描述
MycAway™ 支原體 qPCR 檢測試劑盒是一種用於定性檢測各種來源中的支原體污染的產品,包括原料、細胞庫、病毒種子、病毒或細胞收穫溶液以及用於臨床治療的細胞等。本試劑盒利用Taqman螢光探針(FAM和VIC),以多重聚合酶鍊式反應(PCR)技術分別檢測目標基因和內控基因。其特異性、檢測極限和穩健性已根據 EP <2.6.7> 標準進行了驗證,顯示出高靈敏度、特異性、效率和安全性。檢測極限等於或低於10 CFU/mL。
對於核酸萃取,本產品可與採用手動萃取方法的 MolPure® 磁性殘留 DNA 樣本製備試劑盒(Cat#18461)搭配使用。或者,可以使用 AutoPure 32A 自動核酸萃取儀(Cat#80501)和 MolPure® Mag32 殘留 DNA 樣本製備試劑盒 FA(Cat#18462)自動萃取樣本中的核酸。值得注意的是,含有 Cat#18461 和 Cat#40619 的套件已經經過全面驗證;如需詳細的驗證信息,請聯繫我們的技術支援。將樣本進行預處理,去除乾擾雜質,取得純化的核酸後,利用Real-Time PCR放大器進行qPCR反應,並收集和分析探針的螢光訊號。
貨號 | 40619ES25 / 40619ES60 |
尺寸 | 二十五 噸 / 100 噸 |
偵測 限制 | 10 菌落形成單位/毫升 |
探測 方法 | 定量PCR 方法 (塔克曼 螢光 |
期間 | 4 小時 |
螢光 探測 | 法姆 (目標 通道);VIC (內部的 頻道) |
覆蓋 支原體 | ≥ 100 |
驗證 | 已驗證 根據 到 EP <2.6.7> |
成分
零件編號 | 姓名 | 40619ES25 | 40619ES60 |
40619-A | 4×MyqPCR反應緩衝液 | 250 微升 | 1 毫升 |
40619-B | MyPrimer 與探針 混合 | 二十五 微升 | 100 微升 |
40619-C* | 內部控制(IC) | 二十五 微升 | 100 微升 |
40619-D** | 陽性對照 (PC) | 500 微升 | 2 毫升 |
40619-E*** | DNA稀釋 緩衝 | 1 毫升 | 4×1毫升 |
40619-F**** | 超純水 | 500 微升 | 2×1毫升 |
*IC:內部 控制;
**PCS:正 控制 解決方案 ,這 專注 是 1,000 份/µL。
***去氧核糖核酸 稀釋 緩衝區:已使用 為了 我知道了 稀釋 和 這 範本 的 負溫度係數 (NTC) 和 NCS。
****超純 水:已使用 為了 這 準備 的 定量PCR 混合。
貯存
本產品應儲存於-25~-15℃,儲存期為2年。
*收到套件後,請檢查所有零件是否齊全,並立即存放在-25~-15℃ 如果不滿足條件,則立即進行檢測。請注意,40619-B 應避光保存。
指示
- 實驗前準備
1) 準備好實驗所需的試劑和材料。
2)確認適用性 qPCR 儀器
該試劑盒可在以下類型的qPCR儀器上使用:
- Bio-Rad:CFX96
- Thermo Scientific:7500即時PCR系統;QuantStudio™5;
- 實驗方法
1) DNA萃取
我們建議使用 ‘ 磁性殘留 DNA 樣本製備試劑盒' (目錄號 18461ES 手動提取和 貨號:18462ES 自動提取) DNA萃取, 你 能 訪問 ‘ http://www.yeasenbiotech.com ‘ 為了 這
詳細資訊和購買。
此套件(Cat#40619ES)包含內部控制(IC)。如果在 DNA 萃取之前將 IC 添加到樣本中,則可以驗證完整的過程(包括 DNA 萃取和 qPCR 反應)。如果將 IC 加入 qPCR 主混合物中
直接地, IC 僅作為 qPCR 控制。
2)qPCR Mix 製備
- 根據樣本量,包括陽性對照(PCS)、無模板對照(NTC)、陰性對照 對照溶液(NCS)和測試樣品(TS)來計算反應次數。平行準備 2 反應
