La investigación completa del transcriptoma
[Secuenciación del transcriptoma completo: investigación sobre la regulación dirigida y la relación de interacción entre el ARN no codificante y el ARNm]
La secuenciación de alto rendimiento del transcriptoma completo adopta el método de construcción de bibliotecas específicas de cadena agotada en ribosomas y el método de construcción de bibliotecas de detección de enriquecimiento de fragmentos pequeños, que puede lograr la construcción de bibliotecas, secuenciación, análisis de información, análisis conjunto y ceRNA, etc. de ARN codificante y ARN no codificante, por lo que De esa manera puede obtener Toda la información de los datos de transcripción de ARN relacionada con procesos biológicos específicos (como el desarrollo, las enfermedades, etc.) de forma rápida, completa y precisa. A través del análisis de datos, la investigación sobre el mecanismo de regulación biológica se puede ampliar a un modelo tridimensional que combina "red y multinivel", lo que resulta útil para interpretar de forma integral los fenómenos biológicos.
Hay dos formas de secuenciar el transcriptoma completo, una es LncRNA-Seq + Small RNA y la otra es LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, que puede obtener información más completa de CircRNA.
1.Secuenciación del transcriptoma completo con dos bibliotecas: LncRNA-Seq + Small RNA
2.Secuenciación del transcriptoma completo con tres bibliotecas: LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Solución de materia prima para el transcriptoma completo
| Clasificación | Categoría de animales | Categoría de planta | Categoría de bacterias y hongos | |||
| Tipo de muestra | Tejido/célula animal | Celúla | Sangre entera | Tejido vegetal | Tejido fúngico | Bacterias y hongos cultivados |
| Extracción de ARN | Método de perlas magnéticas: 18605/18607/18606; Método de columna: 19221/19211; Método Trizol: 10606/19202 | Método de perlas magnéticas: 18600/18604; Método de columna: 19231 | Método de columna: 19241; Método Trizol: 19201 | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de columna: 19301 (los hongos necesitan agregar lisozima) 10403) |
| Extracción de miRNA | Método de columna: 19331 | Método de columna: 19331 | Método de columna: 19332 | Método de columna: 19331 | — | — |
| Construcción de la biblioteca de miRNA | Era de esperarse | |||||
| Eliminación de ARNr | ARNasa Eliminación enzimática H: 12257; Eliminación rápida en 3 minutos: 12258 (eliminación de origen humano); Eliminación con método de perlas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 pollo doméstico/12269 pez cebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planaria/12285 abeja/12286 araña de telaraña dorada/12289 garrapata/12290 Aedes albopictus/12287 nematodo | ARNasa Eliminación enzimática H: 12257; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 (eliminación humana, adecuada para patógenos) | ARNasa Eliminación enzimática de H, incluida la eliminación de globina: 12257 + 12806; ARNasa H Eliminación enzimática de globina: 13572; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | ARNasa Eliminación enzimática H: 12254; Eliminación por método de perlas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12271 hongos de tipo universal | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariota |
| Construcción de biblioteca | Kit de construcción de biblioteca de ARN no premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12308 (compatible con Illumina y MGI); Kit de construcción de biblioteca de ARN premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12310 (compatible con Illumina y MGI)/12340 (sin actinomicina D, dUTP)/12341 (sin actinomicina D, dTTP) | |||||
Investigación sobre el ARNmLnc
El ARN no codificante largo (LncRNA) es un tipo de ARN no codificante con una función reguladora única que ha atraído mucha atención en los últimos años. La longitud del LncRNA es superior a 200 nt, no codifica proteínas y su conservación entre especies es deficiente.Algunas de sus estructuras de secuencia son similares a las del ARNm (contienen cola de poliA y splicing alternativo), mientras que otras no tienen estas características. En la actualidad, la generación y el mecanismo funcional del LncRNA aún no se comprenden por completo, sin embargo, Se han descubierto muchos LncRNA con funciones biológicas importantes (como la aparición de cáncer, el silenciamiento del cromosoma X y la formación de redes reguladoras complejas con otros factores reguladores).
