——更多基因分型,更少時間和更少試劑

基於 PCR 的基因分型和其他實驗通常需要從樣本中純化基因組 DNA。當需要檢測的樣本很多時,純化基因組DNA的過程費時、重複,而且成本高。 Yeasen 生物透過改造Taq DNA聚合酶、優化PCR反應體系,無需進行基因組純化,開發了一系列Direct PCR Kit產品。

智慧 PCR:直接 PCR

Yeasen的直接 PCR 試劑盒直接從樣本開始,使用最少量的原始樣本(圖 1-A)或其裂解物產物(圖 1-B)而無需基因組純化作為基於 PCR 的基因分型的模板(圖 1)。與傳統的PCR基因分型相比,Direct PCR Kit樣本用量少,操作簡便,實驗成本低,可進行高通量樣本檢測。

圖1 直接PCR擴增工作流程

A.直接法:取少量樣本直接加入PCR Master Mix進行PCR鑑定。
B.裂解法:採樣後,將樣本加入裂解液中,裂解並釋放基因組DNA。取少量裂解上清液加入PCR Master Mix中,進行PCR鑑定。

技術優勢

直接:無需耗時且昂貴的 DNA 純化。
快速:10分鐘完成模板製備,30分鐘完成PCR反應。
簡單:無需切割或研磨即可裂解樣品,且 PCR 混合物處於預混合形式,從而減少了移液步驟的數量。
節省:所用材料量少。
高通量:裂解反應可在96孔板中完成。
抗抑制:對各種動物、植物樣本有耐受性。

Direct PCR Kit實驗流程

本系列產品採用獨特的蛋白酶裂解系統來裂解樣品。裂解液可直接作為模板,與試劑盒中提供的PCR Master Mix配對進行基因擴增。

圖2 小鼠組織直接PCR實驗流程

圖。3 植物組織直接PCR實驗流程

直接 PCR 產品選擇表

產品系列

小鼠直接PCR第二代

小鼠直接PCR第一代

血液直接 PCR

植物直接PCR

產品編號

10189ES

10185ES

10188ES

10187ES

規格

20 噸/50 噸/200 噸/500 噸

50噸/200噸

20 噸/50 噸/200 噸/500 噸

50噸/200噸

特徵

擴增子長度

≤5kb

≤1kb

≤8kb

≤1kb

延伸時間 (s/kb)

3-20秒

30 秒

≤2kb:3-5秒

≤8kb:10秒

60 秒

適用生物

小鼠、大鼠

小鼠、大鼠

人類、老鼠、山羊、雞、豬等。

米、玉米、煙草、油菜籽、小麥、大豆等。

適用組織/材料類型

老鼠尾巴、老鼠耳朵、腳趾(有​​肌肉)等器官

老鼠尾巴、老鼠耳朵、腳趾(有​​肌肉)等器官

含有常見抗凝血劑(如 EDTA、肝素、檸檬酸鹽)的新鮮血液、冷藏(冷凍)血液以及商用乾血斑(如 Whatman903)® 和自由貿易協定®

嫩葉、老葉、幼苗、嫩莖

範例用法

組織:5 毫克 鼠尾:1-5 毫米

組織:5-10 毫克 鼠尾:1-5 毫米

全血:0。5%-20% 沃特曼® 乾血斑:1 mm2

葉:1-10毫米 種子:1-3毫米

基因組釋放時間

5-10分鐘

15 分鐘

0-3分鐘

0-10 分鐘

產品最終結構

鈍端

鈍端

鈍端

鈍端

退火溫度

溫度-(2~5)℃

溫度-(2~5)℃

溫度-(1~2)℃

溫度-(2~5)℃

GC 裁剪範圍

29-70%

30-70%

30-75%

40-65%

5'-3' 核酸外切酶活性

是的

是的

是的

是的

應用

基因分型

是的

是的

是的

是的

多重PCR

最多 5X

最多 3-4 倍

直接樣本擴增

是的

是的

是的

是的

其他功能

電泳指示劑

無色

藍色的

無色

藍色的

熱啟動

是的

是的

是的

是的

預混/套裝

套件(含混合料)

套件(含混合料)

套件(含混合液+緩衝液)

套件(含混合料)

