描述
Hieff NGS® DNA&RNA 文庫共製備試劑盒 V2 是針對Illumina®&MGI®定序平台的DNA&RNA共文庫試劑盒,含有高效的cDNA合成試劑和酵素切試劑。與傳統圖書館相比 建造 方法,本產品可高效完成cDNA合成及DNA&RNA文庫構建 建造 該試劑盒含有用於 DNA 片段化的高品質酶,並將 DNA 片段化、末端修復和 dA 加尾結合為一個步驟,大大減少了文庫製備的時間和成本。 此文庫製備試劑盒具有優異的文庫轉化率,適用於所有常見的動物、植物、微生物等樣本,也適用於FFPE樣本。此升級試劑盒採用最新優化的連接酶,大大降低了接頭連接過程中的自連接速率。而且新型高保真聚合酶的引入,進一步提高了擴增的均一性和保真度。
試劑盒提供的所有組件均經過嚴格的品質控制和功能驗證,最大程度保證了建庫的穩定性和可重複性。
規格
貨號 | 12305ES08 / 12305ES24 / 12305ES96 |
尺寸 | 8 T / 24 溫度 / 96 電視 |
成分
不。 | 姓名 | 12305ES08 | 12305ES24 | 12305ES96 | |
12305-A | 隨機引子 | 20 微升 | 60 微升 | 240 微升 | |
12305-B | cDNA 反應緩衝液 | 64 微升 | 192 微升 | 768 微升 | |
12305-C | cDNA 酵素混合物 | 16 微升 | 四十八 微升 | 192 微升 | |
12305-D | 塗抹酵素緩衝液 | 80 μL | 240 微升 | 960 μL | |
12305-E | 塗抹酵素混合物 | 40 微升 | 120 微升 | 480 微升 | |
12305-F | 連接增強劑 | 240 微升 | 720 微升 | 2×1440μL | |
12305-G | 小說 T4 DNA連接酶 | 40 微升 | 120 微升 | 480 微升 | |
12305-H | 2×超級卡尼斯® II 高保真混音 | 200 μL | 600 μL | 2×1200μL | |
* | 引子混合物* | 40 微升 | 120 微升 | 480 微升 |
筆記: * 表示該試劑不包含在該試劑盒中,需要額外添加試劑。 是 相容雙平台 伊路明納®麥基爾®,但額外的引子混合物(CAT # 13334 MGI 引子混合物® 和 Cat# 13335 Illumina 引子混合物®) 是必須的。
工作流程:
貯存
本品應儲存於-25~-15℃ 1 年。
筆記
關於手術
- 1.為了您的安全,請穿著工作服,戴上一次性手套操作。
- 在室溫下解凍組件。解凍後,渦旋充分混合,短暫旋轉管子並將它們放在冰上以供日後使用。
- 建議在帶有加熱蓋的熱循環儀中執行每個反應步驟。使用前應將熱循環儀預熱至設定溫度。
- 請使用不含RNase的耗材污染。 經常。 ThermoFisher 的 RNAZap商標 建議使用高效能核酸去除噴霧去除RNase污染。
- 操作不當容易造成氣溶膠污染,影響結果的準確性。建議強制物理隔離 PCR 反應混合區域和 PCR 產物純化檢測區域。附有建庫專用移液器等設備。
- 6.本產品僅供研究使用。
接頭連接
- Illumina或MGI長適配器(Barcoded Adapter)套件和短適配器套件可供客戶根據實驗需求進行選擇。
- 建議選擇高品質的商業適配器。若選擇自製接頭,請委託有NGS引子合成經驗的公司,並註明需要嚴格控制污染。此外,建議在潔淨工作台中製備DNA退火溶液,每次只操作一種轉接器,以防止交叉污染。
- 請在冰上或 4°C 下解凍適配器;室溫操作時,實驗室溫度不應超過25°C,以防止適配器變性。
- 接頭的濃度直接影響連接效率和文庫產量。試劑盒中添加的適配器體積固定為5μl。建議使用0.1×TE緩衝液稀釋接頭,稀釋後可在4°C保存48小時。桌子1 列出了針對不同量 RNA 輸入的建議接頭數量。
表 1-1 推薦的 Illumina® 不同輸入的適配器數量 DNA和RNA