一般情況下每個樣本都是這樣的。
* PCS:正極 控制 溶液;NTC:無 範本 對照;NCS:陰性 控制 解決方案;TS:測試 樣本。那裡 是 不 需要 到 執行
這 樣本 萃取 為了 件 和 NTC,但 國家電腦系統公司 和 TS 是 需要。
反應孔(M1)=(1×NCS + (N×TS) ×2
反應孔(M2)=(1×PCS + 1×NTC) ×2
反應孔(M3)=(1×PCS + 1×NTC+ N×TS) ×2
- 根據實驗設計和下表,在冰上預解凍所需量的試劑。
- 根據反應次數計算 qPCR Mix 的量。請注意,如果該試劑盒將用於產品發布等GMP活動,我們建議使用表1和表2進行製備;如果 該套件將 只是 用於研究,且在評估後提取前無需添加IC,則按照表3進行
準備。請注意,並非所有 M1、M2 和 M3 是 需要 是 準備。
成分 | 反應體積(1×40μL) | 容積(M1×40μL) |
4× MyqPCR 反應緩衝液 | 10 微升 | (M1+2) ×10 微升 |
MyPrimer 與探針 混合 | 1 微升 | (M1+2) ×1 微升 |
氧化還原酶 | 0.8 微升/0 μL** | (M1+2) ×0.8 微升/0 微升 |
純水 | 最多 20 微升 | 最多 (M1+2) ×20 微升 |
全部的 | 20 微升 | (M1+2) ×20 微升 |
表 1 M1 的 qPCR Mix 體系
*這 配置 系統 在 桌子 1 是 基於 在 這 前提 那 我知道了 是 額外 前 萃取 為了 兩個都 國家電腦系統公司 和 TS,所以 它 是 不是 必要的
到 添加 我知道了 什麼時候 定量PCR 混合 準備。我知道了 添加 方法 前 萃取: 首先,稀釋 我知道了 經過 20次 和 脫氧核糖核酸 稀釋劑,以及 添加 1微升
稀 我知道了 進入 每個 100μL 測試 樣本 為了 這 更遠 萃取。
**這 成套工具 做 不是 包含 氧化還原酶 參考 染料。 如果 氧化還原酶 參考 染料 是 需要 為了 這 真實的 時間 聚合酶連鎖反應 擴大機 那 你 是 現在 使用, 50×ROX 參考 染料 (貨號:10200ES)是 受到推崇的 為了 使用。 在 這 案件 額外 體積 是 0.8μL, 作為 顯示 在 桌子 1. 如果 使用 其他
品牌 的 氧化還原酶 產品,請 參考 到 他們的 指示 為了 氧化還原酶 添加。如果 不 氧化還原酶 參考 染料 是 需要, 額外 體積 是 0 μL。
成分 | 反應體積(1×40μL) | 容積(M2×40μL) |
4× MyqPCR 反應緩衝液 | 10 微升 | (M2+2) ×10 微升 |
MyPrimer 與探針 混合 | 1 微升 | (M2+2) ×1 微升 |
內部控制(IC) | 1 μL* | (M2+2) ×1 微升/0 微升 |
氧化還原酶 | 0.8 微升/0 μL** | (M2+2) ×0.8 微升/0 微升 |
純化 水 | 最多 20 微升 | 最多 (M2+2) ×20 微升 |
全部的 | 20 微升 | (M2+2) ×20 微升 |
表 2 M2 的 qPCR Mix 體系
*這 配置 系統 在 桌子 2 是 基於 在 這 前提 那 我知道了 是 不是 額外 在 件 和 負溫度係數 (NTC) 前 萃取, 所以 我知道了 需求 到 是 額外 期間 定量PCR 混合 準備。我知道了 添加 方法 後 萃取: 稀 我知道了 經過 100次 和 脫氧核糖核酸 沖淡 和 添加 1微升 稀 我知道了 進入
每個 定量PCR 混合 系統。
**這 成套工具 做 不是 包含 氧化還原酶 參考 染料。 如果 氧化還原酶 參考 染料 是 需要 為了 這 真實的 時間 聚合酶連鎖反應 擴大機 那 你 是 現在 使用, 50×ROX 參考 染料 (貨號:10200ES)是 受到推崇的 為了 使用。 在 這 案件 額外 體積 是 0.8μL, 作為 顯示 在 桌子 1. 如果 使用 其他
品牌 的 氧化還原酶 產品,請 參考 到 他們的 指示 為了 氧化還原酶 添加。如果 不 氧化還原酶 參考 染料 是 需要, 額外 體積 是 0 μL。