產品優勢

改良的Taq DNA聚合酶是直接PCR的保證:它對抑制劑有超強的耐受性。

當使用未純化的樣本作為模板時,會引入許多抑制PCR反應的成分。採用普通的PCR反應體系和Taq DNA聚合酶很難達到理想的效果,甚至無法進行PCR擴增。此系列試劑盒中的PCR Mix為配方優化的預混料,採用改良的Taq DNA Polymerase,增加了與模板DNA的結合能力,並對常見的PCR抑制劑具有更高的耐受性,從而具有更廣泛的模板適應性。

圖4 Direct PCR Kit中的PCR Mix對雜質的耐受性較高。 使用不同PCR Mixes進行PCR時採用相同量的模板,並在系統中加入不同濃度的PCR反應抑制劑。比較不同條件下PCR產物的量。

宜生 針對不同的樣品開發了一系列的產品:

  • 一、囓齒類特異性:小鼠組織直接 PCR 試劑盒 Plus (10189ES)

適用樣本:小鼠組織(如小鼠尾巴、小鼠耳朵、小鼠腳趾等)

  • 擴增效率高(長度、速度、GC 相容性)

圖 5 小鼠組織直接 PCR 試劑盒 Plus 擴增不同組織的裂解物。 1:質粒; 2:鼠耳; 3:老鼠尾巴; 4:肝臟。裂解條件:70℃裂解10分鐘,95℃滅活5分鐘。目標片段是 1 千位元組, 2 千字節, 3 kb和6 kb,延伸時間分別設定為3、5、10和20秒/kb。米: 10510ES60 (Yeasen)。

  • 廣泛的模板相容性(10189ES)

圖6 使用小鼠組織直接 PCR 試劑盒 Plus 直接裂解(70°C,10 分鐘)並擴增人類 293 細胞 (1)、唾液 (2)頭皮組織 (3)。所有樣品均顯示出清晰的目標條帶,M:10510ES60(Yeasen)。

  • 二.多物種血液通用類型:血液先進直接 PCR 試劑盒 (10188ES)
  • 擴增增長度可達 8 kb

圖 7 使用 Blood Advanced Direct PCR Kit 直接從人類全血中擴增不同長度的 DNA 片段。血液樣本保存於-20℃,以EDTA作為抗凝血劑。血液模板濃度為10%,延伸時間設定為10秒/kb。手機:10510ES60 (Yeasen)。

  • 高耐受性

圖8A: Blood Advanced Direct PCR Kit 用於從人類 EDTA 抗凝血全血直接擴增 2 kb、GC 含量為 71% 的 DNA 片段。血液模板濃度0.5-50%梯度設置,延伸時間設定為10sec/kb。乙: Blood Advanced Direct PCR Kit用於從小鼠EDTA抗凝血全血直接擴增2.2 kb、GC含量67%的DNA片段。血液模板濃度設定為0.5-50%,延伸時間為10秒/kb。手機:10510ES60 (Yeasen)。

  • 三植物特異性類型:植物組織直接 PCR 試劑盒(10187ES)
  • 已通過多種植物樣本驗證

圖9 不同類型植物葉組織直接擴增結果。 M:100 bp DNA 梯子。 C:以對應植物純化的基因組DNA作為模板。 1-2:葉組織裂解物作為模板。循環次數:30次。

客戶案例

  • 一、小鼠基因型鑑定

廣州某生物公司:

圖 10 使用小鼠直接 PCR 試劑盒 (10189ES) 擴增小鼠尾部。目標基因:500 bp;裂解時間:10分鐘; PCR反應體系:25μL,延伸時間:5sec/kb。

  • 二.水稻基因直接擴增

二十 大學

圖11 使用Plant Direct PCR Kit(10187ES)擴增水稻相關基因。

R興高采烈 產品

產品定位

產品名稱

產品編號

產品規格

高品質瓊脂糖

瓊脂糖

10208ES60/76

100克/500克

核酸染色(紫外光下)

YeaRed 核酸凝膠染色劑(10,000× 水中)

10202ES76

500 μL

PCR快速升級,可進行菌落PCR,適合複雜模板擴增

2×希夫商標 超快速 II 熱啟動 PCR 預混液

10167ES03/08

1毫升/5×1毫升

詢問