Hele transkriptomforskningen
[Hele transkriptomsekventering - forskning i målrettet regulering og interaktionsforhold mellem ikke-kodende RNA og mRNA]
High-throughput-sekventering af hele transkriptomer anvender den ribosom-udtømte strengspecifikke bibliotekskonstruktionsmetode og den lille fragmentberigelsesscreeningsbibliotekskonstruktionsmetode, som kan opnå bibliotekskonstruktion, sekventering, informationsanalyse, fælles analyse og ceRNA osv. af kodende RNA og ikke-kodende RNA, så på den måde kan det opnå hele RNA-transkriptionsdataene relateret til specifikke biologiske processer (såsom udvikling, sygdom osv.) hurtigt, omfattende og præcist. Gennem dataanalyse kan forskningen i biologisk reguleringsmekanisme udvides til en tredimensionel model, der kombinerer "netværk og multi-level", hvilket er nyttigt til en omfattende fortolkning af biologiske fænomener.
Der er to måder at sekventere hele transkriptomer på, den ene er LncRNA-Seq + Lille RNA, og den anden er LncRNA-Seq + Lille RNA + CircRNA, som kan opnå mere omfattende information om CircRNA.
1. Hel transkriptomsekventering med to biblioteker: LncRNA-Seq + Lille RNA
2.Hel transkriptomsekventering med tre biblioteker: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Hele transkriptom Råmaterialeløsning
| Klassifikation | Dyrekategori | Plantekategori | Bakterie- og svampekategori | |||
| Prøvetype | Dyrevæv/celle | Celle | Fuldblod | Plantevæv | Svampevæv | dyrkede bakterier og svampe |
| RNA-ekstraktion | Magnetiske perler metode: 18605/18607/18606; Kolonnemetode: 19221/19211; Trizol-metode: 10606/19202 | Magnetiske perler metode: 18600/18604; Kolonnemetode: 19231 | Kolonnemetode: 19241; Trizol-metoden: 19201 | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Kolonnemetode: 19301 (svampe skal tilføje lysozym 10403) |
| miRNA-ekstraktion | Kolonnemetode: 19331 | Kolonnemetode: 19331 | Kolonnemetode: 19332 | Kolonnemetode: 19331 | — | — |
| miRNA bibliotekskonstruktion | Forventes | |||||
| rRNA fjernelse | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (fjernelse af menneskelig kilde); Fjernelse af magnetiske perler: 12266 (pattedyr universal type)/12267 fugleuniversal type/12268 tamkylling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 østers/12278 planarian/12285web spen/122b8 skovflåt/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (human fjernelse, egnet til patogen) | RNase H enzymatisk fjernelse, herunder globinfjernelse: 12257 + 12806; RNase H enzymatisk fjernelse af globin: 13572; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 + 12260 | RNase H enzymatisk fjernelse: 12254; Fjernelse af magnetiske perler: 12262 angiosperm | Magnetiske perler metode fjernelse: 12271 svampe universal type | Magnetiske perler metode fjernelse: 12264 bakteriel universal type/12265 prokaryot universal type |
| Biblioteksbyggeri | Ikke-forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12308 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI); Forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12310 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI)/12340 (uden actinomycin D, dUTP)/12341 (uden actinomycin D, dTTP) | |||||
LncRNA forskning
Langt ikke-kodende RNA (LncRNA) er en slags ikke-kodende RNA med unik regulatorisk funktion, som har tiltrukket sig stor opmærksomhed i de senere år. LncRNA's længde er mere end 200nt, det koder ikke for proteiner, og dets bevarelse blandt arter er dårlig.Nogle af dets sekvensstrukturer ligner mRNA (indeholdende polyA-hale og alternativ splejsning), mens andre ikke har disse egenskaber. På nuværende tidspunkt er genereringen og den funktionelle mekanisme af LncRNA endnu ikke fuldt ud forstået, men mange LncRNA'er med vigtige biologiske funktioner (såsom kræftforekomst, X-kromosomdæmpning og dannelsen af komplekse regulatoriske netværk med andre regulatoriske faktorer) er blevet opdaget.
