描述
維羅 宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒用於各類生物製品中間樣本、半成品及成品中Vero宿主細胞DNA殘留量的定量分析。
本試劑盒採用Taqman螢光探針及聚合酶鍊式反應(PCR)方法,具有fg級最低檢測限,可特異且快速地檢測出殘留的Vero細胞DNA。此試劑盒需與殘留DNA樣本製備試劑盒(Cat#18461ES)一起使用。
產品 成分
不。 | 姓名 | 41307ES50 | 41307ES60 |
41307-A | Vero qPCR 混合物 | 0.75 毫升 | 1.5 毫升 |
41307-B | Vero 引子和探針混合物 | 200 μL | 400 μL |
41307-C | DNA稀釋緩衝液 | 1.8毫升×2 | 1.8毫升×4 |
41307-D | Vero DNA對照(30 ng/μL) | 25 微升 | 50 μL |
41307-E | 我知道了* | 50 μL | 100 μL |
*IC:內部控制
運輸和儲存
1. 使用乾冰運輸 並儲存於-20°C 2 人份 年
2. 收到貨後,請立即檢查並存放於相應的儲存溫度。
注意事項
1. 使用該試劑前請仔細閱讀本說明書,實驗應規範化,包括樣品處理、反應體系製備及樣品的添加。
2. 最好在冰上添加樣品和製備溶液。
3. 確保每個組分在使用前都充分渦旋並以低速離心。
4. 為了您的安全和健康,操作時請穿著工作服和戴上一次性手套。
5. 本產品僅供研究使用!
適用儀器型號
包括但不限於:
Bio-Rad: CFX96光學模組。
熱電科技: ABI 7500; ABI Quant Studio 5; ABI 步驟 OnePlus。
使用說明
1. 維羅 DNA標準稀釋及標準曲線製作
維羅 使用試劑盒中提供的 DNA 稀釋緩衝液對 DNA 對照組進行梯度稀釋, 稀釋濃度分別為300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL、30 fg/μL、3 平均每克
請參閱下面的詳細說明:
1.1 解凍 維羅 DNA 對照和 DNA 稀釋緩衝液置於冰上。 完全解凍後,輕輕渦旋混勻,以低速離心 10 秒。
1.2 取出六個 乾淨的1.5 mL試管,標示3 ng/μL、①、②、③、④、⑤、⑥。
1.3 加入90 μL DNA稀釋緩衝液和10 μL Vero DNA 控制 到 1.5 mL 微量離心管,標示為 3 ng/μL,稀釋至 3 納克/μL。混合後離心 10 秒鐘。將稀釋的DNA標準品分裝後,可在-80℃短期保存(不超過3個月),請避免反覆凍融。
1.4 將 90 μL DNA 稀釋緩衝液加入其他 管,然後按照以下步驟進行連續稀釋。
管子 | 稀釋 比率 | 標準濃度 |
① | 10 μL 3 ng/μL+90 μL DNA 稀釋液 緩衝 | 300 皮克/微升 |
② | 10 μL ①+90 μL DNA稀釋液 緩衝 | 30 皮克/微升 |
③ | 10 μL ②+90 μL DNA稀釋液 緩衝 | 3皮克/微升 |
④ | 10 μL③+90 μL DNA稀釋液 緩衝 | 300 微克/微升 |
⑤ | 10 μL ④+90 μL DNA稀釋液 緩衝 | 30 微克/微升 |
⑥ | 10 μL ⑤+90 μL DNA稀釋液 緩衝 | 3 克/微升 |
[筆記]:
1. 每個濃度需要三個重複孔。檢測範圍為 3 微克/微升~300皮克/微升 和 如果需要的話,可以擴大該範圍。
2. 為了減少重複凍融的次數,避免污染,建議將 DNA 對照組儲存在 首次在-80°C 下分裝。
3. 解凍後,DNA稀釋緩衝液可以 儲存於2-8°C 保存期限為7天,如長期不使用,請存放於-20°C。
4. 確保模板完全混合,輕輕搖晃混合物 15 秒至 1 分鐘 對於每個梯度稀釋。
2. 提取回收控制 (ERC) 準備
設定濃度 維羅 ERC 中的 DNA 根據需要(ERC 樣本 (以3 pg/μL DNA為例)製備如下:
2.1 將100 μL測試樣本加入乾淨的1.5 mL管中,然後加入10 μL 3pg/μL Vero DNA Standard(③),混勻,標記為ERC。
2.2 進行 ERC 樣本的 DNA 萃取 與測試樣品一起製備純化的 ERC 樣本。
3. 陽性對照樣本 (PCS) 製備(可選)
設定濃度 維羅 PCS 中的 DNA 根據需要(PCS (以3 pg/μL DNA為例)製備如下:
3.1 加入100 μL 3 pg/μL Vero DNA標準品(③) 放入乾淨的1.5 mL 管中,然後標記為 PCS。
3.2 進行 PCS 的 DNA 萃取 與測試樣品一起製備純化的PCS。
4. 消極的 對照溶液 (NCS) 製備
實驗中設定陰性對照,具體操作步驟如下:
