描述
珠蛋白 mRNA 消耗探針(人類) 旨在去除人類珠蛋白mRNA。可有效去除成人、嬰兒和胚胎中的珠蛋白mRNA網卡 來源,包括 HBA1/2、HBB、HBD、HBM、HBG1/2、HBE1、HBQ1 和 HBZ。本產品與 Hieff NGS 搭配使用商標 MaxUp rRNA 耗竭試劑盒(人類/小鼠/大鼠)(
產品應用
適用於100 ng~1 μg人類總RNA樣本, 小鼠和大鼠血液資源,以及完整或部分降解的 RNA 樣本。
產品組件
產品名稱 | 規格 | |
珠蛋白探針(人類) | 12806ES24 | 24 T |
12806ES96 | 96噸 |
運輸和儲存
所有組件均採用乾冰運輸,可在-20°C 下保存一年。
數位
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總共500ng和100ng人體血液總RNA分別經過rRNA移除和合併rRNA和珠蛋白移除。建庫並定序後比較Globin mRNA含量。
注意事項
1. 請使用不含RNase污染的耗材,並定期清潔實驗區域。建議使用ThermoFisher的RNAZap商標 高效能核酸去除噴霧,去除RNase污染。
2. RNA 樣本應不含基因組 DNA 污染。如果樣本中殘留 gDNA,則應先用 DNase I 消化,然後純化後再使用。
3. RNA樣本最大輸入量為10μL。若樣本量較大,可以先濃縮。
4. 為了您的安全和健康,操作時請穿著工作服和戴上一次性手套。
5. 僅供研究使用!
指示
1. 探針與 RNA 雜交
1.1 使用無核酸酶水將 10 ng–1 μg 總 RNA 稀釋至 PCR 管中的最終體積為 10 μL。保留 RNA 在冰上。
1.2 集合 以下RNA/探針雜交反應 在冰上 根據表1。
表1 RNA/探針雜交反應
成分 | 容量 (μL) |
雜交緩衝液 | 3 |
探針混合物(身高/體重/R) | 1 |
珠蛋白探針(人類) | 1 |
總 RNA | 10(100 奈克~1 微克) |
全部的 | 15 |
1.3 輕輕上下吹打至少 10 次,徹底混合。將管子放入微量離心機短暫旋轉,以收集管子側面的液體。
1.4 將管子放入熱循環儀中並執行表 2 中的以下程序,將加熱蓋設定為 105°C。
表2 RNA/探針雜交反應程序
溫度 | 期間 |
熱蓋 105°C | 在 |
95°C | 2 分鐘 |
95℃至22℃ | 0.1℃/秒 |
22°攝氏度 | 5 分鐘 |
4°C | 抓住 |
2. RNase H 消化
2.1 組裝以下 RNase H 消化反應 在冰上 根據表3。
表3 RNase H消化反應
成分 | 容量 (μL) |
RNase H緩衝液 | 3 |
核糖核酸酶H | 2 |
雜交 RNA(步驟 1.4) | 15 |
全部的 | 20 |
2.2 輕輕上下吹打至少 10 次,以徹底混合。將管子放入微量離心機短暫旋轉,以收集管子側面的液體。
2.3 將管子放入熱循環儀中並執行以下程序: 蓋子 50°C; 37°C,30分鐘; 4°C,保持。
3. 去氧核糖核酸酶 我 消化
3.1 依表4在冰上配製下列DNase I消化反應。
表4 DNase Ⅰ酶切反應
成分 | 容量 (μL) |
DNase I 緩衝液 | 27.5 |
脫氧核糖核酸酶 | 2.5 |
RNase H 處理的 RNA(步驟 2.3) | 20 |
全部的 | 50 |
3.2 輕輕上下吹打至少 10 次,徹底混合。將管子放入微量離心機短暫旋轉,以收集管子側面的液體。
3.3 將管子放入熱循環儀中並執行以下程序: 蓋子打開; 37°C,30分鐘; 4°C,保持。
4. RNA 純化
4.1 平衡 Hieff NGS商標將 RNA 清潔劑(Cat#12602)恢復至室溫,並在使用前以渦旋徹底重新懸浮珠子。
4.2 添加 110 µL(2.2×) 將珠子加入步驟 3.3 的 RNA 溶液中,透過上下移液至少 10 次徹底混合。
4.3 室溫孵育 5 分鐘,使 RNA 與珠子結合。
4.4 將管子放在磁力架上,將磁珠與上清液分離。 當溶液變清澈時(約 3 分鐘),棄去上清液。注意不要讓移液器尖頭碰到珠子。
4.5 將管子放在磁力架上。 將 200 µL 新鮮製備的 80% 乙醇加入管中。室溫下孵育 30 秒,然後棄去上清液。注意不要讓移液器尖頭碰到珠子。
4.6 重複步驟 4.5 一次,總共清洗兩次。
4.7 用 10 µL 去除殘留乙醇 - 移液管吸頭。 將管子放在磁力架上,打開蓋子,讓珠子風乾長達 5 分鐘。
4.8 從磁力架上取出管子。加入 11 μL 無核酸酶水,從珠子中洗脫 RNA。透過上下吹打至少 10 次來徹底混合,並短暫旋轉試管。
4.9 室溫下孵育 5 分鐘。將管子放在磁力架上,直到溶液變清澈(約 3 分鐘)。
4.10 將10 μL上清液轉移至無核酸酶管。
注意:如果需要在此時停止,樣品可以儲存在–80°C 下。
付款和安全
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