Teknisk rute til LncRNA-sekventering
LncRNA-sekventeringsråmaterialeopløsning
| Klassifikation | Dyrekategori | Plante Kategori | Bakterie- og svampekategori | |||
| Prøvetype | Dyrevæv/celle | Celle | Fuldblod | Plantevæv | Svampevæv | dyrkede bakterier og svampe |
| RNA-ekstraktion | Magnetiske perler metode: 18605/18607/18606; Kolonnemetode: 19221/19211; Trizol-metode: 10606/19202 | Magnetiske perler metode: 18600/18604; Kolonnemetode: 19231 | Kolonnemetode: 19241; Trizol-metoden: 19201 | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Kolonnemetode: 19301 (svampe skal tilføje lywallzyme 10403) |
| rRNA fjernelse | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (fjernelse af menneskelig kilde); Fjernelse af magnetiske perler: 12266 (pattedyr universal type)/12267 fugleuniversal type/12268 tamkylling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 østers/12278 planarian/12285web spen/122b8 skovflåt/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (human fjernelse, egnet til patogen) | RNase H enzymatisk fjernelse, herunder globinfjernelse: 12257 + 12806; RNase H enzymatisk fjernelse af globin: 13572; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 + 12260 | RNase H enzymatisk fjernelse: 12254; Magnetiske perler metode fjernelse: 12262 angiosperm | Magnetiske perler metode fjernelse: 12271 svampe universal type | Magnetiske perler metode fjernelse: 12264 bakteriel universal type/12265 prokaryot universal type |
| Biblioteksbyggeri | Ikke-forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12308 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI); Forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12310 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI)/12340 (uden actinomycin D, dUTP) | |||||
Eukaryotisk transkriptomforskning
Eukaryotisk transkriptomforskning bruger RNA-seq-teknologi til at opnå det totale mRNA, der kan transskriberes af specifikke celler i en bestemt funktionel tilstand.Derefter splejses og samles de downloadede rådata, genekspressionsniveauet tælles, og differentiel analyse og funktionel berigelsesanalyse udføres. Det kan ikke kun få det meste af artens geninformation, men også studere genekspressionsforskellen og funktionel pathway-ændring på det overordnede niveau og afsløre den molekylære mekanisme af specifikke biologiske processer.
Teknisk rute for eukaryotisk transkriptomsekventering
Eukaryotisk transkriptomsekventeringsråmaterialeopløsning
| Klassifikation | Dyrekategori | Plantekategori | Svampekategori | |||
| Prøvetype | Dyrevæv/celle | Celle | Fuldblod | Plantevæv | Svampevæv | dyrkede svampe |
| RNA-ekstraktion | Magnetiske perler metode: 18605/18607/18606; Kolonnemetode: 19221/19211; Trizol-metode: 10606/19202 | Magnetiske perler metode: 18600/18604; Kolonnemetode: 19231 | Kolonnemetode: 19241; Trizol-metoden: 19201 | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Kolonnemetode: 19301 (tilføj lysozym 10403) |
| mRNA-opsamling | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit | 12629 mRNA Isolation Master Kit |
| Biblioteksbyggeri | Ikke-forblandet RNA bibliotekskit: 12308 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina og MGI kompatibel) Ikke-forblandet RNA Library Kit med mRNA Capture: 12309 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina og MGI kompatibel) Forblandet RNA Library Kit: 12310 Dual-Mode RNA Library Kit (Illumina og MGI kompatibel)/12340 (uden Actinomycin D, dUTP) | |||||
circRNA forskning
[circRNA-sekventering - forskning i, hvordan den differentielle ekspression af circRNA påvirker biologiske processer]
Cirkulært RNA (circRNA) er en speciel type ikke-kodende RNA-analyse. Sekventering udføres ved hjælp af en sekventeringsplatform til at udføre nøjagtig circRNA-identifikation og analyse af kildegenerne for prøver med et referencegenom. circRNA-sekventering bruges i stigende grad i medicinske og landbrugsmæssige forskningsområder. Baseret på high-throughput-sekventering og afhængig af mainstream-databaser og circRNA-identifikationssoftware, analyseres circRNA-informationen for projektarten for at udforske de vigtige funktioner af circRNA i transkriptionel regulering.
