Hieff™Superfast DNA甲基化Bisulfite Kit _ 12225ES

節省 $45.00
Sku: 12225ES10

尺寸: 10t
價格:
銷售價格$105.00 正常價格$150.00

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描述

Hieff 超快速 DNA 甲基化亞硫酸鹽試劑盒(基於管柱)可快速將 DNA 樣本中未甲基化的胞嘧啶轉化為尿嘧啶,同時保持甲基化的胞嘧啶不變。在高溫亞硫酸鹽處理過程中,雙股 DNA 變性為單股。在 HSO3- 存在下,胞嘧啶殘基會脫氨並轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶則保持不變。在隨後的 PCR 擴增中,尿嘧啶被胸腺嘧啶 (T) 取代。轉換過程僅需5分鐘,適應的DNA輸入範圍從100 pg到2 μg,對於未甲基化的胞嘧啶,轉換效率可達≥99%。轉換後的DNA適用於PCR擴增及NGS定序等下游應用。

特徵

低輸入: 適用於將 100 pg 至 2 μg 範圍內的樣品轉換為

轉換時間短: 約 5 分鐘。

最小樣品損壞: 轉換後保持良好的樣品完整性。

高轉換效率: 轉換率≥99%, 高 GC 區域的轉換率高,且假陽性率低。

適用於稀有樣本, 例如單細胞DNA甲基化轉換。

能夠對RNA樣本進行甲基化轉換。

產品 成分

不。

組件名稱

12225ES10

12225ES50

12225-A

轉化試劑

2毫升×1

3.3毫升×3

12225-B

洗滌緩衝液

1.1毫升×1

5.5毫升×1

12225-C

脫磺化緩衝液

2.2毫升×1

11毫升×1

12225-D

洗脫緩衝液

500 μL×1

1.5毫升×1

12225-E

DNA 柱

10

50

12225-F

收集管

10

50

筆記:

每盒 10 次測試:在洗滌液中加入 4.4 毫升無水乙醇。

每盒 50 次試驗:在洗滌液中加入 22 毫升無水乙醇。

加入無水乙醇後,顛倒混勻,保存備用。確保瓶蓋緊緊關閉,以防止乙醇蒸發,這會影響試劑性能。

數位

圖 1. 用於檢測的 DNA 樣本包括 300 ng 未甲基化的 Lambda DNA 和 800 ng 人類基因組 DNA。轉換後,以 Qubit ssDNA 定量,洗脫量為 30 μL。

圖 2. 接著對 800ng 人類基因組 DNA 的轉化產物進行針對 286 bp 片段大小的甲基化特異性引子探針 PCR。採用凝膠電泳對擴增產物進行分析。
圖 3. 12225 轉換試劑盒與競爭對手試劑盒 Q 和 Z 的直接比較。轉換後,樣本經過甲基化特異性單股 DNA 文庫製備。

圖 4.使用 12225 和競爭對手的 Q 轉化試劑盒對人類基因組 DNA 樣本進行亞硫酸鹽轉化。隨後,利用甲基化特異性單股 DNA 文庫製備試劑盒來產生文庫。上面給出了文庫產量和品質控制數據。結果表明,在對 12225 和競爭對手 Q 試劑盒的混合文庫進行測序時,12225 試劑盒的數據輸出更高,達到了更高的命中率(%),並且重複率(%)更低。

運輸和儲存

將 12225-A 轉換溶液存放於室溫下,避免光照。其它組件存放於室溫下。保存期限為12個月。

筆記:

1. 為確保下游實驗的成功,需在轉換步驟中精確量化輸入 DNA 的總量。建議使用Qubit 3.0/4.0進行DNA定量,A260/A280比值在1.7~1.9之間。輸入 DNA 範圍應在 100 pg 至 2 μg 之間,最佳範圍為 100 ng 至 1 μg。 DNA 輸入不足會阻礙下游檢測,而輸入過多可能會降低恢復和轉換效率。

2.轉化液、脫磺液、洗滌液中含有易揮發成分。使用後,請立即鎖緊瓶蓋並在室溫下保存。

3. 對於轉化後的樣品,應及時進行下游實驗。短期保存請維持在-20°C,長期保存請維持在-80°C。

4.為了您的安全和健康,操作時請穿戴工作服和一次性手套。

5.本產品僅供研究使用!

指示

試劑及耗材準備: 1.5mL無菌離心管、無酵素水、無水乙醇、PCR管;

公升 亞硫酸鹽轉化率:

1) 根據待檢測樣本數量準備相應的無菌PCR管,按下表配製反應體系:

2) 轉化系統

成分

體積

脫氧核糖核酸

100 pg-2 μg(至 20 μL)

轉換緩衝區

180 微升

總體積

200 μL

用移液器將上述系統吹打混勻或渦旋混合5s,短暫離心,將反應液離心至PCR管底部。

五 注意:1.此時PCR管中反應液總體積為200μL。為了使轉化更加完全,應將步驟2)中反應液吹勻後,分成等份並轉移至新的無菌PCR管中,再運行轉化程序。轉換完畢後,將兩支PCR管內的反應液合併放入同一個純化管柱中進行純化。

2. 如果樣品體積在 20 至 40 μL 之間,則減少轉化溶液的體積以保持總體積為 200 μL。

3. 若樣品體積為50μL,則加入150μL轉化液,總體積維持在200μL,轉化時間延長至6-10分鐘。

3)CT轉換程序的設定

溫度

時間

98 ℃

5 分分鐘

4 ℃

將PCR管放置在已設定好程序的PCR儀上,進行反應。

公升 純化

1) 電視轉移 200 μL 轉換 解決方案 淨化塔s,離心30-60秒13000 ,棄濾液,將純化柱放入 收集管s 再次;

2) 加入 100 μL 洗滌緩衝液 進入 純化柱 (確認已加入無水乙醇),離心30-60秒13000 ,棄濾液,將純化柱放入 收集管s 再次;

3) 加入 200 μL 脫磺化緩衝液 進入 純化柱 ,讓反應在室溫下靜置 20 分鐘。反應結束後離心30-60秒13000 ,棄去濾液,將 純化柱收集管s 再次;

4) 加入 200 μL 洗滌緩衝液純化柱,離心30-60秒13000 棄掉濾液,將 淨化塔s收集管s 再次;

5) 重複步驟4)一次;

6) 轉移 純化柱 在準備好的1.5 mL離心管中,加入10-30 μL 洗脫緩衝液 開蓋晾乾後移至濾膜中央,收集 脫氧核糖核酸 室溫靜置 1 分鐘,然後 13000 離心 1 分鐘

7) 儲存 脫氧核糖核酸 暫存於-20℃。如需長期保存,請將 脫氧核糖核酸 於-80℃保存,避免不必要的重複凍融。

註:純化的轉化產物可直接用於後續的PCR反應或定序過程。

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