Ruta técnica de secuenciación de lncRNA
Solución de materia prima para secuenciación de lncRNA
| Clasificación | Categoría de animales | Planta Categoría | Categoría de bacterias y hongos | |||
| Tipo de muestra | Tejido/célula animal | Celúla | Sangre entera | Tejido vegetal | Tejido fúngico | Bacterias y hongos cultivados |
| Extracción de ARN | Método de perlas magnéticas: 18605/18607/18606; Método de columna: 19221/19211; Método Trizol: 10606/19202 | Método de perlas magnéticas: 18600/18604; Método de columna: 19231 | Método de columna: 19241; Método Trizol: 19201 | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de columna: 19301 (los hongos necesitan agregar lywallzyme 10403) |
| Eliminación de ARNr | ARNasa H eliminación enzimática: 12257; Eliminación rápida en 3 minutos: 12258 (eliminación de origen humano); Eliminación con método de perlas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 pollo doméstico/12269 pez cebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planaria/12285 abeja/12286 araña de telaraña dorada/12289 garrapata/12290 Aedes albopictus/12287 nematodo | ARNasa H Eliminación enzimática: 12257; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 (eliminación humana, adecuada para patógenos) | ARNasa H Eliminación enzimática, incluida la eliminación de globina: 12257 + 12806; ARNasa H Eliminación enzimática de globina: 13572; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | ARNasa H Eliminación enzimática: 12254; Eliminación por método de perlas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12271 hongos de tipo universal | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariota |
| Construcción de biblioteca | Kit de construcción de biblioteca de ARN no premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12308 (compatible con Illumina y MGI); Kit de construcción de biblioteca de ARN premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12310 (compatible con Illumina y MGI)/12340 (sin actinomicina D, dUTP) | |||||
Investigación sobre el transcriptoma eucariota
La investigación del transcriptoma eucariota utiliza la tecnología RNA-seq para obtener el ARNm total que puede ser transcrito por células específicas en un determinado estado funcional.Luego, los datos sin procesar descargados se unen y ensamblan, se cuenta el nivel de expresión genética y se lleva a cabo el análisis diferencial y el análisis de enriquecimiento funcional. No solo se puede obtener la mayor parte de la información genética de la especie, sino que también se estudia la diferencia de expresión genética y el cambio de la vía funcional a nivel general, y se revela el mecanismo molecular de procesos biológicos específicos.
Ruta técnica de secuenciación del transcriptoma eucariota
Solución de materia prima para la secuenciación del transcriptoma eucariota
| Clasificación | Categoría de animales | Categoría de planta | Categoría de hongos | |||
| Tipo de muestra | Tejido/célula animal | Celúla | Sangre entera | Tejido vegetal | Tejido fúngico | Hongos cultivados |
| Extracción de ARN | Método de perlas magnéticas: 18605/18607/18606; Método de columna: 19221/19211; Método Trizol: 10606/19202 | Método de perlas magnéticas: 18600/18604; Método de columna: 19231 | Método de columna: 19241; Método Trizol: 19201 | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de columna: 19301 (agregar lisozima 10403) |
| Captura de ARNm | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 | Kit maestro de aislamiento de ARNm 12629 |
| Construcción de biblioteca | Kit de biblioteca de ARN no premezclado: Kit de biblioteca de ARN de modo dual 12308 (compatible con Illumina y MGI) Kit de biblioteca de ARN sin premezcla con captura de ARNm: kit de biblioteca de ARN de modo dual 12309 (compatible con Illumina y MGI) Kit de biblioteca de ARN premezclado: 12310 Kit de biblioteca de ARN de modo dual (compatible con Illumina y MGI)/12340 (sin actinomicina D, dUTP) | |||||
Investigación sobre el ARN circular
[Secuenciación de circRNA: investigación sobre cómo la expresión diferencial de circRNA afecta los procesos biológicos]
El ARN circular (circARN) es un tipo especial de análisis de ARN no codificante. La secuenciación se lleva a cabo utilizando una plataforma de secuenciación para realizar una identificación precisa del circARN y el análisis de los genes fuente de las muestras con un genoma de referencia. La secuenciación del circARN se utiliza cada vez más en los campos de la investigación médica y agrícola. Basándose en la secuenciación de alto rendimiento y apoyándose en bases de datos convencionales y software de identificación de circARN, se analiza la información del circARN de las especies del proyecto para explorar en profundidad las importantes funciones del circARN en la regulación transcripcional.
