嘌呤黴素 是由白黑鏈黴菌產生的一種氨基糖苷類抗生素。它是氨酰基-tRNA分子3’端的類似物,能與核醣體的A位結合,摻入延伸的肽鏈中,破壞核醣體上的肽易位,導致翻譯過程中鏈過早終止,從而抑制蛋白質的合成。
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圖1 嘌呤黴素(CAS NO.53-79-2)結構式
pac 基因編碼嘌呤黴素 N-乙醯轉移酶 (pac),存在於產生嘌呤黴素的細菌白黑鏈黴菌中,可賦予其對嘌呤黴素的抗性。這項特性目前被廣泛用於篩選攜帶pac基因質粒的哺乳動物穩定轉染細胞系。嘌呤黴素在穩定細胞株篩選中的廣泛應用與慢病毒載體的特性有關,商業化的慢病毒載體中大多攜帶pac基因。在某些特定情況下,嘌呤黴素也可用於篩選轉化了攜帶pac基因的質粒的大腸桿菌菌株。嘌呤黴素作用迅速,低濃度即可迅速導致細胞死亡。黏附哺乳動物細胞對 2-5 µg/mL 的濃度敏感 嘌呤黴素,而懸浮細胞對低至 0.5-2 µg/mL 的嘌呤黴素濃度就已經很敏感了。一週之內即可產生對嘌呤黴素具有穩定抗性的哺乳動物細胞。
穩定細胞系篩選
實驗原理
透過將外源性DNA/shRNA克隆到攜帶pac基因的載體中,重組載體轉染到宿主細胞中並整合到其染色體上,隨細胞分裂而穩定傳遞,最後用嘌呤黴素進行篩選。
準備和預實驗
1 建議使用濃度
哺乳動物細胞:1-10 μg/mL,最佳濃度需預先實驗確定。
大腸桿菌:在 LB 瓊脂培養基上篩選出攜帶 pac 基因的穩定轉殖大腸桿菌,使用濃度為 125 μg/mL。大腸桿菌穩定轉化子的嘌呤黴素篩選需要精確的 pH 調節。
2 溶解方法
將嘌呤黴素溶於蒸餾水中,製成50 mg/mL的原液,用0.22 μm濾膜過濾除菌,分裝,-20°C保存。
3 嘌呤黴素殺傷曲線測定(以shRNA轉染或慢病毒轉導為例)
嘌呤黴素的有效篩選濃度與細胞種類、生長狀態、細胞密度、細胞代謝、細胞週期位置有關。確定殺死未轉染細胞的嘌呤黴素最低濃度至關重要。對於第一次實驗,必須進行嘌呤黴素梯度篩選預實驗,以建立殺滅曲線。
- 接種密度為5~8×104將 24 孔板中的每孔細胞放入培養箱中並培養過夜。
- 製備篩選培養基:含有不同濃度嘌呤黴素(例如0-15μg/mL,至少5個梯度)的新鮮培養基。
- 換上新鮮配製的篩選培養基,繼續培養,觀察細胞生長狀況,每2-3天更換新鮮的篩選培養基。
- 每天觀察細胞存活率; 4-6天內有效殺死所有未轉染細胞的藥物濃度為最低濃度。
穩定轉染子的篩選
- 慢病毒感染48-72h(70-80%匯合度)後,在含有適當濃度嘌呤黴素的培養基中培養細胞至少48h。當未轉染嘌呤黴素的對照組細胞全數死亡時,病毒感染組剩餘的細胞全部為陽性細胞。
【註】:①當細胞處於活躍分裂期,抗生素的作用最為明顯。如果細胞過於密集,抗生素的功效就會大大降低。細胞密度不得超過25%。 ②每日觀察細胞生長狀況;嘌呤黴素篩選至少需要48小時,嘌呤黴素篩選的有效濃度通常可持續3至10天。病毒的MOI越高,每個細胞所包含的shRNA和嘌呤黴素抗性基因的拷貝數就越多。在進行嘌呤黴素篩選時,MOI越高,細胞含有的pac拷貝數越多,可耐受的嘌呤黴素濃度越高。調節嘌呤黴素濃度來篩選轉染細胞,但嘌呤黴素濃度不能低於殺傷曲線的最低有效濃度;
- 加入含最低濃度Puromycin的培養基擴增細胞,qPCR檢測結果符合資格後進行冷凍儲存。
產品s 姓名 | 貓# | 規格 | 外貌 |
嘌呤黴素 二鹽酸鹽 CAS:58-58-2 | 60210ES25 | 25 毫克 | 白色至類白色粉末 |
60210ES60 | 100毫克 | ||
60210ES72 | 250毫克 | ||
60210ES76 | 500 毫克 | ||
60210ES80 | 1 克 | ||
嘌呤黴素 (溶液 10 毫克/毫升) CAS:58-58-2 | 60209ES10 | 1×1毫升 | 溶液(10 mg/mL於H2中)2(哦) |
60209ES50 | 5×1毫升 | ||
60209ES60 | 10×1毫升 | ||
60209ES76 | 50×1毫升 |
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