circRNA Research Raw Material Solution
| Klassifikation | Dyrekategori | Plantekategori | Bakterie- og svampekategori | |||
| Prøvetype | Dyrevæv/celle | Celle | Fuldblod | Plantevæv | Svampevæv | dyrkede bakterier og svampe |
| RNA-ekstraktion | Magnetiske perler metode: 18605/18607/18606; Kolonnemetode: 19221/19211; Trizol-metode: 10606/19202 | Magnetiske perler metode: 18600/18604; Kolonnemetode: 19231 | Kolonnemetode: 19241; Trizol-metoden: 19201 | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Magnetiske perler metode: 18534/18535/18537; Kolonnemetode: 19291ES/19292ES | Kolonnemetode: 19301 (svampe skal tilføje lysozym 10403) |
| rRNA fjernelse | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (fjernelse af menneskelig kilde); Fjernelse af magnetiske perler: 12266 (pattedyr universal type)/12267 fugleuniversal type/12268 tamkylling/12269 zebrafisk/12270 Drosophila/12275 østers/12278 planarian/12285web spen/122b8 skovflåt/12290 Aedes albopictus/12287 nematode | RNase H enzymatisk fjernelse: 12257; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (human fjernelse, egnet til patogen) | RNase H enzymatisk fjernelse, herunder globinfjernelse: 12257 + 12806; RNase H enzymatisk fjernelse af globin: 13572; 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 + 12260 | RNase H enzymatisk fjernelse: 12254; Magnetiske perler metode fjernelse: 12262 angiosperm | Magnetiske perler metode fjernelse: 12271 svampe universal type | Magnetiske perler metode fjernelse: 12264 bakteriel universal type/12265 prokaryot universal type |
| Lineær RNA-fordøjelse | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler | 14606 RNase R for at fjerne lineære RNA-molekyler |
| Biblioteksbyggeri | Ikke-forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12308 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI); Forblandet RNA-biblioteksbyggesæt: 12310 dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI)/12340 (uden actinomycin D, dUTP) | |||||
Metatranskriptom
[Metatranskriptom - indfangning af de dynamiske ændringer af aktive mikroorganismer i det mikroøkologiske mikromiljø]
Metatranskriptom-sekventering: studerer transkriptions- og reguleringsreglerne for alle genomer i et specifikt miljø på det overordnede niveau.Ved at tage alt RNA i det mikroøkologiske mikromiljø som forskningsobjekt kombinerer det high-throughput-sekventering for at studere ændringerne af komplekse mikrobielle samfund på transkriptionsniveau og udvinde de aktive gener, der spiller en rolle.
Metatranskriptomforskning råmaterialeløsning
| Prøvetype | dyrkede bakterier og svampe | Kliniske prøver |
| RNA-ekstraktion | Kolonnemetode: 19301 (svampe skal tilføje lywallzyme 10403) | Søjlemetode: 19321 (viral DNA/RNA-ekstraktion); Magnetiske perler metode: 18521 (viral DNA/RNA ekstraktion); 18306 (patogen DNA/RNA-ekstraktion) |
| rRNA fjernelse | 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (fjernelse af menneskelig kilde) | 3-minutters hurtig fjernelse: 12258 (fjernelse af menneskelig kilde) |
| Biblioteksbyggeri | Mulighed 1. Samlet RNA-bibliotekskonstruktion: 12308ES dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI); Mulighed 2. cDNA enzymatisk fordøjelse bibliotek konstruktion: 13488ES cDNA syntese modul + 12316ES hurtig enzymatisk fordøjelse bibliotek byggesæt | Mulighed 1. Samlet RNA-bibliotekskonstruktion: 12308ES dual-mode RNA-bibliotekskonstruktionssæt (kompatibelt med Illumina og MGI); Mulighed 2.cDNA enzymatisk fordøjelse bibliotek konstruktion: 13488ES cDNA syntese modul + 12316ES hurtig enzymatisk fordøjelse bibliotek byggesæt |
Produktanbefaling
| Produktnavn | Katalognummer | Specifikation |
| Hieff NGS TM EvoMax RNA Library Prep Kit（dUTP） | 12340ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM EvoMax RNA Library Prep Kit (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit (Illumina og MGI) | 12308ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit (forblandet version) | 12310ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM mRNA Isolation Master Kit V2 | 12629ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MaxUp rRNA-udtømningssæt (plante) | 12254ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM Et-trins rRNA-fjernelseskit (menneske, 100-1.000 ng) | 12258ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSTM MagSP rRNA fjernelseskit (bakterier(G- og G+)) med renseperler | 12264ES24/96 | 24 T/ 96 T |