成分 | 反應體積(1×40μL) | 容積(M3×40μL) |
4× MyqPCR 反應緩衝液 | 10 微升 | (M3+2) ×10 微升 |
MyPrimer 與探針 混合 | 1 微升 | (M3+2) ×1 微升 |
內部控制(IC) | 1 μL* | (M3+2) ×1 微升/0 微升 |
氧化還原酶 | 0.8 微升/0 μL** | (M3+2) ×0.8 微升/0 微升 |
純化 水 | 最多 20 微升 | 最多 (M3+2) ×20 微升 |
全部的 | 20 微升 | (M3+2) ×20 微升 |
表 3 M3 的 qPCR Mix 體系
*這 配置 系統 在 桌子 3 是 基於 在 這 前提 那 我知道了 是 不是 額外 到 樣品 前 萃取,所以 我知道了 需求 到 是 額外 期間 定量PCR 混合 準備。我知道了 添加 方法 後 萃取: 稀 我知道了 經過 100次 和 脫氧核糖核酸 沖淡 和 添加 1微升 進入 每個 定量PCR 混合
系統。
**這 成套工具 做 不是 包含 氧化還原酶 參考 染料。 如果 氧化還原酶 參考 染料 是 需要 為了 這 真實的 時間 聚合酶連鎖反應 擴大機 那 你 是 現在 使用, 50×ROX 參考 染料 (貨號:10200ES)是 受到推崇的 為了 使用。 在 這 案件 額外 體積 是 0.8μL, 作為 顯示 在 桌子 1. 如果 使用 其他
品牌 的 氧化還原酶 產品,請 參考 到 他們的 指示 為了 氧化還原酶 添加。如果 不 氧化還原酶 參考 染料 是 需要, 額外 體積 是 0 μL。
3)模板添加
- 將 qPCR 混合物充分搖晃,低速離心,並從蓋子中收集殘留液體
到底部 管子。
- 添加 20 μL qPCR Mix 加入到每個反應管/孔中。請注意將相應的 qPCR Mix 添加到每個
樣品管並避免添加錯誤。
- 將模板加入含有 qPCR Mix 的管子/孔中。模板新增見表4。
測試樣本 | 在每個管子或 出色地 … |
TS | 20 μL qPCR 混合物+20 萃取後樣品量 |
負溫度係數 (NTC) | 20 μL qPCR 混合物+20 微升 脫氧核糖核酸 稀釋 緩衝 |
NCS* | 20 μL qPCR 混合物+20 萃取後陰性檢體μL* |
件 | 20 μL qPCR 混合物 +20 μL 正極 控制 |
桌子 4 個模板 添加
*我們建議使用 DNA 稀釋緩衝液 (40619-E) 作為 NCS 模板進行 DNA 萃取。
**這 全部的 反應 體積 在 每個 管/孔 是 40 μL。
***覆蓋 這 管子 蓋 或者 這 盤子 電影。到 避免 影響 這 螢光 訊號 請閱讀 拿 關心 不是 到 標記 這 管子 蓋 或者 電影
或者 甚至 擦 這 電影 反覆 和 一個 刮刀。
****離心機 這 反應 管子 或者 盤子 簡要地 在 低的 速度 後 範本 添加。 後 充足的 搖晃 和 攪拌,重複 離心機
在 低的 速度 到 收集 這 液體 從 這 蓋 或者 牆 到 這 底部。避免 氣泡 什麼時候 手術。這 基線 將要 是 受到影響 如果 這 混合
是 不是 混合 好吧,那麼 這 步 是 非常 重要的 到 一個 好的 實驗 結果。
4)qPCR程序設置
- 程式檔案設定
範例(7500 實時 PCR 系統儀器和實時 PCR 軟體 v2.4):
儀器型號:7500 (96孔板)
實驗類型:定量-標準曲線;
化學:Taqman® 試劑
升溫速度:標準(約 2 小時完成一次運轉)
- 目標頻道設定