輸入總計 脫氧核糖核酸&核糖核酸 | 伊路明納® 適配器庫存濃度 |
<10 納克 | 3 μM |
≥10納克 | 15 μM |
表 1-2 推薦的 MGI® 不同輸入的適配器數量 DNA和RNA
輸入總計 DNA和RNA | 麥格達® 適配器庫存濃度 |
<10 納克 | 5 μM |
≥10納克 | 10 μM |
*可依Total RNA樣本類型及投入量調整Adapter的使用。
文庫擴增
應嚴格控制擴增循環數。擴增不充分可能導致文庫產量低;過度擴增可能會引入增加的偏差、錯誤、重複讀取和嵌合產物。桌子 2 列出了針對 1 μg 文庫產量的建議循環數。
桌子 2 建議產生 DNA&RNA 文庫的循環次數 *
輸入總DNA和RNA | 循環次數 |
<1 納克 | 10~12 |
1 納克 | 9~10 |
10 納克 | 6~7 |
50 納克 | 4~5 |
100~1000 毫微克 | 4 |
註:*文庫產量不僅與投入量、擴增循環數有關,也受樣本品質、破碎條件、分選條件等影響。在建庫過程中,依照實際情況選擇最適合的條件。
基於珠子的 DNA 清理和尺寸選擇
- 1.文庫建置過程中有多個步驟需要DNA純化磁珠。我們推薦 Hieff NGS™ DNA 選擇珠(
Yeasen 使用 AMPure® XP 磁珠 (Beckman Cat#A63880) 進行 DNA 純化和尺寸選擇。 - 2.磁珠使用前需先在室溫下平衡,否則會降低產量並影響大小選擇效果。
- 3.使用前應將磁珠以渦旋或移液管吹打混合均勻。
- 4.轉移上清液時請勿吸出珠子,即使是微量的珠子也可能影響接下來的反應。
- 5.80%乙醇應新鮮配製,否則影響回收效率。
- 6.洗脫產品前,磁珠應在室溫下乾燥。乾燥不夠容易造成乙醇殘留影響後續反應;過度乾燥會導致磁珠破裂,降低純化產率。通常情況下,在室溫下乾燥 3-5 分鐘就足以讓珠子完全乾燥。
- 7.如果需要,將純化或大小選擇的 DNA 樣本洗脫於1× TE 緩衝液可在 4°C 下保存 1-2 週,或在 -20°C 下保存一個月。
圖書館品質分析
- 通常透過測量濃度和尺寸分佈來分析所建構的文庫品質。
- 可以透過基於螢光的方法(例如 Qubit 和 PicoGreen 或 qPCR)測量文庫濃度。
- 不建議使用基於吸光度的定量方法,例如 NanoDrop。
- 建議使用 qPCR 方法進行文庫定量:基於螢光的方法(例如 Qubit 和 PicoGreen)無法區分不完整的 dsDNA 結構(沒有接頭的插入片段或僅有一端連接接頭的插入片段)和完整的文庫。 qPCR方法只會擴增和測量兩端都連接有接頭的完整文庫(可定序文庫),從而為載入提供更準確的測量。
- 可以使用 Agilent Bioanalyzer 或其他基於毛細管電泳或微流體原理的設備來分析文庫的大小分佈。
其他材料
- 1.DNA純化磁珠:Hieff NGS™ DNA Selection Beads(
Yeasen 目錄號 12601) 或 AMPure®XP Beads(A63880)或其他同等產品。
2.適配器:Illumina 完整適配器(
- 文庫品質分析:Agilent 2100 Bioanalyzer DNA 1000 Chip/High Sensitivity Chip或其他同等產品;文庫定量試劑。
- 其他材料:無水乙醇,無菌超純水,低保留移液管吸頭,PCR管,磁力架,熱循環儀等。
文件:
12305ES-Hieff NGS® DNA&RNA 文庫共製備試劑盒 V2.pdf
付款和安全
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常問問題
本產品僅用於研究目的,不用於人類或動物的治療或診斷用途。產品和內容受以下公司的專利、商標和版權保護:
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