4.1 加入 100 μL 將樣本基質(或DNA稀釋緩衝液)倒入乾淨的1.5 mL管中,然後標記為NCS。
4.2 將NCS樣本與檢測樣本同時進行DNA萃取,製備純化的NCS樣本。
5. 無模板對照 (NTC) 製備
設定無模板 實驗中控制,具體操作步驟如下:
5.1 NTC無需樣本預處理,可配置在qPCR檢測殘留DNA含量的階段。
5.2 每管或每孔中NTC樣品20 微升 混合(即 16 微升 Vero qPCR 混合物 + 4 μL Vero 引子和探針混合物)+ 20 μL DNA 稀釋緩衝液。建議配置三個重複孔。
6. PCR反應體系
成分 | 容量(μL) |
維羅 qPCR 混合物 | 16 |
維羅 引子和探針混合物 | 4 |
DNA模板 | 20 |
總體積 | 40 |
[筆記]:
1. 根據反應次數計算PCR反應總體積:qPCR Mix =(反應次數+2)×(16+4)μL(包含兩個反應孔的損失)。建議實驗中每個樣品重複三次以上。
2. 蓋上管蓋或封上板後,將反應管或板以低速離心 10 秒鐘。充分搖晃和混合 5 秒鐘後,重複離心,以收集從蓋子或壁到底部的液體。操作過程中避免產生氣泡。
請參閱下表以了解建議的板材設定:
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
一個 | 負溫度係數 (NTC) |
| 性病 1 | 性病 1 | 性病 1 |
| TS 1 | TS 1 | TS 1 |
乙 | 負溫度係數 (NTC) |
| 性病 2 | 性病 2 | 性病 2 |
| TS 2 | TS 2 | TS 2 |
碳 | 負溫度係數 (NTC) |
| 性病 3 | 性病 3 | 性病 3 |
| TS 3 | TS 3 | TS 3 |
德 | 國家電腦系統公司 |
| 性病 4 | 性病 4 | 性病 4 |
|
|
|
|
埃 | 國家電腦系統公司 |
| 性病 5 | 性病 5 | 性病 5 |
| ERC 1 | ERC 1 | ERC 1 |
弗 | 國家電腦系統公司 |
| 性病 6 | 性病 6 | 性病 6 |
| ERC 2 | ERC 2 | ERC 2 |
格 |
|
|
|
|
|
| ERC 3 | ERC 3 | ERC 3 |
赫 |
|
|
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|
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| 件 | 件 | 件 |
板塊佈局包括:1 NTC(無 範本 對照)1 國家電腦系統公司 (陰性對照 解決方案), 6 STD(6 個 標準濃度),3 TS(測試樣本),3 ERC(萃取回收對照),1 PCS(陽性對照樣本)。每個樣品設三個重複孔。
7. PCR 儀器設定指南 (兩步法)
以下說明僅適用於 Thermo ABI 7500 qPCR 儀器 (軟體版本2.0)。如果您使用不同的儀器,請參閱適用的儀器指南以取得設定指南。
7.1 建立新實驗,選擇絕對定量或使用者自訂的範本。
7.2 在“Define”介面的“Targets”窗格中,新增一個目標並命名為FAM,選擇報告基因為“FAM”,猝滅劑為“none”。
7.3 在‘Samples’窗格中,依序加入所有樣本的資訊。然後選擇孔,相應地選擇目標和樣本。設定Vero的任務 DNA標準為標準,並賦值300000、30000、3000、300、30、3 (每孔DNA濃度單位為fg/μL)在Quantity欄中填寫,並將各孔命名為STD 1、STD 2、STD 3、STD 4、STD 5、 相應地,STD 6。設定NTC的任務為NTC。設定NCS、TS、ERC 和 PCS 為未知,並根據上面的板塊佈局進行相應命名。然後點擊下一步。
7.4設定擴增程序:設定反應體積為40 μL。
循環步驟 | 溫度(℃) | 時間 | 週期 |
初始變性 | 95 | 10 分鐘 | 1 |
變性 | 95 | 15 秒 | 40 |
退火/延伸 (螢光採集) | 60 | 30 秒 |
8. qPCR 結果分析
8.1 在分析的擴增圖面板中,系統會自動給出閾值。有時系統給出的Threshold太接近基線,導致重複孔之間的Ct差異很大。您可以手動調整閾值到合適的位置,然後按一下分析。然後可以在Multicomponent Plot中初步檢查擴增曲線是否正常。
8.2 在結果分析標籤中,查看標準曲線圖。驗證斜率、Y 截距、R2 的值 和效率。對於正常標準曲線,R²>0.99; 90%≤有效率%≤110%。
8.3 在 '查看井表' 在分析窗格中,每個樣本的濃度以「定量」顯示,單位為fg/μL,可轉換為pg/μL 或檢測報告中的 pg/mL。
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