1, Baggrund
rRNA tegner sig for en høj andel af Total RNA i organismer, men det kan give lidt effektiv information. Disse RNA'er vil producere et stort antal ugyldige data, hvilket er af ringe betydning for undersøgelsen af at opnå biologisk information. I mellemtiden gør rRNA med en høj andel mRNA relativt rigeligt i transkripter lavt, hvilket påvirker påvisningen af transkripter med lav abundance. Ved konventionel RNA-sekventering (RNA-SEQ) er effektiv fjernelse af rRNA derfor afgørende for at opnå omkostningseffektiv sekvensering af RNA.
2, Produktbeskrivelse
（1）MaxUp-serien，rRNA Depletion Kit
MaxUp-serien af rRNA-fjernelsesreagenser er baseret på RNase H-fordøjelse for at fjerne ribosomalt RNA (rRNA) fra en prøves totale RNA for at tilbageholde messenger-RNA (mRNA) og andre ikke-kodende RNA'er. Prøvetyperne er rige, startmængden er bred, hele processen tager mindre end 2 timer, og den manuelle driftstid er mindre end 10 minutter. Samtidig kan rRNA effektivt fjernes for både konventionelle prøver og prøver af lav kvalitet (såsom FFPE), hvilket væsentligt forbedrer den effektive datainformation i sekventeringsdata og realiserer omkostningseffektiv sekventering af RNA-prøver.
（2）MaxUp-seriens rRNA-fjernelsesprocesser
På nuværende tidspunkt er RNase-eliminering den vigtigste metode til rRNA-fjernelse, især for nogle RNA-nedbrydningsprøver (såsom FFPE-prøver), kan RNase-eliminering vise sine fordele.
Figur 1. Skematisk diagram af MaxUp-seriens rRNA-fjernelsesprincip
3、 Display for produktydelse
（1）Planteprøver
RNase H blev brugt til at fordøje og fjerne ribosomalt RNA fra totalt RNA fra planter, og qPCR blev brugt til at sammenligne ekspressionsændringerne af rRNA-gen og mRNA-gen før og efter fjernelse. Resultaterne viste, at dette produkt effektivt kunne fjerne rRNA fra planter.
FIG. 2. 1μg Arabidopsis-blad-RNA blev brugt til rRNA-fjernelse, og qPCR blev brugt til at sammenligne ekspressionsændringerne af rRNA-genet og mRNA-genet før og efter fjernelse
（2） Prøve fra menneske/rotte/mus
RNase H blev brugt til at fordøje og fjerne ribosomalt RNA fra det totale RNA fra planter, opbygge et bibliotek og sende sekventering. Dataanalyse viste, at dette produkt effektivt kunne fjerne rRNA fra sådanne prøver.
Figur 3. 1μg total RNA fra mennesker, mus og rotter blev taget som prøver, og rRNA-resterne blev analyseret ved sekventering efter rRNA-fjernelse
（3） RNA-prøver af lav kvalitet (f.eks. FFPE RNA)
Prøver af lav kvalitet har en tendens til at have en stor andel af ITS/ETS-sekvenser (se FFPE RNA: DV200=20% i den følgende figur), og denne del af sekvenserne vil også producere et stort antal ugyldige data, så ved at tilføje ITS/ETS-prober i prøver af lav kvalitet, kan målsekvenserne effektivt beriges yderligere. Ud over proben til det konventionelle 45S Pre-rRNA er probedesignet til Human 45S ITS/ETS-regionen også tilføjet i dette produkt, hvilket sikrer, at rRNA-fjernelse i prøver af lav kvalitet kan være mere effektiv uden at påvirke rRNA-fjernelseseffekten i konventionelle prøver.
Figur 4.Sammenligning af rRNA-rester og ITS/ETS-rester før og efter tilføjelse af ITS/ETS-prober
4、Bestillingsinformation
| Type | Pproduktnavn | Produktkode | Produktspecifikationer |
| rRNA fjernelse sæt | 12257ES08/24/96 | 24/8/96T | |
| 12254ES08/24/96 | 8/24T/96T |