Solución de materia prima para investigación de circRNA
| Clasificación | Categoría de animales | Categoría de planta | Categoría de bacterias y hongos | |||
| Tipo de muestra | Tejido/célula animal | Celúla | Sangre entera | Tejido vegetal | Tejido fúngico | Bacterias y hongos cultivados |
| Extracción de ARN | Método de perlas magnéticas: 18605/18607/18606; Método de columna: 19221/19211; Método Trizol: 10606/19202 | Método de perlas magnéticas: 18600/18604; Método de columna: 19231 | Método de columna: 19241; Método Trizol: 19201 | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de perlas magnéticas: 18534/18535/18537; Método de columna: 19291ES/19292ES | Método de columna: 19301 (los hongos necesitan agregar lisozima 10403) |
| Eliminación de ARNr | ARNasa H Eliminación enzimática: 12257; Eliminación rápida en 3 minutos: 12258 (eliminación de origen humano); Eliminación con método de perlas magnéticas: 12266 (tipo universal de mamífero)/12267 tipo universal de ave/12268 pollo doméstico/12269 pez cebra/12270 Drosophila/12275 ostra/12278 planaria/12285 abeja/12286 araña de telaraña dorada/12289 garrapata/12290 Aedes albopictus/12287 nematodo | ARNasa H Eliminación enzimática: 12257; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 (eliminación humana, adecuada para patógenos) | ARNasa H Eliminación enzimática, incluida la eliminación de globina: 12257 + 12806; ARNasa H Eliminación enzimática de globina: 13572; eliminación rápida de 3 minutos: 12258 + 12260 | ARNasa H Eliminación enzimática: 12254; Eliminación por método de perlas magnéticas: 12262 angiospermas | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12271 hongos de tipo universal | Método de eliminación de perlas magnéticas: 12264 tipo universal bacteriano/12265 tipo universal procariota |
| Digestión lineal del ARN | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales | 14606 ARNasa R para eliminar moléculas de ARN lineales |
| Construcción de biblioteca | Kit de construcción de biblioteca de ARN no premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12308 (compatible con Illumina y MGI); Kit de construcción de biblioteca de ARN premezclado: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12310 (compatible con Illumina y MGI)/12340 (sin actinomicina D, dUTP) | |||||
Metatranscriptoma
[Metatranscriptoma: captura de los cambios dinámicos de los microorganismos activos en el microambiente microecológico]
Secuenciación del metatranscriptoma: estudia las reglas de transcripción y regulación de todos los genomas en un entorno específico a nivel global.Tomando todo el ARN en el microambiente microecológico como objeto de investigación, combina la secuenciación de alto rendimiento para estudiar los cambios de las comunidades microbianas complejas a nivel transcripcional y extraer los genes activos que juegan un papel.
Solución de materia prima para la investigación del metatranscriptoma
| Tipo de muestra | Bacterias y hongos cultivados | Muestras clínicas |
| Extracción de ARN | Método de columna: 19301 (los hongos necesitan agregar lywallzyme 10403) | Método de columna: 19321 (extracción de ADN/ARN viral); Método de perlas magnéticas: 18521 (extracción de ADN/ARN viral); 18306 (extracción de ADN/ARN patógeno) |
| Eliminación de ARNr | Eliminación rápida en 3 minutos: 12258 (eliminación de origen humano) | Eliminación rápida en 3 minutos: 12258 (eliminación de origen humano) |
| Construcción de biblioteca | Opción 1. Construcción de biblioteca de ARN total: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12308ES (compatible con Illumina y MGI); Opción 2. Construcción de biblioteca de digestión enzimática de ADNc: módulo de síntesis de ADNc 13488ES + kit de construcción de biblioteca de digestión enzimática rápida 12316ES | Opción 1. Construcción de biblioteca de ARN total: kit de construcción de biblioteca de ARN de modo dual 12308ES (compatible con Illumina y MGI); Opción 2.Construcción de una biblioteca de digestión enzimática de ADNc: módulo de síntesis de ADNc 13488ES + kit de construcción de una biblioteca de digestión enzimática rápida 12316ES |
Recomendación de producto
| Nombre del producto | Número de catálogo | Especificación |
| Alto NGS MT. Kit de preparación de biblioteca de ARN EvoMax (dUTP) | 12340ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de preparación de biblioteca de ARN EvoMax (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de preparación de biblioteca de ARN de modo dual Ultima (Illumina y MGI) | 12308ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de preparación de biblioteca de ARN de modo dual Ultima (versión premezclada) | 12310ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit maestro de aislamiento de ARNm V2 | 12629ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de depleción de ARNr humano MaxUp (ARNr e ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de depleción de ARNm MaxUp (planta) | 12254ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de eliminación de ARNr en un solo paso (humano, 100-1000 ng) | 12258ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |
| Alto NGSMT. Kit de eliminación de ARNr MagSP (bacterias (G- y G+)) con perlas de purificación | 12264ES24/96 | 24 toneladas/ 96 toneladas |