在 「定義 目標 和 樣品” 的 「盤子 設定", 創造 一個 目標 1 頻道 (家庭與家庭用品), 選擇 法姆 作為 這 報告 螢光基團和 MGB 或 沒有任何 作為淬火 螢光 團體。 創造 一個 目標 2 頻道 (維多利亞州), 選擇 這 報告 螢光 團體 作為 維多利亞州 和 這 淬火 螢光 團體 作為 沒有任何。 在 「分配 目標 和 樣品” 的 「盤子 設定", 如果 不 額外的 氧化還原酶 染料 是 已添加,選擇 “沒有任何”; 如果 額外的 氧化還原酶 是 已添加,選擇
韓氏。
- 標準擴增程序設定
序號 | 反應階段 | 溫度 | 時間 | 週期 |
1 | 初始變性 | 95℃ | 5 分分鐘 | 1 |
2 | 變性 | 95℃ | 15 秒 |
四十五 |
3 | 退火/延伸 (螢光訊號擷取) |
62℃ |
30 秒 |
表5 標準擴增程序設置
- 基線和閾值設定:
原則 的 基線 調整: 使用 這 自動的 基線 一般來說。 如果 需要 到 調整 在 手動的, 選擇 這 循環 在指數成長之前 週期作為起始週期,避開波動區 最初的 螢光 收藏。選擇最早出現指數擴增的樣本Ct值前1-2個循環作為
終點。
原則 的 臨界點 調整:一般採用自動閾值。如需手動調整,閾值 應該 是 放 更高 比 這 消極的 樣本 或者 這 基線 噪音, 它是 一般來說 放 門檻 在 這 晚的
階段 每個隧道需要指數放大、相對獨立、適當的閾值。
5) 結果 分析
- PCS、NTC、NCS的結果判斷:
若添加IC:每個控製樣品的規格應為 滿足表6:
對照樣品 | 法姆 訊號 | VIC 訊號 |
件 | 冠狀動脈 < 40,且有明顯的擴增曲線 | 冠狀動脈 < 40且有明顯的擴增曲線 |
負溫度係數 (NTC) | 冠狀動脈 ≥ 40 或無明顯擴增曲線 | 冠狀動脈 < 40且有明顯的擴增曲線 |
國家電腦系統公司 | 冠狀動脈 ≥ 40 或無明顯擴增曲線 | 冠狀動脈 < 40且有明顯的擴增曲線 |
桌子 6 結果 判斷 的 封裝, 負溫度係數 和 國家電腦系統公司
若未添加IC:每個品管樣品均應符合表6中FAM訊號欄的規定,且
需要分析 VIC 通道。
- TS結果判斷
先決條件: 它 是 是否需要確定 件, NTC 和 國家電腦系統公司 通過了規範 在表格中 6 TS 之前 結果分析。 如果通過,則可以 繼續 下一步。 如果不 已通過, 這 TS 結果 可能 不是 是 可靠的, 和
需要調查原因。
如果新增IC:找到相應結果 根據FAM的結果資訊進行判斷,並 維多利亞州 表7中:
法姆 訊號 | VIC 訊號 | 結果 判斷 |
Ct<40且有明顯 擴增曲線 | Ct<40且擴增曲線明顯 | 積極的 |
Ct≥40或無明顯擴增曲線 | 存在抑制, 實驗需要重複 | |
Ct≥40或無明顯 擴增曲線 | Ct<40且擴增曲線明顯 | 消極的 |
Ct≥40或無明顯擴增曲線 | 存在抑制, 實驗需要重複 |
桌子 7:結果 判斷 的 TS (我知道了 額外)
*如果 那裡 是 抑制 為了 維多利亞州 信號、治療 是 需要 到 排除 這 抑制劑 或者 重複 這 測試。
若未新增IC:尋找對應結果 根據判斷 FAM結果資訊見表8 ,並且不需要分析 VIC 訊號。
FAM 訊號 | 結果 判斷 |
Ct<40且擴增曲線明顯 | 積極的 |
Ct≥40或無明顯擴增曲線 | 消極的 |
桌子 8:結果 判斷 的 TS (我知道了 不是 額外)
筆記
- 在使用該套件之前,請仔細閱讀本手冊。實驗應以標準化的方式進行,包括樣品的處理、反應體系的製備和樣品的添加。
- 盡可能在冰上進行樣品添加和試劑製備作業。
- 使用前,請將每種試劑旋渦並混勻。
- 請穿戴工作服和一次性手套進行操作, 您的安全。
- 本產品僅供研究使用。
[1] 趙鋒, 王鑫, 李燕, 陳曉, 耿哲, 張聰.飼糧中添加表沒食子兒茶素沒食子酸酯對急性熱應激肉雞肉品質和肌肉抗氧化能力的影響。動物(巴塞爾)。 2021;11(11):3296。出版日期:2021 年 11 月 18 日。
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