描述
膽固醇 宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒用於CHO的定量分析 各類生物製品的中間樣本、半成品、成品中宿主細胞DNA殘留。
本試劑盒採用Taqman螢光探針及聚合酶鍊式反應(PCR)方法,最低檢測極限達fg級,可特異且快速地檢測出血清中CHO殘留量。 細胞 DNA。此試劑盒需與殘留DNA樣本製備試劑盒(Cat#18461ES)一起使用。
產品 成分
不。 | 姓名 | 41332ES50 (50噸) | 41332ES60 (100噸) |
41332-A | 膽固醇 定量PCR 混合 | 0.75 毫升 | 1.5 毫升 |
41332-B | 膽固醇 引子和探針 混合 | 250 微升 | 500 μL |
41332-C | DNA稀釋 緩衝 | 2×1.8 毫升 | 4×1.8 毫升 |
41332-D | 膽固醇 DNA 控制 (30 奈克/微升) | 25 微升 | 50 μL |
運輸和儲存
1. 使用乾冰運輸 並儲存於-20°C 2 人份 年
本產品儲存於-25~-15℃,保質期為2年。
41332-A 和 41332-B 均應避光保存。
適用儀器型號
包括但不限於:
Bio-Rad:CFX96 光學模組。
賽默飛世爾科技:ABI 7500; ABI Quant Studio 5。
指示
- 膽固醇 DNA標準稀釋及標準曲線製作
CHO 使用試劑盒中提供的 DNA 稀釋緩衝液對 DNA 對照組進行梯度稀釋*以及稀釋
濃度為3ng/μL、300pg/μL、30pg/μL、3pg/μL、300fg/μL、30fg/μL、3fg/μL。
請參閱下面的詳細說明:
- 在冰上解凍 CHO DNA 對照和 DNA 稀釋緩衝液。完全解凍後,輕輕渦旋混勻,以低速離心 10 秒。
- 取出七隻乾淨的 1.5 mL 試管,分別標示為 Std0、Std1、Std2、Std3、Std4、Std5、Std6。
- 將90 μL DNA稀釋緩衝液和10 μL CHODNA對照加入標記為Std0的1.5 mL微量離心管中,即 稀釋至 3 ng/μL。混合後離心 10 秒鐘。將稀釋後的DNA標準品分裝,可在-25~-15℃短期保存(不超過3個月)**.請避免反覆凍融。
- 將 90 μL DNA 稀釋緩衝液加入其他管中***,然後按照以下步驟進行連續稀釋****。
管子 | 稀釋比例 | 標準濃度 |
標準1 | 10 μL Std0 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 300 皮克/微升 |
標準2 | 10 μL 標準 1 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 三十 皮克/微升 |
標準3 | 10 μL Std2 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 3 皮克/微升 |
標準4 | 10 μL Std3 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 300 克/微升 |
標準5 | 10 μL Std4 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 三十 克/微升 |
標準6 | 10 μL 標準5 + 90 μL DNA 稀釋緩衝液 | 3 克/微升 |
表1 標準梯度稀釋
*每個濃度需設定3個複孔,偵測範圍為3 fg/μL~300pg/μL,且可擴大範圍。
**為了減少重複凍融次數及避免污染,建議首次將DNA對照分裝於-25~-15℃保存。
***DNA稀釋緩衝液解凍後可在2-8°C保存7天,若長期不使用,請保存於-25~-15℃。
****確保模板完全混合,每個梯度稀釋時輕輕搖晃混合物 15 秒至 1 分鐘。
- 提取回收控制 (ERC) 準備
依需求設定ERC中CHO DNA的濃度(ERC樣品製備30 pg CHO DNA為例),如下:
- 取100 μL檢測樣本於一個乾淨的1.5 mL管中,加入10 μL 3pg/μL CHO DNA Standard(Std3),混勻,標示為ERC。
- 將ERC樣本的DNA萃取與測試樣本一起進行,製備純化的ERC樣本。
- 陰性對照溶液 (NCS) 製備
實驗中設定陰性對照,具體操作步驟如下:
1) 將100 μL樣品基質(或DNA稀釋緩衝液)加入一個乾淨的1.5 mL管中,然後標記為NCS。
2) 將NCS樣本的DNA萃取與檢測樣本同時進行,製備純化的NCS樣本。
- 無模板對照 (NTC) 製備
實驗中設置無模板對照,具體操作步驟如下:
1) NTC不需要樣本預處理,可以在qPCR檢測殘留DNA的階段進行配置。
2) 每個管或孔中的NTC樣品為20 μL Mix(即15 μL CHO qPCR Mix + 4 μL CHO Primer&probe Mix + 1 μL IC)+ 10 μL DNA Dilution Buffer。建議配置三個重複孔。
- PCR反應體系
成分 | 容量(μL) |
膽固醇 qPCR 混合物* | 15 |
膽固醇 引子和探針混合物 | 5 |
DNA模板 | 10 |
總體積** | 三十 |
表2 反應體系
*根據反應次數計算PCR反應總體積:qPCR Mix=(反應次數+2)×(15+4+1)μL(包含兩個反應孔的損失)。建議實驗中每個樣品重複三次以上。
**蓋上管蓋或封上板後,將反應管或板以低速離心 10 秒鐘。充分搖晃和混合 5 秒鐘後,重複離心,以收集從蓋子或壁到底部的液體。操作過程中避免產生氣泡。
請參閱下表以了解建議的板材設定:
