瓊脂糖是從瓊脂或含瓊脂的海藻中提取的純化的線性半乳聚醣親水膠體。從結構上看，它是一種由 β-D-吡喃半乳糖基 (1-4) 與 3,6-脫水-α-L-吡喃半乳糖基殘基連接的線性聚合物。作為凝膠試劑，它通常用於透過凝膠電泳或印跡方法（如Northern或Southern）進行常規核酸分析，也適用於蛋白質應用，例如徑向免疫擴散（RID）實驗。
瓊脂糖凝膠電泳是利用瓊脂糖作為支撐介質的電泳方法，包括凝膠製備、上樣、電泳等步驟。其分析原理與其他支撐物電泳的主要區別在於，它具有「分子篩」和「電泳」的雙重作用。當將凝膠置於電場中時，帶電的核酸會透過凝膠孔向正極遷移。經過不同條件下電泳適當時間後，不同大小、不同構象的核酸片段會位於凝膠中的不同位置，進而達到分離。

圖1 核酸電泳實驗操作步驟

圖2 電泳遷移方向圖

如何選擇正確的瓊脂糖？

根據瓊脂糖的基本參數判斷：

硫酸鹽含量－純度指標；
凝膠強度－破壞凝膠所需的外力；
凝膠點－水溶性瓊脂糖溶液冷卻時形成凝膠的溫度；
電滲透（EEO）－一種液體滲透凝膠的電動運動。瓊脂糖凝膠內的陰離子基團吸附到基質上，不會遷移，但解離出來的陽離子會向負極遷移，產生電滲。由於樣品的電泳遷移通常向正極移動，EEO引起的內部對流會幹擾分離效率。基於瓊脂糖的基本參數，高品質的瓊脂糖凝膠應具有孔隙清晰，不易破碎，純度高（硫酸鹽含量低），凝膠強度高，凝膠點較高（室溫下凝固很快），EEO低等特點。

根據瓊脂糖的分離範圍來判斷：

瓊脂糖凝膠分離範圍較廣，常用於DNA凝膠回收，DNA分離，以及確認DNA是否重組，質粒等是否已切開。不同大小的目標片段對應不同濃度的瓊脂糖。根據高濃度適合分離小片段的原則，您可以參考下表找到適合您需求的最佳凝膠濃度。

瓊脂糖濃度（％）	≥3	2-3	1-2	0.7-1	≤0.7
DNA 片段大小 (bp)	≤200	200-700	700-1500	1500-5000	≥5000

Yeasen 高品質瓊脂糖－覆蓋多種應用場景，滿足您的需求

產品名稱	產品編號	產品規格	應用場景
瓊脂糖	10208ES60/76	100 克 / 500 克	常規核酸電泳

產品優勢

低電滲性（EEO ≤ 0.13），可實現優異的譜帶分離度、清晰的區分度和更快的遷移速度。

圖3 不同濃度凝膠電泳圖

注意：0.75％瓊脂糖凝膠上樣1 kb梯子； 1% 瓊脂糖凝膠上樣 100 bp 梯度，1 kb ladder、2000 DNA marker、5000 DNA marker； 2% 瓊脂糖凝膠上樣 100 bp 梯度、2000 DNA Marker、5000 DNA Marker。樣品量：標示純液 2 μL 稀釋5倍，再裝入10μL。 0.75%、1% 和 2% 瓊脂糖凝膠的電泳程序為：115 V 持續 45 分鐘； 130 V 持續 40 分鐘； 130 V，持續 50 分鐘。

凝膠孔隙清晰、通直，凝膠強度高，不易破膠。

註：圖示為產品展示 Yeasen 瓊脂糖（目錄號：10208ES60）。

高品質瓊脂糖使用方法

瓊脂糖凝膠的濃度通常選擇在0.7％～2％之間。濃度越高，凝膠的分子孔徑越小，DNA遷移速度越慢，解析度越高。相反，濃度越低，DNA遷移速度越快，解析度越低。根據不同的實驗目的，選擇合適的凝膠濃度和相容的電泳緩衝液。

瓊脂糖濃度	有效分離範圍 (bp)	推薦緩衝液
0.5％	2,000-50,000	1×TAE
0.8％	800-10,000	1×TAE
1.0％	400-8,000	1×TAE
1.2％	300-7,000	1×TAE
1.5％	200-3,000	1×TAE/0.5×TBE
2.0％	100-2,000	1×TAE/0.5×TBE
3.0％	25-1,000	0.5×TBE

TAE 緩衝液： TAE緩衝液含有醋酸、EDTA和Tris，適用於快速電泳和分離大片段DNA。乙酸的存在降低了凝膠的pH值，有助於提高電泳速度。

TBE 緩衝液：TBE緩衝液含有硼酸、EDTA和Tris，具有較高的離子強度，適用於小片段DNA的高分辨率分離。硼酸離子的存在增強了凝膠的穩定性，有助於提高分離效率。因此當凝膠濃度較高時，應使用TBE緩衝液以利於條帶分離。

已出版文獻（部分）

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張艷，丁華，王曉玲，等。 MK2透過β-TrCP泛素連接酶促進Tfcp2l1降解，進而調節小鼠胚胎幹細胞自我更新。 Cell Rep. 2021；37(5):109949。 doi:10.1016/j.celrep.2021.109949。如果=9。423
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產品定位	產品名稱	產品編號	產品規格	應用場景
核酸染色	YeaRed 核酸凝膠染色劑（水中 10,000 倍）	10202ES76	500 μL	水溶性，具有與EB相同的光譜特性，在300nm紫外光激發下檢測。
DNA 標記	GoldBand DL2000 DNA 標記	10501ES60/80	100 噸/10×100噸	100-2000 鹼基
	GoldBand DL5000 DNA 標記	10504ES60/80	100 噸/10×100噸	100-5000 鹼基對
	GoldBand 100bp DNA 梯狀圖	10507ES60/80	100 噸/10×100噸	100-1,500 bp
	GoldBand 1 kb DNA 梯狀圖	10510ES60/80	100 噸/10×100噸	250-12,000 bp

Yeasen 瓊脂糖－直擊電泳痛點，跑出好凝膠