。
2) 为满足同时分析四种不同延伸长度的要求,预处理后的检测样品量应≥120 μL,因此建议每种样品准备2管进行预处理,萃取后混合使用。
3. 制备阴性提取对照 (NCS)
根据实验设置准备阴性提取控制 NCS,如下所示:
1) 取 100 μL 样品基质溶液(或 DNA 稀释液 缓冲),加入至1.5 mL干净离心管中,标记为NCS。
2)将阴性对照NCS与该批测试样品一起进行样品预处理,制备纯化的阴性对照NCS溶液。
3) 为满足同时分析四种不同延伸长度的要求,预处理的NCS样品量应≥120 μL,因此建议每种NCS样品准备2管进行预处理,萃取后混合使用。
4. 无模板对照 (NTC) 的制备
根据实验设置准备无模板控制 NTC,如下所示:
1) 无模板对照(NTC)不需要样品 预处理, 并且可以从使用 qPCR 检测残留 DNA 含量的阶段开始准备。
2) 每管或每孔NTC样品由20 μL混合物(即15 μL HEK293 qPCR Mix + 5 μL 相应的HEK293 Primer & Probe Mix)+ 10 μL DNA Dilution Buffer组成。建议准备足够的量用于3个重复孔。
5. qPCR反应体系
82 基点 | 体积 (微升) |
HEK293 qPCR 混合物* | 15 |
HEK293 引物和探针混合物-82 | 5 |
DNA模板** | 10 |
总体积*** | 三十 |
桌子 2。 反应体系 为了 82 bp 片段
133 基点 | 体积 (微升) |
HEK293 qPCR 混合物* | 15 |
HEK293 引物和探针混合物-133 | 5 |
DNA模板** | 10 |
总体积*** | 三十 |
桌子 3。 反应体系 133 bp片段
227 基点 | 体积 (微升) |
HEK293 qPCR 混合物* | 15 |
HEK293 引物和探针混合物-227 | 5 |
DNA模板** | 10 |
总体积*** | 三十 |
桌子 4。 反应体系 2 人份27 bp片段
515 碱基 | 体积 (微升) |
HEK293 qPCR 混合物* | 15 |
HEK293 引物和探针混合物-515 | 5 |
DNA模板** | 10 |
总体积*** | 三十 |
桌子 5。 反应体系 515 的 bp片段
* 根据孔数计算此反应所需的混合物总量:
混合量 = (反应孔数 + 2) × (15 + 5) μL(以弥补 2 个孔的损失)。通常,每个样品准备 3 个重复孔。
** 反应孔数=(5个浓度梯度标准曲线孔+1个无模板对照(NTC)+1个阴性对照液(NCS)+N个检测样本(TS))×3。
NTC(无模板对照):DNA 稀释缓冲液
NCS(阴性对照溶液):样品预处理后的样品基质溶液或DNA稀释缓冲液-治疗 得到纯化溶液,即NCS。
TS(测试样品):需要测试的样品。
***分配样品并密封试管后,低速短暂离心(10 秒),将液体从试管壁收集到底部。然后涡旋至少 5 秒钟以彻底混合。之后,再进行一次低速离心(10 秒)。如果有气泡,请确保将其去除。
| 82 BP | 133 BP | 227 BP | 515 BP | ||||||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
一个 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 | 标准1 |
乙 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 | 标准2 |
碳 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 | 标准3 |
德 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 | 标准4 |
埃 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 | 标准5 |
F | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS | TS |
格 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 | 国家计算机系统公司 |
赫 | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) | 负温度系数 (NTC) |
表 6:参考板布局
这个例子 展示s 用于分析残留 HEK293 DNA 扩增片段的 qPCR 检测程序。检测样本包括:HEK293 DNA标准曲线5个浓度梯度,1个检测样本(TS),1个阴性对照液(NCS),1个无模板对照(NTC),建议每个样本做3个重复孔。
6. 扩增程序参数(T韓步法) (以 ABI 7500 qPCR 仪器、软件版本 2.0 为例)**
1) 新建一个空白程序,选择“绝对定量”作为检测模板。
2) 针对这四种不同的扩增片段长度,创建新的检测探针,分别命名为“HEK293-82”、“HEK293-133”、“HEK293-227”、“HEK293-515”。报告荧光团选择“FAM”,猝灭荧光团选择“无”。检测的参考染料设置为“ROX”(根据仪器型号等因素,可能添加或不添加参考染料)。
3) 在“Assign target(s) to the selected wells”面板中,将标准曲线孔的“Task”字段设置为“Standard”,并在“Quantity”字段中分别赋值“300000”、“30000”、“3000”、“300”、“30”(代表每孔DNA浓度,单位为fg/μL)。在“Sample Name”字段中分别将孔命名为“300 pg/μL”、“30 pg/μL”、“3 pg/μL”、“300 fg/μL”、“30 fg/μL”。对于NTC孔,将“Task”设置为“NTC”。对于NCS和TS孔,将“Task”设置为“Unknown”,并在“Sample Name”字段中分别将孔命名为“NCS”和“TS”。设置完这些参数后,点击“Start Run”开始仪器运行。
4)扩增程序设置:设置三步扩增程序,反应体积为30 μL。
步骤 | 温度 (℃) | 时间 | 周期 |
污染物消化
| 37℃ | 5 分钟 | 1 |
预变性
| 95℃ | 5 分钟 | 1 |
变性
| 95℃ | 15 秒 |
四十五 |
退火
| 60℃ | 30 秒 | |
延伸(收集荧光) | 72℃ | 30 秒 |
桌子7. PCR 程序
7. qPCR结果分析
1)在“扩增曲线”下的“分析”面板中,系统会自动设置“阈值”。有时默认的“阈值”太接近基线,导致重复实验之间的 Ct 值差异较大。您可以手动调整“阈值”到合适位置,然后点击“分析”。此时,您可以初步检查“多组分图”中的扩增曲线是否正常。
2) 在“标准曲线”下的“分析”面板中,您可以读取标准曲线的 R²、扩增效率 (Eff%)、斜率和截距。对于正常的标准曲线:R² > 0.99,扩增效率 (90% ≤ Eff% ≤ 110%),斜率在 -3.6 和 -3.1 之间。
3)在“分析”面板的“查看孔表”下,可以看到无模板对照(NTC)、阴性对照(NCS)和测试样本(TS)的“定量”栏,单位为fg/μL。单位可以在报告中进行转换。
4)结果分析的参数设置需根据具体的仪器型号和软件版本而定,一般仪器可以自动对结果进行解释。
5)阴性对照(NCS)的Ct值应大于标准曲线最低浓度的平均Ct值。
6) 无模板对照(NTC)的结果应为“未确定”或Ct值≥32。
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