1. الخلفية
يشكل rRNA نسبة عالية من إجمالي RNA في الكائنات الحية، لكنه لا يوفر سوى القليل من المعلومات الفعالة. ستنتج هذه RNAs عددًا كبيرًا من البيانات غير الصالحة، وهو أمر لا أهمية له لدراسة الحصول على المعلومات البيولوجية. وفي الوقت نفسه، يجعل rRNA بنسبة عالية mRNA وفيرًا نسبيًا في النسخ المنخفضة، وبالتالي يؤثر على اكتشاف النسخ ذات الوفرة المنخفضة. لذلك، في تسلسل RNA التقليدي (RNA-SEQ)، فإن الإزالة الفعالة لـ rRNA ضرورية لتحقيق تسلسل RNA فعال من حيث التكلفة.
2. وصف المنتج
(1) سلسلة MaxUp، مجموعة استنزاف rRNA
تعتمد سلسلة MaxUp من كواشف إزالة rRNA على هضم RNase H لإزالة rRNA الريبوسومي (rRNA) من إجمالي RNA للعينة للاحتفاظ بـ mRNA الرسول (mRNA) وRNAs غير المشفرة الأخرى. أنواع العينات غنية، والكمية الأولية واسعة، وتستغرق العملية بأكملها أقل من ساعتين، ووقت التشغيل اليدوي أقل من 10 دقائق. في الوقت نفسه، يمكن إزالة rRNA بكفاءة لكل من العينات التقليدية والعينات منخفضة الجودة (مثل FFPE)، مما يحسن بشكل كبير من معلومات البيانات الفعالة في تسلسل البيانات، وتحقيق تسلسل فعال من حيث التكلفة لعينات RNA.
（2）عمليات إزالة rRNA من سلسلة MaxUp
في الوقت الحاضر، يعد إزالة RNase الطريقة الرئيسية لإزالة rRNA، وخاصة بالنسبة لبعض عينات تحلل RNA (مثل عينات FFPE)، يمكن أن يظهر إزالة RNase مزاياه.
الشكل 1. مخطط تخطيطي لمبدأ إزالة rRNA لسلسلة MaxUp
3. عرض أداء المنتج
(1) عينات نباتية
تم استخدام RNase H لهضم وإزالة RNA الريبوسومي من إجمالي RNA من النباتات، وتم استخدام qPCR لمقارنة التغيرات في التعبير عن جين rRNA وجين mRNA قبل وبعد الإزالة. أظهرت النتائج أن هذا المنتج يمكنه إزالة rRNA من النباتات بشكل فعال.
الشكل 2. تم استخدام 1 ميكروجرام من الحمض النووي الريبي لأوراق نبات أرابيدوبسيس لإزالة الحمض النووي الريبي الريبوزي، وتم استخدام qPCR لمقارنة التغيرات في التعبير عن جين الحمض النووي الريبوزي الريبوزي وجين الحمض النووي الريبوزي المرسال قبل وبعد الإزالة
(2) عينة من الإنسان/الجرذ/الفئران
تم استخدام RNase H لهضم وإزالة RNA الريبوسومي من إجمالي RNA من النباتات، وبناء مكتبة وإرسال التسلسل. أظهر تحليل البيانات أن هذا المنتج يمكنه إزالة rRNA بكفاءة من مثل هذه العينات.
الشكل 3. تم أخذ 1 ميكروجرام من إجمالي الحمض النووي الريبي من الإنسان والفئران والجرذان كعينات، وتم تحليل بقايا الحمض النووي الريبي الريبوزي عن طريق التسلسل بعد إزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوزي
(3) عينات RNA منخفضة الجودة (على سبيل المثال FFPE RNA)
تميل العينات منخفضة الجودة إلى أن تحتوي على نسبة كبيرة من تسلسلات ITS/ETS (راجع FFPE RNA: DV200=20% في الشكل التالي)، وسينتج هذا الجزء من التسلسلات أيضًا عددًا كبيرًا من البيانات غير الصالحة، لذلك من خلال إضافة مجسات ITS/ETS في عينات منخفضة الجودة، يمكن إثراء التسلسلات المستهدفة بشكل أكثر فعالية. بالإضافة إلى المسبار الخاص بـ 45S Pre-rRNA التقليدي، تمت إضافة تصميم المسبار لمنطقة Human 45S ITS/ETS في هذا المنتج أيضًا، مما يضمن أن إزالة rRNA في العينات منخفضة الجودة يمكن أن تكون أكثر كفاءة دون التأثير على تأثير إزالة rRNA في العينات التقليدية.
الشكل 4.مقارنة بقايا rRNA وبقايا ITS/ETS قبل وبعد إضافة مجسات ITS/ETS
4. معلومات الطلب
| تنعم | صاسم المنتج | رمز المنتج | مواصفات المنتج |
| إزالة الرنا الريبوسومي عدة | هييف NGSالعلامة التجارية مجموعة MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) | 12257ES08/24/96 | 24/8/96ت |
| 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |