La recherche sur le transcriptome complet
[Séquençage du transcriptome entier - Recherche sur la régulation ciblée et la relation d'interaction entre l'ARN non codant et l'ARNm]
Le séquençage à haut débit du transcriptome entier adopte la méthode de construction de bibliothèque spécifique à brin appauvri en ribosomes et la méthode de construction de bibliothèque de criblage d'enrichissement de petits fragments, qui peuvent réaliser la construction de bibliothèque, le séquençage, l'analyse des informations, l'analyse conjointe et le ceRNA, etc. de l'ARN codant et de l'ARN non codant. de cette façon, il peut obtenir L'ensemble des données de transcription d'ARN relatives à des processus biologiques spécifiques (tels que le développement, la maladie, etc.) sont rapidement, complètement et avec précision. Grâce à l'analyse des données, la recherche sur les mécanismes de régulation biologique peut être étendue à un modèle tridimensionnel combinant « réseau et multi-niveaux », ce qui est utile pour interpréter de manière exhaustive les phénomènes biologiques.
Il existe deux méthodes de séquençage du transcriptome entier, l'une est LncRNA-Seq + Small RNA, et l'autre est LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA, qui peuvent obtenir des informations plus complètes sur CircRNA.
1. Séquençage du transcriptome entier avec deux bibliothèques : LncRNA-Seq + Small RNA
2.Séquençage du transcriptome entier avec trois bibliothèques : LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
Solution de matière première pour transcriptome complet
| Classification | Catégorie d'animaux | Catégorie de plante | Catégorie bactérienne et fongique | |||
| Type d'échantillon | Tissu/cellule animale | Cellule | Sang total | Tissu végétal | Tissu fongique | Culture de bactéries et de champignons |
| Extraction d'ARN | Méthode des billes magnétiques : 18605/18607/18606 ; Méthode des colonnes : 19221/19211 ; Méthode Trizol : 10606/19202 | Méthode des billes magnétiques : 18600/18604 ; Méthode de la colonne : 19231 | Méthode de colonne : 19241 ; Méthode Trizol : 19201 | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode de la colonne : 19301 (les champignons doivent ajouter du lysozyme 10403) |
| Extraction de miRNA | Méthode de colonne : 19331 | Méthode de colonne : 19331 | Méthode de colonne : 19332 | Méthode de colonne : 19331 | — | — |
| Construction d'une bibliothèque de miRNA | À prévoir | |||||
| Élimination de l'ARNr | ARNase Élimination enzymatique H : 12257 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination d'origine humaine) ; élimination par la méthode des billes magnétiques : 12266 (type universel mammifère)/12267 type universel aviaire/12268 poulet domestique/12269 poisson zèbre/12270 drosophile/12275 huître/12278 planaire/12285 abeille/12286 araignée à toile d'orbe dorée/12289 tique/12290 Aedes albopictus/12287 nématode | ARNase Élimination enzymatique H : 12257 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination humaine, adaptée aux agents pathogènes) | ARNase Élimination enzymatique de H, y compris l'élimination de la globine : 12257 + 12806; ARNase H élimination enzymatique de la globine : 13572 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 + 12260 | ARNase Élimination enzymatique H : 12254 ; Élimination par méthode à billes magnétiques : 12262 angiospermes | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12271 champignons de type universel | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12264 type universel bactérien/12265 type universel procaryote |
| Construction d'une bibliothèque | Kit de construction de bibliothèque d'ARN non prémélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12308 (compatible avec Illumina et MGI) ; Kit de construction de bibliothèque d'ARN pré-mélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12310 (compatible avec Illumina et MGI)/12340 (sans actinomycine D, dUTP)/12341 (sans actinomycine D, dTTP) | |||||
Recherche sur les ARNlnc
L'ARN long non codant (LncRNA) est un type d'ARN non codant doté d'une fonction régulatrice unique qui a suscité une attention considérable ces dernières années. La longueur de l'ARN long non codant est supérieure à 200 nt, il ne code pas de protéines et sa conservation entre les espèces est médiocre.Certaines de ses structures de séquence sont similaires à celles de l'ARNm (contenant une queue polyA et un épissage alternatif), tandis que d'autres ne présentent pas ces caractéristiques. À l'heure actuelle, la génération et le mécanisme fonctionnel de LncRNA ne sont pas encore entièrement compris, cependant, de nombreux LncRNA ayant des fonctions biologiques importantes (telles que l'apparition du cancer, le silençage du chromosome X et la formation de réseaux régulateurs complexes avec d'autres facteurs régulateurs) ont été découverts.
Voie technique de séquençage de l'ARNlnc
Solution de matière première pour le séquençage de l'ARNlnc
| Classification | Catégorie d'animaux | Usine Catégorie | Catégorie bactérienne et fongique | |||
| Type d'échantillon | Tissu/cellule animale | Cellule | Sang total | Tissu végétal | Tissu fongique | Culture de bactéries et de champignons |
| Extraction d'ARN | Méthode des billes magnétiques : 18605/18607/18606 ; Méthode de la colonne : 19221/19211 ; Méthode Trizol : 10606/19202 | Méthode des billes magnétiques : 18600/18604 ; Méthode de la colonne : 19231 | Méthode de la colonne : 19241 ; Méthode Trizol : 19201 | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode de la colonne : 19301 (les champignons doivent ajouter du lywallzyme 10403) |
| Élimination de l'ARNr | ARNase H élimination enzymatique : 12257 ; Élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination de source humaine) ; élimination par la méthode des billes magnétiques : 12266 (type universel mammifère)/12267 type universel aviaire/12268 poulet domestique/12269 poisson zèbre/12270 drosophile/12275 huître/12278 planaire/12285 abeille/12286 araignée à toile dorée/12289 tique/12290 Aedes albopictus/12287 nématode | ARNase H élimination enzymatique : 12257 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination humaine, adaptée aux agents pathogènes) | ARNase H élimination enzymatique, y compris l'élimination de la globine : 12257 + 12806; ARNase H élimination enzymatique de la globine : 13572 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 + 12260 | ARNase H élimination enzymatique : 12254 ; élimination par billes magnétiques : 12262 angiospermes | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12271 champignons de type universel | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12264 type universel bactérien/12265 type universel procaryote |
| Construction d'une bibliothèque | Kit de construction de bibliothèque d'ARN non prémélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12308 (compatible avec Illumina et MGI) ; Kit de construction de bibliothèque d'ARN pré-mélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12310 (compatible avec Illumina et MGI)/12340 (sans actinomycine D, dUTP) | |||||
Recherche sur le transcriptome eucaryote
La recherche sur le transcriptome eucaryote utilise la technologie RNA-seq pour obtenir l’ARNm total qui peut être transcrit par des cellules spécifiques dans un certain état fonctionnel.Ensuite, les données brutes téléchargées sont épissées et assemblées, le niveau d'expression des gènes est compté et une analyse différentielle et une analyse d'enrichissement fonctionnel sont effectuées. Il permet non seulement d'obtenir la plupart des informations génétiques de l'espèce, mais également d'étudier la différence d'expression des gènes et le changement de voie fonctionnelle au niveau global, et de révéler le mécanisme moléculaire de processus biologiques spécifiques.
Voie technique de séquençage du transcriptome eucaryote
Solution de matière première pour le séquençage du transcriptome eucaryote
| Classification | Catégorie d'animaux | Catégorie de plante | Catégorie fongique | |||
| Type d'échantillon | Tissu/cellule animale | Cellule | Sang total | Tissu végétal | Tissu fongique | Champignons cultivés |
| Extraction d'ARN | Méthode des billes magnétiques : 18605/18607/18606 ; Méthode de la colonne : 19221/19211 ; Méthode Trizol : 10606/19202 | Méthode des billes magnétiques : 18600/18604 ; Méthode de la colonne : 19231 | Méthode de la colonne : 19241 ; Méthode Trizol : 19201 | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode de la colonne : 19301 (ajouter le lysozyme 10403) |
| Capture d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm | 12629 Kit maître d'isolement d'ARNm |
| Construction d'une bibliothèque | Kit de bibliothèque d'ARN non prémélangé : Kit de bibliothèque d'ARN bimode 12308 (compatible Illumina et MGI) Kit de bibliothèque d'ARN non prémélangé avec capture d'ARNm : 12309 Kit de bibliothèque d'ARN bimode (compatible Illumina et MGI) Kit de bibliothèque d'ARN prémélangé : 12310 Kit de bibliothèque d'ARN bimode (compatible Illumina et MGI)/12340 (sans actinomycine D, dUTP) | |||||
Recherche sur le circRNA
[Séquençage de circRNA - Recherche sur la façon dont l'expression différentielle de circRNA affecte les processus biologiques]
L'ARN circulaire (circRNA) est un type particulier d'analyse d'ARN non codant. Le séquençage est effectué à l'aide d'une plate-forme de séquençage pour effectuer une identification précise de l'ARN circulaire et une analyse des gènes sources pour les échantillons avec un génome de référence. Le séquençage de l'ARN circulaire est de plus en plus utilisé dans les domaines de la recherche médicale et agricole. Sur la base d'un séquençage à haut débit et en s'appuyant sur des bases de données courantes et des logiciels d'identification de l'ARN circulaire, les informations de l'ARN circulaire des espèces du projet sont analysées pour explorer en profondeur les fonctions importantes de l'ARN circulaire dans la régulation transcriptionnelle.
Solution de matière première pour la recherche sur le circRNA
| Classification | Catégorie d'animaux | Catégorie de plante | Catégorie bactérienne et fongique | |||
| Type d'échantillon | Tissu/cellule animale | Cellule | Sang total | Tissu végétal | Tissu fongique | Culture de bactéries et de champignons |
| Extraction d'ARN | Méthode des billes magnétiques : 18605/18607/18606 ; Méthode de la colonne : 19221/19211 ; Méthode Trizol : 10606/19202 | Méthode des billes magnétiques : 18600/18604 ; Méthode de la colonne : 19231 | Méthode de la colonne : 19241 ; Méthode Trizol : 19201 | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode des billes magnétiques : 18534/18535/18537 ; Méthode des colonnes : 19291ES/19292ES | Méthode de la colonne : 19301 (les champignons doivent ajouter du lysozyme 10403) |
| Élimination de l'ARNr | ARNase H élimination enzymatique : 12257 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination d'origine humaine) ; élimination par la méthode des billes magnétiques : 12266 (type universel mammifère)/12267 type universel aviaire/12268 poulet domestique/12269 poisson zèbre/12270 drosophile/12275 huître/12278 planaire/12285 abeille/12286 araignée à toile dorée/12289 tique/12290 Aedes albopictus/12287 nématode | ARNase H élimination enzymatique : 12257 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination humaine, adaptée aux agents pathogènes) | ARNase H élimination enzymatique, y compris l'élimination de la globine : 12257 + 12806; ARNase H élimination enzymatique de la globine : 13572 ; élimination rapide en 3 minutes : 12258 + 12260 | ARNase H élimination enzymatique : 12254 ; élimination par billes magnétiques : 12262 angiospermes | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12271 champignons de type universel | Méthode d'élimination des billes magnétiques : 12264 type universel bactérien/12265 type universel procaryote |
| Digestion de l'ARN linéaire | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires | 14606 RNase R pour éliminer les molécules d'ARN linéaires |
| Construction d'une bibliothèque | Kit de construction de bibliothèque d'ARN non prémélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12308 (compatible avec Illumina et MGI) ; Kit de construction de bibliothèque d'ARN pré-mélangé : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12310 (compatible avec Illumina et MGI)/12340 (sans actinomycine D, dUTP) | |||||
Métatranscriptome
[Métatranscriptome - Capture des changements dynamiques des micro-organismes actifs dans le microenvironnement microécologique]
Séquençage du métatranscriptome : étudie les règles de transcription et de régulation de tous les génomes dans un environnement spécifique au niveau global.En prenant comme objet de recherche l'ensemble de l'ARN du microenvironnement microécologique, il combine le séquençage à haut débit pour étudier les changements des communautés microbiennes complexes au niveau transcriptionnel et exploiter les gènes actifs qui jouent un rôle.
Solution de matière première pour la recherche sur le métatranscriptome
| Type d'échantillon | Culture de bactéries et de champignons | Échantillons cliniques |
| Extraction d'ARN | Méthode de la colonne : 19301 (les champignons doivent ajouter du lywallzyme 10403) | Méthode de la colonne : 19321 (extraction d'ADN/ARN viral) ; méthode des billes magnétiques : 18521 (extraction d'ADN/ARN viral) ; 18306 (extraction d'ADN/ARN pathogène) |
| Élimination de l'ARNr | Élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination de source humaine) | Élimination rapide en 3 minutes : 12258 (élimination de source humaine) |
| Construction d'une bibliothèque | Option 1. Construction d'une bibliothèque d'ARN totale : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12308ES (compatible avec Illumina et MGI) ; Option 2. Construction d'une bibliothèque de digestion enzymatique d'ADNc : module de synthèse d'ADNc 13488ES + kit de construction de bibliothèque de digestion enzymatique rapide 12316ES | Option 1. Construction d'une bibliothèque d'ARN totale : kit de construction de bibliothèque d'ARN bimode 12308ES (compatible avec Illumina et MGI) ; Option 2.Construction d'une bibliothèque de digestion enzymatique d'ADNc : module de synthèse d'ADNc 13488ES + kit de construction d'une bibliothèque de digestion enzymatique rapide 12316ES |
Recommandation de produit
| Nom du produit | Numéro de catalogue | Spécification |
| Hieff NGS MT Kit de préparation de bibliothèque d'ARN EvoMax (dUTP) | 12340ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de préparation de bibliothèque d'ARN EvoMax (dNTP) | 12341ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de préparation de bibliothèque d'ARN double mode Ultima (Illumina et MGI) | 12308ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de préparation de bibliothèque d'ARN double mode Ultima (version prémélangée) | 12310ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit maître d'isolement d'ARNm V2 | 12629ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de déplétion d'ARNr humain MaxUp (ARNr et ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de déplétion d'ARNr MaxUp (plante) | 12254ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit de suppression d'ARNr en une étape (humain, 100-1 000 ng) | 12258ES24/96 | 24 T/ 96 T |
| Hieff NGSMT Kit d'élimination de l'ARNr MagSP (bactéries (G- et G+)) avec billes de purification | 12264ES24/96 | 24 T/ 96 T |