描述
Hieff 超快速 DNA 甲基化亞硫酸鹽試劑盒(基於管柱)可快速將 DNA 樣本中未甲基化的胞嘧啶轉化為尿嘧啶,同時保持甲基化的胞嘧啶不變。在高溫亞硫酸鹽處理過程中,雙股 DNA 變性為單股。在 HSO3- 存在下,胞嘧啶殘基會脫氨並轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶則保持不變。在隨後的 PCR 擴增中,尿嘧啶被胸腺嘧啶 (T) 取代。轉換過程僅需5分鐘,適應的DNA輸入範圍從100 pg到2 μg,對於未甲基化的胞嘧啶,轉換效率可達≥99%。轉換後的DNA適用於PCR擴增及NGS定序等下游應用。
特徵
低輸入: 適用於將 100 pg 至 2 μg 範圍內的樣品轉換為
轉換時間短: 約 5 分鐘。
最小樣品損壞: 轉換後保持良好的樣品完整性。
高轉換效率: 轉換率≥99%, 高 GC 區域的轉換率高,且假陽性率低。
適用於稀有樣本, 例如單細胞DNA甲基化轉換。
能夠對RNA樣本進行甲基化轉換。
產品 成分
不。 | 組件名稱 | 12225ES10 | 12225ES50 |
12225-A | 轉化試劑 | 2毫升×1 | 3.3毫升×3 |
12225-B | 洗滌緩衝液 | 1.1毫升×1 | 5.5毫升×1 |
12225-C | 脫磺化緩衝液 | 2.2毫升×1 | 11毫升×1 |
12225-D | 洗脫緩衝液 | 500 μL×1 | 1.5毫升×1 |
12225-E | DNA 柱 | 10 | 50 |
12225-F | 收集管 | 10 | 50 |
筆記:
每盒 10 次測試:在洗滌液中加入 4.4 毫升無水乙醇。
每盒 50 次試驗:在洗滌液中加入 22 毫升無水乙醇。
加入無水乙醇後,顛倒混勻,保存備用。確保瓶蓋緊緊關閉,以防止乙醇蒸發,這會影響試劑性能。
數位
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圖 4.使用 12225 和競爭對手的 Q 轉化試劑盒對人類基因組 DNA 樣本進行亞硫酸鹽轉化。隨後,利用甲基化特異性單股 DNA 文庫製備試劑盒來產生文庫。上面給出了文庫產量和品質控制數據。結果表明,在對 12225 和競爭對手 Q 試劑盒的混合文庫進行測序時,12225 試劑盒的數據輸出更高,達到了更高的命中率(%),並且重複率(%)更低。
運輸和儲存
將 12225-A 轉換溶液存放於室溫下,避免光照。其它組件存放於室溫下。保存期限為12個月。
筆記:
1. 為確保下游實驗的成功,需在轉換步驟中精確量化輸入 DNA 的總量。建議使用Qubit 3.0/4.0進行DNA定量,A260/A280比值在1.7~1.9之間。輸入 DNA 範圍應在 100 pg 至 2 μg 之間,最佳範圍為 100 ng 至 1 μg。 DNA 輸入不足會阻礙下游檢測,而輸入過多可能會降低恢復和轉換效率。
2.轉化液、脫磺液、洗滌液中含有易揮發成分。使用後,請立即鎖緊瓶蓋並在室溫下保存。
3. 對於轉化後的樣品,應及時進行下游實驗。短期保存請維持在-20°C,長期保存請維持在-80°C。
4.為了您的安全和健康,操作時請穿戴工作服和一次性手套。
5.本產品僅供研究使用!
指示
試劑及耗材準備: 1.5mL無菌離心管、無酵素水、無水乙醇、PCR管;
公升 亞硫酸鹽轉化率:
1) 根據待檢測樣本數量準備相應的無菌PCR管,按下表配製反應體系:
2) 轉化系統
成分 | 體積 |
脫氧核糖核酸 | 100 pg-2 μg(至 20 μL) |
轉換緩衝區 | 180 微升 |
總體積 | 200 μL |
用移液器將上述系統吹打混勻或渦旋混合5s,短暫離心,將反應液離心至PCR管底部。
五 注意:1.此時PCR管中反應液總體積為200μL。為了使轉化更加完全,應將步驟2)中反應液吹勻後,分成等份並轉移至新的無菌PCR管中,再運行轉化程序。轉換完畢後,將兩支PCR管內的反應液合併放入同一個純化管柱中進行純化。
2. 如果樣品體積在 20 至 40 μL 之間,則減少轉化溶液的體積以保持總體積為 200 μL。
3. 若樣品體積為50μL,則加入150μL轉化液,總體積維持在200μL,轉化時間延長至6-10分鐘。
3)CT轉換程序的設定
溫度 | 時間 |
98 ℃ | 5 分分鐘 |
4 ℃ | ∞ |
將PCR管放置在已設定好程序的PCR儀上,進行反應。
公升 純化
1) 電視轉移 200 μL 轉換 解決方案 磷淨化塔s,離心30-60秒13000 克,棄濾液,將純化柱放入 碳收集管s 再次;
2) 加入 100 μL 洗滌緩衝液 進入 純化柱 (確認已加入無水乙醇),離心30-60秒13000 克,棄濾液,將純化柱放入 碳收集管s 再次;
3) 加入 200 μL 脫磺化緩衝液 進入 純化柱 ,讓反應在室溫下靜置 20 分鐘。反應結束後離心30-60秒13000 克,棄去濾液,將 純化柱 在 碳收集管s 再次;
4) 加入 200 μL 洗滌緩衝液 到 純化柱,離心30-60秒13000 克 棄掉濾液,將 磷淨化塔s 在 碳收集管s 再次;
5) 重複步驟4)一次;
6) 轉移 純化柱 在準備好的1.5 mL離心管中,加入10-30 μL 洗脫緩衝液 開蓋晾乾後移至濾膜中央,收集 脫氧核糖核酸 室溫靜置 1 分鐘,然後 13000 離心 1 分鐘 克;
7) 儲存 脫氧核糖核酸 暫存於-20℃。如需長期保存,請將 脫氧核糖核酸 於-80℃保存,避免不必要的重複凍融。
註:純化的轉化產物可直接用於後續的PCR反應或定序過程。
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