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
一個 | 負溫度係數 (NTC) |
| TS 1 | TS 1 | TS 1 |
| 標準 1 | 標準 1 | 標準 1 |
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乙 | 負溫度係數 (NTC) |
| TS 2 | TS 2 | TS 2 |
| 標準 2 | 標準 2 | 標準 2 |
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碳 | 負溫度係數 (NTC) |
| TS 3 | TS 3 | TS 3 |
| 標準 3 | 標準 3 | 標準 3 |
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德 |
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| 標準 4 | 標準 4 | 標準 4 |
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埃 | 國家電腦系統公司 |
| ERC 1 | ERC 1 | ERC 1 |
| 標準 5 | 標準 5 | 標準 5 |
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弗 | 國家電腦系統公司 |
| ERC 2 | ERC 2 | ERC 2 |
| 標準 6 | 標準 6 | 標準 6 |
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格 | 國家電腦系統公司 |
| ERC 3 | ERC 3 | ERC 3 |
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赫 |
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表3 電腦上參考板
板佈局包括:6個Std(6個標準濃度的標準曲線),1個NTC(無模板對照),1個NCS(陰性對照溶液),3個TS(測試樣品),3個ERC(提取回收對照)。每個樣品設三個重複孔。
- 設定 PCR 儀器指南(2步法)(例如。 Thermo ABI 7500 qPCR儀(Version 2.0軟體)
以下說明僅適用於 Thermo ABI 7500 qPCR 儀器(軟體版本 2.0)。如果您使用不同的儀器,請參閱適用的儀器指南以取得設定指南。
1) 產生新實驗,選擇絕對定量或使用者定義的模板。
2) 建立1個檢測探針,命名為“CHO-DNA”,選擇報告螢光團為“FAM”,淬滅螢光團為“None”; 建立 1 個以上的檢測探針,命名為“IC”,並選擇報告螢光團為“CY5”,淬滅螢光團為“無”。參考螢光為「ROX」(參考螢光可依儀器型號等選擇是否需要添加)。
3) 在‘樣本’窗格中,依序新增所有樣本資訊。然後選擇孔,相應地選擇目標和樣本。設定CHO的任務 DNA標準為標準,並賦值300000、30000、3000、300、30、3 在 Quantity 欄中填寫每孔 DNA 濃度(單位為 fg/μL),並將孔命名為 Std 1、標準 2、標準 3、標準 4、標準 5,對應地為 Std 6。設定NTC的任務為NTC。設定 NCS、TS 和 ERC 為未知,並根據上面的板塊佈局進行相應命名。然後點擊下一步。
4) 設定擴增程序:設定反應體積為30 μL。
循環步驟 | 溫度(℃) | 時間 | 週期 |
初始變性 | 95℃ | 5 分鐘 | 1 |
變性 | 95℃ | 15 秒 | 40 |
退火/延伸(螢光收集) | 60℃ | 30 秒 |
表4 擴增步驟
- qPCR 結果分析
1) 系統會在分析的擴增圖面板中自動給出閾值。有時系統給出的Threshold太接近基線,導致重複孔之間的Ct差異很大。您可以手動調整閾值到合適的位置,然後按一下分析。然後可以在Multicomponent Plot中初步檢查擴增曲線是否正常。
2) 在「結果分析」標籤中,查看標準曲線圖。驗證 R 的值2、效率、坡度 和 Y 截距。對於常態標準曲線,R²>0.99, 90%≤效率%≤110%,-3.6≤斜率≤-3.1。
3) 在分析中的「檢視孔表」窗格中,每個樣本的濃度以數量顯示,單位為 fg/μL,可在檢測報告中轉換單位。
4)結果分析的參數設定需要根據特定機型和使用的軟體版本而定,一般可以由儀器自動解讀。
5)根據待測樣品TS的測試結果和樣品加標回收率ERC計算加標回收率,要求加標回收率在50%~150%之間。 {Sample spiked assay (eg.pg/μL) - Sample assay (eg.pg/μL)} x 洗脫體積(μL) / DNA加入量理論值(eg.pg) x 100%。
6)陰性對照NCS的Ct值應大於標準品最低濃度Ct的平均值。
- 無模板對照NTC應為未確定或Ct值≥3
筆記
- 本產品僅供研究使用。
- 為了您的安全,請穿著實驗服和戴上一次性手套進行操作。
3.使用該試劑前請仔細閱讀本說明書,實驗應標準化,包括樣品處理、反應體系製備、樣品的添加等。
4.使用前確保各組分充分渦旋並以低速離心。
付款和安全
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本產品僅用於研究目的,不用於人類或動物的治療或診斷用途。產品和內容受以下公司的專利、商標和版權保護:
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