最適合: rRNA去除mRNA 加帽 效率檢測!

耐熱 RNase H 具有優異的耐熱性,其特異性和效率均優於普通 RNase H!

RNase H 簡介

大腸桿菌 RNase H(大腸桿菌核糖核酸酶 H)是一種特異性降解 RNA-DNA 混合鏈的 RNA 成分的酵素。它透過切割 RNA 鏈來維持 DNA 模板的完整性和穩定性,在 DNA 複製、修復和轉錄等過程中發揮重要作用。這使其廣泛應用於分子生物學實驗,包括 cDNA 合成、rRNA 去除和 RNA 幹擾研究。然而,大腸桿菌 RNase H 有一些限制:

  • 它可能導致單鏈RNA或DNA的非特異性切割,從而降低實驗結果的準確性。
  • 由於其熱穩定性差,無法在高溫下保持活性,不適合進行高溫逆轉錄或 PCR 等需要高溫的實驗。

這些缺點促使研究人員開發耐熱RNase H,以擴大其應用範圍並提高實驗效率。

Figure 1: RNase H Mechanism

圖 1:RNase H 機制

來自嗜熱菌的耐熱 RNase H

耐熱 RNase H 源自嗜熱菌,是大腸桿菌 RNase H 的同源物,具有相似的核糖核酸酶功能。它可以精確識別並有效切割 RNA:DNA 混合物中 RNA 鏈的磷酸二酯鍵,同時保持 DNA 鏈的完整性。深入的結構分析表明,儘管整體穩定性分佈與大腸桿菌RNase H相似,但嗜熱菌RNase H在整體穩定性和局部殘基穩定性方面均表現出顯著的改善。

耐熱 RNase H 的最佳活性溫度高於 65°C,在較高的反應溫度下可提供增強的特異性和效率,最大限度地減少非特異性切割。這項特性釋放了其在分子生物學實驗中的巨大潛力,包括:

  • rRNA去除
  • mRNA封蓋率檢測
  • 去除與 poly(dT) 雜交的 mRNA poly(A)
  • cDNA 第二鏈合成過程中 mRNA 的去除
  • 提高高溫逆轉錄、等溫擴增和 PCR 實驗中的擴增效率
Figure 2: Three-Dimensional Structure Comparison of Thermostable RNase H and E. coli RNase H [1]

圖2:耐熱RNase H與大腸桿菌RNase H的三維結構比較 [1]

緬因大學™耐熱 RNase H (Cat14545)

耐熱 RNase H 經常用於病原體檢測實驗,例如宏基因組定序 (mNGS) 和病原體標靶定序 (tNGS) 中的 rRNA 去除。酵素中殘留的宿主或背景細菌核酸會嚴重影響檢測的準確性。為了解決這個問題, Yeasen 個人簡介科技 介紹 UCF.ME採用其專有的 UCF.ME 開發的耐熱 RNase H (Cat14545)超潔淨過程技術。由 UCF.ME 製作超潔淨分子酵素設施,經過嚴格的品質控制——從材料選擇和環境管理到製程優化和測試——確保背景細菌 gDNA 和核酸酶殘留量最少。這保證了實驗結果的準確、可靠和可重複。

產品優勢:

  • 高活性和優異的批次間一致性
  • 極低的宿主 gDNA 殘留:<0.02 拷貝/U
  • 無外切酶、內切酶或 RNase 殘基
  • 優異的穩定性:在 4°C 下放置 32 天、在 25°C 下放置 16 天或在 37°C 下放置 7 天後酶活性無明顯損失

UCF.ME 的表演展示™ 耐熱 RNase H (Cat14545)

1. 高活性和批次一致性

三批 UCF.ME將耐熱 RNase H 與 RNA:DNA 底物一起孵育,並透過瓊脂糖凝膠電泳分析條帶變化。結果表明,僅 0.05 U 此酵素即可有效切割 20 pmol RNA:DNA 底物中的 RNA,且批次間一致性極佳,凸顯了其穩定性和可靠性。

Figure 3: Activity Detection Results of UCF.ME® Thermostable RNase H &nbsp;

圖3:UCF.ME活性檢測結果耐熱 RNase H

註:反應條件:50℃,20分鐘; RNA:DNA底物 – 20 pmol

2. 低宿主 gDNA 殘留:<0.02 拷貝/U

多個批次的宿主(大腸桿菌)gDNA 殘留檢測表明,UCF.ME 的三個批次耐熱 RNase H 的殘留量遠低於 0.02 Copies/U,確保了高純度和實驗可靠性。

Figure 4: Host gDNA Residue Results of UCF.ME® Thermostable RNase H

圖 4:UCF.ME 的宿主 gDNA 殘留結果耐熱 RNase H

3. 無外切酶、內切酶或 RNase 殘留

25 佛羅裡達大學 將耐熱 RNase H 與核酸底物一起孵育,並透過瓊脂糖凝膠電泳評估條帶變化。三個批次中均未檢測到外切酶、內切酶或RNase殘留,為結果的準確性和可靠性提供了有力的保證。

Figure 5: Detection Results of Exonuclease, Endonuclease, and RNase Residues in UCF.ME® Thermostable RNase H

圖5:UCF.ME中外切酶、內切酶和RNase殘留物的檢測結果耐熱 RNase H

4. 穩定性優良

緬因大學耐熱RNase H進行穩定性測試:4°C下32天,25°C下16天,37°C下7天。酶活性測量沒有顯示出明顯的下降,證明了其在寬溫度範圍內的卓越穩定性以及適合長期儲存和多種實驗條件。

Figure 6: Accelerated Stability Results of UCF.ME® Thermostable RNase H

圖 6:UCF.ME 的加速穩定性結果耐熱 RNase H

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來源

產品名稱

貓N哦。

嗜熱桿菌

緬因大學耐熱 RNase H

14545ES

E.大腸桿菌

核糖核酸酶H

12906ES

參考

1. Hollien J, Marqusee S. 嗜熱酶穩定性的結構分佈[J]。美國國家科學院院刊,1999,96(24):13674-13678。

2.Wolf EJ、Dai N、Chan SH。透過 DNA 探針定向富集和位點特異性核糖核酸酶對 mRNA 5′ 末端進行選擇性表徵 [J]。 [2025-03-03]。

3. 顧華,孫永華,李新徵。針對鳥類總 RNA 定序和核醣體分析所開發的新型 rRNA 消耗方法 [J]。家禽科學,2021,100(7): 101321。 DOI:10.1016/j.psj.2021.101321。

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